TopFIND 4.0

Q8K440: ATP-binding cassette sub-family A member 8-B

General Information

Protein names
- ATP-binding cassette sub-family A member 8-B
Gene names Abca8b
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q8K440

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MIKREISVRQ QTCALLQKNL LKKWRLKRES LMEWVSSLLL LLFLYWYPHG HGATDLSSVP 
        70         80         90        100        110        120 
TKDLGRVDSF RQSGFMIGYT PVTSMTQQIM EKVAATPFMA DKKVLGLLDE ENIKELTESH 
       130        140        150        160        170        180 
AEIIRVIFSD TFSYHLKFQF DQRIPTSREL RDHNAHCDGL YEDVNCLIAI FWKEGFVALQ 
       190        200        210        220        230        240 
AAINAAIIET TTNHSVMEEL LSVSGKFMKI HPFVRQEGIL TDFFIFTCII SFSPITYYVS 
       250        260        270        280        290        300 
INVARERKRM KGLMMMMGLR DPAFWLSWGL LYAGFVFIMA LSLALVIKSV QFFILTSFMV 
       310        320        330        340        350        360 
VFSLFLLYGL SMITLAFLMS ALVRKSVLTG LSVFLLTIFW GSLGFTSLYR YLPAPVEWTL 
       370        380        390        400        410        420 
SLFSPFAFTL GMAQLLRVDY DLNSNAPPDP ASGSNLIIAT NFMLVFDAFL YLALMMYFEK 
       430        440        450        460        470        480 
VLPNEYGHQH SPLFFLKSSF WLQTRKPAHV ILEDGIDPVP SSGDSFEPVS PEFHGKESIR 
       490        500        510        520        530        540 
IRNISKEYKG KPNKIEALKD LTLDIYEGQI TAVLGHSGAG KSTLLNILSG LSVPTKGSVT 
       550        560        570        580        590        600 
IYNNNLSEMA DLENILRIAG VCPQANVQFD FLTVRENLRL FAKIRGIPPQ DVEKEVQRVL 
       610        620        630        640        650        660 
LELEMKNIQN ILAQNLSGGQ KRKLTFGIAI LGDSQIFLLD EPTAGLDPFS RHRVWNLLKE 
       670        680        690        700        710        720 
RRADRVVLFS TQFMDEADIL ADRKVFISNG RLKCAGSSLF LKKKWGVGYH LSLQLKEVCV 
       730        740        750        760        770        780 
PENITSLVKQ HIPAAKLSAE GEGKLLYTLP LETTYRFPEL CQSLDSCPGL GIENYGVSMT 
       790        800        810        820        830        840 
TLNEVFLKLE GKASIDEPEV DIVGEGQTER SGDTERLMEM EQTLSSLRET EKTDGMALWR 
       850        860        870        880        890        900 
QQTCAIAKVR LLKLKHERKT LLSVLLILVV GICPFLFENI STKIRQSSYT WELSPHDYFL 
       910        920        930        940        950        960 
APGQQPQGML TQLLIINKTE ASIDDFIHSV ERQNIALEVD ASGTRDGTDD PSYNGALIVS 
       970        980        990       1000       1010       1020 
GNEKNHSFSF ACNTKRLNCF PVLMDILSNG LLGMVKPSAR IQTDRSTYLM DETIHPLEDL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
WKTAFWLILT SACPPYIAMS SVTDYKNRAW FQLRVSGLFP SAYWVGQAMV DIPLYCFVFL 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
FMSLMDYLFR FPDTMFSIIS HVIQIPCSVG YAISLIFLTY VISFISRKGK KNSGIWSLSF 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
YIITVFSVAV ILLAFDVDGT QYYIIFLIPP STLVGCLILS LHLFIGQIFE EGQVIEPFLV 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
FLIPFLHVFI FIFTLRCLEW KFGKKTMRKD PIFRISPRNN DVYQNPEEPE DEDEDVQMER 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
MRTANALVST SFDEKPVIIA SCLRKEYAGK QKHCLSKKKA KIATRNVSFC VRKGEILGLL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
GHNGAGKSTS LKMISGDTKV TAGQVLLKGS REGDTPGFLG YCPQENALWP NLTVKEHLEI 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
FAAVRGLRKS HAAVAITRLA DALKLQDQLK SPVKTLSEGV KRKLCFVLSI LGNPSILLLD 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
EPSTGLDPEG QQQIWQAIRA IIKNTDRGAL LTTHYMAEAE ALCDRVAILV SGRLRCIGSI 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
QHLKSKFGKD YLLEMKVKTL EQVEPLNTEI LRLFPQASRQ ERYSSLMAYK LPVEAVQPLS 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
QAFFKLEKVK QTFDLEEYSL SQSTLEQVFL ELSKEQELDG LELEELDSSI KWKLLPQEEA 
   

Isoforms

- Isoform 2 of ATP-binding cassette sub-family A member 8-B

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MIKREISVRQ QTCALLQKNL LKKWRLKRES LMEWVSSLLL LLFLYWYPHG HGATDLSSVP 
        70         80         90        100        110        120 
TKDLGRVDSF RQSGFMIGYT PVTSMTQQIM EKVAATPFMA DKKVLGLLDE ENIKELTESH 
       130        140        150        160        170        180 
AEIIRVIFSD TFSYHLKFQF DQRIPTSREL RDHNAHCDGL YEDVNCLIAI FWKEGFVALQ 
       190        200        210        220        230        240 
AAINAAIIET TTNHSVMEEL LSVSGKFMKI HPFVRQEGIL TDFFIFTCII SFSPITYYVS 
       250        260        270        280        290        300 
INVARERKRM KGLMMMMGLR DPAFWLSWGL LYAGFVFIMA LSLALVIKSV QFFILTSFMV 
       310        320        330        340        350        360 
VFSLFLLYGL SMITLAFLMS ALVRKSVLTG LSVFLLTIFW GSLGFTSLYR YLPAPVEWTL 
       370        380        390        400        410        420 
SLFSPFAFTL GMAQLLRVDY DLNSNAPPDP ASGSNLIIAT NFMLVFDAFL YLALMMYFEK 
       430        440        450        460        470        480 
VLPNEYGHQH SPLFFLKSSF WLQTRKPAHV ILEDGIDPVP SSGDSFEPVS PEFHGKESIR 
       490        500        510        520        530        540 
IRNISKEYKG KPNKIEALKD LTLDIYEGQI TAVLGHSGAG KSTLLNILSG LSVPTKGSVT 
       550        560        570        580        590        600 
IYNNNLSEMA DLENILRIAG VCPQANVQFD FLTVRENLRL FAKIRGIPPQ DVEKEVQRVL 
       610        620        630        640        650        660 
LELEMKNIQN ILAQNLSGGQ KRKLTFGIAI LGDSQIFLLD EPTAGLDPFS RHRVWNLLKE 
       670        680        690        700        710        720 
RRADRVVLFS TQFMDEADIL ADRKVFISNG RLKCAGSSLF LKKKWGVGYH LSLQLKEVCV 
       730        740        750        760        770        780 
PENITSLVKQ HIPAAKLSAE GEGKLLYTLP LETTYRFPEL CQSLDSCPGL GIENYGVSMT 
       790        800        810        820        830        840 
TLNEVFLKLE GKASIDEPEV DIVGEGQTER SGDTERLMEM EQTLSSLRET EKTDGMALWR 
       850        860        870        880        890        900 
QQTCAIAKVR LLKLKHERKT LLSVLLILVV GICPFLFENI STKIRQSSYT WELSPHDYFL 
       910        920        930        940        950        960 
APGQQPQGML TQLLIINKTE ASIDDFIHSV ERQNIALEVD ASGTRDGTDD PSYNGALIVS 
       970        980        990       1000       1010       1020 
GNEKNHSFSF ACNTKRLNCF PVLMDILSNG LLGMVKPSAR IQTDRSTYLM DETIHPLEDL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
WKTAFWLILT SACPPYIAMS SVTDYKNRAW FQLRVSGLFP SAYWVGQAMV DIPLYCFVFL 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
FMSLMDYLFR FPDTMFSIIS HVIQIPCSVG YAISLIFLTY VISFISRKGK KNSGIWSLSF 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
YIITVFSVAV ILLAFDVDGT QYYIIFLIPP STLVGCLILS LHLFIGQIFE EGQVIEPFLV 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
FLIPFLHVFI FIFTLRCLEW KFGKKTMRKD PIFRISPRNN DVYQNPEEPE DEDEDVQMER 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
MRTANALVST SFDEKPVIIA SCLRKEYAGK QKHCLSKKKA KIATRNVSFC VRKGEILGLL 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
GHNGAGKSTS LKMISGDTKV TAGQVLLKGS REGDTPGFLG YCPQENALWP NLTVKEHLEI 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
FAAVRGLRKS HAAVAITRLA DALKLQDQLK SPVKTLSEGV KRKLCFVLSI LGNPSILLLD 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
EPSTGLDPEG QQQIWQAIRA IIKNTDRGAL LTTHYMAEAE ALCDRVAILV SGRLRCIGSI 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
QHLKSKFGKD YLLEMKVKTL EQVEPLNTEI LRLFPQASRQ ERYSSLMAYK LPVEAVQPLS 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
QAFFKLEKVK QTFDLEEYSL SQSTLEQVFL ELSKEQELDG LELEELDSSI KWKLLPQEEA 
   



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q8K440-1-unknown MIKREI... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q8K440-1-unknown MIKREI... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt65935

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...PQEEA 1620 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...PQEEA 1620 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt61553

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)