TopFIND 4.0

Q8N139: ATP-binding cassette sub-family A member 6

General Information

Protein names
- ATP-binding cassette sub-family A member 6
Gene names ABCA6
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q8N139

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MNMKQKSVYQ QTKALLCKNF LKKWRMKRES LLEWGLSILL GLCIALFSSS MRNVQFPGMA 
        70         80         90        100        110        120 
PQNLGRVDKF NSSSLMVVYT PISNLTQQIM NKTALAPLLK GTSVIGAPNK THMDEILLEN 
       130        140        150        160        170        180 
LPYAMGIIFN ETFSYKLIFF QGYNSPLWKE DFSAHCWDGY GEFSCTLTKY WNRGFVALQT 
       190        200        210        220        230        240 
AINTAIIEIT TNHPVMEELM SVTAITMKTL PFITKNLLHN EMFILFFLLH FSPLVYFISL 
       250        260        270        280        290        300 
NVTKERKKSK NLMKMMGLQD SAFWLSWGLI YAGFIFIISI FVTIIITFTQ IIVMTGFMVI 
       310        320        330        340        350        360 
FILFFLYGLS LVALVFLMSV LLKKAVLTNL VVFLLTLFWG CLGFTVFYEQ LPSSLEWILN 
       370        380        390        400        410        420 
ICSPFAFTTG MIQIIKLDYN LNGVIFPDPS GDSYTMIATF SMLLLDGLIY LLLALYFDKI 
       430        440        450        460        470        480 
LPYGDERHYS PLFFLNSSSC FQHQRTNAKV IEKEIDAEHP SDDYFEPVAP EFQGKEAIRI 
       490        500        510        520        530        540 
RNVKKEYKGK SGKVEALKGL LFDIYEGQIT AILGHSGAGK SSLLNILNGL SVPTEGSVTI 
       550        560        570        580        590        600 
YNKNLSEMQD LEEIRKITGV CPQFNVQFDI LTVKENLSLF AKIKGIHLKE VEQEVQRILL 
       610        620        630        640        650        660 
ELDMQNIQDN LAKHLSEGQK RKLTFGITIL GDPQILLLDE PTTGLDPFSR DQVWSLLRER 
       670        680        690        700        710        720 
RADHVILFST QSMDEADILA DRKVIMSNGR LKCAGSSMFL KRRWGLGYHL SLHRNEICNP 
       730        740        750        760        770        780 
EQITSFITHH IPDAKLKTEN KEKLVYTLPL ERTNTFPDLF SDLDKCSDQG VTGYDISMST 
       790        800        810        820        830        840 
LNEVFMKLEG QSTIEQDFEQ VEMIRDSESL NEMELAHSSF SEMQTAVSDM GLWRMQVFAM 
       850        860        870        880        890        900 
ARLRFLKLKR QTKVLLTLLL VFGIAIFPLI VENIMYAMLN EKIDWEFKNE LYFLSPGQLP 
       910        920        930        940        950        960 
QEPRTSLLII NNTESNIEDF IKSLKHQNIL LEVDDFENRN GTDGLSYNGA IIVSGKQKDY 
       970        980        990       1000       1010       1020 
RFSVVCNTKR LHCFPILMNI ISNGLLQMFN HTQHIRIESS PFPLSHIGLW TGLPDGSFFL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
FLVLCSISPY ITMGSISDYK KNAKSQLWIS GLYTSAYWCG QALVDVSFFI LILLLMYLIF 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
YIENMQYLLI TSQIVFALVI VTPGYAASLV FFIYMISFIF RKRRKNSGLW SFYFFFASTI 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
MFSITLINHF DLSILITTMV LVPSYTLLGF KTFLEVRDQE HYREFPEANF ELSATDFLVC 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
FIPYFQTLLF VFVLRCMELK CGKKRMRKDP VFRISPQSRD AKPNPEEPID EDEDIQTERI 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RTATALTTSI LDEKPVIIAS CLHKEYAGQK KSCFSKRKKK IAARNISFCV QEGEILGLLG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PNGAGKSSSI RMISGITKPT AGEVELKGCS SVLGHLGYCP QENVLWPMLT LREHLEVYAA 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
VKGLRKADAR LAIARLVSAF KLHEQLNVPV QKLTAGITRK LCFVLSLLGN SPVLLLDEPS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
TGIDPTGQQQ MWQAIQAVVK NTERGVLLTT HNLAEAEALC DRVAIMVSGR LRCIGSIQHL 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KNKLGKDYIL ELKVKETSQV TLVHTEILKL FPQAAGQERY SSLLTYKLPV ADVYPLSQTF 
      1570       1580       1590       1600       1610    
HKLEAVKHNF NLEEYSLSQC TLEKVFLELS KEQEVGNFDE EIDTTMRWKL LPHSDEP

Isoforms

- Isoform 2 of ATP-binding cassette sub-family A member 6 - Isoform 3 of ATP-binding cassette sub-family A member 6

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MNMKQKSVYQ QTKALLCKNF LKKWRMKRES LLEWGLSILL GLCIALFSSS MRNVQFPGMA 
        70         80         90        100        110        120 
PQNLGRVDKF NSSSLMVVYT PISNLTQQIM NKTALAPLLK GTSVIGAPNK THMDEILLEN 
       130        140        150        160        170        180 
LPYAMGIIFN ETFSYKLIFF QGYNSPLWKE DFSAHCWDGY GEFSCTLTKY WNRGFVALQT 
       190        200        210        220        230        240 
AINTAIIEIT TNHPVMEELM SVTAITMKTL PFITKNLLHN EMFILFFLLH FSPLVYFISL 
       250        260        270        280        290        300 
NVTKERKKSK NLMKMMGLQD SAFWLSWGLI YAGFIFIISI FVTIIITFTQ IIVMTGFMVI 
       310        320        330        340        350        360 
FILFFLYGLS LVALVFLMSV LLKKAVLTNL VVFLLTLFWG CLGFTVFYEQ LPSSLEWILN 
       370        380        390        400        410        420 
ICSPFAFTTG MIQIIKLDYN LNGVIFPDPS GDSYTMIATF SMLLLDGLIY LLLALYFDKI 
       430        440        450        460        470        480 
LPYGDERHYS PLFFLNSSSC FQHQRTNAKV IEKEIDAEHP SDDYFEPVAP EFQGKEAIRI 
       490        500        510        520        530        540 
RNVKKEYKGK SGKVEALKGL LFDIYEGQIT AILGHSGAGK SSLLNILNGL SVPTEGSVTI 
       550        560        570        580        590        600 
YNKNLSEMQD LEEIRKITGV CPQFNVQFDI LTVKENLSLF AKIKGIHLKE VEQEVQRILL 
       610        620        630        640        650        660 
ELDMQNIQDN LAKHLSEGQK RKLTFGITIL GDPQILLLDE PTTGLDPFSR DQVWSLLRER 
       670        680        690        700        710        720 
RADHVILFST QSMDEADILA DRKVIMSNGR LKCAGSSMFL KRRWGLGYHL SLHRNEICNP 
       730        740        750        760        770        780 
EQITSFITHH IPDAKLKTEN KEKLVYTLPL ERTNTFPDLF SDLDKCSDQG VTGYDISMST 
       790        800        810        820        830        840 
LNEVFMKLEG QSTIEQDFEQ VEMIRDSESL NEMELAHSSF SEMQTAVSDM GLWRMQVFAM 
       850        860        870        880        890        900 
ARLRFLKLKR QTKVLLTLLL VFGIAIFPLI VENIMYAMLN EKIDWEFKNE LYFLSPGQLP 
       910        920        930        940        950        960 
QEPRTSLLII NNTESNIEDF IKSLKHQNIL LEVDDFENRN GTDGLSYNGA IIVSGKQKDY 
       970        980        990       1000       1010       1020 
RFSVVCNTKR LHCFPILMNI ISNGLLQMFN HTQHIRIESS PFPLSHIGLW TGLPDGSFFL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
FLVLCSISPY ITMGSISDYK KNAKSQLWIS GLYTSAYWCG QALVDVSFFI LILLLMYLIF 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
YIENMQYLLI TSQIVFALVI VTPGYAASLV FFIYMISFIF RKRRKNSGLW SFYFFFASTI 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
MFSITLINHF DLSILITTMV LVPSYTLLGF KTFLEVRDQE HYREFPEANF ELSATDFLVC 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
FIPYFQTLLF VFVLRCMELK CGKKRMRKDP VFRISPQSRD AKPNPEEPID EDEDIQTERI 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RTATALTTSI LDEKPVIIAS CLHKEYAGQK KSCFSKRKKK IAARNISFCV QEGEILGLLG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PNGAGKSSSI RMISGITKPT AGEVELKGCS SVLGHLGYCP QENVLWPMLT LREHLEVYAA 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
VKGLRKADAR LAIARLVSAF KLHEQLNVPV QKLTAGITRK LCFVLSLLGN SPVLLLDEPS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
TGIDPTGQQQ MWQAIQAVVK NTERGVLLTT HNLAEAEALC DRVAIMVSGR LRCIGSIQHL 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KNKLGKDYIL ELKVKETSQV TLVHTEILKL FPQAAGQERY SSLLTYKLPV ADVYPLSQTF 
      1570       1580       1590       1600       1610    
HKLEAVKHNF NLEEYSLSQC TLEKVFLELS KEQEVGNFDE EIDTTMRWKL LPHSDEP         10         20         30         40         50         60 
MNMKQKSVYQ QTKALLCKNF LKKWRMKRES LLEWGLSILL GLCIALFSSS MRNVQFPGMA 
        70         80         90        100        110        120 
PQNLGRVDKF NSSSLMVVYT PISNLTQQIM NKTALAPLLK GTSVIGAPNK THMDEILLEN 
       130        140        150        160        170        180 
LPYAMGIIFN ETFSYKLIFF QGYNSPLWKE DFSAHCWDGY GEFSCTLTKY WNRGFVALQT 
       190        200        210        220        230        240 
AINTAIIEIT TNHPVMEELM SVTAITMKTL PFITKNLLHN EMFILFFLLH FSPLVYFISL 
       250        260        270        280        290        300 
NVTKERKKSK NLMKMMGLQD SAFWLSWGLI YAGFIFIISI FVTIIITFTQ IIVMTGFMVI 
       310        320        330        340        350        360 
FILFFLYGLS LVALVFLMSV LLKKAVLTNL VVFLLTLFWG CLGFTVFYEQ LPSSLEWILN 
       370        380        390        400        410        420 
ICSPFAFTTG MIQIIKLDYN LNGVIFPDPS GDSYTMIATF SMLLLDGLIY LLLALYFDKI 
       430        440        450        460        470        480 
LPYGDERHYS PLFFLNSSSC FQHQRTNAKV IEKEIDAEHP SDDYFEPVAP EFQGKEAIRI 
       490        500        510        520        530        540 
RNVKKEYKGK SGKVEALKGL LFDIYEGQIT AILGHSGAGK SSLLNILNGL SVPTEGSVTI 
       550        560        570        580        590        600 
YNKNLSEMQD LEEIRKITGV CPQFNVQFDI LTVKENLSLF AKIKGIHLKE VEQEVQRILL 
       610        620        630        640        650        660 
ELDMQNIQDN LAKHLSEGQK RKLTFGITIL GDPQILLLDE PTTGLDPFSR DQVWSLLRER 
       670        680        690        700        710        720 
RADHVILFST QSMDEADILA DRKVIMSNGR LKCAGSSMFL KRRWGLGYHL SLHRNEICNP 
       730        740        750        760        770        780 
EQITSFITHH IPDAKLKTEN KEKLVYTLPL ERTNTFPDLF SDLDKCSDQG VTGYDISMST 
       790        800        810        820        830        840 
LNEVFMKLEG QSTIEQDFEQ VEMIRDSESL NEMELAHSSF SEMQTAVSDM GLWRMQVFAM 
       850        860        870        880        890        900 
ARLRFLKLKR QTKVLLTLLL VFGIAIFPLI VENIMYAMLN EKIDWEFKNE LYFLSPGQLP 
       910        920        930        940        950        960 
QEPRTSLLII NNTESNIEDF IKSLKHQNIL LEVDDFENRN GTDGLSYNGA IIVSGKQKDY 
       970        980        990       1000       1010       1020 
RFSVVCNTKR LHCFPILMNI ISNGLLQMFN HTQHIRIESS PFPLSHIGLW TGLPDGSFFL 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
FLVLCSISPY ITMGSISDYK KNAKSQLWIS GLYTSAYWCG QALVDVSFFI LILLLMYLIF 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
YIENMQYLLI TSQIVFALVI VTPGYAASLV FFIYMISFIF RKRRKNSGLW SFYFFFASTI 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
MFSITLINHF DLSILITTMV LVPSYTLLGF KTFLEVRDQE HYREFPEANF ELSATDFLVC 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
FIPYFQTLLF VFVLRCMELK CGKKRMRKDP VFRISPQSRD AKPNPEEPID EDEDIQTERI 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
RTATALTTSI LDEKPVIIAS CLHKEYAGQK KSCFSKRKKK IAARNISFCV QEGEILGLLG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PNGAGKSSSI RMISGITKPT AGEVELKGCS SVLGHLGYCP QENVLWPMLT LREHLEVYAA 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
VKGLRKADAR LAIARLVSAF KLHEQLNVPV QKLTAGITRK LCFVLSLLGN SPVLLLDEPS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
TGIDPTGQQQ MWQAIQAVVK NTERGVLLTT HNLAEAEALC DRVAIMVSGR LRCIGSIQHL 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KNKLGKDYIL ELKVKETSQV TLVHTEILKL FPQAAGQERY SSLLTYKLPV ADVYPLSQTF 
      1570       1580       1590       1600       1610    
HKLEAVKHNF NLEEYSLSQC TLEKVFLELS KEQEVGNFDE EIDTTMRWKL LPHSDEP



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q8N139-1-unknown MNMKQK... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q8N139-1-unknown MNMKQK... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt65940
    Q8N139-1-unknown MNMKQK... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt65941

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...HSDEP 1617 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)