TopFIND 4.0

Q8R418: Endoribonuclease Dicer

General Information

Protein names
- Endoribonuclease Dicer
- 3.1.26.3
- Double-strand-specific ribonuclease mDCR-1
Gene names Dicer1
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q8R418

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MKSPALQPLS MAGLQLMTPA SSPMGPFFGL PWQQEAIHDN IYTPRKYQVE LLEAALDHNT 
        70         80         90        100        110        120 
IVCLNTGSGK TFIAVLLTKE LAHQIRGDLN PHAKRTVFLV NSANQVAQQV SAVRTHSDLK 
       130        140        150        160        170        180 
VGEYSDLEVN ASWTKERWSQ EFTKHQVLIM TCYVALTVLK NGYLSLSDIN LLVFDECHLA 
       190        200        210        220        230        240 
ILDHPYREIM KLCESCPSCP RILGLTASIL NGKCDPEELE EKIQKLERIL RSDAETATDL 
       250        260        270        280        290        300 
VVLDRYTSQP CEIVVDCGPF TDRSGLYERL LMELEAALDF INDCNVAVHS KERDSTLISK 
       310        320        330        340        350        360 
QILSDCRAVL VVLGPWCADK VAGMMVRELQ KYIKHEQEEL HRKFLLFTDT LLRKIHALCE 
       370        380        390        400        410        420 
EYFSPASLDL KYVTPKVMKL LEILRKYKPY ERQQFESVEW YNNRNQDNYV SWSDSEDDDD 
       430        440        450        460        470        480 
DEEIEEKEKP ETNFPSPFTN ILCGIIFVER RYTAVVLNRL IKEAGKQDPE LAYISSNFIT 
       490        500        510        520        530        540 
GHGIGKNQPR SKQMEAEFRK QEEVLRKFRA HETNLLIATS VVEEGVDIPK CNLVVRFDLP 
       550        560        570        580        590        600 
TEYRSYVQSK GRARAPISNY VMLADTDKIK SFEEDLKTYK AIEKILRNKC SKSADGAEAD 
       610        620        630        640        650        660 
VHAGVDDEDA FPPYVLRPDD GGPRVTINTA IGHINRYCAR LPSDPFTHLA PKCRTRELPD 
       670        680        690        700        710        720 
GTFYSTLYLP INSPLRASIV GPPMDSVRLA ERVVALICCE KLHKIGELDE HLMPVGKETV 
       730        740        750        760        770        780 
KYEEELDLHD EEETSVPGRP GSTKRRQCYP KAIPECLRES YPKPDQPCYL YVIGMVLTTP 
       790        800        810        820        830        840 
LPDELNFRRR KLYPPEDTTR CFGILTAKPI PQIPHFPVYT RSGEVTISIE LKKSGFTLSQ 
       850        860        870        880        890        900 
QMLELITRLH QYIFSHILRL EKPALEFKPT GAESAYCVLP LNVVNDSGTL DIDFKFMEDI 
       910        920        930        940        950        960 
EKSEARIGIP STKYSKETPF VFKLEDYQDA VIIPRYRNFD QPHRFYVADV YTDLTPLSKF 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PSPEYETFAE YYKTKYNLDL TNLNQPLLDV DHTSSRLNLL TPRHLNQKGK ALPLSSAEKR 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KAKWESLQNK QILVPELCAI HPIPASLWRK AVCLPSILYR LHCLLTAEEL RAQTASDAGV 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
GVRSLPVDFR YPNLDFGWKK SIDSKSFIST CNSSLAESDN YCKHSTTVVP EHAAHQGATR 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
PSLENHDQMS VNCKRLPAES PAKLQSEVST DLTAINGLSY NKNLANGSYD LVNRDFCQGN 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
QLNYFKQEIP VQPTTSYPIQ NLYNYENQPK PSNECPLLSN TYLDGNANTS TSDGSPAVST 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
MPAMMNAVKA LKDRMDSEQS PSVGYSSRTL GPNPGLILQA LTLSNASDGF NLERLEMLGD 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
SFLKHAITTY LFCTYPDAHE GRLSYMRSKK VSNCNLYRLG KKKGLPSRMV VSIFDPPVNW 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LPPGYVVNQD KSNSEKWEKD EMTKDCLLAN GKLGEACEEE EDLTWRAPKE EAEDEDDFLE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
YDQEHIQFID SMLMGSGAFV RKISLSPFSA SDSAYEWKMP KKASLGSMPF ASGLEDFDYS 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
SWDAMCYLDP SKAVEEDDFV VGFWNPSEEN CGVDTGKQSI SYDLHTEQCI ADKSIADCVE 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
ALLGCYLTSC GERAAQLFLC SLGLKVLPVI KRTSREKALD PAQENGSSQQ KSLSGSCAAP 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
VGPRSSAGKD LEYGCLKIPP RCMFDHPDAE KTLNHLISGF ETFEKKINYR FKNKAYLLQA 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
FTHASYHYNT ITDCYQRLEF LGDAILDYLI TKHLYEDPRQ HSPGVLTDLR SALVNNTIFA 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
SLAVKYDYHK YFKAVSPELF HVIDDFVKFQ LEKNEMQGMD SELRRSEEDE EKEEDIEVPK 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
AMGDIFESLA GAIYMDSGMS LEVVWQVYYP MMQPLIEKFS ANVPRSPVRE LLEMEPETAK 
      1870       1880       1890       1900       1910    
FSPAERTYDG KVRVTVEVVG KGKFKGVGRS YRIAKSAAAR RALRSLKANQ PQVPNS

Isoforms

- Isoform 2 of Endoribonuclease Dicer

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MKSPALQPLS MAGLQLMTPA SSPMGPFFGL PWQQEAIHDN IYTPRKYQVE LLEAALDHNT 
        70         80         90        100        110        120 
IVCLNTGSGK TFIAVLLTKE LAHQIRGDLN PHAKRTVFLV NSANQVAQQV SAVRTHSDLK 
       130        140        150        160        170        180 
VGEYSDLEVN ASWTKERWSQ EFTKHQVLIM TCYVALTVLK NGYLSLSDIN LLVFDECHLA 
       190        200        210        220        230        240 
ILDHPYREIM KLCESCPSCP RILGLTASIL NGKCDPEELE EKIQKLERIL RSDAETATDL 
       250        260        270        280        290        300 
VVLDRYTSQP CEIVVDCGPF TDRSGLYERL LMELEAALDF INDCNVAVHS KERDSTLISK 
       310        320        330        340        350        360 
QILSDCRAVL VVLGPWCADK VAGMMVRELQ KYIKHEQEEL HRKFLLFTDT LLRKIHALCE 
       370        380        390        400        410        420 
EYFSPASLDL KYVTPKVMKL LEILRKYKPY ERQQFESVEW YNNRNQDNYV SWSDSEDDDD 
       430        440        450        460        470        480 
DEEIEEKEKP ETNFPSPFTN ILCGIIFVER RYTAVVLNRL IKEAGKQDPE LAYISSNFIT 
       490        500        510        520        530        540 
GHGIGKNQPR SKQMEAEFRK QEEVLRKFRA HETNLLIATS VVEEGVDIPK CNLVVRFDLP 
       550        560        570        580        590        600 
TEYRSYVQSK GRARAPISNY VMLADTDKIK SFEEDLKTYK AIEKILRNKC SKSADGAEAD 
       610        620        630        640        650        660 
VHAGVDDEDA FPPYVLRPDD GGPRVTINTA IGHINRYCAR LPSDPFTHLA PKCRTRELPD 
       670        680        690        700        710        720 
GTFYSTLYLP INSPLRASIV GPPMDSVRLA ERVVALICCE KLHKIGELDE HLMPVGKETV 
       730        740        750        760        770        780 
KYEEELDLHD EEETSVPGRP GSTKRRQCYP KAIPECLRES YPKPDQPCYL YVIGMVLTTP 
       790        800        810        820        830        840 
LPDELNFRRR KLYPPEDTTR CFGILTAKPI PQIPHFPVYT RSGEVTISIE LKKSGFTLSQ 
       850        860        870        880        890        900 
QMLELITRLH QYIFSHILRL EKPALEFKPT GAESAYCVLP LNVVNDSGTL DIDFKFMEDI 
       910        920        930        940        950        960 
EKSEARIGIP STKYSKETPF VFKLEDYQDA VIIPRYRNFD QPHRFYVADV YTDLTPLSKF 
       970        980        990       1000       1010       1020 
PSPEYETFAE YYKTKYNLDL TNLNQPLLDV DHTSSRLNLL TPRHLNQKGK ALPLSSAEKR 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
KAKWESLQNK QILVPELCAI HPIPASLWRK AVCLPSILYR LHCLLTAEEL RAQTASDAGV 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
GVRSLPVDFR YPNLDFGWKK SIDSKSFIST CNSSLAESDN YCKHSTTVVP EHAAHQGATR 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
PSLENHDQMS VNCKRLPAES PAKLQSEVST DLTAINGLSY NKNLANGSYD LVNRDFCQGN 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
QLNYFKQEIP VQPTTSYPIQ NLYNYENQPK PSNECPLLSN TYLDGNANTS TSDGSPAVST 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
MPAMMNAVKA LKDRMDSEQS PSVGYSSRTL GPNPGLILQA LTLSNASDGF NLERLEMLGD 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
SFLKHAITTY LFCTYPDAHE GRLSYMRSKK VSNCNLYRLG KKKGLPSRMV VSIFDPPVNW 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LPPGYVVNQD KSNSEKWEKD EMTKDCLLAN GKLGEACEEE EDLTWRAPKE EAEDEDDFLE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
YDQEHIQFID SMLMGSGAFV RKISLSPFSA SDSAYEWKMP KKASLGSMPF ASGLEDFDYS 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
SWDAMCYLDP SKAVEEDDFV VGFWNPSEEN CGVDTGKQSI SYDLHTEQCI ADKSIADCVE 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
ALLGCYLTSC GERAAQLFLC SLGLKVLPVI KRTSREKALD PAQENGSSQQ KSLSGSCAAP 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
VGPRSSAGKD LEYGCLKIPP RCMFDHPDAE KTLNHLISGF ETFEKKINYR FKNKAYLLQA 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
FTHASYHYNT ITDCYQRLEF LGDAILDYLI TKHLYEDPRQ HSPGVLTDLR SALVNNTIFA 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
SLAVKYDYHK YFKAVSPELF HVIDDFVKFQ LEKNEMQGMD SELRRSEEDE EKEEDIEVPK 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
AMGDIFESLA GAIYMDSGMS LEVVWQVYYP MMQPLIEKFS ANVPRSPVRE LLEMEPETAK 
      1870       1880       1890       1900       1910    
FSPAERTYDG KVRVTVEVVG KGKFKGVGRS YRIAKSAAAR RALRSLKANQ PQVPNS



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q8R418-1-unknown MKSPAL... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...QVPNS 1916 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...QVPNS 1916 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt68406

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)