TopFIND 4.0

Q7TPM1: Protein PRRC2B

General Information

Protein names
- Protein PRRC2B
- HLA-B-associated transcript 2-like 1
- Proline-rich coiled-coil protein 2B
Gene names Prrc2b
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q7TPM1

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MSDRLGQITQ GKDGKSKYST LSLFDKYKGR SVGAVRSSVI PRHGLQSLGK VATARRMPPP 
        70         80         90        100        110        120 
ANLPSLKSEN KGNDPNIVIV PKDGTGWANK QDQQDPKSSS VTASQPPESQ PQPGLQKSVS 
       130        140        150        160        170        180 
NLQKPTQSIS QENTNSVPGG PKSWAQLSGK PVGHEGGLRG SSRLLSFSPE EFPTLKAAGG 
       190        200        210        220        230        240 
QDKAGKEKGA LDLSYGPGPS LRPQNVTSWR EGGGRNIISA ASLSASPTEL GSRNASGADG 
       250        260        270        280        290        300 
APSLACTSDS KEPSLRPAQP SRRGASQFMG HGYQPPTYHD MLPAFMCSPQ SSENQTTVER 
       310        320        330        340        350        360 
SSFPLPQLRL EPRVPFRQFQ MNDQDGKERP GVARPVRPLR QLVERAPRPT IINAENLKGL 
       370        380        390        400        410        420 
DDLDTDADDG WAGLHEEVDY SEKLKFSDDE DEEDVVKDGR SKWNNWDPRR QRALSLSSAD 
       430        440        450        460        470        480 
STDAKRTQEE GKDWSGTAGG SRVIRKVPEP QPPSRKLHSW ASGPDYQKPT MGSMFRQHSA 
       490        500        510        520        530        540 
EDKEDKPPPR QKFIQSEMSE AVERARKRRE EEERRAREER LAACAAKLKQ LDQKCRQAQK 
       550        560        570        580        590        600 
ANETPKPVEK EVPRSPGIEK VSPPENGPVV RKGSPEFPVQ EAPTMFLEET PATSPTVAQS 
       610        620        630        640        650        660 
NSSSSSSSSS SIEEEVRESG SPAQEFSKYQ KSLPPRFQRQ QQQQQQQQQQ QQQQEQLYKM 
       670        680        690        700        710        720 
QHWQPVYPPP SHPQRTFYPH HPQMLGFDPR WMMMPSYMDP RITPTRTPVD FYPSALHPSG 
       730        740        750        760        770        780 
LMKPMMPQES LSGTGCRSED QNCVPSLQER KVTALDPAPV WSPEGYMALQ NKGYSLPHPK 
       790        800        810        820        830        840 
SADTLAMGMH VRSPDEALPG GLGSHSPYAL ERTTHASSDG PETPSKKSER EVSLPTQRAS 
       850        860        870        880        890        900 
EQEEARKQFD LGYGNALIDN CASSPGEENE ASSVVGEGFI EVLTKKQRRL LEEERRKKEQ 
       910        920        930        940        950        960 
AAQVPVKGRG LSSRIPPRFA KKQNGLCLEQ DVTVPGSSLG TEIWENSSQA LPVQGAASDS 
       970        980        990       1000       1010       1020 
WRTAVTAFSS TEPGTSEQGF KSSQGDSGVD LSAESRESSA TSSQRSSPYG TLKPEEISGP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
GLAESKADSH KDQAQKQAEH KDSEQGSAQS KEHRPGPIGN ERSLKNRKGS EGAERLPGAV 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
VPPVNGVEIH VDSVLPVPPI EFGVSPKDSD FSLPPGSVSG PVGNPVAKLQ DVLASNAGLT 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
QSIPILRRDH HMQRAIGLSP MSFPTADLTL KMESARKAWE NSPSLPEQSS PGGAGSGIQP 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PSSVGASNGV NYSSFGGVSM PPMPVASVAP SASIPGSHLP PLYLDGHVFA SQPRLVPQTI 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
PQQQSYQQAA TAQQIPISLH TSLQAQAQLG LRGGLPVSQS QEIFSSLQPF RSQVYMHPSL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
SPPSTMILSG GTALKPPYSA FPGIQPLEMV KPQSGSPYQP MSGNQALVYE GQLGQAAGLG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
TSQMLDSQLP QLTMPLPRYG SGQQPLILPQ SIQLPPGQSL SVGAPRRVPP PGSQPPVLNT 
      1450       1460       1470       1480    
SRESAPMELK GFHFADSKQN VPTGGSAPSP QAYRQSEWMK NPAWEP

Isoforms

- Isoform 2 of Protein PRRC2B

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MSDRLGQITQ GKDGKSKYST LSLFDKYKGR SVGAVRSSVI PRHGLQSLGK VATARRMPPP 
        70         80         90        100        110        120 
ANLPSLKSEN KGNDPNIVIV PKDGTGWANK QDQQDPKSSS VTASQPPESQ PQPGLQKSVS 
       130        140        150        160        170        180 
NLQKPTQSIS QENTNSVPGG PKSWAQLSGK PVGHEGGLRG SSRLLSFSPE EFPTLKAAGG 
       190        200        210        220        230        240 
QDKAGKEKGA LDLSYGPGPS LRPQNVTSWR EGGGRNIISA ASLSASPTEL GSRNASGADG 
       250        260        270        280        290        300 
APSLACTSDS KEPSLRPAQP SRRGASQFMG HGYQPPTYHD MLPAFMCSPQ SSENQTTVER 
       310        320        330        340        350        360 
SSFPLPQLRL EPRVPFRQFQ MNDQDGKERP GVARPVRPLR QLVERAPRPT IINAENLKGL 
       370        380        390        400        410        420 
DDLDTDADDG WAGLHEEVDY SEKLKFSDDE DEEDVVKDGR SKWNNWDPRR QRALSLSSAD 
       430        440        450        460        470        480 
STDAKRTQEE GKDWSGTAGG SRVIRKVPEP QPPSRKLHSW ASGPDYQKPT MGSMFRQHSA 
       490        500        510        520        530        540 
EDKEDKPPPR QKFIQSEMSE AVERARKRRE EEERRAREER LAACAAKLKQ LDQKCRQAQK 
       550        560        570        580        590        600 
ANETPKPVEK EVPRSPGIEK VSPPENGPVV RKGSPEFPVQ EAPTMFLEET PATSPTVAQS 
       610        620        630        640        650        660 
NSSSSSSSSS SIEEEVRESG SPAQEFSKYQ KSLPPRFQRQ QQQQQQQQQQ QQQQEQLYKM 
       670        680        690        700        710        720 
QHWQPVYPPP SHPQRTFYPH HPQMLGFDPR WMMMPSYMDP RITPTRTPVD FYPSALHPSG 
       730        740        750        760        770        780 
LMKPMMPQES LSGTGCRSED QNCVPSLQER KVTALDPAPV WSPEGYMALQ NKGYSLPHPK 
       790        800        810        820        830        840 
SADTLAMGMH VRSPDEALPG GLGSHSPYAL ERTTHASSDG PETPSKKSER EVSLPTQRAS 
       850        860        870        880        890        900 
EQEEARKQFD LGYGNALIDN CASSPGEENE ASSVVGEGFI EVLTKKQRRL LEEERRKKEQ 
       910        920        930        940        950        960 
AAQVPVKGRG LSSRIPPRFA KKQNGLCLEQ DVTVPGSSLG TEIWENSSQA LPVQGAASDS 
       970        980        990       1000       1010       1020 
WRTAVTAFSS TEPGTSEQGF KSSQGDSGVD LSAESRESSA TSSQRSSPYG TLKPEEISGP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
GLAESKADSH KDQAQKQAEH KDSEQGSAQS KEHRPGPIGN ERSLKNRKGS EGAERLPGAV 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
VPPVNGVEIH VDSVLPVPPI EFGVSPKDSD FSLPPGSVSG PVGNPVAKLQ DVLASNAGLT 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
QSIPILRRDH HMQRAIGLSP MSFPTADLTL KMESARKAWE NSPSLPEQSS PGGAGSGIQP 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PSSVGASNGV NYSSFGGVSM PPMPVASVAP SASIPGSHLP PLYLDGHVFA SQPRLVPQTI 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
PQQQSYQQAA TAQQIPISLH TSLQAQAQLG LRGGLPVSQS QEIFSSLQPF RSQVYMHPSL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
SPPSTMILSG GTALKPPYSA FPGIQPLEMV KPQSGSPYQP MSGNQALVYE GQLGQAAGLG 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
TSQMLDSQLP QLTMPLPRYG SGQQPLILPQ SIQLPPGQSL SVGAPRRVPP PGSQPPVLNT 
      1450       1460       1470       1480    
SRESAPMELK GFHFADSKQN VPTGGSAPSP QAYRQSEWMK NPAWEP



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q7TPM1-1-unknown MSDRLG... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q7TPM1-767-unknown MALQNK... 767 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt86099

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...PAWEP 1486 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)