TopFIND 4.0

Q96RT7: Gamma-tubulin complex component 6

General Information

Protein names
- Gamma-tubulin complex component 6
- GCP-6
Gene names TUBGCP6
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q96RT7

1

N-termini

2

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MASITQLFDD LCEALLPAAK THLGQRSVNR KRAKRSLKKV AYNALFTNLF QDETQQLQPD 
        70         80         90        100        110        120 
MSKLPARNKI LMLSFDLRVG GLGPKADRLE ELVEELEAAP CCPLLEVGSV LDLLVQLAGS 
       130        140        150        160        170        180 
GPPQVLPRKR DYFLNNKHVG RNVPYSGYDC DDLSVFEMDV QSLISREECL CHSMIQETLQ 
       190        200        210        220        230        240 
VMEAAPGTGL PTVGLFSFGD PCGDRFERDT RVSLFGALVH SRTYDMDVRL GLPPVPDNAD 
       250        260        270        280        290        300 
LSGLAIKVPP SVDQWEDEGF QSASNLTPDS QSEPSVTPDV DLWEAALTYE ASKRRCWERV 
       310        320        330        340        350        360 
GCPPGHREEP YLTEAGRDAF DKFCRLHQGE LQLLAGGVLQ APQPVLVKEC ELVKDVLNVL 
       370        380        390        400        410        420 
IGVVSATFSL CQPAQAFVVK RGVHVSGASP ESISSLLSEV AEYGTCYTRL SHFSLQPVLD 
       430        440        450        460        470        480 
SLYSKGLVFQ AFTSGLRRYL QYYRACVLST PPTLSLLTIG FLFKKLGRQL RYLAELCGVG 
       490        500        510        520        530        540 
AVLPGTCGGG PRAAFPTGVK LLSYLYQEAL HNCSNEHYPV LLSLLKTSCE PYTRFIHDWV 
       550        560        570        580        590        600 
YSGVFRDAYG EFMIQVNHEY LSFRDKLYWT HGYVLISKEV EDCVPVFLKH IAHDIYVCGK 
       610        620        630        640        650        660 
TINLLKLCCP RHYLCWSDVP VPRISVIFSL EELKEIEKDC AVYVGRMERV ARHSSVSKEE 
       670        680        690        700        710        720 
KELRMEIAKQ ELIAHAREAA SRVLSALSDR QMSERMALDA RKREQFQRLK EQFVKDQERR 
       730        740        750        760        770        780 
QAARQEELDD DFSYARELRD RERRLKSLEE ELERKARQAL VDHYSKLSAE AARREQKALW 
       790        800        810        820        830        840 
RIQRHRLESA RLRFLLEDEK HIQEMLKAVS EAHQPQEPPD VLLSVHPQVT SPGPEHPEGG 
       850        860        870        880        890        900 
QGCDSGSAEQ HSPAWDGWNR PGLLTPQPLK PLAVGAGGRG LQQAEGARPF SDSLSIGDFL 
       910        920        930        940        950        960 
PVGPGAEPSV QTGMVPLLEV ALQTINLDLP PSAPGEAPAA ASTQPSRPQE YDFSTVLRPA 
       970        980        990       1000       1010       1020 
VATSPAPGPL QAAECSLGSS GLQLWEDSCG KMDACGSASR ETLLPSHPPR RAALEEGSSQ 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
PTERLFGQVS GGGLPTGDYA SEIAPTRPRW NTHGHVSDAS IRVGENVSDV APTQPRWNTH 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
GHVSNASISL GESVSDVAPT RPRWNIHGHV SNASIRVGEN VSDVAPTRPR WNTHGHVSNA 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SIRVGENVSD VAPTRPRWNT HGHVSDASIS LGESVSDMAP ARPRWNTHGH VSDASISLGE 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SVSDMAPTRP RWNTHGHVSD TSIRVGENVS DVAPIRSRCN THGHVSDASI SLGEPVSDVV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
STRPRWNTHV PIPPPHMVLG ALSPEAEPNT PRPQQSPPGH TSQSALSLGA QSTVLDCGPR 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
LPVEVGPSLS SPSSGCGEGS ISVGENVSDV APTQPWWPNT PGDSVSEELG PGRSGDTEDL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SPNWPLNSQE DTAAQSSPGR GEEAEASAAE AQGGEQAYLA GLAGQYHLER YPDSYESMSE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
PPIAHLLRPV LPRAFAFPVD PQVQSAADET AVQLSELLTL PVLMKRSITA PLAAHISLVN 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KAAVDYFFVE LHLEAHYEAL RHFLLMEDGE FAQSLSDLLF EKLGAGQTPG ELLNPLVLNS 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
VLSKALQCSL HGDTPHASNL SLALKYLPEV FAPNAPDVLS CLELRYKVDW PLNIVITEGC 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
VSKYSGVFSF LLQLKLMMWA LKDVCFHLKR TALLSHMAGS VQFRQLQLFK HEMQHFVKVI 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
QGYIANQILH VTWCEFRARL ATVGDLEEIQ RAHAEYLHKA VFRGLLTEKA APVMNVIHSI 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
FSLVLKFRSQ LISQAWGPPG GPRGAEHPNF ALMQQSYNTF KYYSHFLFKV VTKLVNRGYQ 
      1810    
PHLEDFLLRI NFNNYYQDA

Isoforms

- Isoform 2 of Gamma-tubulin complex component 6 - Isoform 3 of Gamma-tubulin complex component 6

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MASITQLFDD LCEALLPAAK THLGQRSVNR KRAKRSLKKV AYNALFTNLF QDETQQLQPD 
        70         80         90        100        110        120 
MSKLPARNKI LMLSFDLRVG GLGPKADRLE ELVEELEAAP CCPLLEVGSV LDLLVQLAGS 
       130        140        150        160        170        180 
GPPQVLPRKR DYFLNNKHVG RNVPYSGYDC DDLSVFEMDV QSLISREECL CHSMIQETLQ 
       190        200        210        220        230        240 
VMEAAPGTGL PTVGLFSFGD PCGDRFERDT RVSLFGALVH SRTYDMDVRL GLPPVPDNAD 
       250        260        270        280        290        300 
LSGLAIKVPP SVDQWEDEGF QSASNLTPDS QSEPSVTPDV DLWEAALTYE ASKRRCWERV 
       310        320        330        340        350        360 
GCPPGHREEP YLTEAGRDAF DKFCRLHQGE LQLLAGGVLQ APQPVLVKEC ELVKDVLNVL 
       370        380        390        400        410        420 
IGVVSATFSL CQPAQAFVVK RGVHVSGASP ESISSLLSEV AEYGTCYTRL SHFSLQPVLD 
       430        440        450        460        470        480 
SLYSKGLVFQ AFTSGLRRYL QYYRACVLST PPTLSLLTIG FLFKKLGRQL RYLAELCGVG 
       490        500        510        520        530        540 
AVLPGTCGGG PRAAFPTGVK LLSYLYQEAL HNCSNEHYPV LLSLLKTSCE PYTRFIHDWV 
       550        560        570        580        590        600 
YSGVFRDAYG EFMIQVNHEY LSFRDKLYWT HGYVLISKEV EDCVPVFLKH IAHDIYVCGK 
       610        620        630        640        650        660 
TINLLKLCCP RHYLCWSDVP VPRISVIFSL EELKEIEKDC AVYVGRMERV ARHSSVSKEE 
       670        680        690        700        710        720 
KELRMEIAKQ ELIAHAREAA SRVLSALSDR QMSERMALDA RKREQFQRLK EQFVKDQERR 
       730        740        750        760        770        780 
QAARQEELDD DFSYARELRD RERRLKSLEE ELERKARQAL VDHYSKLSAE AARREQKALW 
       790        800        810        820        830        840 
RIQRHRLESA RLRFLLEDEK HIQEMLKAVS EAHQPQEPPD VLLSVHPQVT SPGPEHPEGG 
       850        860        870        880        890        900 
QGCDSGSAEQ HSPAWDGWNR PGLLTPQPLK PLAVGAGGRG LQQAEGARPF SDSLSIGDFL 
       910        920        930        940        950        960 
PVGPGAEPSV QTGMVPLLEV ALQTINLDLP PSAPGEAPAA ASTQPSRPQE YDFSTVLRPA 
       970        980        990       1000       1010       1020 
VATSPAPGPL QAAECSLGSS GLQLWEDSCG KMDACGSASR ETLLPSHPPR RAALEEGSSQ 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
PTERLFGQVS GGGLPTGDYA SEIAPTRPRW NTHGHVSDAS IRVGENVSDV APTQPRWNTH 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
GHVSNASISL GESVSDVAPT RPRWNIHGHV SNASIRVGEN VSDVAPTRPR WNTHGHVSNA 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SIRVGENVSD VAPTRPRWNT HGHVSDASIS LGESVSDMAP ARPRWNTHGH VSDASISLGE 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SVSDMAPTRP RWNTHGHVSD TSIRVGENVS DVAPIRSRCN THGHVSDASI SLGEPVSDVV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
STRPRWNTHV PIPPPHMVLG ALSPEAEPNT PRPQQSPPGH TSQSALSLGA QSTVLDCGPR 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
LPVEVGPSLS SPSSGCGEGS ISVGENVSDV APTQPWWPNT PGDSVSEELG PGRSGDTEDL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SPNWPLNSQE DTAAQSSPGR GEEAEASAAE AQGGEQAYLA GLAGQYHLER YPDSYESMSE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
PPIAHLLRPV LPRAFAFPVD PQVQSAADET AVQLSELLTL PVLMKRSITA PLAAHISLVN 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KAAVDYFFVE LHLEAHYEAL RHFLLMEDGE FAQSLSDLLF EKLGAGQTPG ELLNPLVLNS 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
VLSKALQCSL HGDTPHASNL SLALKYLPEV FAPNAPDVLS CLELRYKVDW PLNIVITEGC 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
VSKYSGVFSF LLQLKLMMWA LKDVCFHLKR TALLSHMAGS VQFRQLQLFK HEMQHFVKVI 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
QGYIANQILH VTWCEFRARL ATVGDLEEIQ RAHAEYLHKA VFRGLLTEKA APVMNVIHSI 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
FSLVLKFRSQ LISQAWGPPG GPRGAEHPNF ALMQQSYNTF KYYSHFLFKV VTKLVNRGYQ 
      1810    
PHLEDFLLRI NFNNYYQDA         10         20         30         40         50         60 
MASITQLFDD LCEALLPAAK THLGQRSVNR KRAKRSLKKV AYNALFTNLF QDETQQLQPD 
        70         80         90        100        110        120 
MSKLPARNKI LMLSFDLRVG GLGPKADRLE ELVEELEAAP CCPLLEVGSV LDLLVQLAGS 
       130        140        150        160        170        180 
GPPQVLPRKR DYFLNNKHVG RNVPYSGYDC DDLSVFEMDV QSLISREECL CHSMIQETLQ 
       190        200        210        220        230        240 
VMEAAPGTGL PTVGLFSFGD PCGDRFERDT RVSLFGALVH SRTYDMDVRL GLPPVPDNAD 
       250        260        270        280        290        300 
LSGLAIKVPP SVDQWEDEGF QSASNLTPDS QSEPSVTPDV DLWEAALTYE ASKRRCWERV 
       310        320        330        340        350        360 
GCPPGHREEP YLTEAGRDAF DKFCRLHQGE LQLLAGGVLQ APQPVLVKEC ELVKDVLNVL 
       370        380        390        400        410        420 
IGVVSATFSL CQPAQAFVVK RGVHVSGASP ESISSLLSEV AEYGTCYTRL SHFSLQPVLD 
       430        440        450        460        470        480 
SLYSKGLVFQ AFTSGLRRYL QYYRACVLST PPTLSLLTIG FLFKKLGRQL RYLAELCGVG 
       490        500        510        520        530        540 
AVLPGTCGGG PRAAFPTGVK LLSYLYQEAL HNCSNEHYPV LLSLLKTSCE PYTRFIHDWV 
       550        560        570        580        590        600 
YSGVFRDAYG EFMIQVNHEY LSFRDKLYWT HGYVLISKEV EDCVPVFLKH IAHDIYVCGK 
       610        620        630        640        650        660 
TINLLKLCCP RHYLCWSDVP VPRISVIFSL EELKEIEKDC AVYVGRMERV ARHSSVSKEE 
       670        680        690        700        710        720 
KELRMEIAKQ ELIAHAREAA SRVLSALSDR QMSERMALDA RKREQFQRLK EQFVKDQERR 
       730        740        750        760        770        780 
QAARQEELDD DFSYARELRD RERRLKSLEE ELERKARQAL VDHYSKLSAE AARREQKALW 
       790        800        810        820        830        840 
RIQRHRLESA RLRFLLEDEK HIQEMLKAVS EAHQPQEPPD VLLSVHPQVT SPGPEHPEGG 
       850        860        870        880        890        900 
QGCDSGSAEQ HSPAWDGWNR PGLLTPQPLK PLAVGAGGRG LQQAEGARPF SDSLSIGDFL 
       910        920        930        940        950        960 
PVGPGAEPSV QTGMVPLLEV ALQTINLDLP PSAPGEAPAA ASTQPSRPQE YDFSTVLRPA 
       970        980        990       1000       1010       1020 
VATSPAPGPL QAAECSLGSS GLQLWEDSCG KMDACGSASR ETLLPSHPPR RAALEEGSSQ 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
PTERLFGQVS GGGLPTGDYA SEIAPTRPRW NTHGHVSDAS IRVGENVSDV APTQPRWNTH 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
GHVSNASISL GESVSDVAPT RPRWNIHGHV SNASIRVGEN VSDVAPTRPR WNTHGHVSNA 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SIRVGENVSD VAPTRPRWNT HGHVSDASIS LGESVSDMAP ARPRWNTHGH VSDASISLGE 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SVSDMAPTRP RWNTHGHVSD TSIRVGENVS DVAPIRSRCN THGHVSDASI SLGEPVSDVV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
STRPRWNTHV PIPPPHMVLG ALSPEAEPNT PRPQQSPPGH TSQSALSLGA QSTVLDCGPR 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
LPVEVGPSLS SPSSGCGEGS ISVGENVSDV APTQPWWPNT PGDSVSEELG PGRSGDTEDL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
SPNWPLNSQE DTAAQSSPGR GEEAEASAAE AQGGEQAYLA GLAGQYHLER YPDSYESMSE 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
PPIAHLLRPV LPRAFAFPVD PQVQSAADET AVQLSELLTL PVLMKRSITA PLAAHISLVN 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KAAVDYFFVE LHLEAHYEAL RHFLLMEDGE FAQSLSDLLF EKLGAGQTPG ELLNPLVLNS 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
VLSKALQCSL HGDTPHASNL SLALKYLPEV FAPNAPDVLS CLELRYKVDW PLNIVITEGC 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
VSKYSGVFSF LLQLKLMMWA LKDVCFHLKR TALLSHMAGS VQFRQLQLFK HEMQHFVKVI 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
QGYIANQILH VTWCEFRARL ATVGDLEEIQ RAHAEYLHKA VFRGLLTEKA APVMNVIHSI 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
FSLVLKFRSQ LISQAWGPPG GPRGAEHPNF ALMQQSYNTF KYYSHFLFKV VTKLVNRGYQ 
      1810    
PHLEDFLLRI NFNNYYQDA



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 2 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q96RT7-1-unknown MASITQ... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q96RT7-1-unknown MASITQ... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt75801
    Q96RT7-1-unknown MASITQ... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt75802

C-termini

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)