TopFIND 4.0

Q8NHM5: Lysine-specific demethylase 2B

General Information

Protein names
- Lysine-specific demethylase 2B
- 1.14.11.27 {ECO:0000269|PubMed:16362057, ECO:0000269|PubMed:26237645}
- CXXC-type zinc finger protein 2
- F-box and leucine-rich repeat protein 10
- F-box protein FBL10
- F-box/LRR-repeat protein 10
- JmjC domain-containing histone demethylation protein 1B
- Jumonji domain-containing EMSY-interactor methyltransferase motif protein
- Protein JEMMA
- Protein-containing CXXC domain 2
- Histone-H3]-lysine-36 demethylase 1B

Gene names KDM2B
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q8NHM5

4

N-termini

7

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MAGPQMGGSA EDHPPRKRHA AEKQKKKTVI YTKCFEFESA TQRPIDRQRY DENEDLSDVE 
        70         80         90        100        110        120 
EIVSVRGFSL EEKLRSQLYQ GDFVHAMEGK DFNYEYVQRE ALRVPLIFRE KDGLGIKMPD 
       130        140        150        160        170        180 
PDFTVRDVKL LVGSRRLVDV MDVNTQKGTE MSMSQFVRYY ETPEAQRDKL YNVISLEFSH 
       190        200        210        220        230        240 
TKLEHLVKRP TVVDLVDWVD NMWPQHLKEK QTEATNAIAE MKYPKVKKYC LMSVKGCFTD 
       250        260        270        280        290        300 
FHIDFGGTSV WYHVFRGGKI FWLIPPTLHN LALYEEWVLS GKQSDIFLGD RVERCQRIEL 
       310        320        330        340        350        360 
KQGYTFFIPS GWIHAVYTPV DSLVFGGNIL HSFNVPMQLR IYEIEDRTRV QPKFRYPFYY 
       370        380        390        400        410        420 
EMCWYVLERY VYCVTQRSHL TQEYQRESML IDAPRKPSID GFSSDSWLEM EEEACDQQPQ 
       430        440        450        460        470        480 
EEEEKDEEGE GRDRAPKPPT DGSTSPTSTP SEDQEALGKK PKAPALRFLK RTLSNESEES 
       490        500        510        520        530        540 
VKSTTLAVDY PKTPTGSPAT EVSAKWTHLT EFELKGLKAL VEKLESLPEN KKCVPEGIED 
       550        560        570        580        590        600 
PQALLEGVKN VLKEHADDDP SLAITGVPVV TWPKKTPKNR AVGRPKGKLG PASAVKLAAN 
       610        620        630        640        650        660 
RTTAGARRRR TRCRKCEACL RTECGECHFC KDMKKFGGPG RMKQSCIMRQ CIAPVLPHTA 
       670        680        690        700        710        720 
VCLVCGEAGK EDTVEEEEGK FNLMLMECSI CNEIIHPGCL KIKESEGVVN DELPNCWECP 
       730        740        750        760        770        780 
KCNHAGKTGK QKRGPGFKYA SNLPGSLLKE QKMNRDNKEG QEPAKRRSEC EEAPRRRSDE 
       790        800        810        820        830        840 
HSKKVPPDGL LRRKSDDVHL RKKRKYEKPQ ELSGRKRASS LQTSPGSSSH LSPRPPLGSS 
       850        860        870        880        890        900 
LSPWWRSSLT YFQQQLKPGK EDKLFRKKRR SWKNAEDRMA LANKPLRRFK QEPEDELPEA 
       910        920        930        940        950        960 
PPKTRESDHS RSSSPTAGPS TEGAEGPEEK KKVKMRRKRR LPNKELSREL SKELNHEIQR 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TENSLANENQ QPIKSEPESE GEEPKRPPGI CERPHRFSKG LNGTPRELRH QLGPSLRSPP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
RVISRPPPSV SPPKCIQMER HVIRPPPISP PPDSLPLDDG AAHVMHREVW MAVFSYLSHQ 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DLCVCMRVCR TWNRWCCDKR LWTRIDLNHC KSITPLMLSG IIRRQPVSLD LSWTNISKKQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
LSWLINRLPG LRDLVLSGCS WIAVSALCSS SCPLLRTLDV QWVEGLKDAQ MRDLLSPPTD 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
NRPGQMDNRS KLRNIVELRL AGLDITDASL RLIIRHMPLL SKLHLSYCNH VTDQSINLLT 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
AVGTTTRDSL TEINLSDCNK VTDQCLSFFK RCGNICHIDL RYCKQVTKEG CEQFIAEMSV 
      1330    
SVQFGQVEEK LLQKLS

Isoforms

- Isoform 2 of Lysine-specific demethylase 2B - Isoform 3 of Lysine-specific demethylase 2B - Isoform 4 of Lysine-specific demethylase 2B - Isoform 5 of Lysine-specific demethylase 2B

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MAGPQMGGSA EDHPPRKRHA AEKQKKKTVI YTKCFEFESA TQRPIDRQRY DENEDLSDVE 
        70         80         90        100        110        120 
EIVSVRGFSL EEKLRSQLYQ GDFVHAMEGK DFNYEYVQRE ALRVPLIFRE KDGLGIKMPD 
       130        140        150        160        170        180 
PDFTVRDVKL LVGSRRLVDV MDVNTQKGTE MSMSQFVRYY ETPEAQRDKL YNVISLEFSH 
       190        200        210        220        230        240 
TKLEHLVKRP TVVDLVDWVD NMWPQHLKEK QTEATNAIAE MKYPKVKKYC LMSVKGCFTD 
       250        260        270        280        290        300 
FHIDFGGTSV WYHVFRGGKI FWLIPPTLHN LALYEEWVLS GKQSDIFLGD RVERCQRIEL 
       310        320        330        340        350        360 
KQGYTFFIPS GWIHAVYTPV DSLVFGGNIL HSFNVPMQLR IYEIEDRTRV QPKFRYPFYY 
       370        380        390        400        410        420 
EMCWYVLERY VYCVTQRSHL TQEYQRESML IDAPRKPSID GFSSDSWLEM EEEACDQQPQ 
       430        440        450        460        470        480 
EEEEKDEEGE GRDRAPKPPT DGSTSPTSTP SEDQEALGKK PKAPALRFLK RTLSNESEES 
       490        500        510        520        530        540 
VKSTTLAVDY PKTPTGSPAT EVSAKWTHLT EFELKGLKAL VEKLESLPEN KKCVPEGIED 
       550        560        570        580        590        600 
PQALLEGVKN VLKEHADDDP SLAITGVPVV TWPKKTPKNR AVGRPKGKLG PASAVKLAAN 
       610        620        630        640        650        660 
RTTAGARRRR TRCRKCEACL RTECGECHFC KDMKKFGGPG RMKQSCIMRQ CIAPVLPHTA 
       670        680        690        700        710        720 
VCLVCGEAGK EDTVEEEEGK FNLMLMECSI CNEIIHPGCL KIKESEGVVN DELPNCWECP 
       730        740        750        760        770        780 
KCNHAGKTGK QKRGPGFKYA SNLPGSLLKE QKMNRDNKEG QEPAKRRSEC EEAPRRRSDE 
       790        800        810        820        830        840 
HSKKVPPDGL LRRKSDDVHL RKKRKYEKPQ ELSGRKRASS LQTSPGSSSH LSPRPPLGSS 
       850        860        870        880        890        900 
LSPWWRSSLT YFQQQLKPGK EDKLFRKKRR SWKNAEDRMA LANKPLRRFK QEPEDELPEA 
       910        920        930        940        950        960 
PPKTRESDHS RSSSPTAGPS TEGAEGPEEK KKVKMRRKRR LPNKELSREL SKELNHEIQR 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TENSLANENQ QPIKSEPESE GEEPKRPPGI CERPHRFSKG LNGTPRELRH QLGPSLRSPP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
RVISRPPPSV SPPKCIQMER HVIRPPPISP PPDSLPLDDG AAHVMHREVW MAVFSYLSHQ 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DLCVCMRVCR TWNRWCCDKR LWTRIDLNHC KSITPLMLSG IIRRQPVSLD LSWTNISKKQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
LSWLINRLPG LRDLVLSGCS WIAVSALCSS SCPLLRTLDV QWVEGLKDAQ MRDLLSPPTD 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
NRPGQMDNRS KLRNIVELRL AGLDITDASL RLIIRHMPLL SKLHLSYCNH VTDQSINLLT 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
AVGTTTRDSL TEINLSDCNK VTDQCLSFFK RCGNICHIDL RYCKQVTKEG CEQFIAEMSV 
      1330    
SVQFGQVEEK LLQKLS         10         20         30         40         50         60 
MAGPQMGGSA EDHPPRKRHA AEKQKKKTVI YTKCFEFESA TQRPIDRQRY DENEDLSDVE 
        70         80         90        100        110        120 
EIVSVRGFSL EEKLRSQLYQ GDFVHAMEGK DFNYEYVQRE ALRVPLIFRE KDGLGIKMPD 
       130        140        150        160        170        180 
PDFTVRDVKL LVGSRRLVDV MDVNTQKGTE MSMSQFVRYY ETPEAQRDKL YNVISLEFSH 
       190        200        210        220        230        240 
TKLEHLVKRP TVVDLVDWVD NMWPQHLKEK QTEATNAIAE MKYPKVKKYC LMSVKGCFTD 
       250        260        270        280        290        300 
FHIDFGGTSV WYHVFRGGKI FWLIPPTLHN LALYEEWVLS GKQSDIFLGD RVERCQRIEL 
       310        320        330        340        350        360 
KQGYTFFIPS GWIHAVYTPV DSLVFGGNIL HSFNVPMQLR IYEIEDRTRV QPKFRYPFYY 
       370        380        390        400        410        420 
EMCWYVLERY VYCVTQRSHL TQEYQRESML IDAPRKPSID GFSSDSWLEM EEEACDQQPQ 
       430        440        450        460        470        480 
EEEEKDEEGE GRDRAPKPPT DGSTSPTSTP SEDQEALGKK PKAPALRFLK RTLSNESEES 
       490        500        510        520        530        540 
VKSTTLAVDY PKTPTGSPAT EVSAKWTHLT EFELKGLKAL VEKLESLPEN KKCVPEGIED 
       550        560        570        580        590        600 
PQALLEGVKN VLKEHADDDP SLAITGVPVV TWPKKTPKNR AVGRPKGKLG PASAVKLAAN 
       610        620        630        640        650        660 
RTTAGARRRR TRCRKCEACL RTECGECHFC KDMKKFGGPG RMKQSCIMRQ CIAPVLPHTA 
       670        680        690        700        710        720 
VCLVCGEAGK EDTVEEEEGK FNLMLMECSI CNEIIHPGCL KIKESEGVVN DELPNCWECP 
       730        740        750        760        770        780 
KCNHAGKTGK QKRGPGFKYA SNLPGSLLKE QKMNRDNKEG QEPAKRRSEC EEAPRRRSDE 
       790        800        810        820        830        840 
HSKKVPPDGL LRRKSDDVHL RKKRKYEKPQ ELSGRKRASS LQTSPGSSSH LSPRPPLGSS 
       850        860        870        880        890        900 
LSPWWRSSLT YFQQQLKPGK EDKLFRKKRR SWKNAEDRMA LANKPLRRFK QEPEDELPEA 
       910        920        930        940        950        960 
PPKTRESDHS RSSSPTAGPS TEGAEGPEEK KKVKMRRKRR LPNKELSREL SKELNHEIQR 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TENSLANENQ QPIKSEPESE GEEPKRPPGI CERPHRFSKG LNGTPRELRH QLGPSLRSPP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
RVISRPPPSV SPPKCIQMER HVIRPPPISP PPDSLPLDDG AAHVMHREVW MAVFSYLSHQ 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DLCVCMRVCR TWNRWCCDKR LWTRIDLNHC KSITPLMLSG IIRRQPVSLD LSWTNISKKQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
LSWLINRLPG LRDLVLSGCS WIAVSALCSS SCPLLRTLDV QWVEGLKDAQ MRDLLSPPTD 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
NRPGQMDNRS KLRNIVELRL AGLDITDASL RLIIRHMPLL SKLHLSYCNH VTDQSINLLT 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
AVGTTTRDSL TEINLSDCNK VTDQCLSFFK RCGNICHIDL RYCKQVTKEG CEQFIAEMSV 
      1330    
SVQFGQVEEK LLQKLS         10         20         30         40         50         60 
MAGPQMGGSA EDHPPRKRHA AEKQKKKTVI YTKCFEFESA TQRPIDRQRY DENEDLSDVE 
        70         80         90        100        110        120 
EIVSVRGFSL EEKLRSQLYQ GDFVHAMEGK DFNYEYVQRE ALRVPLIFRE KDGLGIKMPD 
       130        140        150        160        170        180 
PDFTVRDVKL LVGSRRLVDV MDVNTQKGTE MSMSQFVRYY ETPEAQRDKL YNVISLEFSH 
       190        200        210        220        230        240 
TKLEHLVKRP TVVDLVDWVD NMWPQHLKEK QTEATNAIAE MKYPKVKKYC LMSVKGCFTD 
       250        260        270        280        290        300 
FHIDFGGTSV WYHVFRGGKI FWLIPPTLHN LALYEEWVLS GKQSDIFLGD RVERCQRIEL 
       310        320        330        340        350        360 
KQGYTFFIPS GWIHAVYTPV DSLVFGGNIL HSFNVPMQLR IYEIEDRTRV QPKFRYPFYY 
       370        380        390        400        410        420 
EMCWYVLERY VYCVTQRSHL TQEYQRESML IDAPRKPSID GFSSDSWLEM EEEACDQQPQ 
       430        440        450        460        470        480 
EEEEKDEEGE GRDRAPKPPT DGSTSPTSTP SEDQEALGKK PKAPALRFLK RTLSNESEES 
       490        500        510        520        530        540 
VKSTTLAVDY PKTPTGSPAT EVSAKWTHLT EFELKGLKAL VEKLESLPEN KKCVPEGIED 
       550        560        570        580        590        600 
PQALLEGVKN VLKEHADDDP SLAITGVPVV TWPKKTPKNR AVGRPKGKLG PASAVKLAAN 
       610        620        630        640        650        660 
RTTAGARRRR TRCRKCEACL RTECGECHFC KDMKKFGGPG RMKQSCIMRQ CIAPVLPHTA 
       670        680        690        700        710        720 
VCLVCGEAGK EDTVEEEEGK FNLMLMECSI CNEIIHPGCL KIKESEGVVN DELPNCWECP 
       730        740        750        760        770        780 
KCNHAGKTGK QKRGPGFKYA SNLPGSLLKE QKMNRDNKEG QEPAKRRSEC EEAPRRRSDE 
       790        800        810        820        830        840 
HSKKVPPDGL LRRKSDDVHL RKKRKYEKPQ ELSGRKRASS LQTSPGSSSH LSPRPPLGSS 
       850        860        870        880        890        900 
LSPWWRSSLT YFQQQLKPGK EDKLFRKKRR SWKNAEDRMA LANKPLRRFK QEPEDELPEA 
       910        920        930        940        950        960 
PPKTRESDHS RSSSPTAGPS TEGAEGPEEK KKVKMRRKRR LPNKELSREL SKELNHEIQR 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TENSLANENQ QPIKSEPESE GEEPKRPPGI CERPHRFSKG LNGTPRELRH QLGPSLRSPP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
RVISRPPPSV SPPKCIQMER HVIRPPPISP PPDSLPLDDG AAHVMHREVW MAVFSYLSHQ 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DLCVCMRVCR TWNRWCCDKR LWTRIDLNHC KSITPLMLSG IIRRQPVSLD LSWTNISKKQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
LSWLINRLPG LRDLVLSGCS WIAVSALCSS SCPLLRTLDV QWVEGLKDAQ MRDLLSPPTD 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
NRPGQMDNRS KLRNIVELRL AGLDITDASL RLIIRHMPLL SKLHLSYCNH VTDQSINLLT 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
AVGTTTRDSL TEINLSDCNK VTDQCLSFFK RCGNICHIDL RYCKQVTKEG CEQFIAEMSV 
      1330    
SVQFGQVEEK LLQKLS         10         20         30         40         50         60 
MAGPQMGGSA EDHPPRKRHA AEKQKKKTVI YTKCFEFESA TQRPIDRQRY DENEDLSDVE 
        70         80         90        100        110        120 
EIVSVRGFSL EEKLRSQLYQ GDFVHAMEGK DFNYEYVQRE ALRVPLIFRE KDGLGIKMPD 
       130        140        150        160        170        180 
PDFTVRDVKL LVGSRRLVDV MDVNTQKGTE MSMSQFVRYY ETPEAQRDKL YNVISLEFSH 
       190        200        210        220        230        240 
TKLEHLVKRP TVVDLVDWVD NMWPQHLKEK QTEATNAIAE MKYPKVKKYC LMSVKGCFTD 
       250        260        270        280        290        300 
FHIDFGGTSV WYHVFRGGKI FWLIPPTLHN LALYEEWVLS GKQSDIFLGD RVERCQRIEL 
       310        320        330        340        350        360 
KQGYTFFIPS GWIHAVYTPV DSLVFGGNIL HSFNVPMQLR IYEIEDRTRV QPKFRYPFYY 
       370        380        390        400        410        420 
EMCWYVLERY VYCVTQRSHL TQEYQRESML IDAPRKPSID GFSSDSWLEM EEEACDQQPQ 
       430        440        450        460        470        480 
EEEEKDEEGE GRDRAPKPPT DGSTSPTSTP SEDQEALGKK PKAPALRFLK RTLSNESEES 
       490        500        510        520        530        540 
VKSTTLAVDY PKTPTGSPAT EVSAKWTHLT EFELKGLKAL VEKLESLPEN KKCVPEGIED 
       550        560        570        580        590        600 
PQALLEGVKN VLKEHADDDP SLAITGVPVV TWPKKTPKNR AVGRPKGKLG PASAVKLAAN 
       610        620        630        640        650        660 
RTTAGARRRR TRCRKCEACL RTECGECHFC KDMKKFGGPG RMKQSCIMRQ CIAPVLPHTA 
       670        680        690        700        710        720 
VCLVCGEAGK EDTVEEEEGK FNLMLMECSI CNEIIHPGCL KIKESEGVVN DELPNCWECP 
       730        740        750        760        770        780 
KCNHAGKTGK QKRGPGFKYA SNLPGSLLKE QKMNRDNKEG QEPAKRRSEC EEAPRRRSDE 
       790        800        810        820        830        840 
HSKKVPPDGL LRRKSDDVHL RKKRKYEKPQ ELSGRKRASS LQTSPGSSSH LSPRPPLGSS 
       850        860        870        880        890        900 
LSPWWRSSLT YFQQQLKPGK EDKLFRKKRR SWKNAEDRMA LANKPLRRFK QEPEDELPEA 
       910        920        930        940        950        960 
PPKTRESDHS RSSSPTAGPS TEGAEGPEEK KKVKMRRKRR LPNKELSREL SKELNHEIQR 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TENSLANENQ QPIKSEPESE GEEPKRPPGI CERPHRFSKG LNGTPRELRH QLGPSLRSPP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
RVISRPPPSV SPPKCIQMER HVIRPPPISP PPDSLPLDDG AAHVMHREVW MAVFSYLSHQ 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
DLCVCMRVCR TWNRWCCDKR LWTRIDLNHC KSITPLMLSG IIRRQPVSLD LSWTNISKKQ 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
LSWLINRLPG LRDLVLSGCS WIAVSALCSS SCPLLRTLDV QWVEGLKDAQ MRDLLSPPTD 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
NRPGQMDNRS KLRNIVELRL AGLDITDASL RLIIRHMPLL SKLHLSYCNH VTDQSINLLT 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
AVGTTTRDSL TEINLSDCNK VTDQCLSFFK RCGNICHIDL RYCKQVTKEG CEQFIAEMSV 
      1330    
SVQFGQVEEK LLQKLS



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

4 N-termini - 7 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)