TopFIND 4.0

Q6P5D8: Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1 {ECO:0000303|PubMed:18425126}

General Information

Protein names
- Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1 {ECO:0000303|PubMed:18425126}
- SMC hinge domain-containing protein 1 {ECO:0000303|PubMed:18425126}
- 3.6.1.- {ECO:0000269|PubMed:26391951, ECO:0000269|PubMed:27059856}

Gene names Smchd1
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q6P5D8

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MAAEGASDPA GLSEGSGRDG AVDGCRTVYL FDRRGKDSEL GDRALQVSEH ADYAGFRASV 
        70         80         90        100        110        120 
CQTIGISSEE KFVITTTSRK EITCNNFDHT VKDGVTLYLL QSVDQSLLTA TKERIDFLPH 
       130        140        150        160        170        180 
YDTLVKSGMY EYYASEGQNP LPFALAELID NSLSATSRNN GVRRIQIKLL FDETQGKPAV 
       190        200        210        220        230        240 
AVVDNGRGMT SKQLNNWAVY RLSKFTRQGD FESDHSGYVR PLPVPRSLNS DISYFGVGGK 
       250        260        270        280        290        300 
QAVFFVGQSA RMISKPIDSK DVHELVLSKE DFEKKEKNKE AIYSGYIRNR KPADSAHITN 
       310        320        330        340        350        360 
DDERFLHNLI EEEKEKDSFT AVVITGVQPE HIQYLKNYLH LWTRQLTHIY HYYIHGPKGN 
       370        380        390        400        410        420 
EISTAKAIGP FNNIDIEISL FEKGKTPKII NLREIQDDMQ TLYINTASDS FEFKAHVEGD 
       430        440        450        460        470        480 
GVVEGVIRYH PFLYDRETFP DDPCFPSKLK DEDDDDDCFI SEKAARGKRP IFECFWNGRL 
       490        500        510        520        530        540 
IPYTSVGDFD WCAPPKKRGL VPIECFNRIS GALFTNDKFQ VSTNKLTFMD LELKLKDKNT 
       550        560        570        580        590        600 
LFTRILNGQE QRMKIDREFA LWLKDCHEKH DKQIKFTLFK GIITRPDLPT KKQGPWATFS 
       610        620        630        640        650        660 
AIEWDGKIYK AGQLVKTIKT LPLCYGSIVR FFLHGDHDGE VYATGGEVQI AMEPQALYDE 
       670        680        690        700        710        720 
IKTVPIAKLD RTVAEKTIRK YVEDEMARLP DRLSVTWPEG DELLPNEVRP AGTPIGALRI 
       730        740        750        760        770        780 
EILNKKGEAM QKLPGTSHGG SKKLLVELKV ILHTSSGNKE IISHISQHGG KWPYWFKKME 
       790        800        810        820        830        840 
NIQKLGNYTL KLQVVLNESN ADTYAGRSLP SKVIKFSVKE GKPEKFSFGL LDSPFRVGVP 
       850        860        870        880        890        900 
FNIPLELQDE FGHTTQLLSD IEPVLEASGL SLHYEGITKG PNCVIQGVVA KGPVNSCQGK 
       910        920        930        940        950        960 
NFNLKVILPG LKEDSQILKI RLLPGPPHQL KVKPDSEVLV IENGTAFPFQ VEVVDESDNI 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TAQPKLIVHC KFLGAPNLPV YTVDCSSSGT SILTGSPIQV QNIKKDQKTL TARIEIPSCK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
DVSPVEKTIK LLPSSHAACL QIFSVEEQKA IQIKHQDEVT WVAGDVIRNL IFQMYDEGER 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
EINITPSLAE KIKVNWTPEV NKEHLVQGLL PDVQVPTSVK DVRYCHVSFQ DDHVCLESAF 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
TVRPLPDDPK HLKCELKGGK TVQMGQELQG EIVVIIADQY GNQISSFSPD SLSTLSITGD 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GLDSSNLKIT LEANSQSVSV QGIRFTPGPP GPKDLCFTWR EFSDFLRVQL VSGPPTKLLL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
MDWPELKESI PVINGRQLEN PLIVQLCDQW DNPALVPNVK ICLIKASSLR LLPSNQQHKT 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
DDKGRANLGV FTVCAPRGEH TVQVKGVYNK STIEGPTIKL TILPDPEKPI RLNVKYDQDA 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SFIAGDIFTD FMVSVISESG SVIKNINPTR ISMKMWKLSS GMSRPPANAE TFSCNKIKGN 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
DKEDGCFYFR EKTIPNKVGA YCIQFDFMID KTNILSSQQV IVDVLPNQPM KLVPDSQPAT 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
PAVSNVRSIA SRTLVKDLRL SITDNYGNHT GMDLVGTVVA TIKGFNEEDT DTPLFIGKVR 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
TLEFPFVKGS AEITTLVLAE NSPGRDSTEY FIIFEPRLST VSGTLESYSL PFMFYNDVKK 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
QQQMAALTKE KDELSKSITM YRSLFDANKQ LVDEMKCQAE EAKLKETQLR NELKAYNIDI 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
PATQQTTHIE ALLEKKITEQ NELKKRPRRL CTLPNYTKRS GDILGKIAHL AQIEDDRAAM 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
VISWHLASDM DCVVTLTTDA ARAIYDETQG RQQVLPLDSI YRKTLPDWKR PLPHFRNGKL 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
HFKPFGNPVF ARDLLTFPDN IEHCETVFGM LLGDTIILDN LDAANHYRKE VVKITHCPTL 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
LTRDGDRIRS NGKFGGLQNK APPMDKLRGM VFGAPVPKQC VVLGKQIDLI QQYRTALYRL 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
SSVNEDLDNQ LQYLHTPDMK KKKQELDEQE KSLKRIEQKL GMTPVRRCNE SLCHSPKIEV 
      1990       2000    
TECPIPTKRM RRESTRQNRR PKGDVPN

Isoforms



Sequence View



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...GDVPN 2007 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)