TopFIND 4.0

Q6PDX6: E3 ubiquitin-protein ligase Rnf220

General Information

Protein names
- E3 ubiquitin-protein ligase Rnf220
- 2.3.2.27
- RING finger protein 220
- RING-type E3 ubiquitin transferase Rnf220 {ECO:0000305}
Gene names Rnf220
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q6PDX6

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MDLHRAAFKM ENSSYLPNPL ASPALMVLAS TAEASRDASI PCQQPRPFGV PVSVDKDVHI 
        70         80         90        100        110        120 
PFTNGSYTFA SMYHRQGGVP GTFANRDFPP SLLHLHPQFA PPNLDCTPIS MLNHSGVGAF 
       130        140        150        160        170        180 
RPFASTEDRE SYQSAFTPAK RLKNCHDTES PHLRFSDADG KEYDFGTQLP SSSPGSLKVD 
       190        200        210        220        230        240 
DTGKKIFAVS GLISDRETSS SPEDRNDRCK KKAVALFDSQ APLCPICQVL LRPSELQEHM 
       250        260        270        280        290        300 
EQELEQLAQL PASKNSLLKD AMAPGTPKSL LLSASIKREG DSPTASPHSS ATEDLHHSDR 
       310        320        330        340        350        360 
YQTFLRVRAN RQTRLNARIG KMKRRKQDEG QREGSCMAED DAVDIEHADS NRFEEYEWCG 
       370        380        390        400        410        420 
QKRIRATTLL EGGFRGSGFV MCSGKENPDS DADLDVDGDD TLEYGKPQYT EADVIPCTGE 
       430        440        450        460        470        480 
EPGEAKEREA LRGAVLNGGP PSTRITPEFS KWASDEMPST SNGEGSKQEA MQKTCKNSDI 
       490        500        510        520        530        540 
EKITEESAVT TFEALKARVR ELERQLSRGD RYKCLICMDS YSMPLTSIQC WHVHCEECWL 
       550        560    
RTLGAKKLCP QCNTITAPGD LRRIYL

Isoforms

- Isoform 2 of E3 ubiquitin-protein ligase Rnf220 - Isoform 3 of E3 ubiquitin-protein ligase Rnf220 - Isoform 4 of E3 ubiquitin-protein ligase Rnf220

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MDLHRAAFKM ENSSYLPNPL ASPALMVLAS TAEASRDASI PCQQPRPFGV PVSVDKDVHI 
        70         80         90        100        110        120 
PFTNGSYTFA SMYHRQGGVP GTFANRDFPP SLLHLHPQFA PPNLDCTPIS MLNHSGVGAF 
       130        140        150        160        170        180 
RPFASTEDRE SYQSAFTPAK RLKNCHDTES PHLRFSDADG KEYDFGTQLP SSSPGSLKVD 
       190        200        210        220        230        240 
DTGKKIFAVS GLISDRETSS SPEDRNDRCK KKAVALFDSQ APLCPICQVL LRPSELQEHM 
       250        260        270        280        290        300 
EQELEQLAQL PASKNSLLKD AMAPGTPKSL LLSASIKREG DSPTASPHSS ATEDLHHSDR 
       310        320        330        340        350        360 
YQTFLRVRAN RQTRLNARIG KMKRRKQDEG QREGSCMAED DAVDIEHADS NRFEEYEWCG 
       370        380        390        400        410        420 
QKRIRATTLL EGGFRGSGFV MCSGKENPDS DADLDVDGDD TLEYGKPQYT EADVIPCTGE 
       430        440        450        460        470        480 
EPGEAKEREA LRGAVLNGGP PSTRITPEFS KWASDEMPST SNGEGSKQEA MQKTCKNSDI 
       490        500        510        520        530        540 
EKITEESAVT TFEALKARVR ELERQLSRGD RYKCLICMDS YSMPLTSIQC WHVHCEECWL 
       550        560    
RTLGAKKLCP QCNTITAPGD LRRIYL         10         20         30         40         50         60 
MDLHRAAFKM ENSSYLPNPL ASPALMVLAS TAEASRDASI PCQQPRPFGV PVSVDKDVHI 
        70         80         90        100        110        120 
PFTNGSYTFA SMYHRQGGVP GTFANRDFPP SLLHLHPQFA PPNLDCTPIS MLNHSGVGAF 
       130        140        150        160        170        180 
RPFASTEDRE SYQSAFTPAK RLKNCHDTES PHLRFSDADG KEYDFGTQLP SSSPGSLKVD 
       190        200        210        220        230        240 
DTGKKIFAVS GLISDRETSS SPEDRNDRCK KKAVALFDSQ APLCPICQVL LRPSELQEHM 
       250        260        270        280        290        300 
EQELEQLAQL PASKNSLLKD AMAPGTPKSL LLSASIKREG DSPTASPHSS ATEDLHHSDR 
       310        320        330        340        350        360 
YQTFLRVRAN RQTRLNARIG KMKRRKQDEG QREGSCMAED DAVDIEHADS NRFEEYEWCG 
       370        380        390        400        410        420 
QKRIRATTLL EGGFRGSGFV MCSGKENPDS DADLDVDGDD TLEYGKPQYT EADVIPCTGE 
       430        440        450        460        470        480 
EPGEAKEREA LRGAVLNGGP PSTRITPEFS KWASDEMPST SNGEGSKQEA MQKTCKNSDI 
       490        500        510        520        530        540 
EKITEESAVT TFEALKARVR ELERQLSRGD RYKCLICMDS YSMPLTSIQC WHVHCEECWL 
       550        560    
RTLGAKKLCP QCNTITAPGD LRRIYL         10         20         30         40         50         60 
MDLHRAAFKM ENSSYLPNPL ASPALMVLAS TAEASRDASI PCQQPRPFGV PVSVDKDVHI 
        70         80         90        100        110        120 
PFTNGSYTFA SMYHRQGGVP GTFANRDFPP SLLHLHPQFA PPNLDCTPIS MLNHSGVGAF 
       130        140        150        160        170        180 
RPFASTEDRE SYQSAFTPAK RLKNCHDTES PHLRFSDADG KEYDFGTQLP SSSPGSLKVD 
       190        200        210        220        230        240 
DTGKKIFAVS GLISDRETSS SPEDRNDRCK KKAVALFDSQ APLCPICQVL LRPSELQEHM 
       250        260        270        280        290        300 
EQELEQLAQL PASKNSLLKD AMAPGTPKSL LLSASIKREG DSPTASPHSS ATEDLHHSDR 
       310        320        330        340        350        360 
YQTFLRVRAN RQTRLNARIG KMKRRKQDEG QREGSCMAED DAVDIEHADS NRFEEYEWCG 
       370        380        390        400        410        420 
QKRIRATTLL EGGFRGSGFV MCSGKENPDS DADLDVDGDD TLEYGKPQYT EADVIPCTGE 
       430        440        450        460        470        480 
EPGEAKEREA LRGAVLNGGP PSTRITPEFS KWASDEMPST SNGEGSKQEA MQKTCKNSDI 
       490        500        510        520        530        540 
EKITEESAVT TFEALKARVR ELERQLSRGD RYKCLICMDS YSMPLTSIQC WHVHCEECWL 
       550        560    
RTLGAKKLCP QCNTITAPGD LRRIYL



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q6PDX6-1-unknown MDLHRA... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q6PDX6-1-unknown MDLHRA... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt87964
    Q6PDX6-322-unknown MKRRKQ... 322 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt87965

C-termini

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)