TopFIND 4.0

Q8C6K9: Collagen alpha-6(VI) chain

General Information

Protein names
- Collagen alpha-6(VI) chain
Gene names Col6a6
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q8C6K9

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MLLVLCLTMI CFHVCVNQDS GPEYADVVFL VDSSDHLGLK SFPLVKTFIH KMISSLPIEA 
        70         80         90        100        110        120 
NKYRVALAQY SDALHNEFQL GTFKNRNPML NHLKKNFGFI GGSLKIGNAL QEAHRTYFSA 
       130        140        150        160        170        180 
PTNGRDKKQF PPILVVLASA ESEDDVEEAA KALREDGVKI ISVGVQKASE ENLKAMATSQ 
       190        200        210        220        230        240 
FHFNLRTARD LSVFAPNMTE IIKDVTQYRE GMADDIIVEA CQGPSVADVV FLLDMAINGS 
       250        260        270        280        290        300 
QEDLDHLKAF LGESISALDI KENCMRVGLV TYSNETRVIS SLSTGNNKTE VLQRIQDLSP 
       310        320        330        340        350        360 
QVGQAYTGAA LRKTRKEIFS AQRGSRKNQG VPQIAVLVTH RASEDNVTKA AVNLRREGVT 
       370        380        390        400        410        420 
IFTMGIEGAN PDELEKIASH PAEQFTSKLG NFSELATHNQ TFLKKLRNQI THTVSVFSER 
       430        440        450        460        470        480 
TETLKSACVD TEEADIYLLI DGSGSTQPTD FHEMKTFLSE VVGMFNIAPH KVRVGAVQYA 
       490        500        510        520        530        540 
DTWDLEFEIS KYSNKPDLGK AIENIRQMGG NTNTGAALNF TLKLLQRAKK ERGSKVPCHL 
       550        560        570        580        590        600 
VVLTNGMSRD SVLGPAHKLR EENIRVHAIG VKEANQTQLR EIAGEEKRVY YVHEFDALRN 
       610        620        630        640        650        660 
IRNQVVQEIC AEEACRDMKA DIMFLVDSSG SIGPENFSKM KMFMKNLVSK SQIGADRVQI 
       670        680        690        700        710        720 
GVVQFSHENK EEFQLNTFMS QSDIANAIDR MTHIGETTLT GSALTFVSQY FSPDKGARPN 
       730        740        750        760        770        780 
VRKFLILITD GEAQDIVRDP AIALRKEGVI IYSVGVFGSN VTQLEEISGK PEMVFYVENF 
       790        800        810        820        830        840 
DILQHIEDDL VLGICSPREE CKRIEVLDVV FVIDSSGSID YQEYNIMKDF MIGLVKKADV 
       850        860        870        880        890        900 
GKNQVRFGAL KYADDPEVLF YLDELGTKLE VVSVLQNDHP MGGNTYTAEA LAFSDHMFTE 
       910        920        930        940        950        960 
ARGSRLHKGV PQVLIVITDG ESHDAEKLNT TAKALRDKGI LVLAVGIAGA NSWELLAMAG 
       970        980        990       1000       1010       1020 
SSDKYYFVET FGGLKGIFSD VSASVCNSSK VDCEIEKVDL VFLMDGSNSI HPDDFQKMKG 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
FLVSVVQDFD VSLNRVRIGV AQFSDSYRSE FLLGTFTGER EISTQIEGIQ QIFGYTHIGD 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
ALRKVKYYFQ PDMGSRINAG TPQVLLVLTD GRSQDEVAQA AEELRHKGVD IYSVGIGDVD 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
DQELVQITGT AEKKLTVHNF DELKKVKKRI VRNICTSGGE SNCFVDVVVG FDISSLQRGQ 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
TLLEGQPWMG SYLQDLLRAI SSLNGVSCEV GTETQVSIAF QVTNAMERYP SKFEIYSENI 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
LSSLQGVTVN GPSRLNANLL SSLWDTFQNK SAARGKVVLL FSDGLDDGIE KLEQKSDELR 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
KEGLNALITI AVDGAADSSD LADLLYIEFG KGFEYRTQFT IGMRNLGSQL SRQLINVAER 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
TCCCLLCKCT GGDGAMGDPG SAGKKGPPGF KGSDGYLGEE GIAGERGASG PMGEQGTKGC 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
FGAKGPKGTR GLSGEEGEVG EDGLDGLDGE QGDHGIPGRR GEKGDEGSQG NPGRRGAAGD 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
RGAKGLRGDP GTPGRDSSIQ GPKGLKGDLG RQGRRGWPGS PGTPGSRRKM VVHGRRGHIG 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
PQGNPGTPGP DGLAGSPGLR GPQGPRGEVG EKGEKGSLGM KGPQGPPGPG GQAGSQGHLG 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
SQGNKGEPGD LGEKGAAGFP GPRGLQGDDG SPGYGSIGRK GTKGQEGFPG ESGLKGDIGD 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
PGDPGEAGPK GARGKTVSAG IPGEPGSPGE PGPPGRKGVK GARGLASFST CDLIQYVRDH 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
SPGRHGKPEC PVHPTELVFV LDQSRDVTEQ DFERMKGMMV SLVRDVKVRE ANCPVGARVA 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
ILAYNSHTRH LIRFSDAYRK DQLLTAIKAL PYERSSDSRE IGKAMRFISR NVFKRTLPGA 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
HVRRIATFFS SGPSADAQTI TTAAMEFSAL DIVPVVIAFS NVPSVKRAFS IDDTGTFQVI 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
VVPSGSDEGP ALERLQRCTF CYDLCKPDAS CDQAKPPPIQ SYLDTAFLLD GSRHVGSAEF 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
EDMRDFLEAL LDHFEITSEP ETSVTGDRVA LLSHAPLDFL PNTQRSPVRT EFNLTSYSSK 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
RLMKRHVDQA VQQLHGDAFL GHALGWALDN VFLNTPNLRR NKVIFVISAG ETSHLDAETL 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
KKESLRAKCH GYALFVFSLG PDWDDKELED LASHPVDQHL IQLGRIHKPD HGYSVKFVKS 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
FINSIRHGIN KYPPVNLKAK CNRLGSRDLK PPPRQFRSFV PGPQKANLKD HTAEAAKLFQ 
      2230       2240       2250       2260    
DKKRLSSMLK GGRATISSLS RSTRYAFKQG KEAIKATSKL GKRSA

Isoforms

- Isoform 2 of Collagen alpha-6(VI) chain

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MLLVLCLTMI CFHVCVNQDS GPEYADVVFL VDSSDHLGLK SFPLVKTFIH KMISSLPIEA 
        70         80         90        100        110        120 
NKYRVALAQY SDALHNEFQL GTFKNRNPML NHLKKNFGFI GGSLKIGNAL QEAHRTYFSA 
       130        140        150        160        170        180 
PTNGRDKKQF PPILVVLASA ESEDDVEEAA KALREDGVKI ISVGVQKASE ENLKAMATSQ 
       190        200        210        220        230        240 
FHFNLRTARD LSVFAPNMTE IIKDVTQYRE GMADDIIVEA CQGPSVADVV FLLDMAINGS 
       250        260        270        280        290        300 
QEDLDHLKAF LGESISALDI KENCMRVGLV TYSNETRVIS SLSTGNNKTE VLQRIQDLSP 
       310        320        330        340        350        360 
QVGQAYTGAA LRKTRKEIFS AQRGSRKNQG VPQIAVLVTH RASEDNVTKA AVNLRREGVT 
       370        380        390        400        410        420 
IFTMGIEGAN PDELEKIASH PAEQFTSKLG NFSELATHNQ TFLKKLRNQI THTVSVFSER 
       430        440        450        460        470        480 
TETLKSACVD TEEADIYLLI DGSGSTQPTD FHEMKTFLSE VVGMFNIAPH KVRVGAVQYA 
       490        500        510        520        530        540 
DTWDLEFEIS KYSNKPDLGK AIENIRQMGG NTNTGAALNF TLKLLQRAKK ERGSKVPCHL 
       550        560        570        580        590        600 
VVLTNGMSRD SVLGPAHKLR EENIRVHAIG VKEANQTQLR EIAGEEKRVY YVHEFDALRN 
       610        620        630        640        650        660 
IRNQVVQEIC AEEACRDMKA DIMFLVDSSG SIGPENFSKM KMFMKNLVSK SQIGADRVQI 
       670        680        690        700        710        720 
GVVQFSHENK EEFQLNTFMS QSDIANAIDR MTHIGETTLT GSALTFVSQY FSPDKGARPN 
       730        740        750        760        770        780 
VRKFLILITD GEAQDIVRDP AIALRKEGVI IYSVGVFGSN VTQLEEISGK PEMVFYVENF 
       790        800        810        820        830        840 
DILQHIEDDL VLGICSPREE CKRIEVLDVV FVIDSSGSID YQEYNIMKDF MIGLVKKADV 
       850        860        870        880        890        900 
GKNQVRFGAL KYADDPEVLF YLDELGTKLE VVSVLQNDHP MGGNTYTAEA LAFSDHMFTE 
       910        920        930        940        950        960 
ARGSRLHKGV PQVLIVITDG ESHDAEKLNT TAKALRDKGI LVLAVGIAGA NSWELLAMAG 
       970        980        990       1000       1010       1020 
SSDKYYFVET FGGLKGIFSD VSASVCNSSK VDCEIEKVDL VFLMDGSNSI HPDDFQKMKG 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
FLVSVVQDFD VSLNRVRIGV AQFSDSYRSE FLLGTFTGER EISTQIEGIQ QIFGYTHIGD 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
ALRKVKYYFQ PDMGSRINAG TPQVLLVLTD GRSQDEVAQA AEELRHKGVD IYSVGIGDVD 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
DQELVQITGT AEKKLTVHNF DELKKVKKRI VRNICTSGGE SNCFVDVVVG FDISSLQRGQ 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
TLLEGQPWMG SYLQDLLRAI SSLNGVSCEV GTETQVSIAF QVTNAMERYP SKFEIYSENI 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
LSSLQGVTVN GPSRLNANLL SSLWDTFQNK SAARGKVVLL FSDGLDDGIE KLEQKSDELR 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
KEGLNALITI AVDGAADSSD LADLLYIEFG KGFEYRTQFT IGMRNLGSQL SRQLINVAER 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
TCCCLLCKCT GGDGAMGDPG SAGKKGPPGF KGSDGYLGEE GIAGERGASG PMGEQGTKGC 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
FGAKGPKGTR GLSGEEGEVG EDGLDGLDGE QGDHGIPGRR GEKGDEGSQG NPGRRGAAGD 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
RGAKGLRGDP GTPGRDSSIQ GPKGLKGDLG RQGRRGWPGS PGTPGSRRKM VVHGRRGHIG 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
PQGNPGTPGP DGLAGSPGLR GPQGPRGEVG EKGEKGSLGM KGPQGPPGPG GQAGSQGHLG 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
SQGNKGEPGD LGEKGAAGFP GPRGLQGDDG SPGYGSIGRK GTKGQEGFPG ESGLKGDIGD 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
PGDPGEAGPK GARGKTVSAG IPGEPGSPGE PGPPGRKGVK GARGLASFST CDLIQYVRDH 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
SPGRHGKPEC PVHPTELVFV LDQSRDVTEQ DFERMKGMMV SLVRDVKVRE ANCPVGARVA 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
ILAYNSHTRH LIRFSDAYRK DQLLTAIKAL PYERSSDSRE IGKAMRFISR NVFKRTLPGA 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
HVRRIATFFS SGPSADAQTI TTAAMEFSAL DIVPVVIAFS NVPSVKRAFS IDDTGTFQVI 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
VVPSGSDEGP ALERLQRCTF CYDLCKPDAS CDQAKPPPIQ SYLDTAFLLD GSRHVGSAEF 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
EDMRDFLEAL LDHFEITSEP ETSVTGDRVA LLSHAPLDFL PNTQRSPVRT EFNLTSYSSK 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
RLMKRHVDQA VQQLHGDAFL GHALGWALDN VFLNTPNLRR NKVIFVISAG ETSHLDAETL 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
KKESLRAKCH GYALFVFSLG PDWDDKELED LASHPVDQHL IQLGRIHKPD HGYSVKFVKS 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
FINSIRHGIN KYPPVNLKAK CNRLGSRDLK PPPRQFRSFV PGPQKANLKD HTAEAAKLFQ 
      2230       2240       2250       2260    
DKKRLSSMLK GGRATISSLS RSTRYAFKQG KEAIKATSKL GKRSA



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q8C6K9-1-unknown MLLVLC... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt71288
    Q8C6K9-19-unknown DSGPEY... 19 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q8C6K9-19-unknown DSGPEY... 19 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt112267

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...GKRSA 2265 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)