TopFIND 4.0

Q8CF82: ATP-binding cassette sub-family A member 5

General Information

Protein names
- ATP-binding cassette sub-family A member 5
Gene names Abca5
Organism Rattus norvegicus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q8CF82

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MATAIRDVGV WRQTRTLLLK NYLVKCRTKK SSVQEILFPL FFLFWLILIS MMHPNKKYEE 
        70         80         90        100        110        120 
VSDIELSPMD KSILSNLILG YTPVTNTTSS VMQRVSTDHL PDVLVTEEYA SEKELLASSL 
       130        140        150        160        170        180 
SKPSNFVGVV FKDVMSYELR FFPDMVPVSS VYMDSRAGCS KSCDAAQYWS SGFTALQASI 
       190        200        210        220        230        240 
DAAIIQLKTN VSLWRELEST KAVIMGEAAV VEIDTFPRGV ILIYLVIAFS PFGYFLAIHI 
       250        260        270        280        290        300 
VAEKEKRLKE FLKIMGLHDT AFWLSWVLLY TSLIFLMSLL MAVIATASSL FPQSSSIVIF 
       310        320        330        340        350        360 
LLFFLYGLSS VFFALMLTPL FKKSKHVGVV EFFVTVVFGF VGLLIVLVES FPRSLVWLFS 
       370        380        390        400        410        420 
PLCQCAFLIG IAQVMHLEDF NEGALFSSLT EGPYPLIITL TMLALDSVFY ALLAVYLDQV 
       430        440        450        460        470        480 
IPGEFGLRRS SLYFLKPSYW SKNKRNYKEL SEGNINGNIS LNEIVEPVSS EFIGKEAIRI 
       490        500        510        520        530        540 
SGIQKAYRKK NETVEALRNL SFDIYEGQIT ALLGHSGTGK STLMNILCGL CPPSDGFASI 
       550        560        570        580        590        600 
YGHRVSEIDE MFEARKMIGI CPQSDMNFDV LTVEENLSIL ASVKGIPANN IIQEVQKVLL 
       610        620        630        640        650        660 
DLDMQAIKDN QAKKLSGGQK RKLSLGIAVL GNPKILLLDE PTAGMDPCSR HIVWNLLKYR 
       670        680        690        700        710        720 
KANRVTVFST HFMDEADILA DRKAVISQGM LKCVGSSIFL KSKWGIGYRL SMYIDRYCAT 
       730        740        750        760        770        780 
ESLSSLVRQH IPAAALLQQN DQQIVYSLPF KDMDKFSGLF SALDIHSNLG VISYGVSMTT 
       790        800        810        820        830        840 
LEDVFLKLEV EAEIDQADYS VFTQQPREEE TDSKSFDEME QSLLILSETK ASLVSTMSLW 
       850        860        870        880        890        900 
KQQVSTIAKF HFLSLKRESK SVRSVLLLLL IFFAVQIFMF LVHHSFKNAV VPIKLVPDLY 
       910        920        930        940        950        960 
FLKPGDKPHK YKTSLLLQNS TDSDINDLID FFTQQNIIVA MFNDSDYVSA APHSAALNVV 
       970        980        990       1000       1010       1020 
QSEKDYVFTA VFNSTMVYSL PVMMNIISNY YLYHLNVTDT IQIWSTPFIQ EITDIVFKVE 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LYFQAALLGI IVTAMPPYFA MENAENHKIK AYTQLKLSGL LPSAYWIGQA VVDIPLFFVV 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
LTLMLGSLFA FHHGLYFYPV KFLAVVFCLI AYVPSVILFT YIASFTFKKI LNTKEFWSFI 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
YSVTALACVA VTEITFFLGY GVTAVFHYTF CIAIPIYPLL GCLISFIKGS WKNIPKTENA 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
YNPWDRLLVA VIMPYLQCVL WIFLLQHYEK KHGGRSIRKD PLFRALSQKA KHKKFPEPPI 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
NEDEDEDVKA ERLKVKELMG CQCCEEKPAI MVYNLHKEYD DKKDFLHSRK TTKVATKYVS 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
FCVKKGEILG LLGPNGAGKS TIINILVGDV EPTSGKIFLG DYGSHSNEDD ESTKCMGYCP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
QTNPLWPDIT LQEHFEIYGA VKGMSSGDMK EVISRITKAL DLKEHLQKTV KKLPAGIKRK 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
LCFALSMLGN PQVTLLDEPS TGMDPRAKQH MWRAIRTAFK NKKRAALLTT HYMEEAEAVC 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
DRVAIMVSGQ LRCIGTVQHL KSKFGKGYFL EIKLKDWIEN LEIDRLQREI QYIFPNASRQ 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
ESFSSILAYK IPKEDVQSLS QSFAKLEEAK HTFAIEEYSF SQATLEQVFV ELTKEQEEED 
      1630       1640    
NSCGTLNSTL WWERRQEDRV VF

Isoforms

- Isoform 2 of ATP-binding cassette sub-family A member 5

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MATAIRDVGV WRQTRTLLLK NYLVKCRTKK SSVQEILFPL FFLFWLILIS MMHPNKKYEE 
        70         80         90        100        110        120 
VSDIELSPMD KSILSNLILG YTPVTNTTSS VMQRVSTDHL PDVLVTEEYA SEKELLASSL 
       130        140        150        160        170        180 
SKPSNFVGVV FKDVMSYELR FFPDMVPVSS VYMDSRAGCS KSCDAAQYWS SGFTALQASI 
       190        200        210        220        230        240 
DAAIIQLKTN VSLWRELEST KAVIMGEAAV VEIDTFPRGV ILIYLVIAFS PFGYFLAIHI 
       250        260        270        280        290        300 
VAEKEKRLKE FLKIMGLHDT AFWLSWVLLY TSLIFLMSLL MAVIATASSL FPQSSSIVIF 
       310        320        330        340        350        360 
LLFFLYGLSS VFFALMLTPL FKKSKHVGVV EFFVTVVFGF VGLLIVLVES FPRSLVWLFS 
       370        380        390        400        410        420 
PLCQCAFLIG IAQVMHLEDF NEGALFSSLT EGPYPLIITL TMLALDSVFY ALLAVYLDQV 
       430        440        450        460        470        480 
IPGEFGLRRS SLYFLKPSYW SKNKRNYKEL SEGNINGNIS LNEIVEPVSS EFIGKEAIRI 
       490        500        510        520        530        540 
SGIQKAYRKK NETVEALRNL SFDIYEGQIT ALLGHSGTGK STLMNILCGL CPPSDGFASI 
       550        560        570        580        590        600 
YGHRVSEIDE MFEARKMIGI CPQSDMNFDV LTVEENLSIL ASVKGIPANN IIQEVQKVLL 
       610        620        630        640        650        660 
DLDMQAIKDN QAKKLSGGQK RKLSLGIAVL GNPKILLLDE PTAGMDPCSR HIVWNLLKYR 
       670        680        690        700        710        720 
KANRVTVFST HFMDEADILA DRKAVISQGM LKCVGSSIFL KSKWGIGYRL SMYIDRYCAT 
       730        740        750        760        770        780 
ESLSSLVRQH IPAAALLQQN DQQIVYSLPF KDMDKFSGLF SALDIHSNLG VISYGVSMTT 
       790        800        810        820        830        840 
LEDVFLKLEV EAEIDQADYS VFTQQPREEE TDSKSFDEME QSLLILSETK ASLVSTMSLW 
       850        860        870        880        890        900 
KQQVSTIAKF HFLSLKRESK SVRSVLLLLL IFFAVQIFMF LVHHSFKNAV VPIKLVPDLY 
       910        920        930        940        950        960 
FLKPGDKPHK YKTSLLLQNS TDSDINDLID FFTQQNIIVA MFNDSDYVSA APHSAALNVV 
       970        980        990       1000       1010       1020 
QSEKDYVFTA VFNSTMVYSL PVMMNIISNY YLYHLNVTDT IQIWSTPFIQ EITDIVFKVE 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LYFQAALLGI IVTAMPPYFA MENAENHKIK AYTQLKLSGL LPSAYWIGQA VVDIPLFFVV 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
LTLMLGSLFA FHHGLYFYPV KFLAVVFCLI AYVPSVILFT YIASFTFKKI LNTKEFWSFI 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
YSVTALACVA VTEITFFLGY GVTAVFHYTF CIAIPIYPLL GCLISFIKGS WKNIPKTENA 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
YNPWDRLLVA VIMPYLQCVL WIFLLQHYEK KHGGRSIRKD PLFRALSQKA KHKKFPEPPI 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
NEDEDEDVKA ERLKVKELMG CQCCEEKPAI MVYNLHKEYD DKKDFLHSRK TTKVATKYVS 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
FCVKKGEILG LLGPNGAGKS TIINILVGDV EPTSGKIFLG DYGSHSNEDD ESTKCMGYCP 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
QTNPLWPDIT LQEHFEIYGA VKGMSSGDMK EVISRITKAL DLKEHLQKTV KKLPAGIKRK 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
LCFALSMLGN PQVTLLDEPS TGMDPRAKQH MWRAIRTAFK NKKRAALLTT HYMEEAEAVC 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
DRVAIMVSGQ LRCIGTVQHL KSKFGKGYFL EIKLKDWIEN LEIDRLQREI QYIFPNASRQ 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
ESFSSILAYK IPKEDVQSLS QSFAKLEEAK HTFAIEEYSF SQATLEQVFV ELTKEQEEED 
      1630       1640    
NSCGTLNSTL WWERRQEDRV VF



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q8CF82-1-unknown MATAIR... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q8CF82-1-unknown MATAIR... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt192193

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...DRVVF 1642 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)