TopFIND 4.0

Q8N1V2: Cilia- and flagella-associated protein 52 {ECO:0000312|HGNC:HGNC:16053}

General Information

Protein names
- Cilia- and flagella-associated protein 52 {ECO:0000312|HGNC:HGNC:16053}
- WD repeat-containing protein 16 {ECO:0000312|HGNC:HGNC:16053}
- WD40-repeat protein up-regulated in HCC {ECO:0000303|PubMed:15967112}
Gene names WDR16
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q8N1V2

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MDNKISPEAQ VAELELDAVI GFNGHVPTGL KCHPDQEHMI YPLGCTVLIQ AINTKEQNFL 
        70         80         90        100        110        120 
QGHGNNVSCL AISRSGEYIA SGQVTFMGFK ADIILWDYKN RELLARLSLH KGKIEALAFS 
       130        140        150        160        170        180 
PNDLYLVSLG GPDDGSVVVW SIAKRDAICG SPAAGLNVGN ATNVIFSRCR DEMFMTAGNG 
       190        200        210        220        230        240 
TIRVWELDLP NRKIWPTECQ TGQLKRIVMS IGVDDDDSFF YLGTTTGDIL KMNPRTKLLT 
       250        260        270        280        290        300 
DVGPAKDKFS LGVSAIRCLK MGGLLVGSGA GLLVFCKSPG YKPIKKIQLQ GGITSITLRG 
       310        320        330        340        350        360 
EGHQFLVGTE ESHIYRVSFT DFKETLIATC HFDAVEDIVF PFGTAELFAT CAKKDIRVWH 
       370        380        390        400        410        420 
TSSNRELLRI TVPNMTCHGI DFMRDGKSII SAWNDGKIRA FAPETGRLMY VINNAHRIGV 
       430        440        450        460        470        480 
TAIATTSDCK RVISGGGEGE VRVWQIGCQT QKLEEALKEH KSSVSCIRVK RNNEECVTAS 
       490        500        510        520        530        540 
TDGTCIIWDL VRLRRNQMIL ANTLFQCVCY HPEEFQIITS GTDRKIAYWE VFDGTVIREL 
       550        560        570        580        590        600 
EGSLSGSING MDITQEGVHF VTGGNDHLVK VWDYNEGEVT HVGVGHSGNI TRIRISPGNQ 
       610        620    
YIVSVSADGA ILRWKYPYTS 

Isoforms

- Isoform 2 of WD repeat-containing protein 16 - Isoform 3 of WD repeat-containing protein 16 - Isoform 2 of Cilia- and flagella-associated protein 52 - Isoform 3 of Cilia- and flagella-associated protein 52

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MDNKISPEAQ VAELELDAVI GFNGHVPTGL KCHPDQEHMI YPLGCTVLIQ AINTKEQNFL 
        70         80         90        100        110        120 
QGHGNNVSCL AISRSGEYIA SGQVTFMGFK ADIILWDYKN RELLARLSLH KGKIEALAFS 
       130        140        150        160        170        180 
PNDLYLVSLG GPDDGSVVVW SIAKRDAICG SPAAGLNVGN ATNVIFSRCR DEMFMTAGNG 
       190        200        210        220        230        240 
TIRVWELDLP NRKIWPTECQ TGQLKRIVMS IGVDDDDSFF YLGTTTGDIL KMNPRTKLLT 
       250        260        270        280        290        300 
DVGPAKDKFS LGVSAIRCLK MGGLLVGSGA GLLVFCKSPG YKPIKKIQLQ GGITSITLRG 
       310        320        330        340        350        360 
EGHQFLVGTE ESHIYRVSFT DFKETLIATC HFDAVEDIVF PFGTAELFAT CAKKDIRVWH 
       370        380        390        400        410        420 
TSSNRELLRI TVPNMTCHGI DFMRDGKSII SAWNDGKIRA FAPETGRLMY VINNAHRIGV 
       430        440        450        460        470        480 
TAIATTSDCK RVISGGGEGE VRVWQIGCQT QKLEEALKEH KSSVSCIRVK RNNEECVTAS 
       490        500        510        520        530        540 
TDGTCIIWDL VRLRRNQMIL ANTLFQCVCY HPEEFQIITS GTDRKIAYWE VFDGTVIREL 
       550        560        570        580        590        600 
EGSLSGSING MDITQEGVHF VTGGNDHLVK VWDYNEGEVT HVGVGHSGNI TRIRISPGNQ 
       610        620    
YIVSVSADGA ILRWKYPYTS          10         20         30         40         50         60 
MDNKISPEAQ VAELELDAVI GFNGHVPTGL KCHPDQEHMI YPLGCTVLIQ AINTKEQNFL 
        70         80         90        100        110        120 
QGHGNNVSCL AISRSGEYIA SGQVTFMGFK ADIILWDYKN RELLARLSLH KGKIEALAFS 
       130        140        150        160        170        180 
PNDLYLVSLG GPDDGSVVVW SIAKRDAICG SPAAGLNVGN ATNVIFSRCR DEMFMTAGNG 
       190        200        210        220        230        240 
TIRVWELDLP NRKIWPTECQ TGQLKRIVMS IGVDDDDSFF YLGTTTGDIL KMNPRTKLLT 
       250        260        270        280        290        300 
DVGPAKDKFS LGVSAIRCLK MGGLLVGSGA GLLVFCKSPG YKPIKKIQLQ GGITSITLRG 
       310        320        330        340        350        360 
EGHQFLVGTE ESHIYRVSFT DFKETLIATC HFDAVEDIVF PFGTAELFAT CAKKDIRVWH 
       370        380        390        400        410        420 
TSSNRELLRI TVPNMTCHGI DFMRDGKSII SAWNDGKIRA FAPETGRLMY VINNAHRIGV 
       430        440        450        460        470        480 
TAIATTSDCK RVISGGGEGE VRVWQIGCQT QKLEEALKEH KSSVSCIRVK RNNEECVTAS 
       490        500        510        520        530        540 
TDGTCIIWDL VRLRRNQMIL ANTLFQCVCY HPEEFQIITS GTDRKIAYWE VFDGTVIREL 
       550        560        570        580        590        600 
EGSLSGSING MDITQEGVHF VTGGNDHLVK VWDYNEGEVT HVGVGHSGNI TRIRISPGNQ 
       610        620    
YIVSVSADGA ILRWKYPYTS          10         20         30         40         50         60 
MDNKISPEAQ VAELELDAVI GFNGHVPTGL KCHPDQEHMI YPLGCTVLIQ AINTKEQNFL 
        70         80         90        100        110        120 
QGHGNNVSCL AISRSGEYIA SGQVTFMGFK ADIILWDYKN RELLARLSLH KGKIEALAFS 
       130        140        150        160        170        180 
PNDLYLVSLG GPDDGSVVVW SIAKRDAICG SPAAGLNVGN ATNVIFSRCR DEMFMTAGNG 
       190        200        210        220        230        240 
TIRVWELDLP NRKIWPTECQ TGQLKRIVMS IGVDDDDSFF YLGTTTGDIL KMNPRTKLLT 
       250        260        270        280        290        300 
DVGPAKDKFS LGVSAIRCLK MGGLLVGSGA GLLVFCKSPG YKPIKKIQLQ GGITSITLRG 
       310        320        330        340        350        360 
EGHQFLVGTE ESHIYRVSFT DFKETLIATC HFDAVEDIVF PFGTAELFAT CAKKDIRVWH 
       370        380        390        400        410        420 
TSSNRELLRI TVPNMTCHGI DFMRDGKSII SAWNDGKIRA FAPETGRLMY VINNAHRIGV 
       430        440        450        460        470        480 
TAIATTSDCK RVISGGGEGE VRVWQIGCQT QKLEEALKEH KSSVSCIRVK RNNEECVTAS 
       490        500        510        520        530        540 
TDGTCIIWDL VRLRRNQMIL ANTLFQCVCY HPEEFQIITS GTDRKIAYWE VFDGTVIREL 
       550        560        570        580        590        600 
EGSLSGSING MDITQEGVHF VTGGNDHLVK VWDYNEGEVT HVGVGHSGNI TRIRISPGNQ 
       610        620    
YIVSVSADGA ILRWKYPYTS          10         20         30         40         50         60 
MDNKISPEAQ VAELELDAVI GFNGHVPTGL KCHPDQEHMI YPLGCTVLIQ AINTKEQNFL 
        70         80         90        100        110        120 
QGHGNNVSCL AISRSGEYIA SGQVTFMGFK ADIILWDYKN RELLARLSLH KGKIEALAFS 
       130        140        150        160        170        180 
PNDLYLVSLG GPDDGSVVVW SIAKRDAICG SPAAGLNVGN ATNVIFSRCR DEMFMTAGNG 
       190        200        210        220        230        240 
TIRVWELDLP NRKIWPTECQ TGQLKRIVMS IGVDDDDSFF YLGTTTGDIL KMNPRTKLLT 
       250        260        270        280        290        300 
DVGPAKDKFS LGVSAIRCLK MGGLLVGSGA GLLVFCKSPG YKPIKKIQLQ GGITSITLRG 
       310        320        330        340        350        360 
EGHQFLVGTE ESHIYRVSFT DFKETLIATC HFDAVEDIVF PFGTAELFAT CAKKDIRVWH 
       370        380        390        400        410        420 
TSSNRELLRI TVPNMTCHGI DFMRDGKSII SAWNDGKIRA FAPETGRLMY VINNAHRIGV 
       430        440        450        460        470        480 
TAIATTSDCK RVISGGGEGE VRVWQIGCQT QKLEEALKEH KSSVSCIRVK RNNEECVTAS 
       490        500        510        520        530        540 
TDGTCIIWDL VRLRRNQMIL ANTLFQCVCY HPEEFQIITS GTDRKIAYWE VFDGTVIREL 
       550        560        570        580        590        600 
EGSLSGSING MDITQEGVHF VTGGNDHLVK VWDYNEGEVT HVGVGHSGNI TRIRISPGNQ 
       610        620    
YIVSVSADGA ILRWKYPYTS 



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q8N1V2-1-unknown MDNKIS... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q8N1V2-1-unknown MDNKIS... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt94408

C-termini

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)