TopFIND 4.0

Q70IV5: Synemin {ECO:0000303|PubMed:15265691}

General Information

Protein names
- Synemin {ECO:0000303|PubMed:15265691}
- Desmuslin {ECO:0000250|UniProtKB:O15061}
Gene names Synm
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q70IV5

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MLSWRLQTGS EKAELQELNA RLYDYVCRVR ELERENLLLE EELRSRLSRE DRWAEDQALY 
        70         80         90        100        110        120 
AEEARSLRQQ LDELNWSTAL AEGERDALRR ELLELQREGV EAGTARSRLD AELGAQRREL 
       130        140        150        160        170        180 
EEALGARAAL EALLGRLETE RRDLDAAHER QVRDLRARAA SLTMHFRARA TSPAAPPPRL 
       190        200        210        220        230        240 
RDVHDSYALL VAESWRESVQ LYEDEVRELE QALRRGQESR LQAEDEARLC AQEADALRNQ 
       250        260        270        280        290        300 
ALELEQLRAR LEDELLRMRE EYGMQAEERQ RVIDSLEDEK EALTLAMADR LRDYQELLQV 
       310        320        330        340        350        360 
KTGLSLEVAT YRALLEGESN PEILIWTENI ENVPQEPRNT SYRYTNSVLQ RKNEKNLFPR 
       370        380        390        400        410        420 
RKTPWAAVNH SSASYSNWPG HLDSQTTTAV GSAARRGLLT SRHSSSATTS GQQKPLEKTI 
       430        440        450        460        470        480 
SSRANLRPVT PTHGFLRNTD AQMKTLPHRS KVEGTGDTHA RRATESVITR ESYRGHQGHV 
       490        500        510        520        530        540 
AAGAVSSTPS NERTVILGKK LEAQATKEQE RDRSGVIRIK PEEKMFDSKE KASEERNLRW 
       550        560        570        580        590        600 
EELTKLDRDA RKRESRHLRD EAREKEALKE RSVKEREVPI SLEVSRGSRA EVSTIHLQSP 
       610        620        630        640        650        660 
GRKDVSHSGG REAETKETRF RLDTQDTASS LQSDSTTETI AESIVTTILK QFTQSPGAEE 
       670        680        690        700        710        720 
EATSFPDTKV TYVDRKEFPG DGKTKTEIVV ESKLTDVVDV SDEAGLDYLL SKDVKEVGLK 
       730        740        750        760        770        780 
GKSTETMIGE MINLGLKGRE GRAKVVNVEI VEEPMSYIGG GKIDFSTPFQ VEEVDDVSPS 
       790        800        810        820        830        840 
PKGFVEEEDG EGETHMAFSM RPHQTKQPQG TIPHVEEVTE AGDSEGEQSY FVSTPDEYPG 
       850        860        870        880        890        900 
GHDREDDGSV YGQIHIEEES TIRYSWQDEI AQGTWRRKMR GDVGGEKPVK VLEVPALSLG 
       910        920        930        940        950        960 
GAIGSAHLKE EASGELRAEP TVIEKEIKIP HEFHTSIKGV FSSEPRHQLV EVIGQLEETL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PERMKEELSA LTRQSQGESG SVSVDVKKVQ SAAGGSVTLM AEVNLSQTVD ADQLDLEQLS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
RDEAGEIERA VESVVRESLA KRSSPVPRSP DREDGEEVPA GGILFKRWAT RELYSPSGER 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DDAGQVSPSS DQRVTQGPVS ATVEVTSPTG FVQSHVLEDV SQSVRHVKLG PTEMWRTEQV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
TFGGPTAQVV EVSGDFSEAV SSEGASRSVR HITLGPHQSQ VSTEVIFRGS VPTWQETGDT 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
EKPGPVVLSV GADISGSGRM PGSERSHTEK EIRFQGPVSG TAQVGGNFAT EESVGSQTFV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RSLQLGPKEG FREEIQFIAP IPDKVGWGEE DSEHTKVSLE RATSIQRIDI VPQRYLASKQ 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
MAPQTLEFRD SEDMVMVEGS AGTIQATHNF TSDREILQNK ENTFQRVISG SPPDSVGDTG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
AEVTANVSRS FRHIQIGPTE EEPSEYFVTG RPVSKTFVLD GSVASPGLVG GADGGSTPCR 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
IALGPKETSF TFQMDLSDTR AIRSWTRDTG SEVEAHGVSH RGGWRIAHSR DERVASTGSG 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
ASPGDAHQAP GEKGTEQAGF DKTVQLQRMV DQRSVASDEK KVALLYLDNE EEEEEEGEGW 
   
F

Isoforms

- Isoform 2 of Synemin - Isoform 3 of Synemin

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MLSWRLQTGS EKAELQELNA RLYDYVCRVR ELERENLLLE EELRSRLSRE DRWAEDQALY 
        70         80         90        100        110        120 
AEEARSLRQQ LDELNWSTAL AEGERDALRR ELLELQREGV EAGTARSRLD AELGAQRREL 
       130        140        150        160        170        180 
EEALGARAAL EALLGRLETE RRDLDAAHER QVRDLRARAA SLTMHFRARA TSPAAPPPRL 
       190        200        210        220        230        240 
RDVHDSYALL VAESWRESVQ LYEDEVRELE QALRRGQESR LQAEDEARLC AQEADALRNQ 
       250        260        270        280        290        300 
ALELEQLRAR LEDELLRMRE EYGMQAEERQ RVIDSLEDEK EALTLAMADR LRDYQELLQV 
       310        320        330        340        350        360 
KTGLSLEVAT YRALLEGESN PEILIWTENI ENVPQEPRNT SYRYTNSVLQ RKNEKNLFPR 
       370        380        390        400        410        420 
RKTPWAAVNH SSASYSNWPG HLDSQTTTAV GSAARRGLLT SRHSSSATTS GQQKPLEKTI 
       430        440        450        460        470        480 
SSRANLRPVT PTHGFLRNTD AQMKTLPHRS KVEGTGDTHA RRATESVITR ESYRGHQGHV 
       490        500        510        520        530        540 
AAGAVSSTPS NERTVILGKK LEAQATKEQE RDRSGVIRIK PEEKMFDSKE KASEERNLRW 
       550        560        570        580        590        600 
EELTKLDRDA RKRESRHLRD EAREKEALKE RSVKEREVPI SLEVSRGSRA EVSTIHLQSP 
       610        620        630        640        650        660 
GRKDVSHSGG REAETKETRF RLDTQDTASS LQSDSTTETI AESIVTTILK QFTQSPGAEE 
       670        680        690        700        710        720 
EATSFPDTKV TYVDRKEFPG DGKTKTEIVV ESKLTDVVDV SDEAGLDYLL SKDVKEVGLK 
       730        740        750        760        770        780 
GKSTETMIGE MINLGLKGRE GRAKVVNVEI VEEPMSYIGG GKIDFSTPFQ VEEVDDVSPS 
       790        800        810        820        830        840 
PKGFVEEEDG EGETHMAFSM RPHQTKQPQG TIPHVEEVTE AGDSEGEQSY FVSTPDEYPG 
       850        860        870        880        890        900 
GHDREDDGSV YGQIHIEEES TIRYSWQDEI AQGTWRRKMR GDVGGEKPVK VLEVPALSLG 
       910        920        930        940        950        960 
GAIGSAHLKE EASGELRAEP TVIEKEIKIP HEFHTSIKGV FSSEPRHQLV EVIGQLEETL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PERMKEELSA LTRQSQGESG SVSVDVKKVQ SAAGGSVTLM AEVNLSQTVD ADQLDLEQLS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
RDEAGEIERA VESVVRESLA KRSSPVPRSP DREDGEEVPA GGILFKRWAT RELYSPSGER 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DDAGQVSPSS DQRVTQGPVS ATVEVTSPTG FVQSHVLEDV SQSVRHVKLG PTEMWRTEQV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
TFGGPTAQVV EVSGDFSEAV SSEGASRSVR HITLGPHQSQ VSTEVIFRGS VPTWQETGDT 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
EKPGPVVLSV GADISGSGRM PGSERSHTEK EIRFQGPVSG TAQVGGNFAT EESVGSQTFV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RSLQLGPKEG FREEIQFIAP IPDKVGWGEE DSEHTKVSLE RATSIQRIDI VPQRYLASKQ 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
MAPQTLEFRD SEDMVMVEGS AGTIQATHNF TSDREILQNK ENTFQRVISG SPPDSVGDTG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
AEVTANVSRS FRHIQIGPTE EEPSEYFVTG RPVSKTFVLD GSVASPGLVG GADGGSTPCR 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
IALGPKETSF TFQMDLSDTR AIRSWTRDTG SEVEAHGVSH RGGWRIAHSR DERVASTGSG 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
ASPGDAHQAP GEKGTEQAGF DKTVQLQRMV DQRSVASDEK KVALLYLDNE EEEEEEGEGW 
   
F         10         20         30         40         50         60 
MLSWRLQTGS EKAELQELNA RLYDYVCRVR ELERENLLLE EELRSRLSRE DRWAEDQALY 
        70         80         90        100        110        120 
AEEARSLRQQ LDELNWSTAL AEGERDALRR ELLELQREGV EAGTARSRLD AELGAQRREL 
       130        140        150        160        170        180 
EEALGARAAL EALLGRLETE RRDLDAAHER QVRDLRARAA SLTMHFRARA TSPAAPPPRL 
       190        200        210        220        230        240 
RDVHDSYALL VAESWRESVQ LYEDEVRELE QALRRGQESR LQAEDEARLC AQEADALRNQ 
       250        260        270        280        290        300 
ALELEQLRAR LEDELLRMRE EYGMQAEERQ RVIDSLEDEK EALTLAMADR LRDYQELLQV 
       310        320        330        340        350        360 
KTGLSLEVAT YRALLEGESN PEILIWTENI ENVPQEPRNT SYRYTNSVLQ RKNEKNLFPR 
       370        380        390        400        410        420 
RKTPWAAVNH SSASYSNWPG HLDSQTTTAV GSAARRGLLT SRHSSSATTS GQQKPLEKTI 
       430        440        450        460        470        480 
SSRANLRPVT PTHGFLRNTD AQMKTLPHRS KVEGTGDTHA RRATESVITR ESYRGHQGHV 
       490        500        510        520        530        540 
AAGAVSSTPS NERTVILGKK LEAQATKEQE RDRSGVIRIK PEEKMFDSKE KASEERNLRW 
       550        560        570        580        590        600 
EELTKLDRDA RKRESRHLRD EAREKEALKE RSVKEREVPI SLEVSRGSRA EVSTIHLQSP 
       610        620        630        640        650        660 
GRKDVSHSGG REAETKETRF RLDTQDTASS LQSDSTTETI AESIVTTILK QFTQSPGAEE 
       670        680        690        700        710        720 
EATSFPDTKV TYVDRKEFPG DGKTKTEIVV ESKLTDVVDV SDEAGLDYLL SKDVKEVGLK 
       730        740        750        760        770        780 
GKSTETMIGE MINLGLKGRE GRAKVVNVEI VEEPMSYIGG GKIDFSTPFQ VEEVDDVSPS 
       790        800        810        820        830        840 
PKGFVEEEDG EGETHMAFSM RPHQTKQPQG TIPHVEEVTE AGDSEGEQSY FVSTPDEYPG 
       850        860        870        880        890        900 
GHDREDDGSV YGQIHIEEES TIRYSWQDEI AQGTWRRKMR GDVGGEKPVK VLEVPALSLG 
       910        920        930        940        950        960 
GAIGSAHLKE EASGELRAEP TVIEKEIKIP HEFHTSIKGV FSSEPRHQLV EVIGQLEETL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PERMKEELSA LTRQSQGESG SVSVDVKKVQ SAAGGSVTLM AEVNLSQTVD ADQLDLEQLS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
RDEAGEIERA VESVVRESLA KRSSPVPRSP DREDGEEVPA GGILFKRWAT RELYSPSGER 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DDAGQVSPSS DQRVTQGPVS ATVEVTSPTG FVQSHVLEDV SQSVRHVKLG PTEMWRTEQV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
TFGGPTAQVV EVSGDFSEAV SSEGASRSVR HITLGPHQSQ VSTEVIFRGS VPTWQETGDT 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
EKPGPVVLSV GADISGSGRM PGSERSHTEK EIRFQGPVSG TAQVGGNFAT EESVGSQTFV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RSLQLGPKEG FREEIQFIAP IPDKVGWGEE DSEHTKVSLE RATSIQRIDI VPQRYLASKQ 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
MAPQTLEFRD SEDMVMVEGS AGTIQATHNF TSDREILQNK ENTFQRVISG SPPDSVGDTG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
AEVTANVSRS FRHIQIGPTE EEPSEYFVTG RPVSKTFVLD GSVASPGLVG GADGGSTPCR 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
IALGPKETSF TFQMDLSDTR AIRSWTRDTG SEVEAHGVSH RGGWRIAHSR DERVASTGSG 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
ASPGDAHQAP GEKGTEQAGF DKTVQLQRMV DQRSVASDEK KVALLYLDNE EEEEEEGEGW 
   
F



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q70IV5-1-unknown MLSWRL... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q70IV5-1-unknown MLSWRL... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt91224
    Q70IV5-1-unknown MLSWRL... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt91225

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...GEGWF 1561 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...GEGWF 1561 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt86842

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)