TopFIND 4.0

Q96JI7: Spatacsin

General Information

Protein names
- Spatacsin
- Colorectal carcinoma-associated protein
- Spastic paraplegia 11 protein
Gene names SPG11
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q96JI7

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MAAEEGVASA ASAGGSWGTA AMGRVLPMLL VPVPAEAMGQ LGSRAQLRTQ PEALGSLTAA 
        70         80         90        100        110        120 
GSLQVLSLTP GSRGGGRCCL EGPFWHFLWE DSRNSSTPTE KPKLLALGEN YELLIYEFNL 
       130        140        150        160        170        180 
KDGRCDATIL YSCSREALQK LIDDQDISIS LLSLRILSFH NNTSLLFINK CVILHIIFPE 
       190        200        210        220        230        240 
RDAAIRVLNC FTLPLPAQAV DMIIDTQLCR GILFVLSSLG WIYIFDVVDG TYVAHVDLAL 
       250        260        270        280        290        300 
HKEDMCNEQQ QEPAKISSFT SLKVSQDLDV AVIVSSSNSA VALNLNLYFR QHPGHLLCER 
       310        320        330        340        350        360 
ILEDLPIQGP KGVDEDDPVN SAYNMKLAKF SFQIDRSWKA QLSSLNETIK NSKLEVSCCA 
       370        380        390        400        410        420 
PWFQDILHLE SPESGNHSTS VQSWAFIPQD IMHGQYNVLQ KDHAKTSDPG RSWKIMHISE 
       430        440        450        460        470        480 
QEEPIELKCV SVTGFTALFT WEVERMGYTI TLWDLETQGM QCFSLGTKCI PVDSSGDQQL 
       490        500        510        520        530        540 
CFVLTENGLS LILFGLTQEE FLNRLMIHGS ASTVDTLCHL NGWGRCSIPI HALEAGIENR 
       550        560        570        580        590        600 
QLDTVNFFLK SKENLFNPSS KSSVSDQFDH LSSHLYLRNV EELIPALDLL CSAIRESYSE 
       610        620        630        640        650        660 
PQSKHFSEQL LNLTLSFLNN QIKELFIHTE ELDEHLQKGV NILTSYINEL RTFMIKFPWK 
       670        680        690        700        710        720 
LTDAIDEYDV HENVPKVKES NIWKKLSFEE VIASAILNNK IPEAQTFFRI DSHSAQKLEE 
       730        740        750        760        770        780 
LIGIGLNLVF DNLKKNNIKE ASELLKNMGF DVKGQLLKIC FYTTNKNIRD FLVEILKEKN 
       790        800        810        820        830        840 
YFSEKEKRTI DFVHQVEKLY LGHFQENMQI QSFPRYWIKE QDFFKHKSVL DSFLKYDCKD 
       850        860        870        880        890        900 
EFNKQDHRIV LNWALWWDQL TQESILLPRI SPEEYKSYSP EALWRYLTAR HDWLNIILWI 
       910        920        930        940        950        960 
GEFQTQHSYA SLQQNKWPLL TVDVINQNTS CNNYMRNEIL DKLARNGVFL ASELEDFECF 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LLRLSRIGGV IQDTLPVQNY KTKEGWDFHS QFILYCLEHS LQHLLYVYLD CYKLSPENCP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
FLEKKELHEA HPWFEFLVQC RQVASNLTDP KLIFQASLAN AQILIPTNQA SVSSMLLEGH 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
TLLALATTMY SPGGVSQVVQ NEENENCLKK VDPQLLKMAL TPYPKLKTAL FPQCTPPSVL 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
PSDITIYHLI QSLSPFDPSR LFGWQSANTL AIGDAWSHLP HFSSPDLVNK YAIVERLNFA 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
YYLHNGRPSF AFGTFLVQEL IKSKTPKQLI QQVGNEAYVI GLSSFHIPSI GAACVCFLEL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
LGLDSLKLRV DMKVANIILS YKCRNEDAQY SFIRESVAEK LSKLADGEKT TTEELLVLLE 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
EGTWNSIQQQ EIKRLSSESS SQWALVVQFC RLHNMKLSIS YLRECAKAND WLQFIIHSQL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
HNYHPAEVKS LIQYFSPVIQ DHLRLAFENL PSVPTSKMDS DQVCNKCPQE LQGSKQEMTD 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
LFEILLQCSE EPDSWHWLLV EAVKQQAPIL SVLASCLQGA SAISCLCVWI ITSVEDNVAT 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
EAMGHIQDST EDHTWNLEDL SVIWRTLLTR QKSKTLIRGF QLFFKDSPLL LVMEMYELCM 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
FFRNYKEAEA KLLEFQKSLE TLNTAATKVH PVIPAMWLED QVCFLLKLML QQCKTQYELG 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
KLLQLFVERE HLFSDGPDVK KLCILCQILK DTSIAINHTI ITSYSIENLQ HECRSILERL 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
QTDGQFALAR RVAELAELPV DNLVIKEITQ EMQTLKHIEQ WSLKQARIDF WKKCHENFKK 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
NSISSKAASS FFSTQAHVAC EHPTGWSSME ERHLLLTLAG HWLAQEDVVP LDKLEELEKQ 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
IWLCRITQHT LGRNQEETEP RFSRQISTSG ELSFDSLASE FSFSKLAALN TSKYLELNSL 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
PSKETCENRL DWKEQESLNF LIGRLLDDGC VHEASRVCRY FHFYNPDVAL VLHCRALASG 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
EASMEDLHPE IHALLQSAEL LEEEAPDIPL RRVHSTSSLD SQKFVTVPSS NEVVTNLEVL 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
TSKCLHGKNY CRQVLCLYDL AKELGCSYTD VAAQDGEAML RKILASQQPD RCKRAQAFIS 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
TQGLKPDTVA ELVAEEVTRE LLTSSQGTGH KQMFNPTEES QTFLQLTTLC QDRTLVGMKL 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
LDKISSVPHG ELSCTTELLI LAHHCFTLTC HMEGIIRVLQ AAHMLTDNHL APSEEYGLVV 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
RLLTGIGRYN EMTYIFDLLH KKHYFEVLMR KKLDPSGTLK TALLDYIKRC RPGDSEKHNM 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
IALCFSMCRE IGENHEAAAR IQLKLIESQP WEDSLKDGHQ LKQLLLKALT LMLDAAESYA 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
KDSCVRQAQH CQRLTKLITL QIHFLNTGQN TMLINLGRHK LMDCILALPR FYQASIVAEA 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
YDFVPDWAEI LYQQVILKGD FNYLEEFKQQ RLLKSSIFEE ISKKYKQHQP TDMVMENLKK 
      2410       2420       2430       2440    
LLTYCEDVYL YYKLAYEHKF YEIVNVLLKD PQTGCCLKDM LAG

Isoforms

- Isoform 2 of Spatacsin - Isoform 3 of Spatacsin

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MAAEEGVASA ASAGGSWGTA AMGRVLPMLL VPVPAEAMGQ LGSRAQLRTQ PEALGSLTAA 
        70         80         90        100        110        120 
GSLQVLSLTP GSRGGGRCCL EGPFWHFLWE DSRNSSTPTE KPKLLALGEN YELLIYEFNL 
       130        140        150        160        170        180 
KDGRCDATIL YSCSREALQK LIDDQDISIS LLSLRILSFH NNTSLLFINK CVILHIIFPE 
       190        200        210        220        230        240 
RDAAIRVLNC FTLPLPAQAV DMIIDTQLCR GILFVLSSLG WIYIFDVVDG TYVAHVDLAL 
       250        260        270        280        290        300 
HKEDMCNEQQ QEPAKISSFT SLKVSQDLDV AVIVSSSNSA VALNLNLYFR QHPGHLLCER 
       310        320        330        340        350        360 
ILEDLPIQGP KGVDEDDPVN SAYNMKLAKF SFQIDRSWKA QLSSLNETIK NSKLEVSCCA 
       370        380        390        400        410        420 
PWFQDILHLE SPESGNHSTS VQSWAFIPQD IMHGQYNVLQ KDHAKTSDPG RSWKIMHISE 
       430        440        450        460        470        480 
QEEPIELKCV SVTGFTALFT WEVERMGYTI TLWDLETQGM QCFSLGTKCI PVDSSGDQQL 
       490        500        510        520        530        540 
CFVLTENGLS LILFGLTQEE FLNRLMIHGS ASTVDTLCHL NGWGRCSIPI HALEAGIENR 
       550        560        570        580        590        600 
QLDTVNFFLK SKENLFNPSS KSSVSDQFDH LSSHLYLRNV EELIPALDLL CSAIRESYSE 
       610        620        630        640        650        660 
PQSKHFSEQL LNLTLSFLNN QIKELFIHTE ELDEHLQKGV NILTSYINEL RTFMIKFPWK 
       670        680        690        700        710        720 
LTDAIDEYDV HENVPKVKES NIWKKLSFEE VIASAILNNK IPEAQTFFRI DSHSAQKLEE 
       730        740        750        760        770        780 
LIGIGLNLVF DNLKKNNIKE ASELLKNMGF DVKGQLLKIC FYTTNKNIRD FLVEILKEKN 
       790        800        810        820        830        840 
YFSEKEKRTI DFVHQVEKLY LGHFQENMQI QSFPRYWIKE QDFFKHKSVL DSFLKYDCKD 
       850        860        870        880        890        900 
EFNKQDHRIV LNWALWWDQL TQESILLPRI SPEEYKSYSP EALWRYLTAR HDWLNIILWI 
       910        920        930        940        950        960 
GEFQTQHSYA SLQQNKWPLL TVDVINQNTS CNNYMRNEIL DKLARNGVFL ASELEDFECF 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LLRLSRIGGV IQDTLPVQNY KTKEGWDFHS QFILYCLEHS LQHLLYVYLD CYKLSPENCP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
FLEKKELHEA HPWFEFLVQC RQVASNLTDP KLIFQASLAN AQILIPTNQA SVSSMLLEGH 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
TLLALATTMY SPGGVSQVVQ NEENENCLKK VDPQLLKMAL TPYPKLKTAL FPQCTPPSVL 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
PSDITIYHLI QSLSPFDPSR LFGWQSANTL AIGDAWSHLP HFSSPDLVNK YAIVERLNFA 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
YYLHNGRPSF AFGTFLVQEL IKSKTPKQLI QQVGNEAYVI GLSSFHIPSI GAACVCFLEL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
LGLDSLKLRV DMKVANIILS YKCRNEDAQY SFIRESVAEK LSKLADGEKT TTEELLVLLE 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
EGTWNSIQQQ EIKRLSSESS SQWALVVQFC RLHNMKLSIS YLRECAKAND WLQFIIHSQL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
HNYHPAEVKS LIQYFSPVIQ DHLRLAFENL PSVPTSKMDS DQVCNKCPQE LQGSKQEMTD 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
LFEILLQCSE EPDSWHWLLV EAVKQQAPIL SVLASCLQGA SAISCLCVWI ITSVEDNVAT 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
EAMGHIQDST EDHTWNLEDL SVIWRTLLTR QKSKTLIRGF QLFFKDSPLL LVMEMYELCM 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
FFRNYKEAEA KLLEFQKSLE TLNTAATKVH PVIPAMWLED QVCFLLKLML QQCKTQYELG 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
KLLQLFVERE HLFSDGPDVK KLCILCQILK DTSIAINHTI ITSYSIENLQ HECRSILERL 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
QTDGQFALAR RVAELAELPV DNLVIKEITQ EMQTLKHIEQ WSLKQARIDF WKKCHENFKK 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
NSISSKAASS FFSTQAHVAC EHPTGWSSME ERHLLLTLAG HWLAQEDVVP LDKLEELEKQ 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
IWLCRITQHT LGRNQEETEP RFSRQISTSG ELSFDSLASE FSFSKLAALN TSKYLELNSL 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
PSKETCENRL DWKEQESLNF LIGRLLDDGC VHEASRVCRY FHFYNPDVAL VLHCRALASG 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
EASMEDLHPE IHALLQSAEL LEEEAPDIPL RRVHSTSSLD SQKFVTVPSS NEVVTNLEVL 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
TSKCLHGKNY CRQVLCLYDL AKELGCSYTD VAAQDGEAML RKILASQQPD RCKRAQAFIS 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
TQGLKPDTVA ELVAEEVTRE LLTSSQGTGH KQMFNPTEES QTFLQLTTLC QDRTLVGMKL 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
LDKISSVPHG ELSCTTELLI LAHHCFTLTC HMEGIIRVLQ AAHMLTDNHL APSEEYGLVV 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
RLLTGIGRYN EMTYIFDLLH KKHYFEVLMR KKLDPSGTLK TALLDYIKRC RPGDSEKHNM 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
IALCFSMCRE IGENHEAAAR IQLKLIESQP WEDSLKDGHQ LKQLLLKALT LMLDAAESYA 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
KDSCVRQAQH CQRLTKLITL QIHFLNTGQN TMLINLGRHK LMDCILALPR FYQASIVAEA 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
YDFVPDWAEI LYQQVILKGD FNYLEEFKQQ RLLKSSIFEE ISKKYKQHQP TDMVMENLKK 
      2410       2420       2430       2440    
LLTYCEDVYL YYKLAYEHKF YEIVNVLLKD PQTGCCLKDM LAG         10         20         30         40         50         60 
MAAEEGVASA ASAGGSWGTA AMGRVLPMLL VPVPAEAMGQ LGSRAQLRTQ PEALGSLTAA 
        70         80         90        100        110        120 
GSLQVLSLTP GSRGGGRCCL EGPFWHFLWE DSRNSSTPTE KPKLLALGEN YELLIYEFNL 
       130        140        150        160        170        180 
KDGRCDATIL YSCSREALQK LIDDQDISIS LLSLRILSFH NNTSLLFINK CVILHIIFPE 
       190        200        210        220        230        240 
RDAAIRVLNC FTLPLPAQAV DMIIDTQLCR GILFVLSSLG WIYIFDVVDG TYVAHVDLAL 
       250        260        270        280        290        300 
HKEDMCNEQQ QEPAKISSFT SLKVSQDLDV AVIVSSSNSA VALNLNLYFR QHPGHLLCER 
       310        320        330        340        350        360 
ILEDLPIQGP KGVDEDDPVN SAYNMKLAKF SFQIDRSWKA QLSSLNETIK NSKLEVSCCA 
       370        380        390        400        410        420 
PWFQDILHLE SPESGNHSTS VQSWAFIPQD IMHGQYNVLQ KDHAKTSDPG RSWKIMHISE 
       430        440        450        460        470        480 
QEEPIELKCV SVTGFTALFT WEVERMGYTI TLWDLETQGM QCFSLGTKCI PVDSSGDQQL 
       490        500        510        520        530        540 
CFVLTENGLS LILFGLTQEE FLNRLMIHGS ASTVDTLCHL NGWGRCSIPI HALEAGIENR 
       550        560        570        580        590        600 
QLDTVNFFLK SKENLFNPSS KSSVSDQFDH LSSHLYLRNV EELIPALDLL CSAIRESYSE 
       610        620        630        640        650        660 
PQSKHFSEQL LNLTLSFLNN QIKELFIHTE ELDEHLQKGV NILTSYINEL RTFMIKFPWK 
       670        680        690        700        710        720 
LTDAIDEYDV HENVPKVKES NIWKKLSFEE VIASAILNNK IPEAQTFFRI DSHSAQKLEE 
       730        740        750        760        770        780 
LIGIGLNLVF DNLKKNNIKE ASELLKNMGF DVKGQLLKIC FYTTNKNIRD FLVEILKEKN 
       790        800        810        820        830        840 
YFSEKEKRTI DFVHQVEKLY LGHFQENMQI QSFPRYWIKE QDFFKHKSVL DSFLKYDCKD 
       850        860        870        880        890        900 
EFNKQDHRIV LNWALWWDQL TQESILLPRI SPEEYKSYSP EALWRYLTAR HDWLNIILWI 
       910        920        930        940        950        960 
GEFQTQHSYA SLQQNKWPLL TVDVINQNTS CNNYMRNEIL DKLARNGVFL ASELEDFECF 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LLRLSRIGGV IQDTLPVQNY KTKEGWDFHS QFILYCLEHS LQHLLYVYLD CYKLSPENCP 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
FLEKKELHEA HPWFEFLVQC RQVASNLTDP KLIFQASLAN AQILIPTNQA SVSSMLLEGH 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
TLLALATTMY SPGGVSQVVQ NEENENCLKK VDPQLLKMAL TPYPKLKTAL FPQCTPPSVL 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
PSDITIYHLI QSLSPFDPSR LFGWQSANTL AIGDAWSHLP HFSSPDLVNK YAIVERLNFA 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
YYLHNGRPSF AFGTFLVQEL IKSKTPKQLI QQVGNEAYVI GLSSFHIPSI GAACVCFLEL 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
LGLDSLKLRV DMKVANIILS YKCRNEDAQY SFIRESVAEK LSKLADGEKT TTEELLVLLE 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
EGTWNSIQQQ EIKRLSSESS SQWALVVQFC RLHNMKLSIS YLRECAKAND WLQFIIHSQL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
HNYHPAEVKS LIQYFSPVIQ DHLRLAFENL PSVPTSKMDS DQVCNKCPQE LQGSKQEMTD 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
LFEILLQCSE EPDSWHWLLV EAVKQQAPIL SVLASCLQGA SAISCLCVWI ITSVEDNVAT 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
EAMGHIQDST EDHTWNLEDL SVIWRTLLTR QKSKTLIRGF QLFFKDSPLL LVMEMYELCM 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
FFRNYKEAEA KLLEFQKSLE TLNTAATKVH PVIPAMWLED QVCFLLKLML QQCKTQYELG 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
KLLQLFVERE HLFSDGPDVK KLCILCQILK DTSIAINHTI ITSYSIENLQ HECRSILERL 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
QTDGQFALAR RVAELAELPV DNLVIKEITQ EMQTLKHIEQ WSLKQARIDF WKKCHENFKK 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
NSISSKAASS FFSTQAHVAC EHPTGWSSME ERHLLLTLAG HWLAQEDVVP LDKLEELEKQ 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
IWLCRITQHT LGRNQEETEP RFSRQISTSG ELSFDSLASE FSFSKLAALN TSKYLELNSL 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
PSKETCENRL DWKEQESLNF LIGRLLDDGC VHEASRVCRY FHFYNPDVAL VLHCRALASG 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
EASMEDLHPE IHALLQSAEL LEEEAPDIPL RRVHSTSSLD SQKFVTVPSS NEVVTNLEVL 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
TSKCLHGKNY CRQVLCLYDL AKELGCSYTD VAAQDGEAML RKILASQQPD RCKRAQAFIS 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
TQGLKPDTVA ELVAEEVTRE LLTSSQGTGH KQMFNPTEES QTFLQLTTLC QDRTLVGMKL 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
LDKISSVPHG ELSCTTELLI LAHHCFTLTC HMEGIIRVLQ AAHMLTDNHL APSEEYGLVV 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
RLLTGIGRYN EMTYIFDLLH KKHYFEVLMR KKLDPSGTLK TALLDYIKRC RPGDSEKHNM 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
IALCFSMCRE IGENHEAAAR IQLKLIESQP WEDSLKDGHQ LKQLLLKALT LMLDAAESYA 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
KDSCVRQAQH CQRLTKLITL QIHFLNTGQN TMLINLGRHK LMDCILALPR FYQASIVAEA 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
YDFVPDWAEI LYQQVILKGD FNYLEEFKQQ RLLKSSIFEE ISKKYKQHQP TDMVMENLKK 
      2410       2420       2430       2440    
LLTYCEDVYL YYKLAYEHKF YEIVNVLLKD PQTGCCLKDM LAG



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q96JI7-1-unknown MAAEEG... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q96JI7-1-unknown MAAEEG... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt90570
    Q96JI7-1-unknown MAAEEG... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt90571

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...DMLAG 2443 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...DMLAG 2443 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt86189

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)