TopFIND 4.0

Q99J72: DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3

General Information

Protein names
- DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3
- 3.5.4.38
- Apolipoprotein B mRNA-editing complex 3
- Arp3
- CEM-15
- CEM15
Gene names Apobec3
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q99J72

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MQPQRLGPRA GMGPFCLGCS HRKCYSPIRN LISQETFKFH FKNLGYAKGR KDTFLCYEVT 
        70         80         90        100        110        120 
RKDCDSPVSL HHGVFKNKDN IHAEICFLYW FHDKVLKVLS PREEFKITWY MSWSPCFECA 
       130        140        150        160        170        180 
EQIVRFLATH HNLSLDIFSS RLYNVQDPET QQNLCRLVQE GAQVAAMDLY EFKKCWKKFV 
       190        200        210        220        230        240 
DNGGRRFRPW KRLLTNFRYQ DSKLQEILRP CYISVPSSSS STLSNICLTK GLPETRFWVE 
       250        260        270        280        290        300 
GRRMDPLSEE EFYSQFYNQR VKHLCYYHRM KPYLCYQLEQ FNGQAPLKGC LLSEKGKQHA 
       310        320        330        340        350        360 
EILFLDKIRS MELSQVTITC YLTWSPCPNC AWQLAAFKRD RPDLILHIYT SRLYFHWKRP 
       370        380        390        400        410        420 
FQKGLCSLWQ SGILVDVMDL PQFTDCWTNF VNPKRPFWPW KGLEIISRRT QRRLRRIKES 
       430        440    
WGLQDLVNDF GNLQLGPPMS 

Isoforms

- Isoform 2 of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3 - Isoform 3 of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3 - Isoform 4 of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3 - Isoform 2 of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3 - Isoform 3 of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3 - Isoform 4 of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MQPQRLGPRA GMGPFCLGCS HRKCYSPIRN LISQETFKFH FKNLGYAKGR KDTFLCYEVT 
        70         80         90        100        110        120 
RKDCDSPVSL HHGVFKNKDN IHAEICFLYW FHDKVLKVLS PREEFKITWY MSWSPCFECA 
       130        140        150        160        170        180 
EQIVRFLATH HNLSLDIFSS RLYNVQDPET QQNLCRLVQE GAQVAAMDLY EFKKCWKKFV 
       190        200        210        220        230        240 
DNGGRRFRPW KRLLTNFRYQ DSKLQEILRP CYISVPSSSS STLSNICLTK GLPETRFWVE 
       250        260        270        280        290        300 
GRRMDPLSEE EFYSQFYNQR VKHLCYYHRM KPYLCYQLEQ FNGQAPLKGC LLSEKGKQHA 
       310        320        330        340        350        360 
EILFLDKIRS MELSQVTITC YLTWSPCPNC AWQLAAFKRD RPDLILHIYT SRLYFHWKRP 
       370        380        390        400        410        420 
FQKGLCSLWQ SGILVDVMDL PQFTDCWTNF VNPKRPFWPW KGLEIISRRT QRRLRRIKES 
       430        440    
WGLQDLVNDF GNLQLGPPMS          10         20         30         40         50         60 
MQPQRLGPRA GMGPFCLGCS HRKCYSPIRN LISQETFKFH FKNLGYAKGR KDTFLCYEVT 
        70         80         90        100        110        120 
RKDCDSPVSL HHGVFKNKDN IHAEICFLYW FHDKVLKVLS PREEFKITWY MSWSPCFECA 
       130        140        150        160        170        180 
EQIVRFLATH HNLSLDIFSS RLYNVQDPET QQNLCRLVQE GAQVAAMDLY EFKKCWKKFV 
       190        200        210        220        230        240 
DNGGRRFRPW KRLLTNFRYQ DSKLQEILRP CYISVPSSSS STLSNICLTK GLPETRFWVE 
       250        260        270        280        290        300 
GRRMDPLSEE EFYSQFYNQR VKHLCYYHRM KPYLCYQLEQ FNGQAPLKGC LLSEKGKQHA 
       310        320        330        340        350        360 
EILFLDKIRS MELSQVTITC YLTWSPCPNC AWQLAAFKRD RPDLILHIYT SRLYFHWKRP 
       370        380        390        400        410        420 
FQKGLCSLWQ SGILVDVMDL PQFTDCWTNF VNPKRPFWPW KGLEIISRRT QRRLRRIKES 
       430        440    
WGLQDLVNDF GNLQLGPPMS          10         20         30         40         50         60 
MQPQRLGPRA GMGPFCLGCS HRKCYSPIRN LISQETFKFH FKNLGYAKGR KDTFLCYEVT 
        70         80         90        100        110        120 
RKDCDSPVSL HHGVFKNKDN IHAEICFLYW FHDKVLKVLS PREEFKITWY MSWSPCFECA 
       130        140        150        160        170        180 
EQIVRFLATH HNLSLDIFSS RLYNVQDPET QQNLCRLVQE GAQVAAMDLY EFKKCWKKFV 
       190        200        210        220        230        240 
DNGGRRFRPW KRLLTNFRYQ DSKLQEILRP CYISVPSSSS STLSNICLTK GLPETRFWVE 
       250        260        270        280        290        300 
GRRMDPLSEE EFYSQFYNQR VKHLCYYHRM KPYLCYQLEQ FNGQAPLKGC LLSEKGKQHA 
       310        320        330        340        350        360 
EILFLDKIRS MELSQVTITC YLTWSPCPNC AWQLAAFKRD RPDLILHIYT SRLYFHWKRP 
       370        380        390        400        410        420 
FQKGLCSLWQ SGILVDVMDL PQFTDCWTNF VNPKRPFWPW KGLEIISRRT QRRLRRIKES 
       430        440    
WGLQDLVNDF GNLQLGPPMS          10         20         30         40         50         60 
MQPQRLGPRA GMGPFCLGCS HRKCYSPIRN LISQETFKFH FKNLGYAKGR KDTFLCYEVT 
        70         80         90        100        110        120 
RKDCDSPVSL HHGVFKNKDN IHAEICFLYW FHDKVLKVLS PREEFKITWY MSWSPCFECA 
       130        140        150        160        170        180 
EQIVRFLATH HNLSLDIFSS RLYNVQDPET QQNLCRLVQE GAQVAAMDLY EFKKCWKKFV 
       190        200        210        220        230        240 
DNGGRRFRPW KRLLTNFRYQ DSKLQEILRP CYISVPSSSS STLSNICLTK GLPETRFWVE 
       250        260        270        280        290        300 
GRRMDPLSEE EFYSQFYNQR VKHLCYYHRM KPYLCYQLEQ FNGQAPLKGC LLSEKGKQHA 
       310        320        330        340        350        360 
EILFLDKIRS MELSQVTITC YLTWSPCPNC AWQLAAFKRD RPDLILHIYT SRLYFHWKRP 
       370        380        390        400        410        420 
FQKGLCSLWQ SGILVDVMDL PQFTDCWTNF VNPKRPFWPW KGLEIISRRT QRRLRRIKES 
       430        440    
WGLQDLVNDF GNLQLGPPMS          10         20         30         40         50         60 
MQPQRLGPRA GMGPFCLGCS HRKCYSPIRN LISQETFKFH FKNLGYAKGR KDTFLCYEVT 
        70         80         90        100        110        120 
RKDCDSPVSL HHGVFKNKDN IHAEICFLYW FHDKVLKVLS PREEFKITWY MSWSPCFECA 
       130        140        150        160        170        180 
EQIVRFLATH HNLSLDIFSS RLYNVQDPET QQNLCRLVQE GAQVAAMDLY EFKKCWKKFV 
       190        200        210        220        230        240 
DNGGRRFRPW KRLLTNFRYQ DSKLQEILRP CYISVPSSSS STLSNICLTK GLPETRFWVE 
       250        260        270        280        290        300 
GRRMDPLSEE EFYSQFYNQR VKHLCYYHRM KPYLCYQLEQ FNGQAPLKGC LLSEKGKQHA 
       310        320        330        340        350        360 
EILFLDKIRS MELSQVTITC YLTWSPCPNC AWQLAAFKRD RPDLILHIYT SRLYFHWKRP 
       370        380        390        400        410        420 
FQKGLCSLWQ SGILVDVMDL PQFTDCWTNF VNPKRPFWPW KGLEIISRRT QRRLRRIKES 
       430        440    
WGLQDLVNDF GNLQLGPPMS          10         20         30         40         50         60 
MQPQRLGPRA GMGPFCLGCS HRKCYSPIRN LISQETFKFH FKNLGYAKGR KDTFLCYEVT 
        70         80         90        100        110        120 
RKDCDSPVSL HHGVFKNKDN IHAEICFLYW FHDKVLKVLS PREEFKITWY MSWSPCFECA 
       130        140        150        160        170        180 
EQIVRFLATH HNLSLDIFSS RLYNVQDPET QQNLCRLVQE GAQVAAMDLY EFKKCWKKFV 
       190        200        210        220        230        240 
DNGGRRFRPW KRLLTNFRYQ DSKLQEILRP CYISVPSSSS STLSNICLTK GLPETRFWVE 
       250        260        270        280        290        300 
GRRMDPLSEE EFYSQFYNQR VKHLCYYHRM KPYLCYQLEQ FNGQAPLKGC LLSEKGKQHA 
       310        320        330        340        350        360 
EILFLDKIRS MELSQVTITC YLTWSPCPNC AWQLAAFKRD RPDLILHIYT SRLYFHWKRP 
       370        380        390        400        410        420 
FQKGLCSLWQ SGILVDVMDL PQFTDCWTNF VNPKRPFWPW KGLEIISRRT QRRLRRIKES 
       430        440    
WGLQDLVNDF GNLQLGPPMS 



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...DLVNDF 429 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...DLVNDF 429 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt61626

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)