TopFIND 4.0

Q96T23: Remodeling and spacing factor 1

General Information

Protein names
- Remodeling and spacing factor 1
- Rsf-1
- HBV pX-associated protein 8
- Hepatitis B virus X-associated protein
- p325 subunit of RSF chromatin-remodeling complex
Gene names RSF1
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q96T23

2

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MATAAAAAAV MAPPGCPGSC PNFAVVCSFL ERYGPLLDLP ELPFPELERV LQAPPPDVGN 
        70         80         90        100        110        120 
GEVPKELVEL HLKLMRKIGK SVTADRWEKY LIKICQEFNS TWAWEMEKKG YLEMSVECKL 
       130        140        150        160        170        180 
ALLKYLCECQ FDDNLKFKNI INEEDADTMR LQPIGRDKDG LMYWYQLDQD HNVRMYIEEQ 
       190        200        210        220        230        240 
DDQDGSSWKC IVRNRNELAE TLALLKAQID PVLLKNSSQQ DNSSRESPSL EDEETKKEEE 
       250        260        270        280        290        300 
TPKQEEQKES EKMKSEEQPM DLENRSTANV LEETTVKKEK EDEKELVKLP VIVKLEKPLP 
       310        320        330        340        350        360 
ENEEKKIIKE ESDSFKENVK PIKVEVKECR ADPKDTKSSM EKPVAQEPER IEFGGNIKSS 
       370        380        390        400        410        420 
HEITEKSTEE TEKLKNDQQA KIPLKKREIK LSDDFDSPVK GPLCKSVTPT KEFLKDEIKQ 
       430        440        450        460        470        480 
EEETCKRIST ITALGHEGKQ LVNGEVSDER VAPNFKTEPI ETKFYETKEE SYSPSKDRNI 
       490        500        510        520        530        540 
ITEGNGTESL NSVITSMKTG ELEKETAPLR KDADSSISVL EIHSQKAQIE EPDPPEMETS 
       550        560        570        580        590        600 
LDSSEMAKDL SSKTALSSTE SCTMKGEEKS PKTKKDKRPP ILECLEKLEK SKKTFLDKDA 
       610        620        630        640        650        660 
QRLSPIPEEV PKSTLESEKP GSPEAAETSP PSNIIDHCEK LASEKEVVEC QSTSTVGGQS 
       670        680        690        700        710        720 
VKKVDLETLK EDSEFTKVEM DNLDNAQTSG IEEPSETKGS MQKSKFKYKL VPEEETTASE 
       730        740        750        760        770        780 
NTEITSERQK EGIKLTIRIS SRKKKPDSPP KVLEPENKQE KTEKEEEKTN VGRTLRRSPR 
       790        800        810        820        830        840 
ISRPTAKVAE IRDQKADKKR GEGEDEVEEE STALQKTDKK EILKKSEKDT NSKVSKVKPK 
       850        860        870        880        890        900 
GKVRWTGSRT RGRWKYSSND ESEGSGSEKS SAASEEEEEK ESEEAILADD DEPCKKCGLP 
       910        920        930        940        950        960 
NHPELILLCD SCDSGYHTAC LRPPLMIIPD GEWFCPPCQH KLLCEKLEEQ LQDLDVALKK 
       970        980        990       1000       1010       1020 
KERAERRKER LVYVGISIEN IIPPQEPDFS EDQEEKKKDS KKSKANLLER RSTRTRKCIS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
YRFDEFDEAI DEAIEDDIKE ADGGGVGRGK DISTITGHRG KDISTILDEE RKENKRPQRA 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
AAARRKKRRR LNDLDSDSNL DEEESEDEFK ISDGSQDEFV VSDENPDESE EDPPSNDDSD 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
TDFCSRRLRR HPSRPMRQSR RLRRKTPKKK YSDDDEEEES EENSRDSESD FSDDFSDDFV 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
ETRRRRSRRN QKRQINYKED SESDGSQKSL RRGKEIRRVH KRRLSSSESE ESYLSKNSED 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
DELAKESKRS VRKRGRSTDE YSEADEEEEE EEGKPSRKRL HRIETDEEES CDNAHGDANQ 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PARDSQPRVL PSEQESTKKP YRIESDEEED FENVGKVGSP LDYSLVDLPS TNGQSPGKAI 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
ENLIGKPTEK SQTPKDNSTA SASLASNGTS GGQEAGAPEE EEDELLRVTD LVDYVCNSEQ 
   
L

Isoforms

- Isoform 2 of Remodeling and spacing factor 1 - Isoform 3 of Remodeling and spacing factor 1

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MATAAAAAAV MAPPGCPGSC PNFAVVCSFL ERYGPLLDLP ELPFPELERV LQAPPPDVGN 
        70         80         90        100        110        120 
GEVPKELVEL HLKLMRKIGK SVTADRWEKY LIKICQEFNS TWAWEMEKKG YLEMSVECKL 
       130        140        150        160        170        180 
ALLKYLCECQ FDDNLKFKNI INEEDADTMR LQPIGRDKDG LMYWYQLDQD HNVRMYIEEQ 
       190        200        210        220        230        240 
DDQDGSSWKC IVRNRNELAE TLALLKAQID PVLLKNSSQQ DNSSRESPSL EDEETKKEEE 
       250        260        270        280        290        300 
TPKQEEQKES EKMKSEEQPM DLENRSTANV LEETTVKKEK EDEKELVKLP VIVKLEKPLP 
       310        320        330        340        350        360 
ENEEKKIIKE ESDSFKENVK PIKVEVKECR ADPKDTKSSM EKPVAQEPER IEFGGNIKSS 
       370        380        390        400        410        420 
HEITEKSTEE TEKLKNDQQA KIPLKKREIK LSDDFDSPVK GPLCKSVTPT KEFLKDEIKQ 
       430        440        450        460        470        480 
EEETCKRIST ITALGHEGKQ LVNGEVSDER VAPNFKTEPI ETKFYETKEE SYSPSKDRNI 
       490        500        510        520        530        540 
ITEGNGTESL NSVITSMKTG ELEKETAPLR KDADSSISVL EIHSQKAQIE EPDPPEMETS 
       550        560        570        580        590        600 
LDSSEMAKDL SSKTALSSTE SCTMKGEEKS PKTKKDKRPP ILECLEKLEK SKKTFLDKDA 
       610        620        630        640        650        660 
QRLSPIPEEV PKSTLESEKP GSPEAAETSP PSNIIDHCEK LASEKEVVEC QSTSTVGGQS 
       670        680        690        700        710        720 
VKKVDLETLK EDSEFTKVEM DNLDNAQTSG IEEPSETKGS MQKSKFKYKL VPEEETTASE 
       730        740        750        760        770        780 
NTEITSERQK EGIKLTIRIS SRKKKPDSPP KVLEPENKQE KTEKEEEKTN VGRTLRRSPR 
       790        800        810        820        830        840 
ISRPTAKVAE IRDQKADKKR GEGEDEVEEE STALQKTDKK EILKKSEKDT NSKVSKVKPK 
       850        860        870        880        890        900 
GKVRWTGSRT RGRWKYSSND ESEGSGSEKS SAASEEEEEK ESEEAILADD DEPCKKCGLP 
       910        920        930        940        950        960 
NHPELILLCD SCDSGYHTAC LRPPLMIIPD GEWFCPPCQH KLLCEKLEEQ LQDLDVALKK 
       970        980        990       1000       1010       1020 
KERAERRKER LVYVGISIEN IIPPQEPDFS EDQEEKKKDS KKSKANLLER RSTRTRKCIS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
YRFDEFDEAI DEAIEDDIKE ADGGGVGRGK DISTITGHRG KDISTILDEE RKENKRPQRA 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
AAARRKKRRR LNDLDSDSNL DEEESEDEFK ISDGSQDEFV VSDENPDESE EDPPSNDDSD 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
TDFCSRRLRR HPSRPMRQSR RLRRKTPKKK YSDDDEEEES EENSRDSESD FSDDFSDDFV 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
ETRRRRSRRN QKRQINYKED SESDGSQKSL RRGKEIRRVH KRRLSSSESE ESYLSKNSED 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
DELAKESKRS VRKRGRSTDE YSEADEEEEE EEGKPSRKRL HRIETDEEES CDNAHGDANQ 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PARDSQPRVL PSEQESTKKP YRIESDEEED FENVGKVGSP LDYSLVDLPS TNGQSPGKAI 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
ENLIGKPTEK SQTPKDNSTA SASLASNGTS GGQEAGAPEE EEDELLRVTD LVDYVCNSEQ 
   
L         10         20         30         40         50         60 
MATAAAAAAV MAPPGCPGSC PNFAVVCSFL ERYGPLLDLP ELPFPELERV LQAPPPDVGN 
        70         80         90        100        110        120 
GEVPKELVEL HLKLMRKIGK SVTADRWEKY LIKICQEFNS TWAWEMEKKG YLEMSVECKL 
       130        140        150        160        170        180 
ALLKYLCECQ FDDNLKFKNI INEEDADTMR LQPIGRDKDG LMYWYQLDQD HNVRMYIEEQ 
       190        200        210        220        230        240 
DDQDGSSWKC IVRNRNELAE TLALLKAQID PVLLKNSSQQ DNSSRESPSL EDEETKKEEE 
       250        260        270        280        290        300 
TPKQEEQKES EKMKSEEQPM DLENRSTANV LEETTVKKEK EDEKELVKLP VIVKLEKPLP 
       310        320        330        340        350        360 
ENEEKKIIKE ESDSFKENVK PIKVEVKECR ADPKDTKSSM EKPVAQEPER IEFGGNIKSS 
       370        380        390        400        410        420 
HEITEKSTEE TEKLKNDQQA KIPLKKREIK LSDDFDSPVK GPLCKSVTPT KEFLKDEIKQ 
       430        440        450        460        470        480 
EEETCKRIST ITALGHEGKQ LVNGEVSDER VAPNFKTEPI ETKFYETKEE SYSPSKDRNI 
       490        500        510        520        530        540 
ITEGNGTESL NSVITSMKTG ELEKETAPLR KDADSSISVL EIHSQKAQIE EPDPPEMETS 
       550        560        570        580        590        600 
LDSSEMAKDL SSKTALSSTE SCTMKGEEKS PKTKKDKRPP ILECLEKLEK SKKTFLDKDA 
       610        620        630        640        650        660 
QRLSPIPEEV PKSTLESEKP GSPEAAETSP PSNIIDHCEK LASEKEVVEC QSTSTVGGQS 
       670        680        690        700        710        720 
VKKVDLETLK EDSEFTKVEM DNLDNAQTSG IEEPSETKGS MQKSKFKYKL VPEEETTASE 
       730        740        750        760        770        780 
NTEITSERQK EGIKLTIRIS SRKKKPDSPP KVLEPENKQE KTEKEEEKTN VGRTLRRSPR 
       790        800        810        820        830        840 
ISRPTAKVAE IRDQKADKKR GEGEDEVEEE STALQKTDKK EILKKSEKDT NSKVSKVKPK 
       850        860        870        880        890        900 
GKVRWTGSRT RGRWKYSSND ESEGSGSEKS SAASEEEEEK ESEEAILADD DEPCKKCGLP 
       910        920        930        940        950        960 
NHPELILLCD SCDSGYHTAC LRPPLMIIPD GEWFCPPCQH KLLCEKLEEQ LQDLDVALKK 
       970        980        990       1000       1010       1020 
KERAERRKER LVYVGISIEN IIPPQEPDFS EDQEEKKKDS KKSKANLLER RSTRTRKCIS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
YRFDEFDEAI DEAIEDDIKE ADGGGVGRGK DISTITGHRG KDISTILDEE RKENKRPQRA 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
AAARRKKRRR LNDLDSDSNL DEEESEDEFK ISDGSQDEFV VSDENPDESE EDPPSNDDSD 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
TDFCSRRLRR HPSRPMRQSR RLRRKTPKKK YSDDDEEEES EENSRDSESD FSDDFSDDFV 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
ETRRRRSRRN QKRQINYKED SESDGSQKSL RRGKEIRRVH KRRLSSSESE ESYLSKNSED 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
DELAKESKRS VRKRGRSTDE YSEADEEEEE EEGKPSRKRL HRIETDEEES CDNAHGDANQ 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PARDSQPRVL PSEQESTKKP YRIESDEEED FENVGKVGSP LDYSLVDLPS TNGQSPGKAI 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
ENLIGKPTEK SQTPKDNSTA SASLASNGTS GGQEAGAPEE EEDELLRVTD LVDYVCNSEQ 
   
L



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q96T23-1-unknown MATAAA... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q96T23-1-unknown MATAAA... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt88269
    Q96T23-253-unknown MKSEEQ... 253 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt88270
    Q96T23-253-unknown MKSEEQ... 253 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt107451

C-termini

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)