TopFIND 4.0

Q8K4E0: Alstrom syndrome protein 1 homolog

General Information

Protein names
- Alstrom syndrome protein 1 homolog
Gene names Alms1
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q8K4E0

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MEPEDLPWPD ELEEEEEEEE EEGEEEEGKK EVENASAAAT EEALTSEESG RLEEFEEAGP 
        70         80         90        100        110        120 
DLDFNYESQR QESSDEEEDE LAKAWLQAHP DRPGSAFSLP PPTPPPPPPP LSPRLRYTPV 
       130        140        150        160        170        180 
EHLGKTEVVP LTCRVWQQSS YQDNSRAQFS NSSTMLLETG VRWGSEEDQR TESWHCLPQE 
       190        200        210        220        230        240 
RDSSQTLAMS QTEIGRVEGT EVPDLPSQEG GLPAQSQCPG KKPKLNVLCS PLLVIQDNFA 
       250        260        270        280        290        300 
APDLPLLTCL IQDQEEVEPD SLFQQSELEF APLRGIPDKS EDSEWLARPS EVSEALIQAT 
       310        320        330        340        350        360 
SETSSDLANS CFSISQHPLT EGLQGKAESG VLTRCGDAKY SSLYENLGAQ SERIAVLQRE 
       370        380        390        400        410        420 
VGCSNLGISQ ASPSSLPSFV PQEPTSEPEY HSSNLRMLRV SPDTLLTTHT HSAGSADQKI 
       430        440        450        460        470        480 
GAAVVSSAYS QEIKPGSFHQ EELPDRHLNE EIRKVSPALR TAGQKPEMLP VQSSSYSKGM 
       490        500        510        520        530        540 
KSIFYQHPVS HGHQGKEPLS VSAVCGSAGN KAFHQLSTLS DSLLTEETWP VSVIPGLGNQ 
       550        560        570        580        590        600 
KTPLPSEFSL SYSHRGKNLP EDVVKVSTDS GSAHKKADIL TASSRTYQHK MKPANIYHQE 
       610        620        630        640        650        660 
LPDSRVPIGT RKVAFESGPA GQKSGVSHPY GEMPSVFYQQ GLPDRHSAKS PTKTFIPGPA 
       670        680        690        700        710        720 
DQKTDLSPVP PTSSSHAEKP VSPYQLTLPG SHLPEDVFKA SSVCKSSDEL SGITALTSAS 
       730        740        750        760        770        780 
YSYKGRPNSS YQQKFPDSHL NEEAQKILGT TGTVDQKTVT PTMSSSFLQK EKPSIFYQQT 
       790        800        810        820        830        840 
LPDGGLSEED LQVSAVPWPA DQNIAIPTVT SAAFSQREKP RIFYQQTLSV DRLPGEPLNV 
       850        860        870        880        890        900 
LGTSGPPDQN TGAPTVTPSS YFPGEESIIF YQAGFPGNTL SAMSFKVPRI SGSTEQTNVT 
       910        920        930        940        950        960 
TGSSSSYSVG EKSIIFYHQA LPDGRLPQEA SPAPADLNTG EPPMYLASCS VGVKPIIFYQ 
       970        980        990       1000       1010       1020 
QPMSDSQRTK GHKESDVPGP TDQKTGIATV HSTSQSYIGR RTVSYQKEFP DLSEKALKVL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
GDVGSTEQKT QIPVVSSALL HKEGPSAYQE DLPDLTEEPL QILGVSEEVS SSSYQRKLPD 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
HIEVFLKSVG SGSADRKTGA QIVSSSREKS SGFHQQELPN TGGDAVDAFH PEPVVQEVRK 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
VQTPGAPAGP SSSHFHKEKL SDYQKASPHR DLTESSLKAS TVPGLSDQKK KPAVSSGFCL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
HKEKHEISAS ALLNCQTAEL LTVTQRSCLH REDPAISTVI KPDDQKIPLP TTFHGSSDQK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
VKPVIFVQKQ LRDRDQSEDI PKISTVSEPT VVNTVLPVLL PGSYSHREKS DSFYPQELPD 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
GHLTEVDLKV SSGLGQADQI SGLPTGIPGT YSHSEKHQLI SEHVQELMDN LNSSESSCLS 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
VDSMPLNSQI DDGVIICKPE SLGFANAGCE EMQNIDRGSK TLKEIQTLLM EAENMALKRC 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
NFSVPLVPFR DVNDVSFIRS KKVVCFKESS TTDVCTQRES FVEEVPHIEY VQKDIGTQTN 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
LKYQRGVGNW EFISSATFRS PLQEAEGTAR MAYDETFRQY KAARSVMRSE PEGCSTGIGN 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
KMIIPMMTII KSDSSSDVSD GCCSWDNNLP ESLESVSDVF LNFFPYTSPK TSITDSREEE 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
WLSESEDGYG STDSLAAHVK YLLQCETSLN QAKQILKNAE EEEYRVRTQA WNLKFNLGRD 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
RGYSISELNE DDRRKVEEIK AKLFGHGRAT HMSEGLRSPQ GIGCLPEAVC SRIIIESHEK 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
GCFRTLTAEQ PRPDSCHCAF RSVEPSDLIR GHRSPSSWRG RHINLSRSIE QSNPCFKVGS 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
SFQLQSHPPF QKLLPDDIKI SKGVGMPVHA YMDPQPSELV EPTCVPAKEM DFPSSSQILP 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
PEPKKQFTTA ITFSSHEHSE CISDSSGCKV GVTADSQCSG PSLGVFKPHI PEEQISPRDL 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
KQKTSFQSSL ERHGSTPVTI LADGSRQRQK LPVDFEHSHQ KEKLLQRLGF KVSHSEPNVS 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
TNVSNFKGVQ FSGKDTIVSQ DKLTSTVEVK EKNVTVTPDL PSCIFLEQPE LFEESHTPHT 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
DLQMRKYPSP SCPEIASRIF LEQPKLSEQS KAPHVDREIR EDHSFFPKCQ DYIVADPSPD 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
FPDQQQCKPP DVVGHTRKQN SLLSEGQDYE LEEVQHIPQS YFSNMVNVEA KVSDAISQSA 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
PDHCTAASTP PSNRKALSCV RITLCPKTSS KLDSGTLGER FHSLDPASKT RINSEFNSDL 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
RIISSRSLEP TSKLLTCKPV AQDQESLVFL GPKSPLDLQV AQSSLPDSKT IFQDLKTKPP 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
QNSQIVTSRQ TQVNISHLEG YSKPEGTPVS ADGSQEQSKV SFTTSFGKLS SDAITQITTE 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
SPEKTTFSSE IFIHADDRGQ GILDPMAQKP SRFASSSSVQ QIPASHGKDA QPVLLPYKPS 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
GSSKMYYVPL LKRVPSYLDS KSDTTVESSH SGSNDAIAPD FPPQMLGTRD DDLSNTVNIK 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
HKEGIYSKRA ATKGKNPSQK GDAAAPVQMP ITWDENVLDE NQEEVISRGV VIKMAGPEEM 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
SSLEKDLAGP SDITVQDRKT ENLPDTKSIK QKEGSLEIES ECHSAFENTA HSVFRSAKFY 
      2590       2600       2610       2620       2630       2640 
FHHPVHLPHE QDFCHESLGR SVFMQHSWKD FFHHHSGHSC LPPPGPSSDK LDKTKMDYTR 
      2650       2660       2670       2680       2690       2700 
IKSLSINLNL GEHEKIHTIK NQARDPKGKR QANEQKKDQK VTPELTTECP VSLNELWNRY 
      2710       2720       2730       2740       2750       2760 
QERQKQQNPS GACDTKELSL VERLDRLAKL LQNPITHSLR ASESAQDDSR GGHRAREWTG 
      2770       2780       2790       2800       2810       2820 
RRQQKQKGKQ HRKWSKSLER GQSTGDFRKS KVFSPHQGGK SSQFKIEQIK LDKYILRKEP 
      2830       2840       2850       2860       2870       2880 
GFNNVSNTSL DSRPSEESVS LTDSPNIFSS TDSPVDSDVL TPTDRDMPLN ERSSSISTID 
      2890       2900       2910       2920       2930       2940 
TVRLIQAFGQ DRLSLSPRRI KLYSTVTSQR RRYLEQPCKH NRKALNTACP QMTSEHSRRR 
      2950       2960       2970       2980       2990       3000 
HIQVANHMTS SDSVSSPGSL LSLDSALSNE ETVRMVSKGV QAGNLEIVAG VKKYTQDVGV 
      3010       3020       3030       3040       3050       3060 
TFPTPSSSEA RLEEDSDVTS SSEEKAKEKK FLSNYLQTKN LRKNKPNPCA GVSWFVPVES 
      3070       3080       3090       3100       3110       3120 
GQSGSKKENL PKIYRPVISW FEPVTKTKPW REPLREQNWQ AQCMNSRGSL GGPGRDSGQV 
      3130       3140       3150       3160       3170       3180 
SLRPFVRATL QESLQLHRPD FISHSGERIK RLKLLVQERK LQSLFQSERE ALFHSARPLP 
      3190       3200       3210       3220       3230       3240 
RRVLLAVQKN KPIGKKEMIQ RTRRIYEQLP EVKKKREEEK RKSEYKSYWL RAQHYKMKVT 
      3250    
NHLLGRKVPW D

Isoforms

- Isoform 2 of Alstrom syndrome protein 1 homolog

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MEPEDLPWPD ELEEEEEEEE EEGEEEEGKK EVENASAAAT EEALTSEESG RLEEFEEAGP 
        70         80         90        100        110        120 
DLDFNYESQR QESSDEEEDE LAKAWLQAHP DRPGSAFSLP PPTPPPPPPP LSPRLRYTPV 
       130        140        150        160        170        180 
EHLGKTEVVP LTCRVWQQSS YQDNSRAQFS NSSTMLLETG VRWGSEEDQR TESWHCLPQE 
       190        200        210        220        230        240 
RDSSQTLAMS QTEIGRVEGT EVPDLPSQEG GLPAQSQCPG KKPKLNVLCS PLLVIQDNFA 
       250        260        270        280        290        300 
APDLPLLTCL IQDQEEVEPD SLFQQSELEF APLRGIPDKS EDSEWLARPS EVSEALIQAT 
       310        320        330        340        350        360 
SETSSDLANS CFSISQHPLT EGLQGKAESG VLTRCGDAKY SSLYENLGAQ SERIAVLQRE 
       370        380        390        400        410        420 
VGCSNLGISQ ASPSSLPSFV PQEPTSEPEY HSSNLRMLRV SPDTLLTTHT HSAGSADQKI 
       430        440        450        460        470        480 
GAAVVSSAYS QEIKPGSFHQ EELPDRHLNE EIRKVSPALR TAGQKPEMLP VQSSSYSKGM 
       490        500        510        520        530        540 
KSIFYQHPVS HGHQGKEPLS VSAVCGSAGN KAFHQLSTLS DSLLTEETWP VSVIPGLGNQ 
       550        560        570        580        590        600 
KTPLPSEFSL SYSHRGKNLP EDVVKVSTDS GSAHKKADIL TASSRTYQHK MKPANIYHQE 
       610        620        630        640        650        660 
LPDSRVPIGT RKVAFESGPA GQKSGVSHPY GEMPSVFYQQ GLPDRHSAKS PTKTFIPGPA 
       670        680        690        700        710        720 
DQKTDLSPVP PTSSSHAEKP VSPYQLTLPG SHLPEDVFKA SSVCKSSDEL SGITALTSAS 
       730        740        750        760        770        780 
YSYKGRPNSS YQQKFPDSHL NEEAQKILGT TGTVDQKTVT PTMSSSFLQK EKPSIFYQQT 
       790        800        810        820        830        840 
LPDGGLSEED LQVSAVPWPA DQNIAIPTVT SAAFSQREKP RIFYQQTLSV DRLPGEPLNV 
       850        860        870        880        890        900 
LGTSGPPDQN TGAPTVTPSS YFPGEESIIF YQAGFPGNTL SAMSFKVPRI SGSTEQTNVT 
       910        920        930        940        950        960 
TGSSSSYSVG EKSIIFYHQA LPDGRLPQEA SPAPADLNTG EPPMYLASCS VGVKPIIFYQ 
       970        980        990       1000       1010       1020 
QPMSDSQRTK GHKESDVPGP TDQKTGIATV HSTSQSYIGR RTVSYQKEFP DLSEKALKVL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
GDVGSTEQKT QIPVVSSALL HKEGPSAYQE DLPDLTEEPL QILGVSEEVS SSSYQRKLPD 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
HIEVFLKSVG SGSADRKTGA QIVSSSREKS SGFHQQELPN TGGDAVDAFH PEPVVQEVRK 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
VQTPGAPAGP SSSHFHKEKL SDYQKASPHR DLTESSLKAS TVPGLSDQKK KPAVSSGFCL 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
HKEKHEISAS ALLNCQTAEL LTVTQRSCLH REDPAISTVI KPDDQKIPLP TTFHGSSDQK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
VKPVIFVQKQ LRDRDQSEDI PKISTVSEPT VVNTVLPVLL PGSYSHREKS DSFYPQELPD 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
GHLTEVDLKV SSGLGQADQI SGLPTGIPGT YSHSEKHQLI SEHVQELMDN LNSSESSCLS 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
VDSMPLNSQI DDGVIICKPE SLGFANAGCE EMQNIDRGSK TLKEIQTLLM EAENMALKRC 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
NFSVPLVPFR DVNDVSFIRS KKVVCFKESS TTDVCTQRES FVEEVPHIEY VQKDIGTQTN 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
LKYQRGVGNW EFISSATFRS PLQEAEGTAR MAYDETFRQY KAARSVMRSE PEGCSTGIGN 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
KMIIPMMTII KSDSSSDVSD GCCSWDNNLP ESLESVSDVF LNFFPYTSPK TSITDSREEE 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
WLSESEDGYG STDSLAAHVK YLLQCETSLN QAKQILKNAE EEEYRVRTQA WNLKFNLGRD 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
RGYSISELNE DDRRKVEEIK AKLFGHGRAT HMSEGLRSPQ GIGCLPEAVC SRIIIESHEK 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
GCFRTLTAEQ PRPDSCHCAF RSVEPSDLIR GHRSPSSWRG RHINLSRSIE QSNPCFKVGS 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
SFQLQSHPPF QKLLPDDIKI SKGVGMPVHA YMDPQPSELV EPTCVPAKEM DFPSSSQILP 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
PEPKKQFTTA ITFSSHEHSE CISDSSGCKV GVTADSQCSG PSLGVFKPHI PEEQISPRDL 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
KQKTSFQSSL ERHGSTPVTI LADGSRQRQK LPVDFEHSHQ KEKLLQRLGF KVSHSEPNVS 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
TNVSNFKGVQ FSGKDTIVSQ DKLTSTVEVK EKNVTVTPDL PSCIFLEQPE LFEESHTPHT 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
DLQMRKYPSP SCPEIASRIF LEQPKLSEQS KAPHVDREIR EDHSFFPKCQ DYIVADPSPD 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
FPDQQQCKPP DVVGHTRKQN SLLSEGQDYE LEEVQHIPQS YFSNMVNVEA KVSDAISQSA 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
PDHCTAASTP PSNRKALSCV RITLCPKTSS KLDSGTLGER FHSLDPASKT RINSEFNSDL 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
RIISSRSLEP TSKLLTCKPV AQDQESLVFL GPKSPLDLQV AQSSLPDSKT IFQDLKTKPP 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
QNSQIVTSRQ TQVNISHLEG YSKPEGTPVS ADGSQEQSKV SFTTSFGKLS SDAITQITTE 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
SPEKTTFSSE IFIHADDRGQ GILDPMAQKP SRFASSSSVQ QIPASHGKDA QPVLLPYKPS 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
GSSKMYYVPL LKRVPSYLDS KSDTTVESSH SGSNDAIAPD FPPQMLGTRD DDLSNTVNIK 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
HKEGIYSKRA ATKGKNPSQK GDAAAPVQMP ITWDENVLDE NQEEVISRGV VIKMAGPEEM 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
SSLEKDLAGP SDITVQDRKT ENLPDTKSIK QKEGSLEIES ECHSAFENTA HSVFRSAKFY 
      2590       2600       2610       2620       2630       2640 
FHHPVHLPHE QDFCHESLGR SVFMQHSWKD FFHHHSGHSC LPPPGPSSDK LDKTKMDYTR 
      2650       2660       2670       2680       2690       2700 
IKSLSINLNL GEHEKIHTIK NQARDPKGKR QANEQKKDQK VTPELTTECP VSLNELWNRY 
      2710       2720       2730       2740       2750       2760 
QERQKQQNPS GACDTKELSL VERLDRLAKL LQNPITHSLR ASESAQDDSR GGHRAREWTG 
      2770       2780       2790       2800       2810       2820 
RRQQKQKGKQ HRKWSKSLER GQSTGDFRKS KVFSPHQGGK SSQFKIEQIK LDKYILRKEP 
      2830       2840       2850       2860       2870       2880 
GFNNVSNTSL DSRPSEESVS LTDSPNIFSS TDSPVDSDVL TPTDRDMPLN ERSSSISTID 
      2890       2900       2910       2920       2930       2940 
TVRLIQAFGQ DRLSLSPRRI KLYSTVTSQR RRYLEQPCKH NRKALNTACP QMTSEHSRRR 
      2950       2960       2970       2980       2990       3000 
HIQVANHMTS SDSVSSPGSL LSLDSALSNE ETVRMVSKGV QAGNLEIVAG VKKYTQDVGV 
      3010       3020       3030       3040       3050       3060 
TFPTPSSSEA RLEEDSDVTS SSEEKAKEKK FLSNYLQTKN LRKNKPNPCA GVSWFVPVES 
      3070       3080       3090       3100       3110       3120 
GQSGSKKENL PKIYRPVISW FEPVTKTKPW REPLREQNWQ AQCMNSRGSL GGPGRDSGQV 
      3130       3140       3150       3160       3170       3180 
SLRPFVRATL QESLQLHRPD FISHSGERIK RLKLLVQERK LQSLFQSERE ALFHSARPLP 
      3190       3200       3210       3220       3230       3240 
RRVLLAVQKN KPIGKKEMIQ RTRRIYEQLP EVKKKREEEK RKSEYKSYWL RAQHYKMKVT 
      3250    
NHLLGRKVPW D



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q8K4E0-1-unknown MEPEDL... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q8K4E0-2948-unknown MTSSDS... 2948 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt66764

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...KVPWD 3251 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...KVPWD 3251 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt62382

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)