TopFIND 4.0

Q8IYD8: Fanconi anemia group M protein

General Information

Protein names
- Fanconi anemia group M protein
- Protein FACM
- 3.6.4.13 {ECO:0000269|PubMed:16116422, ECO:0000269|PubMed:17289582, ECO:0000269|PubMed:19423727, ECO:0000269|PubMed:20347429}
- ATP-dependent RNA helicase FANCM
- Fanconi anemia-associated polypeptide of 250 kDa
- FAAP250 {ECO:0000303|PubMed:16116422}
- Protein Hef ortholog {ECO:0000303|PubMed:16116422, ECO:0000303|PubMed:16116434}
Gene names FANCM
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q8IYD8

3

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MSGRQRTLFQ TWGSSISRSS GTPGCSSGTE RPQSPGSSKA PLPAAAEAQL ESDDDVLLVA 
        70         80         90        100        110        120 
AYEAERQLCL ENGGFCTSAG ALWIYPTNCP VRDYQLHISR AALFCNTLVC LPTGLGKTFI 
       130        140        150        160        170        180 
AAVVMYNFYR WFPSGKVVFM APTKPLVTQQ IEACYQVMGI PQSHMAEMTG STQASTRKEI 
       190        200        210        220        230        240 
WCSKRVLFLT PQVMVNDLSR GACPAAEIKC LVIDEAHKAL GNYAYCQVVR ELVKYTNHFR 
       250        260        270        280        290        300 
ILALSATPGS DIKAVQQVIT NLLIGQIELR SEDSPDILTY SHERKVEKLI VPLGEELAAI 
       310        320        330        340        350        360 
QKTYIQILES FARSLIQRNV LMRRDIPNLT KYQIILARDQ FRKNPSPNIV GIQQGIIEGE 
       370        380        390        400        410        420 
FAICISLYHG YELLQQMGMR SLYFFLCGIM DGTKGMTRSK NELGRNEDFM KLYNHLECMF 
       430        440        450        460        470        480 
ARTRSTSANG ISAIQQGDKN KKFVYSHPKL KKLEEVVIEH FKSWNAENTT EKKRDETRVM 
       490        500        510        520        530        540 
IFSSFRDSVQ EIAEMLSQHQ PIIRVMTFVG HASGKSTKGF TQKEQLEVVK QFRDGGYNTL 
       550        560        570        580        590        600 
VSTCVGEEGL DIGEVDLIIC FDSQKSPIRL VQRMGRTGRK RQGRIVIILS EGREERIYNQ 
       610        620        630        640        650        660 
SQSNKRSIYK AISSNRQVLH FYQRSPRMVP DGINPKLHKM FITHGVYEPE KPSRNLQRKS 
       670        680        690        700        710        720 
SIFSYRDGMR QSSLKKDWFL SEEEFKLWNR LYRLRDSDEI KEITLPQVQF SSLQNEENKP 
       730        740        750        760        770        780 
AQESTTGIHQ LSLSEWRLWQ DHPLPTHQVD HSDRCRHFIG LMQMIEGMRH EEGECSYELE 
       790        800        810        820        830        840 
VESYLQMEDV TSTFIAPRNE SNNLASDTFI THKKSSFIKN INQGSSSSVI ESDEECAEIV 
       850        860        870        880        890        900 
KQTHIKPTKI VSLKKKVSKE IKKDQLKKEN NHGIIDSVDN DRNSTVENIF QEDLPNDKRT 
       910        920        930        940        950        960 
SDTDEIAATC TINENVIKEP CVLLTECQFT NKSTSSLAGN VLDSGYNSFN DEKSVSSNLF 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LPFEEELYIV RTDDQFYNCH SLTKEVLANV ERFLSYSPPP LSGLSDLEYE IAKGTALENL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LFLPCAEHLR SDKCTCLLSH SAVNSQQNLE LNSLKCINYP SEKSCLYDIP NDNISDEPSL 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
CDCDVHKHNQ NENLVPNNRV QIHRSPAQNL VGENNHDVDN SDLPVLSTDQ DESLLLFEDV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
NTEFDDVSLS PLNSKSESLP VSDKTAISET PLVSQFLISD ELLLDNNSEL QDQITRDANS 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
FKSRDQRGVQ EEKVKNHEDI FDCSRDLFSV TFDLGFCSPD SDDEILEHTS DSNRPLDDLY 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GRYLEIKEIS DANYVSNQAL IPRDHSKNFT SGTVIIPSNE DMQNPNYVHL PLSAAKNEEL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
LSPGYSQFSL PVQKKVMSTP LSKSNTLNSF SKIRKEILKT PDSSKEKVNL QRFKEALNST 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
FDYSEFSLEK SKSSGPMYLH KSCHSVEDGQ LLTSNESEDD EIFRRKVKRA KGNVLNSPED 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QKNSEVDSPL HAVKKRRFPI NRSELSSSDE SENFPKPCSQ LEDFKVCNGN ARRGIKVPKR 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
QSHLKHVARK FLDDEAELSE EDAEYVSSDE NDESENEQDS SLLDFLNDET QLSQAINDSE 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
MRAIYMKSLR SPMMNNKYKM IHKTHKNINI FSQIPEQDET YLEDSFCVDE EESCKGQSSE 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
EEVCVDFNLI TDDCFANSKK YKTRRAVMLK EMMEQNCAHS KKKLSRIILP DDSSEEENNV 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
NDKRESNIAV NPSTVKKNKQ QDHCLNSVPS GSSAQSKVRS TPRVNPLAKQ SKQTSLNLKD 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
TISEVSDFKP QNHNEVQSTT PPFTTVDSQK DCRKFPVPQK DGSALEDSST SGASCSKSRP 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
HLAGTHTSLR LPQEGKGTCI LVGGHEITSG LEVISSLRAI HGLQVEVCPL NGCDYIVSNR 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
MVVERRSQSE MLNSVNKNKF IEQIQHLQSM FERICVIVEK DREKTGDTSR MFRRTKSYDS 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
LLTTLIGAGI RILFSSCQEE TADLLKELSL VEQRKNVGIH VPTVVNSNKS EALQFYLSIP 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
NISYITALNM CHQFSSVKRM ANSSLQEISM YAQVTHQKAE EIYRYIHYVF DIQMLPNDLN 
   
QDRLKSDI

Isoforms

- Isoform 2 of Fanconi anemia group M protein - Isoform 3 of Fanconi anemia group M protein

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MSGRQRTLFQ TWGSSISRSS GTPGCSSGTE RPQSPGSSKA PLPAAAEAQL ESDDDVLLVA 
        70         80         90        100        110        120 
AYEAERQLCL ENGGFCTSAG ALWIYPTNCP VRDYQLHISR AALFCNTLVC LPTGLGKTFI 
       130        140        150        160        170        180 
AAVVMYNFYR WFPSGKVVFM APTKPLVTQQ IEACYQVMGI PQSHMAEMTG STQASTRKEI 
       190        200        210        220        230        240 
WCSKRVLFLT PQVMVNDLSR GACPAAEIKC LVIDEAHKAL GNYAYCQVVR ELVKYTNHFR 
       250        260        270        280        290        300 
ILALSATPGS DIKAVQQVIT NLLIGQIELR SEDSPDILTY SHERKVEKLI VPLGEELAAI 
       310        320        330        340        350        360 
QKTYIQILES FARSLIQRNV LMRRDIPNLT KYQIILARDQ FRKNPSPNIV GIQQGIIEGE 
       370        380        390        400        410        420 
FAICISLYHG YELLQQMGMR SLYFFLCGIM DGTKGMTRSK NELGRNEDFM KLYNHLECMF 
       430        440        450        460        470        480 
ARTRSTSANG ISAIQQGDKN KKFVYSHPKL KKLEEVVIEH FKSWNAENTT EKKRDETRVM 
       490        500        510        520        530        540 
IFSSFRDSVQ EIAEMLSQHQ PIIRVMTFVG HASGKSTKGF TQKEQLEVVK QFRDGGYNTL 
       550        560        570        580        590        600 
VSTCVGEEGL DIGEVDLIIC FDSQKSPIRL VQRMGRTGRK RQGRIVIILS EGREERIYNQ 
       610        620        630        640        650        660 
SQSNKRSIYK AISSNRQVLH FYQRSPRMVP DGINPKLHKM FITHGVYEPE KPSRNLQRKS 
       670        680        690        700        710        720 
SIFSYRDGMR QSSLKKDWFL SEEEFKLWNR LYRLRDSDEI KEITLPQVQF SSLQNEENKP 
       730        740        750        760        770        780 
AQESTTGIHQ LSLSEWRLWQ DHPLPTHQVD HSDRCRHFIG LMQMIEGMRH EEGECSYELE 
       790        800        810        820        830        840 
VESYLQMEDV TSTFIAPRNE SNNLASDTFI THKKSSFIKN INQGSSSSVI ESDEECAEIV 
       850        860        870        880        890        900 
KQTHIKPTKI VSLKKKVSKE IKKDQLKKEN NHGIIDSVDN DRNSTVENIF QEDLPNDKRT 
       910        920        930        940        950        960 
SDTDEIAATC TINENVIKEP CVLLTECQFT NKSTSSLAGN VLDSGYNSFN DEKSVSSNLF 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LPFEEELYIV RTDDQFYNCH SLTKEVLANV ERFLSYSPPP LSGLSDLEYE IAKGTALENL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LFLPCAEHLR SDKCTCLLSH SAVNSQQNLE LNSLKCINYP SEKSCLYDIP NDNISDEPSL 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
CDCDVHKHNQ NENLVPNNRV QIHRSPAQNL VGENNHDVDN SDLPVLSTDQ DESLLLFEDV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
NTEFDDVSLS PLNSKSESLP VSDKTAISET PLVSQFLISD ELLLDNNSEL QDQITRDANS 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
FKSRDQRGVQ EEKVKNHEDI FDCSRDLFSV TFDLGFCSPD SDDEILEHTS DSNRPLDDLY 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GRYLEIKEIS DANYVSNQAL IPRDHSKNFT SGTVIIPSNE DMQNPNYVHL PLSAAKNEEL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
LSPGYSQFSL PVQKKVMSTP LSKSNTLNSF SKIRKEILKT PDSSKEKVNL QRFKEALNST 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
FDYSEFSLEK SKSSGPMYLH KSCHSVEDGQ LLTSNESEDD EIFRRKVKRA KGNVLNSPED 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QKNSEVDSPL HAVKKRRFPI NRSELSSSDE SENFPKPCSQ LEDFKVCNGN ARRGIKVPKR 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
QSHLKHVARK FLDDEAELSE EDAEYVSSDE NDESENEQDS SLLDFLNDET QLSQAINDSE 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
MRAIYMKSLR SPMMNNKYKM IHKTHKNINI FSQIPEQDET YLEDSFCVDE EESCKGQSSE 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
EEVCVDFNLI TDDCFANSKK YKTRRAVMLK EMMEQNCAHS KKKLSRIILP DDSSEEENNV 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
NDKRESNIAV NPSTVKKNKQ QDHCLNSVPS GSSAQSKVRS TPRVNPLAKQ SKQTSLNLKD 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
TISEVSDFKP QNHNEVQSTT PPFTTVDSQK DCRKFPVPQK DGSALEDSST SGASCSKSRP 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
HLAGTHTSLR LPQEGKGTCI LVGGHEITSG LEVISSLRAI HGLQVEVCPL NGCDYIVSNR 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
MVVERRSQSE MLNSVNKNKF IEQIQHLQSM FERICVIVEK DREKTGDTSR MFRRTKSYDS 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
LLTTLIGAGI RILFSSCQEE TADLLKELSL VEQRKNVGIH VPTVVNSNKS EALQFYLSIP 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
NISYITALNM CHQFSSVKRM ANSSLQEISM YAQVTHQKAE EIYRYIHYVF DIQMLPNDLN 
   
QDRLKSDI         10         20         30         40         50         60 
MSGRQRTLFQ TWGSSISRSS GTPGCSSGTE RPQSPGSSKA PLPAAAEAQL ESDDDVLLVA 
        70         80         90        100        110        120 
AYEAERQLCL ENGGFCTSAG ALWIYPTNCP VRDYQLHISR AALFCNTLVC LPTGLGKTFI 
       130        140        150        160        170        180 
AAVVMYNFYR WFPSGKVVFM APTKPLVTQQ IEACYQVMGI PQSHMAEMTG STQASTRKEI 
       190        200        210        220        230        240 
WCSKRVLFLT PQVMVNDLSR GACPAAEIKC LVIDEAHKAL GNYAYCQVVR ELVKYTNHFR 
       250        260        270        280        290        300 
ILALSATPGS DIKAVQQVIT NLLIGQIELR SEDSPDILTY SHERKVEKLI VPLGEELAAI 
       310        320        330        340        350        360 
QKTYIQILES FARSLIQRNV LMRRDIPNLT KYQIILARDQ FRKNPSPNIV GIQQGIIEGE 
       370        380        390        400        410        420 
FAICISLYHG YELLQQMGMR SLYFFLCGIM DGTKGMTRSK NELGRNEDFM KLYNHLECMF 
       430        440        450        460        470        480 
ARTRSTSANG ISAIQQGDKN KKFVYSHPKL KKLEEVVIEH FKSWNAENTT EKKRDETRVM 
       490        500        510        520        530        540 
IFSSFRDSVQ EIAEMLSQHQ PIIRVMTFVG HASGKSTKGF TQKEQLEVVK QFRDGGYNTL 
       550        560        570        580        590        600 
VSTCVGEEGL DIGEVDLIIC FDSQKSPIRL VQRMGRTGRK RQGRIVIILS EGREERIYNQ 
       610        620        630        640        650        660 
SQSNKRSIYK AISSNRQVLH FYQRSPRMVP DGINPKLHKM FITHGVYEPE KPSRNLQRKS 
       670        680        690        700        710        720 
SIFSYRDGMR QSSLKKDWFL SEEEFKLWNR LYRLRDSDEI KEITLPQVQF SSLQNEENKP 
       730        740        750        760        770        780 
AQESTTGIHQ LSLSEWRLWQ DHPLPTHQVD HSDRCRHFIG LMQMIEGMRH EEGECSYELE 
       790        800        810        820        830        840 
VESYLQMEDV TSTFIAPRNE SNNLASDTFI THKKSSFIKN INQGSSSSVI ESDEECAEIV 
       850        860        870        880        890        900 
KQTHIKPTKI VSLKKKVSKE IKKDQLKKEN NHGIIDSVDN DRNSTVENIF QEDLPNDKRT 
       910        920        930        940        950        960 
SDTDEIAATC TINENVIKEP CVLLTECQFT NKSTSSLAGN VLDSGYNSFN DEKSVSSNLF 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LPFEEELYIV RTDDQFYNCH SLTKEVLANV ERFLSYSPPP LSGLSDLEYE IAKGTALENL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LFLPCAEHLR SDKCTCLLSH SAVNSQQNLE LNSLKCINYP SEKSCLYDIP NDNISDEPSL 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
CDCDVHKHNQ NENLVPNNRV QIHRSPAQNL VGENNHDVDN SDLPVLSTDQ DESLLLFEDV 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
NTEFDDVSLS PLNSKSESLP VSDKTAISET PLVSQFLISD ELLLDNNSEL QDQITRDANS 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
FKSRDQRGVQ EEKVKNHEDI FDCSRDLFSV TFDLGFCSPD SDDEILEHTS DSNRPLDDLY 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
GRYLEIKEIS DANYVSNQAL IPRDHSKNFT SGTVIIPSNE DMQNPNYVHL PLSAAKNEEL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
LSPGYSQFSL PVQKKVMSTP LSKSNTLNSF SKIRKEILKT PDSSKEKVNL QRFKEALNST 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
FDYSEFSLEK SKSSGPMYLH KSCHSVEDGQ LLTSNESEDD EIFRRKVKRA KGNVLNSPED 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QKNSEVDSPL HAVKKRRFPI NRSELSSSDE SENFPKPCSQ LEDFKVCNGN ARRGIKVPKR 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
QSHLKHVARK FLDDEAELSE EDAEYVSSDE NDESENEQDS SLLDFLNDET QLSQAINDSE 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
MRAIYMKSLR SPMMNNKYKM IHKTHKNINI FSQIPEQDET YLEDSFCVDE EESCKGQSSE 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
EEVCVDFNLI TDDCFANSKK YKTRRAVMLK EMMEQNCAHS KKKLSRIILP DDSSEEENNV 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
NDKRESNIAV NPSTVKKNKQ QDHCLNSVPS GSSAQSKVRS TPRVNPLAKQ SKQTSLNLKD 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
TISEVSDFKP QNHNEVQSTT PPFTTVDSQK DCRKFPVPQK DGSALEDSST SGASCSKSRP 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
HLAGTHTSLR LPQEGKGTCI LVGGHEITSG LEVISSLRAI HGLQVEVCPL NGCDYIVSNR 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
MVVERRSQSE MLNSVNKNKF IEQIQHLQSM FERICVIVEK DREKTGDTSR MFRRTKSYDS 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
LLTTLIGAGI RILFSSCQEE TADLLKELSL VEQRKNVGIH VPTVVNSNKS EALQFYLSIP 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
NISYITALNM CHQFSSVKRM ANSSLQEISM YAQVTHQKAE EIYRYIHYVF DIQMLPNDLN 
   
QDRLKSDI



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

3 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...LKSDI 2048 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...LKSDI 2048 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt70400

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)