TopFIND 4.0

Q6QIY3: Sodium channel protein type 10 subunit alpha

General Information

Protein names
- Sodium channel protein type 10 subunit alpha
- Peripheral nerve sodium channel 3
- PN3
- Sensory neuron sodium channel
- Sodium channel protein type X subunit alpha
- Voltage-gated sodium channel subunit alpha Nav1.8
Gene names Scn10a
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q6QIY3

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MEFPFGSVGT TNFRRFTPES LAEIEKQIAA HRAAKKGRPK QRGQKDKSEK PRPQLDLKAC 
        70         80         90        100        110        120 
NQLPRFYGEL PAELVGEPLE DLDPFYSTHR TFIVLDKSRT ISRFSATWAL WLFSPFNLIR 
       130        140        150        160        170        180 
RTAIKVSVHS WFSIFITVTI LVNCVCMTRT DLPEKLEYAF TVVYTFEALI KILARGFCLN 
       190        200        210        220        230        240 
EFTYLRDPWN WLDFSVITLA YVGAAIDLRG ISGLRTFRVL RALKTVSVIP GLKVIVGALI 
       250        260        270        280        290        300 
HSVRKLADVT ILTVFCLSVF ALVGLQLFKG NLKNKCIKNG TDPHKADNLS SEMAGDIFIK 
       310        320        330        340        350        360 
PGTTDPLLCG NGSDAGHCPN DYVCRKTSDN PDFNYTSFDS FAWAFLSLFR LMTQDSWERL 
       370        380        390        400        410        420 
YQQTLRASGK MYMVFFVLVI FLGSFYLVNL ILAVVTMAYE EQSQATIAEI EAKEKKFKEA 
       430        440        450        460        470        480 
LEVLQKEQEV LAALGIDTTS LYSHNGSPLA PKNANERRPR VKSRMSEGST DDNRSLQSDP 
       490        500        510        520        530        540 
YNQRRMSFLG LSSGRRRASH SSVFHFRAPS QDVSFPDGIL DDGVFHGDQE SRRSSILLGR 
       550        560        570        580        590        600 
GAGQAGPLPR SPLPQSPNPG PRRGEEGQRG VPTGELATGA PEGPALDAAG QKNFLSADYL 
       610        620        630        640        650        660 
NEPFRAQRAM SVVSIMTSVI EELEESKLKC PPCLISLAQK YLIWECCPKW KKFKMVLFEL 
       670        680        690        700        710        720 
VTDPFAELTI TLCIVVNTVF MAMEHYPMTD AFDAMLQAGN IVFTVFFTME MAFKIIAFDP 
       730        740        750        760        770        780 
YYYFQKKWNI FDCVIVTVSL LELSTSKKGS LSVLRTFRLL RVFKLAKSWP TLNMLIKIIG 
       790        800        810        820        830        840 
NSVGALGNLT FILAIIVFIF ALVGKQLLSE NYGCRRDGIS VWNGERLRWH MCDFFHSFLV 
       850        860        870        880        890        900 
VFRILCGEWI ENMWVCMEVS QDYICLTLFL TVMVLGNLVV LNLFIALLLN SFSADNLTAP 
       910        920        930        940        950        960 
EDDGEVNNLQ VALARIQVFG HRASRAITSY IRSHCRLRWP KVETQLGMKP PLTSCKAENH 
       970        980        990       1000       1010       1020 
IATDAVNAAV GNLAKPALGG PKENHGDFIT DPNVWVSVPI AEGESDLDEL EEDVEHASQS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SWQEESPKGQ QELLQQVQKC EDHQAARSPP SGMSSEDLAP YLGERWQREE SPRVPAEGVD 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DTSSSEGSTV DCPDPEEILR KIPELAEELD EPDDCFPEGC TRRCPCCKVN TSKFPWATGW 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
QVRKTCYRIV EHSWFESFII FMILLSSGAL AFEDNYLEEK PRVKSVLEYT DRVFTFIFVF 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
EMLLKWVAYG FKKYFTNAWC WLDFLIVNIS LTSLIAKILE YSDVASIKAL RTLRALRPLR 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
ALSRFEGMRV VVDALVGAIP SIMNVLLVCL IFWLIFSIMG VNLFAGKFSR CVDTRSNPFS 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
VVNSTFVTNK SDCYNQNNTG HFFWVNVKVN FDNVAMGYLA LLQVATFKGW MDIMYAAVDS 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
RDINSQPNWE ESLYMYLYFV VFIIFGGFFT LNLFVGVIID NFNQQKKKLG GQDIFMTEEQ 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
KKYYNAMKKL GSKKPQKPIP RPLNKYQGFV FDIVTRQAFD IIIMALICLN MITMMVETDN 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
QSEEKTKVLG RINQFFVAVF TGECVMKMFA LRQYYFTNGW NVFDFIVVIL SISSLLFSAI 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LSSLESYFSP TLLRVIRLAR IGRILRLIRA AKGIRTLLFA LMMSLPALFN IGLLLFLVMF 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
IYSIFGMASF ANVIDEAGID DMFNFKTFGN SMLCLFQITT SAGWDGLLSP ILNTGPPYCD 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
PNRPNSNGSK GNCGSPAVGI LFFTTYIIIS FLIVVNMYIA VILENFNVAT EESTEPLSED 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
DFDMFYETWE KFDPEATQFI AFSALSDFAD TLSGPLRIPK PNQNILIQMD LPLVPGDKIH 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
CLDILFAFTK NVLGESGELD SLKTNMEEKF MATNLSKASY EPIATTLRCK QEDISATIIQ 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
KAYRNYMLQR SLMLSNPLHV PRAEEDGVSL PREGYVTFMA NDNGGLPDKS ETASATSFPP 
      1930       1940       1950    
SYDSVTRGLS DRANISTSSS MQNEDEVTAK EGKSPGPQ

Isoforms

- Isoform 2 of Sodium channel protein type 10 subunit alpha - Isoform 3 of Sodium channel protein type 10 subunit alpha

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MEFPFGSVGT TNFRRFTPES LAEIEKQIAA HRAAKKGRPK QRGQKDKSEK PRPQLDLKAC 
        70         80         90        100        110        120 
NQLPRFYGEL PAELVGEPLE DLDPFYSTHR TFIVLDKSRT ISRFSATWAL WLFSPFNLIR 
       130        140        150        160        170        180 
RTAIKVSVHS WFSIFITVTI LVNCVCMTRT DLPEKLEYAF TVVYTFEALI KILARGFCLN 
       190        200        210        220        230        240 
EFTYLRDPWN WLDFSVITLA YVGAAIDLRG ISGLRTFRVL RALKTVSVIP GLKVIVGALI 
       250        260        270        280        290        300 
HSVRKLADVT ILTVFCLSVF ALVGLQLFKG NLKNKCIKNG TDPHKADNLS SEMAGDIFIK 
       310        320        330        340        350        360 
PGTTDPLLCG NGSDAGHCPN DYVCRKTSDN PDFNYTSFDS FAWAFLSLFR LMTQDSWERL 
       370        380        390        400        410        420 
YQQTLRASGK MYMVFFVLVI FLGSFYLVNL ILAVVTMAYE EQSQATIAEI EAKEKKFKEA 
       430        440        450        460        470        480 
LEVLQKEQEV LAALGIDTTS LYSHNGSPLA PKNANERRPR VKSRMSEGST DDNRSLQSDP 
       490        500        510        520        530        540 
YNQRRMSFLG LSSGRRRASH SSVFHFRAPS QDVSFPDGIL DDGVFHGDQE SRRSSILLGR 
       550        560        570        580        590        600 
GAGQAGPLPR SPLPQSPNPG PRRGEEGQRG VPTGELATGA PEGPALDAAG QKNFLSADYL 
       610        620        630        640        650        660 
NEPFRAQRAM SVVSIMTSVI EELEESKLKC PPCLISLAQK YLIWECCPKW KKFKMVLFEL 
       670        680        690        700        710        720 
VTDPFAELTI TLCIVVNTVF MAMEHYPMTD AFDAMLQAGN IVFTVFFTME MAFKIIAFDP 
       730        740        750        760        770        780 
YYYFQKKWNI FDCVIVTVSL LELSTSKKGS LSVLRTFRLL RVFKLAKSWP TLNMLIKIIG 
       790        800        810        820        830        840 
NSVGALGNLT FILAIIVFIF ALVGKQLLSE NYGCRRDGIS VWNGERLRWH MCDFFHSFLV 
       850        860        870        880        890        900 
VFRILCGEWI ENMWVCMEVS QDYICLTLFL TVMVLGNLVV LNLFIALLLN SFSADNLTAP 
       910        920        930        940        950        960 
EDDGEVNNLQ VALARIQVFG HRASRAITSY IRSHCRLRWP KVETQLGMKP PLTSCKAENH 
       970        980        990       1000       1010       1020 
IATDAVNAAV GNLAKPALGG PKENHGDFIT DPNVWVSVPI AEGESDLDEL EEDVEHASQS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SWQEESPKGQ QELLQQVQKC EDHQAARSPP SGMSSEDLAP YLGERWQREE SPRVPAEGVD 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DTSSSEGSTV DCPDPEEILR KIPELAEELD EPDDCFPEGC TRRCPCCKVN TSKFPWATGW 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
QVRKTCYRIV EHSWFESFII FMILLSSGAL AFEDNYLEEK PRVKSVLEYT DRVFTFIFVF 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
EMLLKWVAYG FKKYFTNAWC WLDFLIVNIS LTSLIAKILE YSDVASIKAL RTLRALRPLR 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
ALSRFEGMRV VVDALVGAIP SIMNVLLVCL IFWLIFSIMG VNLFAGKFSR CVDTRSNPFS 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
VVNSTFVTNK SDCYNQNNTG HFFWVNVKVN FDNVAMGYLA LLQVATFKGW MDIMYAAVDS 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
RDINSQPNWE ESLYMYLYFV VFIIFGGFFT LNLFVGVIID NFNQQKKKLG GQDIFMTEEQ 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
KKYYNAMKKL GSKKPQKPIP RPLNKYQGFV FDIVTRQAFD IIIMALICLN MITMMVETDN 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
QSEEKTKVLG RINQFFVAVF TGECVMKMFA LRQYYFTNGW NVFDFIVVIL SISSLLFSAI 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LSSLESYFSP TLLRVIRLAR IGRILRLIRA AKGIRTLLFA LMMSLPALFN IGLLLFLVMF 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
IYSIFGMASF ANVIDEAGID DMFNFKTFGN SMLCLFQITT SAGWDGLLSP ILNTGPPYCD 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
PNRPNSNGSK GNCGSPAVGI LFFTTYIIIS FLIVVNMYIA VILENFNVAT EESTEPLSED 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
DFDMFYETWE KFDPEATQFI AFSALSDFAD TLSGPLRIPK PNQNILIQMD LPLVPGDKIH 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
CLDILFAFTK NVLGESGELD SLKTNMEEKF MATNLSKASY EPIATTLRCK QEDISATIIQ 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
KAYRNYMLQR SLMLSNPLHV PRAEEDGVSL PREGYVTFMA NDNGGLPDKS ETASATSFPP 
      1930       1940       1950    
SYDSVTRGLS DRANISTSSS MQNEDEVTAK EGKSPGPQ         10         20         30         40         50         60 
MEFPFGSVGT TNFRRFTPES LAEIEKQIAA HRAAKKGRPK QRGQKDKSEK PRPQLDLKAC 
        70         80         90        100        110        120 
NQLPRFYGEL PAELVGEPLE DLDPFYSTHR TFIVLDKSRT ISRFSATWAL WLFSPFNLIR 
       130        140        150        160        170        180 
RTAIKVSVHS WFSIFITVTI LVNCVCMTRT DLPEKLEYAF TVVYTFEALI KILARGFCLN 
       190        200        210        220        230        240 
EFTYLRDPWN WLDFSVITLA YVGAAIDLRG ISGLRTFRVL RALKTVSVIP GLKVIVGALI 
       250        260        270        280        290        300 
HSVRKLADVT ILTVFCLSVF ALVGLQLFKG NLKNKCIKNG TDPHKADNLS SEMAGDIFIK 
       310        320        330        340        350        360 
PGTTDPLLCG NGSDAGHCPN DYVCRKTSDN PDFNYTSFDS FAWAFLSLFR LMTQDSWERL 
       370        380        390        400        410        420 
YQQTLRASGK MYMVFFVLVI FLGSFYLVNL ILAVVTMAYE EQSQATIAEI EAKEKKFKEA 
       430        440        450        460        470        480 
LEVLQKEQEV LAALGIDTTS LYSHNGSPLA PKNANERRPR VKSRMSEGST DDNRSLQSDP 
       490        500        510        520        530        540 
YNQRRMSFLG LSSGRRRASH SSVFHFRAPS QDVSFPDGIL DDGVFHGDQE SRRSSILLGR 
       550        560        570        580        590        600 
GAGQAGPLPR SPLPQSPNPG PRRGEEGQRG VPTGELATGA PEGPALDAAG QKNFLSADYL 
       610        620        630        640        650        660 
NEPFRAQRAM SVVSIMTSVI EELEESKLKC PPCLISLAQK YLIWECCPKW KKFKMVLFEL 
       670        680        690        700        710        720 
VTDPFAELTI TLCIVVNTVF MAMEHYPMTD AFDAMLQAGN IVFTVFFTME MAFKIIAFDP 
       730        740        750        760        770        780 
YYYFQKKWNI FDCVIVTVSL LELSTSKKGS LSVLRTFRLL RVFKLAKSWP TLNMLIKIIG 
       790        800        810        820        830        840 
NSVGALGNLT FILAIIVFIF ALVGKQLLSE NYGCRRDGIS VWNGERLRWH MCDFFHSFLV 
       850        860        870        880        890        900 
VFRILCGEWI ENMWVCMEVS QDYICLTLFL TVMVLGNLVV LNLFIALLLN SFSADNLTAP 
       910        920        930        940        950        960 
EDDGEVNNLQ VALARIQVFG HRASRAITSY IRSHCRLRWP KVETQLGMKP PLTSCKAENH 
       970        980        990       1000       1010       1020 
IATDAVNAAV GNLAKPALGG PKENHGDFIT DPNVWVSVPI AEGESDLDEL EEDVEHASQS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SWQEESPKGQ QELLQQVQKC EDHQAARSPP SGMSSEDLAP YLGERWQREE SPRVPAEGVD 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DTSSSEGSTV DCPDPEEILR KIPELAEELD EPDDCFPEGC TRRCPCCKVN TSKFPWATGW 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
QVRKTCYRIV EHSWFESFII FMILLSSGAL AFEDNYLEEK PRVKSVLEYT DRVFTFIFVF 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
EMLLKWVAYG FKKYFTNAWC WLDFLIVNIS LTSLIAKILE YSDVASIKAL RTLRALRPLR 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
ALSRFEGMRV VVDALVGAIP SIMNVLLVCL IFWLIFSIMG VNLFAGKFSR CVDTRSNPFS 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
VVNSTFVTNK SDCYNQNNTG HFFWVNVKVN FDNVAMGYLA LLQVATFKGW MDIMYAAVDS 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
RDINSQPNWE ESLYMYLYFV VFIIFGGFFT LNLFVGVIID NFNQQKKKLG GQDIFMTEEQ 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
KKYYNAMKKL GSKKPQKPIP RPLNKYQGFV FDIVTRQAFD IIIMALICLN MITMMVETDN 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
QSEEKTKVLG RINQFFVAVF TGECVMKMFA LRQYYFTNGW NVFDFIVVIL SISSLLFSAI 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
LSSLESYFSP TLLRVIRLAR IGRILRLIRA AKGIRTLLFA LMMSLPALFN IGLLLFLVMF 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
IYSIFGMASF ANVIDEAGID DMFNFKTFGN SMLCLFQITT SAGWDGLLSP ILNTGPPYCD 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
PNRPNSNGSK GNCGSPAVGI LFFTTYIIIS FLIVVNMYIA VILENFNVAT EESTEPLSED 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
DFDMFYETWE KFDPEATQFI AFSALSDFAD TLSGPLRIPK PNQNILIQMD LPLVPGDKIH 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
CLDILFAFTK NVLGESGELD SLKTNMEEKF MATNLSKASY EPIATTLRCK QEDISATIIQ 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
KAYRNYMLQR SLMLSNPLHV PRAEEDGVSL PREGYVTFMA NDNGGLPDKS ETASATSFPP 
      1930       1940       1950    
SYDSVTRGLS DRANISTSSS MQNEDEVTAK EGKSPGPQ



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q6QIY3-1-unknown MEFPFG... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q6QIY3-1-unknown MEFPFG... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt89080
    Q6QIY3-1436-unknown MTEEQK... 1436 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt89081
    Q6QIY3-1436-unknown MTEEQK... 1436 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt109735

C-termini

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)