TopFIND 4.0

Q99250: Sodium channel protein type 2 subunit alpha

General Information

Protein names
- Sodium channel protein type 2 subunit alpha
- HBSC II
- Sodium channel protein brain II subunit alpha
- Sodium channel protein type II subunit alpha
- Voltage-gated sodium channel subunit alpha Nav1.2
Gene names SCN2A
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q99250

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MAQSVLVPPG PDSFRFFTRE SLAAIEQRIA EEKAKRPKQE RKDEDDENGP KPNSDLEAGK 
        70         80         90        100        110        120 
SLPFIYGDIP PEMVSVPLED LDPYYINKKT FIVLNKGKAI SRFSATPALY ILTPFNPIRK 
       130        140        150        160        170        180 
LAIKILVHSL FNMLIMCTIL TNCVFMTMSN PPDWTKNVEY TFTGIYTFES LIKILARGFC 
       190        200        210        220        230        240 
LEDFTFLRDP WNWLDFTVIT FAYVTEFVDL GNVSALRTFR VLRALKTISV IPGLKTIVGA 
       250        260        270        280        290        300 
LIQSVKKLSD VMILTVFCLS VFALIGLQLF MGNLRNKCLQ WPPDNSSFEI NITSFFNNSL 
       310        320        330        340        350        360 
DGNGTTFNRT VSIFNWDEYI EDKSHFYFLE GQNDALLCGN SSDAGQCPEG YICVKAGRNP 
       370        380        390        400        410        420 
NYGYTSFDTF SWAFLSLFRL MTQDFWENLY QLTLRAAGKT YMIFFVLVIF LGSFYLINLI 
       430        440        450        460        470        480 
LAVVAMAYEE QNQATLEEAE QKEAEFQQML EQLKKQQEEA QAAAAAASAE SRDFSGAGGI 
       490        500        510        520        530        540 
GVFSESSSVA SKLSSKSEKE LKNRRKKKKQ KEQSGEEEKN DRVRKSESED SIRRKGFRFS 
       550        560        570        580        590        600 
LEGSRLTYEK RFSSPHQSLL SIRGSLFSPR RNSRASLFSF RGRAKDIGSE NDFADDEHST 
       610        620        630        640        650        660 
FEDNDSRRDS LFVPHRHGER RHSNVSQASR ASRVLPILPM NGKMHSAVDC NGVVSLVGGP 
       670        680        690        700        710        720 
STLTSAGQLL PEGTTTETEI RKRRSSSYHV SMDLLEDPTS RQRAMSIASI LTNTMEELEE 
       730        740        750        760        770        780 
SRQKCPPCWY KFANMCLIWD CCKPWLKVKH LVNLVVMDPF VDLAITICIV LNTLFMAMEH 
       790        800        810        820        830        840 
YPMTEQFSSV LSVGNLVFTG IFTAEMFLKI IAMDPYYYFQ EGWNIFDGFI VSLSLMELGL 
       850        860        870        880        890        900 
ANVEGLSVLR SFRLLRVFKL AKSWPTLNML IKIIGNSVGA LGNLTLVLAI IVFIFAVVGM 
       910        920        930        940        950        960 
QLFGKSYKEC VCKISNDCEL PRWHMHDFFH SFLIVFRVLC GEWIETMWDC MEVAGQTMCL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TVFMMVMVIG NLVVLNLFLA LLLSSFSSDN LAATDDDNEM NNLQIAVGRM QKGIDFVKRK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
IREFIQKAFV RKQKALDEIK PLEDLNNKKD SCISNHTTIE IGKDLNYLKD GNGTTSGIGS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SVEKYVVDES DYMSFINNPS LTVTVPIAVG ESDFENLNTE EFSSESDMEE SKEKLNATSS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SEGSTVDIGA PAEGEQPEVE PEESLEPEAC FTEDCVRKFK CCQISIEEGK GKLWWNLRKT 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
CYKIVEHNWF ETFIVFMILL SSGALAFEDI YIEQRKTIKT MLEYADKVFT YIFILEMLLK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
WVAYGFQVYF TNAWCWLDFL IVDVSLVSLT ANALGYSELG AIKSLRTLRA LRPLRALSRF 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
EGMRVVVNAL LGAIPSIMNV LLVCLIFWLI FSIMGVNLFA GKFYHCINYT TGEMFDVSVV 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
NNYSECKALI ESNQTARWKN VKVNFDNVGL GYLSLLQVAT FKGWMDIMYA AVDSRNVELQ 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
PKYEDNLYMY LYFVIFIIFG SFFTLNLFIG VIIDNFNQQK KKFGGQDIFM TEEQKKYYNA 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
MKKLGSKKPQ KPIPRPANKF QGMVFDFVTK QVFDISIMIL ICLNMVTMMV ETDDQSQEMT 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
NILYWINLVF IVLFTGECVL KLISLRYYYF TIGWNIFDFV VVILSIVGMF LAELIEKYFV 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
SPTLFRVIRL ARIGRILRLI KGAKGIRTLL FALMMSLPAL FNIGLLLFLV MFIYAIFGMS 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
NFAYVKREVG IDDMFNFETF GNSMICLFQI TTSAGWDGLL APILNSGPPD CDPDKDHPGS 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
SVKGDCGNPS VGIFFFVSYI IISFLVVVNM YIAVILENFS VATEESAEPL SEDDFEMFYE 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
VWEKFDPDAT QFIEFAKLSD FADALDPPLL IAKPNKVQLI AMDLPMVSGD RIHCLDILFA 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
FTKRVLGESG EMDALRIQME ERFMASNPSK VSYEPITTTL KRKQEEVSAI IIQRAYRRYL 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
LKQKVKKVSS IYKKDKGKEC DGTPIKEDTL IDKLNENSTP EKTDMTPSTT SPPSYDSVTK 
      1990       2000    
PEKEKFEKDK SEKEDKGKDI RESKK

Isoforms

- Isoform 2 of Sodium channel protein type 2 subunit alpha

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MAQSVLVPPG PDSFRFFTRE SLAAIEQRIA EEKAKRPKQE RKDEDDENGP KPNSDLEAGK 
        70         80         90        100        110        120 
SLPFIYGDIP PEMVSVPLED LDPYYINKKT FIVLNKGKAI SRFSATPALY ILTPFNPIRK 
       130        140        150        160        170        180 
LAIKILVHSL FNMLIMCTIL TNCVFMTMSN PPDWTKNVEY TFTGIYTFES LIKILARGFC 
       190        200        210        220        230        240 
LEDFTFLRDP WNWLDFTVIT FAYVTEFVDL GNVSALRTFR VLRALKTISV IPGLKTIVGA 
       250        260        270        280        290        300 
LIQSVKKLSD VMILTVFCLS VFALIGLQLF MGNLRNKCLQ WPPDNSSFEI NITSFFNNSL 
       310        320        330        340        350        360 
DGNGTTFNRT VSIFNWDEYI EDKSHFYFLE GQNDALLCGN SSDAGQCPEG YICVKAGRNP 
       370        380        390        400        410        420 
NYGYTSFDTF SWAFLSLFRL MTQDFWENLY QLTLRAAGKT YMIFFVLVIF LGSFYLINLI 
       430        440        450        460        470        480 
LAVVAMAYEE QNQATLEEAE QKEAEFQQML EQLKKQQEEA QAAAAAASAE SRDFSGAGGI 
       490        500        510        520        530        540 
GVFSESSSVA SKLSSKSEKE LKNRRKKKKQ KEQSGEEEKN DRVRKSESED SIRRKGFRFS 
       550        560        570        580        590        600 
LEGSRLTYEK RFSSPHQSLL SIRGSLFSPR RNSRASLFSF RGRAKDIGSE NDFADDEHST 
       610        620        630        640        650        660 
FEDNDSRRDS LFVPHRHGER RHSNVSQASR ASRVLPILPM NGKMHSAVDC NGVVSLVGGP 
       670        680        690        700        710        720 
STLTSAGQLL PEGTTTETEI RKRRSSSYHV SMDLLEDPTS RQRAMSIASI LTNTMEELEE 
       730        740        750        760        770        780 
SRQKCPPCWY KFANMCLIWD CCKPWLKVKH LVNLVVMDPF VDLAITICIV LNTLFMAMEH 
       790        800        810        820        830        840 
YPMTEQFSSV LSVGNLVFTG IFTAEMFLKI IAMDPYYYFQ EGWNIFDGFI VSLSLMELGL 
       850        860        870        880        890        900 
ANVEGLSVLR SFRLLRVFKL AKSWPTLNML IKIIGNSVGA LGNLTLVLAI IVFIFAVVGM 
       910        920        930        940        950        960 
QLFGKSYKEC VCKISNDCEL PRWHMHDFFH SFLIVFRVLC GEWIETMWDC MEVAGQTMCL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
TVFMMVMVIG NLVVLNLFLA LLLSSFSSDN LAATDDDNEM NNLQIAVGRM QKGIDFVKRK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
IREFIQKAFV RKQKALDEIK PLEDLNNKKD SCISNHTTIE IGKDLNYLKD GNGTTSGIGS 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SVEKYVVDES DYMSFINNPS LTVTVPIAVG ESDFENLNTE EFSSESDMEE SKEKLNATSS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
SEGSTVDIGA PAEGEQPEVE PEESLEPEAC FTEDCVRKFK CCQISIEEGK GKLWWNLRKT 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
CYKIVEHNWF ETFIVFMILL SSGALAFEDI YIEQRKTIKT MLEYADKVFT YIFILEMLLK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
WVAYGFQVYF TNAWCWLDFL IVDVSLVSLT ANALGYSELG AIKSLRTLRA LRPLRALSRF 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
EGMRVVVNAL LGAIPSIMNV LLVCLIFWLI FSIMGVNLFA GKFYHCINYT TGEMFDVSVV 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
NNYSECKALI ESNQTARWKN VKVNFDNVGL GYLSLLQVAT FKGWMDIMYA AVDSRNVELQ 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
PKYEDNLYMY LYFVIFIIFG SFFTLNLFIG VIIDNFNQQK KKFGGQDIFM TEEQKKYYNA 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
MKKLGSKKPQ KPIPRPANKF QGMVFDFVTK QVFDISIMIL ICLNMVTMMV ETDDQSQEMT 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
NILYWINLVF IVLFTGECVL KLISLRYYYF TIGWNIFDFV VVILSIVGMF LAELIEKYFV 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
SPTLFRVIRL ARIGRILRLI KGAKGIRTLL FALMMSLPAL FNIGLLLFLV MFIYAIFGMS 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
NFAYVKREVG IDDMFNFETF GNSMICLFQI TTSAGWDGLL APILNSGPPD CDPDKDHPGS 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
SVKGDCGNPS VGIFFFVSYI IISFLVVVNM YIAVILENFS VATEESAEPL SEDDFEMFYE 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
VWEKFDPDAT QFIEFAKLSD FADALDPPLL IAKPNKVQLI AMDLPMVSGD RIHCLDILFA 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
FTKRVLGESG EMDALRIQME ERFMASNPSK VSYEPITTTL KRKQEEVSAI IIQRAYRRYL 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
LKQKVKKVSS IYKKDKGKEC DGTPIKEDTL IDKLNENSTP EKTDMTPSTT SPPSYDSVTK 
      1990       2000    
PEKEKFEKDK SEKEDKGKDI RESKK



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q99250-1-unknown MAQSVL... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q99250-1-unknown MAQSVL... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt89058

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...RESKK 2005 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...RESKK 2005 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt84676

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)