TopFIND 4.0

Q80Y84: Lysine-specific demethylase 5B

General Information

Protein names
- Lysine-specific demethylase 5B
- 1.14.11.-
- Histone demethylase JARID1B
- Jumonji/ARID domain-containing protein 1B
- PLU-1
Gene names Kdm5b
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q80Y84

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MEPATTLPPG PRPALPLGGP GPLGEFLPPP ECPVFEPSWE EFADPFAFIH KIRPIAEQTG 
        70         80         90        100        110        120 
ICKVRPPPDW QPPFACDVDK LHFTPRIQRL NELEAQTRVK LNFLDQIAKY WELQGSTLKI 
       130        140        150        160        170        180 
PHVERKILDL FQLNKLVAEE GGFAVVCKDR KWTKIATKMG FAPGKAVGSH IRGHYERILN 
       190        200        210        220        230        240 
PYNLFLSGDS LRCLQKPNLT SDTKDKEYKP HDIPQRQSVQ PAETCPPARR AKRMRAEAMN 
       250        260        270        280        290        300 
IKIEPEEATE ARTHNLRRRM GCTTPKWENE KEMKSTIKQE PTEKKDCELE SEKEKPKSRA 
       310        320        330        340        350        360 
KKTATAVDLY VCLLCGSGND EDRLLLCDGC DDSYHTFCLV PPLHDVPKGD WRCPKCLAQE 
       370        380        390        400        410        420 
CNKPQEAFGF EQAARDYTLR TFGEMADAFK SDYFNMPVHM VPTELVEKEF WRLVSTIEED 
       430        440        450        460        470        480 
VTVEYGADIA SKEFGSGFPV RDGKIKISPE EEEYLDSGWN LNNMPVMEQS VLAHITADIC 
       490        500        510        520        530        540 
GMKLPWLYVG MCFSSFCWHI EDHWSYSINY LHWGEPKTWY GVPGYAAEQL ENVMKKLAPE 
       550        560        570        580        590        600 
LFVSQPDLLH QLVTIMNPNT LMTHEVPVYR TNQCAGEFVI TFPRAYHSGF NQGFNFAEAV 
       610        620        630        640        650        660 
NFCTVDWLPL GRQCVEHYRL LHRYCVFSHD EMICKMASKA DVLDVVVAST VQKDMAIMIE 
       670        680        690        700        710        720 
DEKALRETVR KLGVIDSERM DFELLPDDER QCIKCKTTCF MSAISCSCKP GLLVCLHHVK 
       730        740        750        760        770        780 
ELCSCPPYKY NLRYRYTLDD LYPMMNALKL RAESYNEWAL NVNEALEAKI NKKKSLVSFK 
       790        800        810        820        830        840 
ALIEESEMKK FPDNDLLRHL RLVTQDAEKC ASVAQQLLNG KRQTRYRSGG GKSQNQLTVN 
       850        860        870        880        890        900 
ELRQFVTQLY ALPCVLSQTP LLKDLLNRVE DFQQQSQKLL SEEMPSAAEL QELLDVSFEF 
       910        920        930        940        950        960 
DVELPQLTEM RIRLEQARWL EEVQQACLDS SSLSLDDMRR LIDLGVGLAP YSAVEKAMAR 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LQELLTVSEH WDDKAKSLLR ARPRHSLSSL ATAVKEMEEI PAYLPNGTVL KDSVQRARDW 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
VQDVDALQAG GRVPVLETLI ELVARGRSIP VHLNSLPRLE MLVAEVHAWK ECAAKTFLPE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
NSTYSLLEVL CPRCDIGLLG LKRKQRKLKE PLPSGKKRST KLESLSDLER ALMESKETAA 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
AMATLGEARL REMEALQSLR FANEEKLLSP VQDLEMKVCL CQKTPATPMI QCELCRDAFH 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
TSCVAAPSIS QSSRIWLCPH CRRSEKPPLE KILPLLASLQ RIRVRLPEGD ALRYMIERTV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
NWQHRAQQLL SSGNLKLVQD QVGSGLLSSR WPASAGQASA TDKVSQPPGT TSFSLPDDWD 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
NRTSYLHSPF STGQSCLPLH GLSPEVNELL MEAQLLQVSL PEIQELYQTL LTKPSSVQQA 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
DRSSPVRSSS EKNDCLRGKR DAINSPERKL KRRPEREGLP SERWDRVKHM RTPQKKKIKL 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
SHPKDMDSFK LERERSYDLV RNAETHSLPS DTSYSEQEDS EDEDAICPAV SCLQPEGDEV 
      1510       1520       1530       1540    
DWVQCDGSCN QWFHQVCVGV SPEMAEKEDY ICVRCTGKDA PSRK

Isoforms

- Isoform 2 of Lysine-specific demethylase 5B

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MEPATTLPPG PRPALPLGGP GPLGEFLPPP ECPVFEPSWE EFADPFAFIH KIRPIAEQTG 
        70         80         90        100        110        120 
ICKVRPPPDW QPPFACDVDK LHFTPRIQRL NELEAQTRVK LNFLDQIAKY WELQGSTLKI 
       130        140        150        160        170        180 
PHVERKILDL FQLNKLVAEE GGFAVVCKDR KWTKIATKMG FAPGKAVGSH IRGHYERILN 
       190        200        210        220        230        240 
PYNLFLSGDS LRCLQKPNLT SDTKDKEYKP HDIPQRQSVQ PAETCPPARR AKRMRAEAMN 
       250        260        270        280        290        300 
IKIEPEEATE ARTHNLRRRM GCTTPKWENE KEMKSTIKQE PTEKKDCELE SEKEKPKSRA 
       310        320        330        340        350        360 
KKTATAVDLY VCLLCGSGND EDRLLLCDGC DDSYHTFCLV PPLHDVPKGD WRCPKCLAQE 
       370        380        390        400        410        420 
CNKPQEAFGF EQAARDYTLR TFGEMADAFK SDYFNMPVHM VPTELVEKEF WRLVSTIEED 
       430        440        450        460        470        480 
VTVEYGADIA SKEFGSGFPV RDGKIKISPE EEEYLDSGWN LNNMPVMEQS VLAHITADIC 
       490        500        510        520        530        540 
GMKLPWLYVG MCFSSFCWHI EDHWSYSINY LHWGEPKTWY GVPGYAAEQL ENVMKKLAPE 
       550        560        570        580        590        600 
LFVSQPDLLH QLVTIMNPNT LMTHEVPVYR TNQCAGEFVI TFPRAYHSGF NQGFNFAEAV 
       610        620        630        640        650        660 
NFCTVDWLPL GRQCVEHYRL LHRYCVFSHD EMICKMASKA DVLDVVVAST VQKDMAIMIE 
       670        680        690        700        710        720 
DEKALRETVR KLGVIDSERM DFELLPDDER QCIKCKTTCF MSAISCSCKP GLLVCLHHVK 
       730        740        750        760        770        780 
ELCSCPPYKY NLRYRYTLDD LYPMMNALKL RAESYNEWAL NVNEALEAKI NKKKSLVSFK 
       790        800        810        820        830        840 
ALIEESEMKK FPDNDLLRHL RLVTQDAEKC ASVAQQLLNG KRQTRYRSGG GKSQNQLTVN 
       850        860        870        880        890        900 
ELRQFVTQLY ALPCVLSQTP LLKDLLNRVE DFQQQSQKLL SEEMPSAAEL QELLDVSFEF 
       910        920        930        940        950        960 
DVELPQLTEM RIRLEQARWL EEVQQACLDS SSLSLDDMRR LIDLGVGLAP YSAVEKAMAR 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LQELLTVSEH WDDKAKSLLR ARPRHSLSSL ATAVKEMEEI PAYLPNGTVL KDSVQRARDW 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
VQDVDALQAG GRVPVLETLI ELVARGRSIP VHLNSLPRLE MLVAEVHAWK ECAAKTFLPE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
NSTYSLLEVL CPRCDIGLLG LKRKQRKLKE PLPSGKKRST KLESLSDLER ALMESKETAA 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
AMATLGEARL REMEALQSLR FANEEKLLSP VQDLEMKVCL CQKTPATPMI QCELCRDAFH 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
TSCVAAPSIS QSSRIWLCPH CRRSEKPPLE KILPLLASLQ RIRVRLPEGD ALRYMIERTV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
NWQHRAQQLL SSGNLKLVQD QVGSGLLSSR WPASAGQASA TDKVSQPPGT TSFSLPDDWD 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
NRTSYLHSPF STGQSCLPLH GLSPEVNELL MEAQLLQVSL PEIQELYQTL LTKPSSVQQA 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
DRSSPVRSSS EKNDCLRGKR DAINSPERKL KRRPEREGLP SERWDRVKHM RTPQKKKIKL 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
SHPKDMDSFK LERERSYDLV RNAETHSLPS DTSYSEQEDS EDEDAICPAV SCLQPEGDEV 
      1510       1520       1530       1540    
DWVQCDGSCN QWFHQVCVGV SPEMAEKEDY ICVRCTGKDA PSRK



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q80Y84-1-unknown MEPATT... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q80Y84-1-unknown MEPATT... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt78883

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...APSRK 1544 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)