TopFIND 4.0

Q8K441: ATP-binding cassette sub-family A member 6

General Information

Protein names
- ATP-binding cassette sub-family A member 6
Gene names Abca6
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q8K441

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MKELSVHVRQ QTRALLHKIL LKKWRRKRES LLEWSIPIII GLHMGLFSYL ARNIQVLEVP 
        70         80         90        100        110        120 
PQDLGSLNEF NGSSLVVVYT PISNITQQIM NKTTFAPTMK GTRIIGVPSI EDLDEVLLHN 
       130        140        150        160        170        180 
IPDALGVIFN DSFSYQLKVL RMYGNPFLKE DLLAHCWDTH SQAFCSLSKY WERGFVALQT 
       190        200        210        220        230        240 
AINAGIIEVT TNHSVMEELM SIDGINMKTL PFIPRDLSDY EIFILFCLLY FSSFIYFASS 
       250        260        270        280        290        300 
NVTKERKQCK EVMKVMGLQD SAFWLSWGLI YVGFIFIISI FIAIIITSTQ IIMMTGFLVI 
       310        320        330        340        350        360 
FTLFFLYGLS LIAVTFLMAV LLQKAVLTNL IVLFFTLFWG CVGFTVLHKE LPPSLEWVLS 
       370        380        390        400        410        420 
IFSPFAFTSG MAKVIFQDYN LNGVVFPDPS GESYVMIAVF FILAFDSLLY LVLALYFDKI 
       430        440        450        460        470        480 
LLYGAEHRSA PLFFLNPTSC FRKTANRNKV IERDLDPELP SDEYFEPVDP EYQGKEAIRI 
       490        500        510        520        530        540 
RNIKKEYKGK SGKVKALKGL FLDIYESQIT AILGHSGAGK SSLLNILSGL YVPTAGSVTV 
       550        560        570        580        590        600 
YNKNLSDMQD LKEIRKAIGV CPQHNVQFDA LTVKENLTLF AKIKGILPQD VEQEVQQILS 
       610        620        630        640        650        660 
ELDMQNIRDD LAEHLSEGQK RKLTFGIATV GDPQILLLDE PTVGLDPFSR QRIWGFLKER 
       670        680        690        700        710        720 
RADHVILFST QFMDEADILA DRKVLIANGA LKCTGSSVFL KRKWGLGYHL SLFMDETCDS 
       730        740        750        760        770        780 
ERLTSFINHH IPYAKLKAKT KEKLVYILPL ERTSEFPEFF SDLDKYSGQG LMSYEVSMST 
       790        800        810        820        830        840 
LNDVFLNLEG EPSTKQDFEK RETATDSESL NDMEVAYPSL SQVQETVSTM SLWRMQVCAI 
       850        860        870        880        890        900 
ARLRILKLKR ERKAFLIILL LLGIALLPLV IEYVANALLE VKNNWEFKTD LYFLSPGQLP 
       910        920        930        940        950        960 
QGLRTSLLVI NNTESNIEDF LQSLKHQNIV LEVDDFENRN ATNSLSYNGA IIVSGRQKDY 
       970        980        990       1000       1010       1020 
RFSAVCNTKR LHCFPILMNV ISNGILHMLN HTQYIRIKED IFSPFIVLVW TGIQETCLFI 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LCVICSLSPH IAMSSVSDYK KKADSQLWIS GLYPSAYWCG QAVVDISLFS GMLLTSYFTS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
YTSKLLNIDM TSEIVFSVIV LALGCAASLV FLTYVISFVF GKRKKNSTLW SICFLLVIAI 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
TFEKVANGPF NEALVISATM LVPSFALNGL LVVLEMRAYQ YYIEFEEIKH GLSAVDLLLC 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
LIPYIHTLLF IFVLRCLELK YGKNVVRRDP IFRIAPQSLK AQPNPEEPID EDENVQAERL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RTSDALSTPN LDEKPVIIAS CLHKEYAGQK KHCCSRRTRN MAVRNVSFCV NKGEILGLLG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PDGAGKSSSI RMIAGITKPT AGQVELKRLS SAVGHQGDSR AEFGYCPQEN GLWPNLTVKE 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
HLELYAAVKG LRKEDAVVAI SRLVNALKLH DQLNVQVQNL VAGATRKLCF VLSILGNSPV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
LILDEPSTGL DVSGKHQVWQ AIQAVVKDNE KGVLLSTHDL AEAEALCDRA AIMVSGRLRC 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
IGPIQHLKRK FGQDYVLELR VKDVSQEPLV HREILKLFPQ AARQDRCFSL LTYKLPVTDV 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
HPLSQAFHKL EAVKHGFDLE DYSLSQCTLD RVILELSKEQ ELGTVYEEAD MTLGRKLLPP 
   
SDEL

Isoforms

- Isoform 2 of ATP-binding cassette sub-family A member 6

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MKELSVHVRQ QTRALLHKIL LKKWRRKRES LLEWSIPIII GLHMGLFSYL ARNIQVLEVP 
        70         80         90        100        110        120 
PQDLGSLNEF NGSSLVVVYT PISNITQQIM NKTTFAPTMK GTRIIGVPSI EDLDEVLLHN 
       130        140        150        160        170        180 
IPDALGVIFN DSFSYQLKVL RMYGNPFLKE DLLAHCWDTH SQAFCSLSKY WERGFVALQT 
       190        200        210        220        230        240 
AINAGIIEVT TNHSVMEELM SIDGINMKTL PFIPRDLSDY EIFILFCLLY FSSFIYFASS 
       250        260        270        280        290        300 
NVTKERKQCK EVMKVMGLQD SAFWLSWGLI YVGFIFIISI FIAIIITSTQ IIMMTGFLVI 
       310        320        330        340        350        360 
FTLFFLYGLS LIAVTFLMAV LLQKAVLTNL IVLFFTLFWG CVGFTVLHKE LPPSLEWVLS 
       370        380        390        400        410        420 
IFSPFAFTSG MAKVIFQDYN LNGVVFPDPS GESYVMIAVF FILAFDSLLY LVLALYFDKI 
       430        440        450        460        470        480 
LLYGAEHRSA PLFFLNPTSC FRKTANRNKV IERDLDPELP SDEYFEPVDP EYQGKEAIRI 
       490        500        510        520        530        540 
RNIKKEYKGK SGKVKALKGL FLDIYESQIT AILGHSGAGK SSLLNILSGL YVPTAGSVTV 
       550        560        570        580        590        600 
YNKNLSDMQD LKEIRKAIGV CPQHNVQFDA LTVKENLTLF AKIKGILPQD VEQEVQQILS 
       610        620        630        640        650        660 
ELDMQNIRDD LAEHLSEGQK RKLTFGIATV GDPQILLLDE PTVGLDPFSR QRIWGFLKER 
       670        680        690        700        710        720 
RADHVILFST QFMDEADILA DRKVLIANGA LKCTGSSVFL KRKWGLGYHL SLFMDETCDS 
       730        740        750        760        770        780 
ERLTSFINHH IPYAKLKAKT KEKLVYILPL ERTSEFPEFF SDLDKYSGQG LMSYEVSMST 
       790        800        810        820        830        840 
LNDVFLNLEG EPSTKQDFEK RETATDSESL NDMEVAYPSL SQVQETVSTM SLWRMQVCAI 
       850        860        870        880        890        900 
ARLRILKLKR ERKAFLIILL LLGIALLPLV IEYVANALLE VKNNWEFKTD LYFLSPGQLP 
       910        920        930        940        950        960 
QGLRTSLLVI NNTESNIEDF LQSLKHQNIV LEVDDFENRN ATNSLSYNGA IIVSGRQKDY 
       970        980        990       1000       1010       1020 
RFSAVCNTKR LHCFPILMNV ISNGILHMLN HTQYIRIKED IFSPFIVLVW TGIQETCLFI 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LCVICSLSPH IAMSSVSDYK KKADSQLWIS GLYPSAYWCG QAVVDISLFS GMLLTSYFTS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
YTSKLLNIDM TSEIVFSVIV LALGCAASLV FLTYVISFVF GKRKKNSTLW SICFLLVIAI 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
TFEKVANGPF NEALVISATM LVPSFALNGL LVVLEMRAYQ YYIEFEEIKH GLSAVDLLLC 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
LIPYIHTLLF IFVLRCLELK YGKNVVRRDP IFRIAPQSLK AQPNPEEPID EDENVQAERL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RTSDALSTPN LDEKPVIIAS CLHKEYAGQK KHCCSRRTRN MAVRNVSFCV NKGEILGLLG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PDGAGKSSSI RMIAGITKPT AGQVELKRLS SAVGHQGDSR AEFGYCPQEN GLWPNLTVKE 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
HLELYAAVKG LRKEDAVVAI SRLVNALKLH DQLNVQVQNL VAGATRKLCF VLSILGNSPV 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
LILDEPSTGL DVSGKHQVWQ AIQAVVKDNE KGVLLSTHDL AEAEALCDRA AIMVSGRLRC 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
IGPIQHLKRK FGQDYVLELR VKDVSQEPLV HREILKLFPQ AARQDRCFSL LTYKLPVTDV 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
HPLSQAFHKL EAVKHGFDLE DYSLSQCTLD RVILELSKEQ ELGTVYEEAD MTLGRKLLPP 
   
SDEL



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q8K441-1-unknown MKELSV... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q8K441-1-unknown MKELSV... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt65942

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...PSDEL 1624 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)