TopFIND 4.0

Q6V1P9: Protocadherin-23

General Information

Protein names
- Protocadherin-23
- Cadherin-27
- Cadherin-like protein CDHJ
- Cadherin-like protein VR8
- Protein dachsous homolog 2
- Protocadherin PCDHJ
Gene names DCHS2
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q6V1P9

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MRLDEITKSE NEDGEKKMFT QQFESTDACV YEVYVKINSI VKSQSQCGLK RGSPETELWG 
        70         80         90        100        110        120 
AIVFRSQEEN AKPVKETEVT ASDADSGLYG FIEYSLYDGF LSYEAPQAFR IDPHDGQICV 
       130        140        150        160        170        180 
SQDIDRERDP ATYDLLVEAK DGDEQRMTHL ALVKGGLSAQ AFVRVDLEDV NDNHPVFNPS 
       190        200        210        220        230        240 
TYVTSISDET QPGTEIINVL ATDQDSGIYG TVAYELIPGN VSSLFTIDST TGLYSPEVEI 
       250        260        270        280        290        300 
LSAVNFSADK EVMNSLEMFL PLLRHFKKVE RDEEAAEKKF EASRGWFMRF KGRRHLHYLK 
       310        320        330        340        350        360 
VQDEAASADG EAAARYVANL AKILGEGIIY LTLPLSHLES TTLSLMVSAQ DGGGLTAVIN 
       370        380        390        400        410        420 
ADVTIHIFQT TLAPAEFERP KYTFLVYEDV PEDSPIGTVK AREPLNSSEP IFYRISSGDL 
       430        440        450        460        470        480 
GGKFSIHPRL GTIRTRKPLD HETQPVVVLT VQAQLGSAPA CSSTEVNITV MDVNDNHPAF 
       490        500        510        520        530        540 
LRTSDEIRIS QTTPPGTALY LARAEDRDSG RNGLIRYSIA SPQPGVFAID RALGVLFLNG 
       550        560        570        580        590        600 
SLGAGEQREL TLTLRAEDQG VHPQAALLVL TVVIEKREHS PSWTFEHLVY QVEVSESLSP 
       610        620        630        640        650        660 
MTQMLQTQAH PLGPQRAASP LRYSLEPSVD SAMFGIRPYT GWIYLRRQFD YESTQTYNFR 
       670        680        690        700        710        720 
VFAWIPEDGF LQNVSTTVIV RVWDENDNSP TFLHDVLFLK VEESPVPQGV IGKITAIDMD 
       730        740        750        760        770        780 
SGKNGQLLYF LLSDGKFFKM NPNTGPAGTI YVITWADGAA AFSGTDFAFS SDELQAFVLK 
       790        800        810        820        830        840 
SLFCELGEGE LINWVALDRE HRGHHEMTVL VTDRGSPPRN ATMAVYVSVT DINDNRPFFP 
       850        860        870        880        890        900 
QCLPGKELHV KVLEGQPVNM LVTTVFAKDP DEGNNAEVTY SVSSEDSSDH FKIDANNGEI 
       910        920        930        940        950        960 
RTTTILSYDY RPSYRMSVIA TDQGVPPLQG QAVVNIQVIP LSKGRAIMSQ NIRHLIIPEN 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LKPTKIMSLI KSSDHLQQHY NGKLHFSIVA DDKDGHFEID SSTGDLFLSK ELDYETTSHY 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LFRVITTDHS KNLSLSSTVF LSIDVEDQND HSPSFQDELI VISVEENVPI GTLVYVFNAK 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DDDGSFLNSR IQYYIESHNP GTNPFLIHPS FGTLVTVSRL DRESIPTVIL TVTASDQAVN 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
VTDRRLRSLT AQIVILDVND HNPTFISFPN AHVKEDVTVG SLVHHITAHD PDEGRNGKVT 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
YSILSGNENM TFMLDESSGL LTTTCPLDYE MKTQHILTVL ALDDGTPALS SSQTLTVTVL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
DVNDEAPVFK QHLYEASVKE NQNPGEFVTR VEALDRDSGV NSKLQFEIMP GASFELFEIN 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
SDTGEVVTTT ILDREIQEVF TLRVLVRDGG FPSLSSTTTI LCTVEDENDH APEFIVSSYD 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
IEVLENQEPE VVYTVLASDM DAGNNRAVEY HIIDGNTDEC FTINEMSGEL STTRALDREQ 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
ISNFTLVILC SDLGDPPRSS VIHLQVRVLD ANDHSPSFPT LYYQSSVRED AEVGTVVLVL 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
SAVDKDEGLN GQTEYFLTDE ASGAFTIDPM SGTLKTSNTL DREARSQHTF SAVARDCSIQ 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
GSRSTTVIIK VYVTDVNDND PVLEQNPFDV FLSPESPTNQ TTVIVRADDL DLGPNGTVVF 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
SFAETQSMFS IDKYTGEIQF QQNPSSEYFP IWLQLKVTDQ GIPARTTTGL LVIHMEGEDV 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
KISFSHHLYK GLVTENCEAG TSIVTVKAFA PDSIQDSMKY SIFSGNEDGV LSLCSKSGQL 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
TVKEPKFLDF EVRNEVQLIV LAESSGHRAY CKVAVLIQDE NDNSPCFEQS IYQASVSESQ 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
LYNAHVIQVF ATDLDSGLNG LIEYSILSGN QEEAFQIDAL SGVITTKAIL DYELTSSYSL 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
IVQATDKGMP RLSNTTVIKV QVTDINDNAP AFLPSEAVEI TEDSLPGVIV THVSVHDVDL 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
NSAFIFSFAK ESNPGTKFAI DQNTGVVVLV KTLDFEEMTE YELLIQISDS VHYTEGALVV 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
RVLDVNDNPP VFSQDFYQVT VPESIPVGYS VLTLSATDLE SNENISYRIL SSSKEFSIDP 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
KNGTIFTISP VLLLDTISTT QFLVEASDGG NPDLRALTLV EIGIEDMNNY APEFTVKSYN 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
LSLSEDALVG STLVTFSNID HDWTRENTYV EYSIISGNSQ NNFHVETKFF HSEYPYKQVG 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
YLVLLHSLDR EASASHELVI LASDSGCPPL SSTAVISIQV LDVNDNPPNF SSLSYHTHVK 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
ESTPLGSHIT VVSANDRDTG SHAEIIYNII SGNEKGHFYL EENTGVLYLI KPLDYEKMTK 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
FTLTVQASDA EKKHFSFAVV FVSVLDDNDH APQFMFSSFS CIVPENLPIS STICSINALD 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
FDAGPYGELT YSIVSPCFLT HGMSYDHDLF LIDPLTGDIH AKQILDYENG NKYCLTVQAK 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
DKGDATASLV VWVDIEGIDE FEPIFTQDQY FFTLPEKNKD RQLIGRVEAS DADAGIDGVI 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
LYSLGTSSPF FSVNKTNGNI YLIRALPLIK SQLNKEDTLE MKIIAHSPKS DSKFASCTVF 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
VNVSFSSEGT PLAVFASSFS ISLVVSFLVF LILICILIVM ILRHKQKDTI NNYEEKKTSS 
      2590       2600       2610       2620       2630       2640 
LDADLRVTRD ASVLKAFQKT DDCSNEVVPV DATPEWLSLI SIMEKDIVNL YRHSNSSGHC 
      2650       2660       2670       2680       2690       2700 
SVEGETAEDK EIQRINEHPY RKCSDSALSD HESRVPDSGI PRDSDQLSCL SGETDVMVTA 
      2710       2720       2730       2740       2750       2760 
ETAEASQTFG EGDQGEGCST TCAQNNVLPQ TVQKREAKES ILADVRKESV FISGDQEVRC 
      2770       2780       2790       2800       2810       2820 
AALSTQTTSD HDGKDNYHWN YLLSWEPKFQ PLASVFNDIA KLKDEHLHMP GIPKEKKSFV 
      2830       2840       2850       2860       2870       2880 
FPPPLITAVA QPGIKAVPPR MPAVNLGQVP PKHPRSPIPY HLGSLPEGMT PNFSPSLSLL 
      2890       2900       2910    
TMQPPALSPL LREGELLGTH ISGTCHELKA EDEVQI

Isoforms

- Isoform 4 of Protocadherin-23

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MRLDEITKSE NEDGEKKMFT QQFESTDACV YEVYVKINSI VKSQSQCGLK RGSPETELWG 
        70         80         90        100        110        120 
AIVFRSQEEN AKPVKETEVT ASDADSGLYG FIEYSLYDGF LSYEAPQAFR IDPHDGQICV 
       130        140        150        160        170        180 
SQDIDRERDP ATYDLLVEAK DGDEQRMTHL ALVKGGLSAQ AFVRVDLEDV NDNHPVFNPS 
       190        200        210        220        230        240 
TYVTSISDET QPGTEIINVL ATDQDSGIYG TVAYELIPGN VSSLFTIDST TGLYSPEVEI 
       250        260        270        280        290        300 
LSAVNFSADK EVMNSLEMFL PLLRHFKKVE RDEEAAEKKF EASRGWFMRF KGRRHLHYLK 
       310        320        330        340        350        360 
VQDEAASADG EAAARYVANL AKILGEGIIY LTLPLSHLES TTLSLMVSAQ DGGGLTAVIN 
       370        380        390        400        410        420 
ADVTIHIFQT TLAPAEFERP KYTFLVYEDV PEDSPIGTVK AREPLNSSEP IFYRISSGDL 
       430        440        450        460        470        480 
GGKFSIHPRL GTIRTRKPLD HETQPVVVLT VQAQLGSAPA CSSTEVNITV MDVNDNHPAF 
       490        500        510        520        530        540 
LRTSDEIRIS QTTPPGTALY LARAEDRDSG RNGLIRYSIA SPQPGVFAID RALGVLFLNG 
       550        560        570        580        590        600 
SLGAGEQREL TLTLRAEDQG VHPQAALLVL TVVIEKREHS PSWTFEHLVY QVEVSESLSP 
       610        620        630        640        650        660 
MTQMLQTQAH PLGPQRAASP LRYSLEPSVD SAMFGIRPYT GWIYLRRQFD YESTQTYNFR 
       670        680        690        700        710        720 
VFAWIPEDGF LQNVSTTVIV RVWDENDNSP TFLHDVLFLK VEESPVPQGV IGKITAIDMD 
       730        740        750        760        770        780 
SGKNGQLLYF LLSDGKFFKM NPNTGPAGTI YVITWADGAA AFSGTDFAFS SDELQAFVLK 
       790        800        810        820        830        840 
SLFCELGEGE LINWVALDRE HRGHHEMTVL VTDRGSPPRN ATMAVYVSVT DINDNRPFFP 
       850        860        870        880        890        900 
QCLPGKELHV KVLEGQPVNM LVTTVFAKDP DEGNNAEVTY SVSSEDSSDH FKIDANNGEI 
       910        920        930        940        950        960 
RTTTILSYDY RPSYRMSVIA TDQGVPPLQG QAVVNIQVIP LSKGRAIMSQ NIRHLIIPEN 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LKPTKIMSLI KSSDHLQQHY NGKLHFSIVA DDKDGHFEID SSTGDLFLSK ELDYETTSHY 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LFRVITTDHS KNLSLSSTVF LSIDVEDQND HSPSFQDELI VISVEENVPI GTLVYVFNAK 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DDDGSFLNSR IQYYIESHNP GTNPFLIHPS FGTLVTVSRL DRESIPTVIL TVTASDQAVN 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
VTDRRLRSLT AQIVILDVND HNPTFISFPN AHVKEDVTVG SLVHHITAHD PDEGRNGKVT 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
YSILSGNENM TFMLDESSGL LTTTCPLDYE MKTQHILTVL ALDDGTPALS SSQTLTVTVL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
DVNDEAPVFK QHLYEASVKE NQNPGEFVTR VEALDRDSGV NSKLQFEIMP GASFELFEIN 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
SDTGEVVTTT ILDREIQEVF TLRVLVRDGG FPSLSSTTTI LCTVEDENDH APEFIVSSYD 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
IEVLENQEPE VVYTVLASDM DAGNNRAVEY HIIDGNTDEC FTINEMSGEL STTRALDREQ 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
ISNFTLVILC SDLGDPPRSS VIHLQVRVLD ANDHSPSFPT LYYQSSVRED AEVGTVVLVL 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
SAVDKDEGLN GQTEYFLTDE ASGAFTIDPM SGTLKTSNTL DREARSQHTF SAVARDCSIQ 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
GSRSTTVIIK VYVTDVNDND PVLEQNPFDV FLSPESPTNQ TTVIVRADDL DLGPNGTVVF 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
SFAETQSMFS IDKYTGEIQF QQNPSSEYFP IWLQLKVTDQ GIPARTTTGL LVIHMEGEDV 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
KISFSHHLYK GLVTENCEAG TSIVTVKAFA PDSIQDSMKY SIFSGNEDGV LSLCSKSGQL 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
TVKEPKFLDF EVRNEVQLIV LAESSGHRAY CKVAVLIQDE NDNSPCFEQS IYQASVSESQ 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
LYNAHVIQVF ATDLDSGLNG LIEYSILSGN QEEAFQIDAL SGVITTKAIL DYELTSSYSL 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
IVQATDKGMP RLSNTTVIKV QVTDINDNAP AFLPSEAVEI TEDSLPGVIV THVSVHDVDL 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
NSAFIFSFAK ESNPGTKFAI DQNTGVVVLV KTLDFEEMTE YELLIQISDS VHYTEGALVV 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
RVLDVNDNPP VFSQDFYQVT VPESIPVGYS VLTLSATDLE SNENISYRIL SSSKEFSIDP 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
KNGTIFTISP VLLLDTISTT QFLVEASDGG NPDLRALTLV EIGIEDMNNY APEFTVKSYN 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
LSLSEDALVG STLVTFSNID HDWTRENTYV EYSIISGNSQ NNFHVETKFF HSEYPYKQVG 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
YLVLLHSLDR EASASHELVI LASDSGCPPL SSTAVISIQV LDVNDNPPNF SSLSYHTHVK 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
ESTPLGSHIT VVSANDRDTG SHAEIIYNII SGNEKGHFYL EENTGVLYLI KPLDYEKMTK 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
FTLTVQASDA EKKHFSFAVV FVSVLDDNDH APQFMFSSFS CIVPENLPIS STICSINALD 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
FDAGPYGELT YSIVSPCFLT HGMSYDHDLF LIDPLTGDIH AKQILDYENG NKYCLTVQAK 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
DKGDATASLV VWVDIEGIDE FEPIFTQDQY FFTLPEKNKD RQLIGRVEAS DADAGIDGVI 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
LYSLGTSSPF FSVNKTNGNI YLIRALPLIK SQLNKEDTLE MKIIAHSPKS DSKFASCTVF 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
VNVSFSSEGT PLAVFASSFS ISLVVSFLVF LILICILIVM ILRHKQKDTI NNYEEKKTSS 
      2590       2600       2610       2620       2630       2640 
LDADLRVTRD ASVLKAFQKT DDCSNEVVPV DATPEWLSLI SIMEKDIVNL YRHSNSSGHC 
      2650       2660       2670       2680       2690       2700 
SVEGETAEDK EIQRINEHPY RKCSDSALSD HESRVPDSGI PRDSDQLSCL SGETDVMVTA 
      2710       2720       2730       2740       2750       2760 
ETAEASQTFG EGDQGEGCST TCAQNNVLPQ TVQKREAKES ILADVRKESV FISGDQEVRC 
      2770       2780       2790       2800       2810       2820 
AALSTQTTSD HDGKDNYHWN YLLSWEPKFQ PLASVFNDIA KLKDEHLHMP GIPKEKKSFV 
      2830       2840       2850       2860       2870       2880 
FPPPLITAVA QPGIKAVPPR MPAVNLGQVP PKHPRSPIPY HLGSLPEGMT PNFSPSLSLL 
      2890       2900       2910    
TMQPPALSPL LREGELLGTH ISGTCHELKA EDEVQI



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q6V1P9-1-unknown MRLDEI... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...DEVQI 2916 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)