TopFIND 4.0

Q8CDN9: Leucine-rich repeat-containing protein 9

General Information

Protein names
- Leucine-rich repeat-containing protein 9
Gene names Lrrc9
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q8CDN9

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MIESENLNRG EIIKELCLCN GLTYEIVGQE GSDTSKLEMF FSGYPRIVGL SLFHNLSSLT 
        70         80         90        100        110        120 
IVAQDIREIS GLETCLQLKE LWIAECCIEK IEGLQGCRNL EKLYLYYNKI SKIENLEKLI 
       130        140        150        160        170        180 
KLEVLWLNHN MIKNIEGLQT LKNLKDLNLA GNLVSSIGRC LDPNEQLEKL NLSGNQITSF 
       190        200        210        220        230        240 
KDLTNLTKLT RLKDLCLNDP QYKSNPVCQL CNYSTHVLYH LPSLQRLDTF DVSAKQIKEL 
       250        260        270        280        290        300 
ADSTAMKKIM YYNMRIKTVQ RHLNEELEKL NDRKCKLQKL PEERIKLFNF AKKTLERELA 
       310        320        330        340        350        360 
ELKISSKGQS DTTPEAEKPR NSEVVTQESV LQQKILTKLS ALDDRVTFWN KKLHEIEAIY 
       370        380        390        400        410        420 
RTEVKQKKKT HGLLTPFLLT ELETVGNIHF EEGTQADDWF NSCCELILSR FCTWDFRAYG 
       430        440        450        460        470        480 
ITGVKVKRVI KVNNRILRLK FEEKFQKCLD LEDTQDPDYR KMLECLFYVF DPEVTVKKKH 
       490        500        510        520        530        540 
LLQILERGFK DSDTSKPSLK KEAVTLVNSL SMCECPRIEF LQQKYKEEKK GPSESELYRH 
       550        560        570        580        590        600 
GTILIAKVFL GQSIQARDQE PINKANYPMV NSVFVPQRHV LRQRTCDCGY RQYKWFVFDH 
       610        620        630        640        650        660 
DLVLPEYIVE FEYTTVVKVH SLFSTSNNVI LEEGKKYSEG LVFSQDLKFD DEVLKMEPRI 
       670        680        690        700        710        720 
KPRPKLISLD EKTIISLAKT NIYSHIVNLN LHGNSLSKLR DLAKLTGLRK LNISFNEFTC 
       730        740        750        760        770        780 
LDDVYHLYNL EYLDASHNHV ITLEGFRGLM KLKHLDLSWN QLKKTGEEIN VLCKHTTSLL 
       790        800        810        820        830        840 
TLDIQHNPWQ KPATLRLSVI GRLKTLTHLD GLVISEEETR AALKFISGTK ITQLTLLQHS 
       850        860        870        880        890        900 
SSKEERPRML STWPSAKILT QISKLGPHFH LTGNWYSKIT ALNLDGQHLF EITNLEKLEN 
       910        920        930        940        950        960 
LKWASFSNNN LSKMEGLESC VNLEELTLDG NCISKIEGIT RLTKLSRLSM NNNLLTGLEK 
       970        980        990       1000       1010       1020 
HTFDNLLHLH SLSLENNRIT SLSALQKTFT LIELYISNNY IAVNQEIYNL KGLCNLVILD 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
MYGNIIIWNQ ENYRFFVIFH LPELKALDGV SIETSETETA KDLFGGRLTS DMIAERQGHS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
NFIQMQELNW TSSAIRTVDL IPVDHFRNVS NVNLQNNNLT SFSGLIYLPN VKVLCLNYNH 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
IESIMPRLKP QTHLSSRQLL YQKVPSSGYG QQGTSKLNRD SVGSENLPPI MQSLEVLHLG 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
YNGICNLVQL QLNRLRNLKF LFLQGNEISQ VEGLDNLIVL QELVVDHNRI RAFNDTAFSK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
PSSLLMLHLE ENRLRELSKL QSLVKLEKLF LGYNKIQDIT ELEKLDVIPS LRELTVYGNP 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
ICRKMVHRHV LIFRLPNLQM LDGIPINSDD RAKAEFHFSE LQAKKSSIIQ NNLPTSKSSL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PSHLQTPLPC KFVPVTNSTD GGSFCHVKAS PIKITNVLLP AGFSRFLGPD FTLTPEVEGI 
      1450    
FTKSFRENEK TNKQQQ

Isoforms

- Isoform 2 of Leucine-rich repeat-containing protein 9

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MIESENLNRG EIIKELCLCN GLTYEIVGQE GSDTSKLEMF FSGYPRIVGL SLFHNLSSLT 
        70         80         90        100        110        120 
IVAQDIREIS GLETCLQLKE LWIAECCIEK IEGLQGCRNL EKLYLYYNKI SKIENLEKLI 
       130        140        150        160        170        180 
KLEVLWLNHN MIKNIEGLQT LKNLKDLNLA GNLVSSIGRC LDPNEQLEKL NLSGNQITSF 
       190        200        210        220        230        240 
KDLTNLTKLT RLKDLCLNDP QYKSNPVCQL CNYSTHVLYH LPSLQRLDTF DVSAKQIKEL 
       250        260        270        280        290        300 
ADSTAMKKIM YYNMRIKTVQ RHLNEELEKL NDRKCKLQKL PEERIKLFNF AKKTLERELA 
       310        320        330        340        350        360 
ELKISSKGQS DTTPEAEKPR NSEVVTQESV LQQKILTKLS ALDDRVTFWN KKLHEIEAIY 
       370        380        390        400        410        420 
RTEVKQKKKT HGLLTPFLLT ELETVGNIHF EEGTQADDWF NSCCELILSR FCTWDFRAYG 
       430        440        450        460        470        480 
ITGVKVKRVI KVNNRILRLK FEEKFQKCLD LEDTQDPDYR KMLECLFYVF DPEVTVKKKH 
       490        500        510        520        530        540 
LLQILERGFK DSDTSKPSLK KEAVTLVNSL SMCECPRIEF LQQKYKEEKK GPSESELYRH 
       550        560        570        580        590        600 
GTILIAKVFL GQSIQARDQE PINKANYPMV NSVFVPQRHV LRQRTCDCGY RQYKWFVFDH 
       610        620        630        640        650        660 
DLVLPEYIVE FEYTTVVKVH SLFSTSNNVI LEEGKKYSEG LVFSQDLKFD DEVLKMEPRI 
       670        680        690        700        710        720 
KPRPKLISLD EKTIISLAKT NIYSHIVNLN LHGNSLSKLR DLAKLTGLRK LNISFNEFTC 
       730        740        750        760        770        780 
LDDVYHLYNL EYLDASHNHV ITLEGFRGLM KLKHLDLSWN QLKKTGEEIN VLCKHTTSLL 
       790        800        810        820        830        840 
TLDIQHNPWQ KPATLRLSVI GRLKTLTHLD GLVISEEETR AALKFISGTK ITQLTLLQHS 
       850        860        870        880        890        900 
SSKEERPRML STWPSAKILT QISKLGPHFH LTGNWYSKIT ALNLDGQHLF EITNLEKLEN 
       910        920        930        940        950        960 
LKWASFSNNN LSKMEGLESC VNLEELTLDG NCISKIEGIT RLTKLSRLSM NNNLLTGLEK 
       970        980        990       1000       1010       1020 
HTFDNLLHLH SLSLENNRIT SLSALQKTFT LIELYISNNY IAVNQEIYNL KGLCNLVILD 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
MYGNIIIWNQ ENYRFFVIFH LPELKALDGV SIETSETETA KDLFGGRLTS DMIAERQGHS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
NFIQMQELNW TSSAIRTVDL IPVDHFRNVS NVNLQNNNLT SFSGLIYLPN VKVLCLNYNH 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
IESIMPRLKP QTHLSSRQLL YQKVPSSGYG QQGTSKLNRD SVGSENLPPI MQSLEVLHLG 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
YNGICNLVQL QLNRLRNLKF LFLQGNEISQ VEGLDNLIVL QELVVDHNRI RAFNDTAFSK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
PSSLLMLHLE ENRLRELSKL QSLVKLEKLF LGYNKIQDIT ELEKLDVIPS LRELTVYGNP 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
ICRKMVHRHV LIFRLPNLQM LDGIPINSDD RAKAEFHFSE LQAKKSSIIQ NNLPTSKSSL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
PSHLQTPLPC KFVPVTNSTD GGSFCHVKAS PIKITNVLLP AGFSRFLGPD FTLTPEVEGI 
      1450    
FTKSFRENEK TNKQQQ



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q8CDN9-1-unknown MIESEN... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q8CDN9-1-unknown MIESEN... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt79974

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...NKQQQ 1456 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)