TopFIND 4.0

Q8LK56: Transcriptional activator DEMETER

General Information

Protein names
- Transcriptional activator DEMETER
- 3.2.2.-
- DNA glycosylase-related protein DME
Gene names DME
Organism Arabidopsis thaliana
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q8LK56

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MNSRADPGDR YFRVPLENQT QQEFMGSWIP FTPKKPRSSL MVDERVINQD LNGFPGGEFV 
        70         80         90        100        110        120 
DRGFCNTGVD HNGVFDHGAH QGVTNLSMMI NSLAGSHAQA WSNSERDLLG RSEVTSPLAP 
       130        140        150        160        170        180 
VIRNTTGNVE PVNGNFTSDV GMVNGPFTQS GTSQAGYNEF ELDDLLNPDQ MPFSFTSLLS 
       190        200        210        220        230        240 
GGDSLFKVRQ YGPPACNKPL YNLNSPIRRE AVGSVCESSF QYVPSTPSLF RTGEKTGFLE 
       250        260        270        280        290        300 
QIVTTTGHEI PEPKSDKSMQ SIMDSSAVNA TEATEQNDGS RQDVLEFDLN KTPQQKPSKR 
       310        320        330        340        350        360 
KRKFMPKVVV EGKPKRKPRK PAELPKVVVE GKPKRKPRKA ATQEKVKSKE TGSAKKKNLK 
       370        380        390        400        410        420 
ESATKKPANV GDMSNKSPEV TLKSCRKALN FDLENPGDAR QGDSESEIVQ NSSGANSFSE 
       430        440        450        460        470        480 
IRDAIGGTNG SFLDSVSQID KTNGLGAMNQ PLEVSMGNQP DKLSTGAKLA RDQQPDLLTR 
       490        500        510        520        530        540 
NQQCQFPVAT QNTQFPMENQ QAWLQMKNQL IGFPFGNQQP RMTIRNQQPC LAMGNQQPMY 
       550        560        570        580        590        600 
LIGTPRPALV SGNQQLGGPQ GNKRPIFLNH QTCLPAGNQL YGSPTDMHQL VMSTGGQQHG 
       610        620        630        640        650        660 
LLIKNQQPGS LIRGQQPCVP LIDQQPATPK GFTHLNQMVA TSMSSPGLRP HSQSQVPTTY 
       670        680        690        700        710        720 
LHVESVSRIL NGTTGTCQRS RAPAYDSLQQ DIHQGNKYIL SHEISNGNGC KKALPQNSSL 
       730        740        750        760        770        780 
PTPIMAKLEE ARGSKRQYHR AMGQTEKHDL NLAQQIAQSQ DVERHNSSTC VEYLDAAKKT 
       790        800        810        820        830        840 
KIQKVVQENL HGMPPEVIEI EDDPTDGARK GKNTASISKG ASKGNSSPVK KTAEKEKCIV 
       850        860        870        880        890        900 
PKTPAKKGRA GRKKSVPPPA HASEIQLWQP TPPKTPLSRS KPKGKGRKSI QDSGKARGPS 
       910        920        930        940        950        960 
GELLCQDSIA EIIYRMQNLY LGDKEREQEQ NAMVLYKGDG ALVPYESKKR KPRPKVDIDD 
       970        980        990       1000       1010       1020 
ETTRIWNLLM GKGDEKEGDE EKDKKKEKWW EEERRVFRGR ADSFIARMHL VQGDRRFSPW 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KGSVVDSVIG VFLTQNVSDH LSSSAFMSLA ARFPPKLSSS REDERNVRSV VVEDPEGCIL 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
NLNEIPSWQE KVQHPSDMEV SGVDSGSKEQ LRDCSNSGIE RFNFLEKSIQ NLEEEVLSSQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
DSFDPAIFQS CGRVGSCSCS KSDAEFPTTR CETKTVSGTS QSVQTGSPNL SDEICLQGNE 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
RPHLYEGSGD VQKQETTNVA QKKPDLEKTM NWKDSVCFGQ PRNDTNWQTT PSSSYEQCAT 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RQPHVLDIED FGMQGEGLGY SWMSISPRVD RVKNKNVPRR FFRQGGSVPR EFTGQIIPST 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PHELPGMGLS GSSSAVQEHQ DDTQHNQQDE MNKASHLQKT FLDLLNSSEE CLTRQSSTKQ 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
NITDGCLPRD RTAEDVVDPL SNNSSLQNIL VESNSSNKEQ TAVEYKETNA TILREMKGTL 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
ADGKKPTSQW DSLRKDVEGN EGRQERNKNN MDSIDYEAIR RASISEISEA IKERGMNNML 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
AVRIKDFLER IVKDHGGIDL EWLRESPPDK AKDYLLSIRG LGLKSVECVR LLTLHNLAFP 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
VDTNVGRIAV RMGWVPLQPL PESLQLHLLE LYPVLESIQK FLWPRLCKLD QRTLYELHYQ 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
LITFGKVFCT KSRPNCNACP MRGECRHFAS AYASARLALP APEERSLTSA TIPVPPESYP 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
PVAIPMIELP LPLEKSLASG APSNRENCEP IIEEPASPGQ ECTEITESDI EDAYYNEDPD 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
EIPTIKLNIE QFGMTLREHM ERNMELQEGD MSKALVALHP TTTSIPTPKL KNISRLRTEH 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
QVYELPDSHR LLDGMDKREP DDPSPYLLAI WTPGETANSA QPPEQKCGGK ASGKMCFDET 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
CSECNSLREA NSQTVRGTLL IPCRTAMRGS FPLNGTYFQV NELFADHESS LKPIDVPRDW 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
IWDLPRRTVY FGTSVTSIFR GLSTEQIQFC FWKGFVCVRG FEQKTRAPRP LMARLHFPAS 
   
KLKNNKT

Isoforms

- Isoform 1 of Transcriptional activator DEMETER - Isoform 2 of Transcriptional activator DEMETER

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MNSRADPGDR YFRVPLENQT QQEFMGSWIP FTPKKPRSSL MVDERVINQD LNGFPGGEFV 
        70         80         90        100        110        120 
DRGFCNTGVD HNGVFDHGAH QGVTNLSMMI NSLAGSHAQA WSNSERDLLG RSEVTSPLAP 
       130        140        150        160        170        180 
VIRNTTGNVE PVNGNFTSDV GMVNGPFTQS GTSQAGYNEF ELDDLLNPDQ MPFSFTSLLS 
       190        200        210        220        230        240 
GGDSLFKVRQ YGPPACNKPL YNLNSPIRRE AVGSVCESSF QYVPSTPSLF RTGEKTGFLE 
       250        260        270        280        290        300 
QIVTTTGHEI PEPKSDKSMQ SIMDSSAVNA TEATEQNDGS RQDVLEFDLN KTPQQKPSKR 
       310        320        330        340        350        360 
KRKFMPKVVV EGKPKRKPRK PAELPKVVVE GKPKRKPRKA ATQEKVKSKE TGSAKKKNLK 
       370        380        390        400        410        420 
ESATKKPANV GDMSNKSPEV TLKSCRKALN FDLENPGDAR QGDSESEIVQ NSSGANSFSE 
       430        440        450        460        470        480 
IRDAIGGTNG SFLDSVSQID KTNGLGAMNQ PLEVSMGNQP DKLSTGAKLA RDQQPDLLTR 
       490        500        510        520        530        540 
NQQCQFPVAT QNTQFPMENQ QAWLQMKNQL IGFPFGNQQP RMTIRNQQPC LAMGNQQPMY 
       550        560        570        580        590        600 
LIGTPRPALV SGNQQLGGPQ GNKRPIFLNH QTCLPAGNQL YGSPTDMHQL VMSTGGQQHG 
       610        620        630        640        650        660 
LLIKNQQPGS LIRGQQPCVP LIDQQPATPK GFTHLNQMVA TSMSSPGLRP HSQSQVPTTY 
       670        680        690        700        710        720 
LHVESVSRIL NGTTGTCQRS RAPAYDSLQQ DIHQGNKYIL SHEISNGNGC KKALPQNSSL 
       730        740        750        760        770        780 
PTPIMAKLEE ARGSKRQYHR AMGQTEKHDL NLAQQIAQSQ DVERHNSSTC VEYLDAAKKT 
       790        800        810        820        830        840 
KIQKVVQENL HGMPPEVIEI EDDPTDGARK GKNTASISKG ASKGNSSPVK KTAEKEKCIV 
       850        860        870        880        890        900 
PKTPAKKGRA GRKKSVPPPA HASEIQLWQP TPPKTPLSRS KPKGKGRKSI QDSGKARGPS 
       910        920        930        940        950        960 
GELLCQDSIA EIIYRMQNLY LGDKEREQEQ NAMVLYKGDG ALVPYESKKR KPRPKVDIDD 
       970        980        990       1000       1010       1020 
ETTRIWNLLM GKGDEKEGDE EKDKKKEKWW EEERRVFRGR ADSFIARMHL VQGDRRFSPW 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KGSVVDSVIG VFLTQNVSDH LSSSAFMSLA ARFPPKLSSS REDERNVRSV VVEDPEGCIL 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
NLNEIPSWQE KVQHPSDMEV SGVDSGSKEQ LRDCSNSGIE RFNFLEKSIQ NLEEEVLSSQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
DSFDPAIFQS CGRVGSCSCS KSDAEFPTTR CETKTVSGTS QSVQTGSPNL SDEICLQGNE 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
RPHLYEGSGD VQKQETTNVA QKKPDLEKTM NWKDSVCFGQ PRNDTNWQTT PSSSYEQCAT 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RQPHVLDIED FGMQGEGLGY SWMSISPRVD RVKNKNVPRR FFRQGGSVPR EFTGQIIPST 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PHELPGMGLS GSSSAVQEHQ DDTQHNQQDE MNKASHLQKT FLDLLNSSEE CLTRQSSTKQ 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
NITDGCLPRD RTAEDVVDPL SNNSSLQNIL VESNSSNKEQ TAVEYKETNA TILREMKGTL 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
ADGKKPTSQW DSLRKDVEGN EGRQERNKNN MDSIDYEAIR RASISEISEA IKERGMNNML 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
AVRIKDFLER IVKDHGGIDL EWLRESPPDK AKDYLLSIRG LGLKSVECVR LLTLHNLAFP 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
VDTNVGRIAV RMGWVPLQPL PESLQLHLLE LYPVLESIQK FLWPRLCKLD QRTLYELHYQ 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
LITFGKVFCT KSRPNCNACP MRGECRHFAS AYASARLALP APEERSLTSA TIPVPPESYP 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
PVAIPMIELP LPLEKSLASG APSNRENCEP IIEEPASPGQ ECTEITESDI EDAYYNEDPD 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
EIPTIKLNIE QFGMTLREHM ERNMELQEGD MSKALVALHP TTTSIPTPKL KNISRLRTEH 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
QVYELPDSHR LLDGMDKREP DDPSPYLLAI WTPGETANSA QPPEQKCGGK ASGKMCFDET 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
CSECNSLREA NSQTVRGTLL IPCRTAMRGS FPLNGTYFQV NELFADHESS LKPIDVPRDW 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
IWDLPRRTVY FGTSVTSIFR GLSTEQIQFC FWKGFVCVRG FEQKTRAPRP LMARLHFPAS 
   
KLKNNKT         10         20         30         40         50         60 
MNSRADPGDR YFRVPLENQT QQEFMGSWIP FTPKKPRSSL MVDERVINQD LNGFPGGEFV 
        70         80         90        100        110        120 
DRGFCNTGVD HNGVFDHGAH QGVTNLSMMI NSLAGSHAQA WSNSERDLLG RSEVTSPLAP 
       130        140        150        160        170        180 
VIRNTTGNVE PVNGNFTSDV GMVNGPFTQS GTSQAGYNEF ELDDLLNPDQ MPFSFTSLLS 
       190        200        210        220        230        240 
GGDSLFKVRQ YGPPACNKPL YNLNSPIRRE AVGSVCESSF QYVPSTPSLF RTGEKTGFLE 
       250        260        270        280        290        300 
QIVTTTGHEI PEPKSDKSMQ SIMDSSAVNA TEATEQNDGS RQDVLEFDLN KTPQQKPSKR 
       310        320        330        340        350        360 
KRKFMPKVVV EGKPKRKPRK PAELPKVVVE GKPKRKPRKA ATQEKVKSKE TGSAKKKNLK 
       370        380        390        400        410        420 
ESATKKPANV GDMSNKSPEV TLKSCRKALN FDLENPGDAR QGDSESEIVQ NSSGANSFSE 
       430        440        450        460        470        480 
IRDAIGGTNG SFLDSVSQID KTNGLGAMNQ PLEVSMGNQP DKLSTGAKLA RDQQPDLLTR 
       490        500        510        520        530        540 
NQQCQFPVAT QNTQFPMENQ QAWLQMKNQL IGFPFGNQQP RMTIRNQQPC LAMGNQQPMY 
       550        560        570        580        590        600 
LIGTPRPALV SGNQQLGGPQ GNKRPIFLNH QTCLPAGNQL YGSPTDMHQL VMSTGGQQHG 
       610        620        630        640        650        660 
LLIKNQQPGS LIRGQQPCVP LIDQQPATPK GFTHLNQMVA TSMSSPGLRP HSQSQVPTTY 
       670        680        690        700        710        720 
LHVESVSRIL NGTTGTCQRS RAPAYDSLQQ DIHQGNKYIL SHEISNGNGC KKALPQNSSL 
       730        740        750        760        770        780 
PTPIMAKLEE ARGSKRQYHR AMGQTEKHDL NLAQQIAQSQ DVERHNSSTC VEYLDAAKKT 
       790        800        810        820        830        840 
KIQKVVQENL HGMPPEVIEI EDDPTDGARK GKNTASISKG ASKGNSSPVK KTAEKEKCIV 
       850        860        870        880        890        900 
PKTPAKKGRA GRKKSVPPPA HASEIQLWQP TPPKTPLSRS KPKGKGRKSI QDSGKARGPS 
       910        920        930        940        950        960 
GELLCQDSIA EIIYRMQNLY LGDKEREQEQ NAMVLYKGDG ALVPYESKKR KPRPKVDIDD 
       970        980        990       1000       1010       1020 
ETTRIWNLLM GKGDEKEGDE EKDKKKEKWW EEERRVFRGR ADSFIARMHL VQGDRRFSPW 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KGSVVDSVIG VFLTQNVSDH LSSSAFMSLA ARFPPKLSSS REDERNVRSV VVEDPEGCIL 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
NLNEIPSWQE KVQHPSDMEV SGVDSGSKEQ LRDCSNSGIE RFNFLEKSIQ NLEEEVLSSQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
DSFDPAIFQS CGRVGSCSCS KSDAEFPTTR CETKTVSGTS QSVQTGSPNL SDEICLQGNE 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
RPHLYEGSGD VQKQETTNVA QKKPDLEKTM NWKDSVCFGQ PRNDTNWQTT PSSSYEQCAT 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RQPHVLDIED FGMQGEGLGY SWMSISPRVD RVKNKNVPRR FFRQGGSVPR EFTGQIIPST 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PHELPGMGLS GSSSAVQEHQ DDTQHNQQDE MNKASHLQKT FLDLLNSSEE CLTRQSSTKQ 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
NITDGCLPRD RTAEDVVDPL SNNSSLQNIL VESNSSNKEQ TAVEYKETNA TILREMKGTL 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
ADGKKPTSQW DSLRKDVEGN EGRQERNKNN MDSIDYEAIR RASISEISEA IKERGMNNML 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
AVRIKDFLER IVKDHGGIDL EWLRESPPDK AKDYLLSIRG LGLKSVECVR LLTLHNLAFP 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
VDTNVGRIAV RMGWVPLQPL PESLQLHLLE LYPVLESIQK FLWPRLCKLD QRTLYELHYQ 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
LITFGKVFCT KSRPNCNACP MRGECRHFAS AYASARLALP APEERSLTSA TIPVPPESYP 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
PVAIPMIELP LPLEKSLASG APSNRENCEP IIEEPASPGQ ECTEITESDI EDAYYNEDPD 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
EIPTIKLNIE QFGMTLREHM ERNMELQEGD MSKALVALHP TTTSIPTPKL KNISRLRTEH 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
QVYELPDSHR LLDGMDKREP DDPSPYLLAI WTPGETANSA QPPEQKCGGK ASGKMCFDET 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
CSECNSLREA NSQTVRGTLL IPCRTAMRGS FPLNGTYFQV NELFADHESS LKPIDVPRDW 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
IWDLPRRTVY FGTSVTSIFR GLSTEQIQFC FWKGFVCVRG FEQKTRAPRP LMARLHFPAS 
   
KLKNNKT



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q8LK56-1-unknown MNSRAD... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q8LK56-1-unknown MNSRAD... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt72964

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...KNNKT 1987 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...KNNKT 1987 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt68582

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)