TopFIND 4.0

Q8BKI2: Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein

General Information

Protein names
- Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein
Gene names Tnrc6b
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q8BKI2

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MQTNEGEVEE ESSSQVEQED FVMEGHGKTP PPGEESKQEK EQEREEQLME DKKRKKEDKK 
        70         80         90        100        110        120 
KKEATQKVTE QKTKVPEVTK PSLSQPTAAS PIGSSPSPPV NGGNNAKRVA VPNGQPPSAA 
       130        140        150        160        170        180 
RYMPREVPPR FRCQQDHKVL LKRGQPPPPS CMLLGGGAGP PPCTAPGANP NNNAQVTGAL 
       190        200        210        220        230        240 
LQSESGTAPE STLGGAAASN YANSTWGPGA SSNSGASPNP IHIWDKVIVD GSDMEEWPCI 
       250        260        270        280        290        300 
ASKDTESSSE NTTDNNSASN PGSEKSSLPG STTSNKGKGS QCQAASSGNE CNLGVWKSDP 
       310        320        330        340        350        360 
KAKSVQPPNS TSDSNNGLGN WRSTSGQDRI GPGSGFSNFN PNSNPSAWPA LVQEGTSRKG 
       370        380        390        400        410        420 
ALETESSSSS AQVSTVGQAS REQQSKMENA GVNFVVSGRE QAQIHNTDGP KNGNTNSLNL 
       430        440        450        460        470        480 
SSPNPMENKG MPFGMGLGNT SRSTDAPSQS TGDRKTGSVG SWGAARGPSG TDTVSGQSNS 
       490        500        510        520        530        540 
GNNGNNGKDR EDSWKGASVP KPTGSKSDSW DNNNRSTGGS WNFGPQDNND NKWGEGNKMT 
       550        560        570        580        590        600 
SGVSQGEWKQ PTGSDELKIG EWSGPNQPNS STGAWDNQKG HPLPENQGNA QAPCWGRSSS 
       610        620        630        640        650        660 
SAGSEVGGQS TGSNHKAGSS DSHNSGRRSY RPTHPDCQAV LQTLLSRTDL DPRVLSNTGW 
       670        680        690        700        710        720 
GQTQIKQDTV WDIEEVPRPE GKSDKGTEGW ESAATQTKNS GGWGDAPSQS NQMKSGWGEL 
       730        740        750        760        770        780 
SASTEWKDPK STGGWNDYKN NNSSNWGGGR ADEKTPSSWN ESSCKDQGWG GGRQPNQGWT 
       790        800        810        820        830        840 
SGKNGWGEEV DQVKNNNWES SANKPVSGWG EGGQNEIGTW GNGGNTNLAS KGGWEDCKRS 
       850        860        870        880        890        900 
PAWNETGRQP NSWNKQHQQQ QQPPPPQPEA SGSWGGPPPP PQGNVRPSNS NWSSGPQPTT 
       910        920        930        940        950        960 
PKDDEPSGWE EPSPQSISRK MDIDDGTSAW GDPNSYNYKN VNLWDKNSQG GPAPREPNLP 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TPMTGKSASV WSKSTPPAPD NGTSAWGEPN ESSPGWGEMD DAGASTTGWG NTPANAPNAM 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KPNSKSMQDG WGESDGPVTG ARHPSWEEED DGGVWNTAGS QGSTSSHNSA SWGQGGKKQM 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
KCSLKGGNND SWMNPLAKQF SNMGLLSQTE DNPSSKMDLS VDKKFDVDKR TMNLGDFNDI 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
MRKDRPGFRP PNSKDLGTTD SGPYFEKGGS HGLFGNSTAQ SRGLHTPVQP LSSSPGLRAQ 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
VPPQFISPQV SASMLKQFPN SGLNPGLFNV GPQLSPQQIA MLSQLPQIPQ FQLACQLLLQ 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
QQQQQQQLLQ NQRKISQAVR QQQEQQLARM VSALQQQQQQ QQQQQRQPSM KHSPSHPVGP 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
KPHLDNMVPN ALNVGLPDLP TKGPIPGYGS GFSSGGMDYG MVGGKEAGTE SRFKQWTSMM 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
EGLPSVATQE ATMHKNGAIV APGKTRGGSP YNQFDIIPGD TLGGHTGPAG DSWLPAKSPP 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
TNKIGSKSSN ASWPPEFQPG VPWKGIQNID PESDPYVTPG SVLGGTTTSP IVDTDHQLLR 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
DNTTGSNSSL NTSLPSPGAW PYSASDNSFT NVHSTSAKFP DYKSTWSPDP IGHNPTHLSN 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
KMWKNHISSR NTTPLTRPPP GLTNPKPASP WSSTAPRSVR GWGTQDSRIA SASTWSDGGS 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
VRPSYWLVLH NLTPQIDGST LRTICMQHGP LLTFHLNLTQ GTALIRYSTK QEAAKAQTAL 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
HMCVLGNTTI LAEFATEDEV SRFLAQAQPP TPAATPSAPA TGWQSLETSQ NQADPVGPAL 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
NLFGGSTGLG QWSSSAGGSS GADLAGTSLW GPPNYSSSLW GVPTVEDPHR MGSPAPLLPG 
      1810    
DLLGGGSDSI 

Isoforms

- Isoform 2 of Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MQTNEGEVEE ESSSQVEQED FVMEGHGKTP PPGEESKQEK EQEREEQLME DKKRKKEDKK 
        70         80         90        100        110        120 
KKEATQKVTE QKTKVPEVTK PSLSQPTAAS PIGSSPSPPV NGGNNAKRVA VPNGQPPSAA 
       130        140        150        160        170        180 
RYMPREVPPR FRCQQDHKVL LKRGQPPPPS CMLLGGGAGP PPCTAPGANP NNNAQVTGAL 
       190        200        210        220        230        240 
LQSESGTAPE STLGGAAASN YANSTWGPGA SSNSGASPNP IHIWDKVIVD GSDMEEWPCI 
       250        260        270        280        290        300 
ASKDTESSSE NTTDNNSASN PGSEKSSLPG STTSNKGKGS QCQAASSGNE CNLGVWKSDP 
       310        320        330        340        350        360 
KAKSVQPPNS TSDSNNGLGN WRSTSGQDRI GPGSGFSNFN PNSNPSAWPA LVQEGTSRKG 
       370        380        390        400        410        420 
ALETESSSSS AQVSTVGQAS REQQSKMENA GVNFVVSGRE QAQIHNTDGP KNGNTNSLNL 
       430        440        450        460        470        480 
SSPNPMENKG MPFGMGLGNT SRSTDAPSQS TGDRKTGSVG SWGAARGPSG TDTVSGQSNS 
       490        500        510        520        530        540 
GNNGNNGKDR EDSWKGASVP KPTGSKSDSW DNNNRSTGGS WNFGPQDNND NKWGEGNKMT 
       550        560        570        580        590        600 
SGVSQGEWKQ PTGSDELKIG EWSGPNQPNS STGAWDNQKG HPLPENQGNA QAPCWGRSSS 
       610        620        630        640        650        660 
SAGSEVGGQS TGSNHKAGSS DSHNSGRRSY RPTHPDCQAV LQTLLSRTDL DPRVLSNTGW 
       670        680        690        700        710        720 
GQTQIKQDTV WDIEEVPRPE GKSDKGTEGW ESAATQTKNS GGWGDAPSQS NQMKSGWGEL 
       730        740        750        760        770        780 
SASTEWKDPK STGGWNDYKN NNSSNWGGGR ADEKTPSSWN ESSCKDQGWG GGRQPNQGWT 
       790        800        810        820        830        840 
SGKNGWGEEV DQVKNNNWES SANKPVSGWG EGGQNEIGTW GNGGNTNLAS KGGWEDCKRS 
       850        860        870        880        890        900 
PAWNETGRQP NSWNKQHQQQ QQPPPPQPEA SGSWGGPPPP PQGNVRPSNS NWSSGPQPTT 
       910        920        930        940        950        960 
PKDDEPSGWE EPSPQSISRK MDIDDGTSAW GDPNSYNYKN VNLWDKNSQG GPAPREPNLP 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TPMTGKSASV WSKSTPPAPD NGTSAWGEPN ESSPGWGEMD DAGASTTGWG NTPANAPNAM 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KPNSKSMQDG WGESDGPVTG ARHPSWEEED DGGVWNTAGS QGSTSSHNSA SWGQGGKKQM 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
KCSLKGGNND SWMNPLAKQF SNMGLLSQTE DNPSSKMDLS VDKKFDVDKR TMNLGDFNDI 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
MRKDRPGFRP PNSKDLGTTD SGPYFEKGGS HGLFGNSTAQ SRGLHTPVQP LSSSPGLRAQ 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
VPPQFISPQV SASMLKQFPN SGLNPGLFNV GPQLSPQQIA MLSQLPQIPQ FQLACQLLLQ 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
QQQQQQQLLQ NQRKISQAVR QQQEQQLARM VSALQQQQQQ QQQQQRQPSM KHSPSHPVGP 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
KPHLDNMVPN ALNVGLPDLP TKGPIPGYGS GFSSGGMDYG MVGGKEAGTE SRFKQWTSMM 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
EGLPSVATQE ATMHKNGAIV APGKTRGGSP YNQFDIIPGD TLGGHTGPAG DSWLPAKSPP 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
TNKIGSKSSN ASWPPEFQPG VPWKGIQNID PESDPYVTPG SVLGGTTTSP IVDTDHQLLR 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
DNTTGSNSSL NTSLPSPGAW PYSASDNSFT NVHSTSAKFP DYKSTWSPDP IGHNPTHLSN 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
KMWKNHISSR NTTPLTRPPP GLTNPKPASP WSSTAPRSVR GWGTQDSRIA SASTWSDGGS 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
VRPSYWLVLH NLTPQIDGST LRTICMQHGP LLTFHLNLTQ GTALIRYSTK QEAAKAQTAL 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
HMCVLGNTTI LAEFATEDEV SRFLAQAQPP TPAATPSAPA TGWQSLETSQ NQADPVGPAL 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
NLFGGSTGLG QWSSSAGGSS GADLAGTSLW GPPNYSSSLW GVPTVEDPHR MGSPAPLLPG 
      1810    
DLLGGGSDSI 



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q8BKI2-1-unknown MQTNEG... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...GSDSI 1810 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)