TopFIND 4.0

Q8VH51: RNA-binding protein 39

General Information

Protein names
- RNA-binding protein 39
- Coactivator of activating protein 1 and estrogen receptors
- Coactivator of AP-1 and ERs
- RNA-binding motif protein 39
- RNA-binding region-containing protein 2
- Transcription coactivator CAPER
Gene names Rbm39
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q8VH51

3

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MADDIDIEAM LEAPYKKDEN KLNSANGHEE RSKKRKKSKS RSRSHERKRS KSKERKRSRD 
        70         80         90        100        110        120 
RERKKSKSRE RKRSRSKERR RSRSRSRDRR FRGRYRSPYS GPKFNSAIRG KIGLPHSIKL 
       130        140        150        160        170        180 
SRRRSRSKSP FRKDKSPVRE PIDNLTPEER DARTVFCMQL AARIRPRDLE EFFSTVGKVR 
       190        200        210        220        230        240 
DVRMISDRNS RRSKGIAYVE FVDVSSVPLA IGLTGQRVLG VPIIVQASQA EKNRAAAMAN 
       250        260        270        280        290        300 
NLQKGSAGPM RLYVGSLHFN ITEDMLRGIF EPFGRIESIQ LMMDSETGRS KGYGFITFSD 
       310        320        330        340        350        360 
SECAKKALEQ LNGFELAGRP MKVGHVTERT DASSASSFLD SDELERTGID LGTTGRLQLM 
       370        380        390        400        410        420 
ARLAEGTGLQ IPPAAQQALQ MSGSLAFGAV AEFSFVIDLQ TRLSQQTEAS ALAAAASVQP 
       430        440        450        460        470        480 
LATQCFQLSN MFNPQTEEEV GWDTEIKDDV IEECNKHGGV IHIYVDKNSA QGNVYVKCPS 
       490        500        510        520        530    
IAAAIAAVNA LHGRWFAGKM ITAAYVPLPT YHNLFPDSMT ATQLLVPSRR 

Isoforms

- Isoform 2 of RNA-binding protein 39 - Isoform 3 of RNA-binding protein 39 - Isoform 3 of RNA-binding protein 39

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MADDIDIEAM LEAPYKKDEN KLNSANGHEE RSKKRKKSKS RSRSHERKRS KSKERKRSRD 
        70         80         90        100        110        120 
RERKKSKSRE RKRSRSKERR RSRSRSRDRR FRGRYRSPYS GPKFNSAIRG KIGLPHSIKL 
       130        140        150        160        170        180 
SRRRSRSKSP FRKDKSPVRE PIDNLTPEER DARTVFCMQL AARIRPRDLE EFFSTVGKVR 
       190        200        210        220        230        240 
DVRMISDRNS RRSKGIAYVE FVDVSSVPLA IGLTGQRVLG VPIIVQASQA EKNRAAAMAN 
       250        260        270        280        290        300 
NLQKGSAGPM RLYVGSLHFN ITEDMLRGIF EPFGRIESIQ LMMDSETGRS KGYGFITFSD 
       310        320        330        340        350        360 
SECAKKALEQ LNGFELAGRP MKVGHVTERT DASSASSFLD SDELERTGID LGTTGRLQLM 
       370        380        390        400        410        420 
ARLAEGTGLQ IPPAAQQALQ MSGSLAFGAV AEFSFVIDLQ TRLSQQTEAS ALAAAASVQP 
       430        440        450        460        470        480 
LATQCFQLSN MFNPQTEEEV GWDTEIKDDV IEECNKHGGV IHIYVDKNSA QGNVYVKCPS 
       490        500        510        520        530    
IAAAIAAVNA LHGRWFAGKM ITAAYVPLPT YHNLFPDSMT ATQLLVPSRR          10         20         30         40         50         60 
MADDIDIEAM LEAPYKKDEN KLNSANGHEE RSKKRKKSKS RSRSHERKRS KSKERKRSRD 
        70         80         90        100        110        120 
RERKKSKSRE RKRSRSKERR RSRSRSRDRR FRGRYRSPYS GPKFNSAIRG KIGLPHSIKL 
       130        140        150        160        170        180 
SRRRSRSKSP FRKDKSPVRE PIDNLTPEER DARTVFCMQL AARIRPRDLE EFFSTVGKVR 
       190        200        210        220        230        240 
DVRMISDRNS RRSKGIAYVE FVDVSSVPLA IGLTGQRVLG VPIIVQASQA EKNRAAAMAN 
       250        260        270        280        290        300 
NLQKGSAGPM RLYVGSLHFN ITEDMLRGIF EPFGRIESIQ LMMDSETGRS KGYGFITFSD 
       310        320        330        340        350        360 
SECAKKALEQ LNGFELAGRP MKVGHVTERT DASSASSFLD SDELERTGID LGTTGRLQLM 
       370        380        390        400        410        420 
ARLAEGTGLQ IPPAAQQALQ MSGSLAFGAV AEFSFVIDLQ TRLSQQTEAS ALAAAASVQP 
       430        440        450        460        470        480 
LATQCFQLSN MFNPQTEEEV GWDTEIKDDV IEECNKHGGV IHIYVDKNSA QGNVYVKCPS 
       490        500        510        520        530    
IAAAIAAVNA LHGRWFAGKM ITAAYVPLPT YHNLFPDSMT ATQLLVPSRR          10         20         30         40         50         60 
MADDIDIEAM LEAPYKKDEN KLNSANGHEE RSKKRKKSKS RSRSHERKRS KSKERKRSRD 
        70         80         90        100        110        120 
RERKKSKSRE RKRSRSKERR RSRSRSRDRR FRGRYRSPYS GPKFNSAIRG KIGLPHSIKL 
       130        140        150        160        170        180 
SRRRSRSKSP FRKDKSPVRE PIDNLTPEER DARTVFCMQL AARIRPRDLE EFFSTVGKVR 
       190        200        210        220        230        240 
DVRMISDRNS RRSKGIAYVE FVDVSSVPLA IGLTGQRVLG VPIIVQASQA EKNRAAAMAN 
       250        260        270        280        290        300 
NLQKGSAGPM RLYVGSLHFN ITEDMLRGIF EPFGRIESIQ LMMDSETGRS KGYGFITFSD 
       310        320        330        340        350        360 
SECAKKALEQ LNGFELAGRP MKVGHVTERT DASSASSFLD SDELERTGID LGTTGRLQLM 
       370        380        390        400        410        420 
ARLAEGTGLQ IPPAAQQALQ MSGSLAFGAV AEFSFVIDLQ TRLSQQTEAS ALAAAASVQP 
       430        440        450        460        470        480 
LATQCFQLSN MFNPQTEEEV GWDTEIKDDV IEECNKHGGV IHIYVDKNSA QGNVYVKCPS 
       490        500        510        520        530    
IAAAIAAVNA LHGRWFAGKM ITAAYVPLPT YHNLFPDSMT ATQLLVPSRR 



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

3 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)