TopFIND 4.0

Q80TY5: Vacuolar protein sorting-associated protein 13B

General Information

Protein names
- Vacuolar protein sorting-associated protein 13B
- Cohen syndrome protein 1 homolog

Gene names Vps13b
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q80TY5

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MLESYVTPIL MSYVNRYIKN LKPSDLQLSL WGGDVVLSKL ELKLDVLEQE LKLPFTFLSG 
        70         80         90        100        110        120 
HIHELRIHVP WTKLGSEPVV ITINTMECIL KLKDGIQDDH ESCGSNSTNR STAENTKSSI 
       130        140        150        160        170        180 
KPRRIQQAAP ADPDLPPGYV QSLIRRVVNN VNIVINNLIL KYVEDDIVLS VNITSAECYT 
       190        200        210        220        230        240 
VGELWDRAFM DISATDLVLR KAINFSDCTV CLDKRNASGK IEFYQDPLLY KCSFRTRLHF 
       250        260        270        280        290        300 
TYDNLNSKMP SVIKIHTLVE SLKLSITDQQ LPMFIRIMQL GIALYYGEIG NFKDGETEDP 
       310        320        330        340        350        360 
PCLSKDTLAN LTGTEEESRI DMQYPAPYKG QELYSQDYEE PQGWVSWAWS FVPAIVSYDD 
       370        380        390        400        410        420 
GEEDDLGTDP ASIMHQQKAQ TLKDPIVSVG FYCTKATVTF KLTEMQAENS YYSPQKVKSK 
       430        440        450        460        470        480 
EVLCWEQEGT TIEALMMGEP FFDCQIGFVG CRAMCLKGIL GVKDFEEHMN RSETEACFFI 
       490        500        510        520        530        540 
CGENLSTKGL TYLTNSLFDY RSPENNGTRA EFILDAAHHK ETHTDIAGIQ RFGAFYMDYL 
       550        560        570        580        590        600 
YTVEHSSGKG PTSQQDFPSG KNEDLGIVQE KSTKSLVIGP LDCRLDSSAV HRVLKMIVCA 
       610        620        630        640        650        660 
LEHEYEPYSR LKPESKDEKE TVLDPEEVSS LEEYIPTRHT SVTLLKCTCT VFMAEFNLLD 
       670        680        690        700        710        720 
CLLPVIMGGK NSSNVTNATN FQSLRPLPSI QILVDKINLE HSVPMYAEQL VHVVSSLNQP 
       730        740        750        760        770        780 
SDNLLHYCYV HCYLKVFGFQ AGLTCLDHSG SYCLPAPIIP SFSTALYGKL LKLPALWTKR 
       790        800        810        820        830        840 
SQTVVTEGIF ELPNLTIQAT RAQTLLLQAI YQSWSHIGNV SSSTVNEALM NEVFPMTGVK 
       850        860        870        880        890        900 
SKNPLPTLEG SIQNVELKYC STSLVKCASG TLGSIKICAK APGDSGKEKL IPLLQGPSDT 
       910        920        930        940        950        960 
RDLHSSKWLN ESRKPESLLA PDLIAFTIQV PQYMDYCHHS GAVFLCSVQG LAVNIDPILY 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TWVIYQPQKR ANRHAQQQPV VAVPLVTSVN RRKEDELSIG SAPLGKQQSY QASEYASSPI 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KTKTVTESRP VSVPVKAVLR VHEECRSPED KMKEFIAILW NAVKSLTLQL DVQSCCVFIP 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
NDNLPSPSTI VSGDIPGTVR SWYHGQTSIP GTLVLCLPQI KIISAGHKYM EPLQEIPFVI 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
PRPILEEGDA FPWTISLHHF SIYTLLGKQV TLSLVEPMGC TSTLAVTSQK LLPVGPDGRH 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SFVVCLHVDL ESLEIKCSNP QVQLIYELAD TMSKVWSKIQ KRGNLSPSSV YPETVAGPIP 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GSPVWSSVGT APPDTSTCSP SADIGTTTEG DSVQAGDDSP FSDSVTLEQT TSNIGGSSGR 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
VSLWMQWVLP KATVKLFAPD LEKKGTEVCM VSELEDLSAS IDVQDVYTKV KCKVESFSID 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
HYQSRPGEGW QSGHFEGVFL QCKEKPVTTT KLLDGAHQQH GFLSLTYTKA VTKNVRHKLT 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
SRNERRSFYK LSEGLMDGSP HFLHEILLSA QAFDIVVCFP LLNAIASVFH TKLPKTQREK 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
RKSSGQPMRT HTLTSRNLPL IYINTSVIRI FVPQTEETQS TVAVNQAAKE DTMVLKVGSI 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
AMAPQADNPL GRSVLRKDIY QKALNLGILR DPGSEIEDRQ YQIDLQSINI GTAQWDQLKP 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
EKGSGSGGVP TESERNSQNP ALEWNMASSI QRHQERRAIL TPILTDFSVR ITGAPAIIFT 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
KIISQENLHM EEILVCGHSL EVNITTNLDF FLSVAQVQLL HQLIVANMTG LEPSTKATEI 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
SKQEQKKVDT FDGGTAETSS RYSGAQDSGI GSDSVKIRIV QIEQYSGASQ HRIARPSHQS 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
SIVKNLNFIP FDIFITASRI SLMTYSSVAL PKFKLPEQKE DGKTGRTFLN LAEVDSDVAK 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
PNQACVSMVT AEDPLSSSTS FSSGKKVRVL SLESLHASTR SSARQALGVT VVRQPGRRGT 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
GDLELDLFLH LIVSQPSLLL SCHHRKQRVE VSIFDAMLKG VPSDYTCTDP GKTLPEASDY 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
NIVWLQTVPG ETDSKSGIPP SLVTLHIKDF LNGPADIYLD VSKPLKANLS FTKLDQINHF 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
LKKIKKAHSS AHSKETSTPS DSILNMDEPP VPKCYRGKLS KTKVHCDEAQ KTSFQENIWR 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
AISCFQKVSV HTTQIVVSME TVPHPHKPCV LASLSNLNGS LTVKAAQKVP GASLGSSFLL 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
SIHDVLLKTS LKERSRILIG PFSATVNLEA KWCKHSGNPG PQQSIPKISM DLRGGLLQVF 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
WGQEHLNCLA LLHELFNGYL QEGKSEMPVP ESAPQMPSPV EKTQAFKTEQ SSDDLRTGIF 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
QYVQDAESLK LPGVYEVLFY NETEESPGMM LWRYPEPRVL TLVRITPVPF NTTEDPDIST 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
ADLGDVLQVP CGLEYWDELQ KVFVAFQEFS LSESKVCELQ LPDINLVHDQ KKLVSSDLWR 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
IVLNNNQNTT DDQSSASESG SQSTCEPLVT PTALAACTRV DSCFTPWFVP SLCMSFQFAH 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
LEFRLCHHLD QLGTASPQYL QPFISDKNVP SELEYMIISF REPNLHLRQW NSGPVCQEIK 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
FSSQMDCKLL ECRNVTMQTV VKPFGICGQM ALSSDGVQKL LDSTVIVDSV LVNFGQHVVH 
      2590       2600       2610       2620       2630       2640 
SLNTAIQAWQ QNKCPEVEEL VFSHFVICND TQETLRFGQV DTDENILLAS LHSHQYSWRS 
      2650       2660       2670       2680       2690       2700 
HKSPQLLHIC IEGWGNWRWS EPFTVDHAGT FIRTIQYKGR TASLIIKVRA LSGVQKQIII 
      2710       2720       2730       2740       2750       2760 
CGRQIICSYL SQSIELKVVQ HYIGQDGQAV VREHFDCLTA KQKLPSYILE NNELTELCVK 
      2770       2780       2790       2800       2810       2820 
AKGDEDWSRD VCLEPKASEY STVIQVPTSN SSIIYVWCTV LTLEPNSQVQ QRMIVFSPLF 
      2830       2840       2850       2860       2870       2880 
IMRSHLPDPI IIHLEKRSLG LSETQIIPGR GQENPLQNVE PDLVHHLTFQ AREEYDPSDC 
      2890       2900       2910       2920       2930       2940 
AVPISTALIK QIATKIQPGG TVNEMLDEFY GPEKSQEPTW PYSNKDSDRN EQLSQWDSPM 
      2950       2960       2970       2980       2990       3000 
RVKLSIWKPY VRTLLIELLP WALLINQSKW DLWLFEGEKI VLQVPAGKII IPPNFQEAFQ 
      3010       3020       3030       3040       3050       3060 
IGIYWENTNT VHKTLAIKLV HNLTSPKWKD GGNGEVVTLD EEAFVDAEIR LGAFPGHQKL 
      3070       3080       3090       3100       3110       3120 
CQFCISSMVQ HGIQVIQIED KTTVINNTPY QIVYKPHLAI SNSYSGKEHC HVPDSATFSI 
      3130       3140       3150       3160       3170       3180 
CPGGEHPAVR SSSLPCWDVT PAVGSSELDT ATLQKQILLG FSPVPGADSA QCWSLPAIIG 
      3190       3200       3210       3220       3230       3240 
GEFPRQSVAV PFGTGRENGF CTRAIALTYQ EHLGVTYITL SEDPSPRVVF HNRCPVPMLM 
      3250       3260       3270       3280       3290       3300 
KENIRDIPKF DVYCKKIPPE SSVHHELYHQ IISYPDCKTK DLLPSLFLRI DSMEEMTAEW 
      3310       3320       3330       3340       3350       3360 
SDPVDINSQG TQVVFLTGFG YVYVDIAQQC GTVFIILAPE GKAGPIFTST SRALERMVTF 
      3370       3380       3390       3400       3410       3420 
RMFITQLSLA VSDDLTHQAP SELLRLTLDN VFLHVSPVPA LLPGEEPPSS FFQLYGVEVY 
      3430       3440       3450       3460       3470       3480 
CGDLQLDNQL YNKSNFHFAV LVCQGERTDP AQYSRVQSLL VSSKALEEYK ENCFIKLCLT 
      3490       3500       3510       3520       3530       3540 
VSEGKDILLD VSEFTFELKP ARLYVEDTFV YYIKTLFDTY LPPSRMSGHH AQLFTGQQVL 
      3550       3560       3570       3580       3590       3600 
PVQVTQHAKA LVNAVKLRKL LIQPVNLLIS IHASLKLYIA SDHTPLSFSV FERGPVFTTA 
      3610       3620       3630       3640       3650       3660 
RQLVHALAMH YAAGALFRAG WVVGSLEILG SPASLVRSIG NGISDFFRLP YEGLTRGPGA 
      3670       3680       3690       3700       3710       3720 
FVSGVSRGTT SFVKHISKGA LTSITNLATS LARNMGRLSL DEEHYNRQEE WRRQLPESLG 
      3730       3740       3750       3760       3770       3780 
EGLRQGLSRL GISLLGAIAG IVDQPMQNFQ KTSETQASAG HKAKGVISGV GKGIMGVFTK 
      3790       3800       3810       3820       3830       3840 
PIGGAAELVS QTGYGILHGA GLSQLPKQRC QPTHLYADQA PNSHVKYVWK MLQSLGRPEV 
      3850       3860       3870       3880       3890       3900 
HMALDVVLVR GSGQEHEGCL LLTSEVLFVV SISEDTQQQA FPITEISCAQ DTKQNNLLTV 
      3910       3920       3930       3940       3950       3960 
QLKQPRVASD VEIDGARERL SEQQFKRLVD YIAKTSCHLA PSCSSMQTCS VVAVEPPPAT 
      3970       3980       3990    
VKTYHYLVDP HFAQVFISKF TMVKNKALRK GFS

Isoforms



Sequence View



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q80TY5-1-unknown MLESYV... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ... 4013 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)