TopFIND 4.0

Q9JIR4: Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1

General Information

Protein names
- Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1
- Rab-3-interacting molecule 1
- RIM 1
Gene names Rims1
Organism Rattus norvegicus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q9JIR4

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MSSAVGPRGP RPPTVPPPMQ ELPDLSHLTE EERNIIMAVM DRQKEEEEKE EAMLKCVVRD 
        70         80         90        100        110        120 
MAKPAACKTP RNAESQPHQP PLNIFRCVCV PRKPSSEEGG PERDWRLHQQ FESYKEQVRK 
       130        140        150        160        170        180 
IGEEARRYQG EHKDDAPTCG ICHKTKFADG CGHLCSYCRT KFCARCGGRV SLRSNNEDKV 
       190        200        210        220        230        240 
VMWVCNLCRK QQEILTKSGA WFFGSGPQQP SQDGTLSDTA TGAGSEVPRE KKARLQERSR 
       250        260        270        280        290        300 
SQTPLSTAAV SSQDTATPGA PLHRNKGAEP SQQALGPEQK QASRSRSEPP RERKKAPGLS 
       310        320        330        340        350        360 
EQNGKGGQKS ERKRVPKSVV QPGEGIADER ERKERRETRR LEKGRSQDYS DRPEKRDNGR 
       370        380        390        400        410        420 
VAEDQKQRKE EEYQTRYRSD PNLARYPVKA PPEEQQMRMH ARVSRARHER RHSDVALPHT 
       430        440        450        460        470        480 
EAAAAAPAEA TAGKRAPATA RVSPPESPRA RAAAAQPPTE HGPPPPRPAP GPAEPPEPRV 
       490        500        510        520        530        540 
PEPLRKQGRL DPGSAVLLRK AKREKAESML RNDSLSSDQS ESVRPSPPKP HRPKRGGKRR 
       550        560        570        580        590        600 
QMSVSSSEEE GVSTPEYTSC EDVELESESV SEKGDLDYYW LDPATWHSRE TSPISSHPVT 
       610        620        630        640        650        660 
WQPSKEGDRL IGRVILNKRT TMPKESGALL GLKVVGGKMT DLGRLGAFIT KVKKGSLADV 
       670        680        690        700        710        720 
VGHLRAGDEV LEWNGKPLPG ATNEEVYNII LESKSEPQVE IIVSRPIGDI PRIPESSHPP 
       730        740        750        760        770        780 
LESSSSSFES QKMERPSISV ISPTSPGALK DAPQVLPGQL SVKLWYDKVG HQLIVNVLQA 
       790        800        810        820        830        840 
TDLPPRVDGR PRNPYVKMYF LPDRSDKSKR RTKTVKKLLE PKWNQTFVYS HVHRRDFRER 
       850        860        870        880        890        900 
MLEITVWDQP RVQDEESEFL GEILIELETA LLDDEPHWYK LQTHDESSLP LPQPSPFMPR 
       910        920        930        940        950        960 
RHIHGESSSK KLQRSQRISD SDISDYEVDD GIGVVPPVGY RASARESKAT TLTVPEQQRT 
       970        980        990       1000       1010       1020 
THHRSRSVSP HRGDDQGRPR SRLPNVPLQR SLDEIHPTRR SRSPTRHHDA SRSPADHRSR 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
HVESQYSSEP DSELLMLPRA KRGRSAESLH MTSELQPSLD RARSASTNCL RPDTSLHSPE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
RERHSRKSER CSIQKQSRKG TASDADRVLP PCLSRRGYAT PRATDQPVVR GKYPTRSRSS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
EHSSVRTLCS MHHLAPGGSA PPSPLLLTRT HRQGSPTQSP PADTSFGSRR GRQLPQVPVR 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SGSIEQASLV VEERTRQMKV KVHRFKQTTG SGSSQELDHE QYSKYNIHKD QYRSCDNASA 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
KSSDSDVSDV SAISRASSTS RLSSTSFMSE QSERPRGRIS SFTPKMQGRR MGTSGRAIIK 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
STSVSGEIYT LERNDGSQSD TAVGTVGAGG KKRRSSLSAK VVAIVSRRSR STSQLSQTES 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
GHKKLKSTIQ RSTETGMAAE MRKMVRQPSR ESTDGSINSY SSEGNLIFPG VRVGPDSQFS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
DFLDGLGPAQ LVGRQTLATP AMGDIQIGME DKKGQLEVEV IRARSLTQKP GSKSTPAPYV 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KVYLLENGAC IAKKKTRIAR KTLDPLYQQS LVFDESPQGK VLQVIVWGDY GRMDHKCFMG 
      1570       1580       1590       1600       1610    
VAQILLEELD LSSMVIGWYK LFPPSSLVDP TLAPLTRRAS QSSLESSSGP PCIRS

Isoforms

- Isoform 2 of Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MSSAVGPRGP RPPTVPPPMQ ELPDLSHLTE EERNIIMAVM DRQKEEEEKE EAMLKCVVRD 
        70         80         90        100        110        120 
MAKPAACKTP RNAESQPHQP PLNIFRCVCV PRKPSSEEGG PERDWRLHQQ FESYKEQVRK 
       130        140        150        160        170        180 
IGEEARRYQG EHKDDAPTCG ICHKTKFADG CGHLCSYCRT KFCARCGGRV SLRSNNEDKV 
       190        200        210        220        230        240 
VMWVCNLCRK QQEILTKSGA WFFGSGPQQP SQDGTLSDTA TGAGSEVPRE KKARLQERSR 
       250        260        270        280        290        300 
SQTPLSTAAV SSQDTATPGA PLHRNKGAEP SQQALGPEQK QASRSRSEPP RERKKAPGLS 
       310        320        330        340        350        360 
EQNGKGGQKS ERKRVPKSVV QPGEGIADER ERKERRETRR LEKGRSQDYS DRPEKRDNGR 
       370        380        390        400        410        420 
VAEDQKQRKE EEYQTRYRSD PNLARYPVKA PPEEQQMRMH ARVSRARHER RHSDVALPHT 
       430        440        450        460        470        480 
EAAAAAPAEA TAGKRAPATA RVSPPESPRA RAAAAQPPTE HGPPPPRPAP GPAEPPEPRV 
       490        500        510        520        530        540 
PEPLRKQGRL DPGSAVLLRK AKREKAESML RNDSLSSDQS ESVRPSPPKP HRPKRGGKRR 
       550        560        570        580        590        600 
QMSVSSSEEE GVSTPEYTSC EDVELESESV SEKGDLDYYW LDPATWHSRE TSPISSHPVT 
       610        620        630        640        650        660 
WQPSKEGDRL IGRVILNKRT TMPKESGALL GLKVVGGKMT DLGRLGAFIT KVKKGSLADV 
       670        680        690        700        710        720 
VGHLRAGDEV LEWNGKPLPG ATNEEVYNII LESKSEPQVE IIVSRPIGDI PRIPESSHPP 
       730        740        750        760        770        780 
LESSSSSFES QKMERPSISV ISPTSPGALK DAPQVLPGQL SVKLWYDKVG HQLIVNVLQA 
       790        800        810        820        830        840 
TDLPPRVDGR PRNPYVKMYF LPDRSDKSKR RTKTVKKLLE PKWNQTFVYS HVHRRDFRER 
       850        860        870        880        890        900 
MLEITVWDQP RVQDEESEFL GEILIELETA LLDDEPHWYK LQTHDESSLP LPQPSPFMPR 
       910        920        930        940        950        960 
RHIHGESSSK KLQRSQRISD SDISDYEVDD GIGVVPPVGY RASARESKAT TLTVPEQQRT 
       970        980        990       1000       1010       1020 
THHRSRSVSP HRGDDQGRPR SRLPNVPLQR SLDEIHPTRR SRSPTRHHDA SRSPADHRSR 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
HVESQYSSEP DSELLMLPRA KRGRSAESLH MTSELQPSLD RARSASTNCL RPDTSLHSPE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
RERHSRKSER CSIQKQSRKG TASDADRVLP PCLSRRGYAT PRATDQPVVR GKYPTRSRSS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
EHSSVRTLCS MHHLAPGGSA PPSPLLLTRT HRQGSPTQSP PADTSFGSRR GRQLPQVPVR 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
SGSIEQASLV VEERTRQMKV KVHRFKQTTG SGSSQELDHE QYSKYNIHKD QYRSCDNASA 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
KSSDSDVSDV SAISRASSTS RLSSTSFMSE QSERPRGRIS SFTPKMQGRR MGTSGRAIIK 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
STSVSGEIYT LERNDGSQSD TAVGTVGAGG KKRRSSLSAK VVAIVSRRSR STSQLSQTES 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
GHKKLKSTIQ RSTETGMAAE MRKMVRQPSR ESTDGSINSY SSEGNLIFPG VRVGPDSQFS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
DFLDGLGPAQ LVGRQTLATP AMGDIQIGME DKKGQLEVEV IRARSLTQKP GSKSTPAPYV 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KVYLLENGAC IAKKKTRIAR KTLDPLYQQS LVFDESPQGK VLQVIVWGDY GRMDHKCFMG 
      1570       1580       1590       1600       1610    
VAQILLEELD LSSMVIGWYK LFPPSSLVDP TLAPLTRRAS QSSLESSSGP PCIRS



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q9JIR4-1-unknown MSSAVG... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q9JIR4-1-unknown MSSAVG... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt193392

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...PCIRS 1615 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...PCIRS 1615 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt153338

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)