TopFIND 4.0

Q9JIX5: Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8 {ECO:0000255|HAMAP-Rule:MF_03071}

General Information

Protein names
- Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8 {ECO:0000255|HAMAP-Rule:MF_03071}
- CHD-8 {ECO:0000255|HAMAP-Rule:MF_03071}
- 3.6.4.12 {ECO:0000255|HAMAP-Rule:MF_03071}
- ATP-dependent helicase CHD8 {ECO:0000255|HAMAP-Rule:MF_03071}
- Axis duplication inhibitor
- Duplin
Gene names Chd8
Organism Rattus norvegicus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q9JIX5

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MADPIMDLFD DPNLFGLDSL TDDSFNQVTQ DPIEEALGLP SSLDSLDQMN QDGGSGDVGN 
        70         80         90        100        110        120 
SSASDLVPPP EETASTELPK ESTAPAPESL TLHDYTTQPT SQEQPAQPVL QTSTPTSGLL 
       130        140        150        160        170        180 
QVSKSQEILS QGNPFMGVSA TAVSPSNTGG QPSQSAPKIV ILKAPPNSSV TGAHVAQIQA 
       190        200        210        220        230        240 
QGITSTAQPL VAGTANGGKV TFTKVLTGTP LRPGVSIVSG NTVLATKVPG NQAAVQRIVQ 
       250        260        270        280        290        300 
PSRPVKQLVL QPVKGSAPAG NPGATGPPLK PAVTLTSTPA QGESKRITLV LQQPQSGGPQ 
       310        320        330        340        350        360 
GHRHVVLGSL PGKIVLQGNQ LAALTQAKSA QGQPAKVVTI QLQVQQPQQK IQIVPQPPSS 
       370        380        390        400        410        420 
QPQPQPPPSA QPLTLSSVQQ AQIMGPGQNP GQRLSVPLKM VLQPQAGSSQ GASSGLSVVK 
       430        440        450        460        470        480 
VLSASEVAAL SSPASCAPHT AGKTGMEENR RLEHQKKQEK ANRIVAEAIA RARARGEQNI 
       490        500        510        520        530        540 
PRVLNEDELP SVRPEEEGEK KRRKKSSGER LKEEKPKKSK TAAASKTKGK SKLNTITPVV 
       550        560        570        580        590        600 
GKKRKRNTSS DNSDVEVMPA QSPREDEESS IQKRRSNRQV KRKKYTEDLD IKITDDEEEE 
       610        620        630        640        650        660 
EVDVTGPIKP EPILPEPVPE PDGETLPSMQ FFVENPSEED AAIVDKVLSM RVVKKELPSG 
       670        680        690        700        710        720 
QYTEAEEFFV KYKNYSYLHC EWATISQLEK DKRIHQKLKR FKTKMAQMRH FFHEDEEPFN 
       730        740        750        760        770        780 
PDYVEVDRIL DESHSVDKDN GEPVIYYLVK WCSLPYEDST WELKEDVDEG KIREFKRIQS 
       790        800        810        820        830        840 
RHPELKRVNR PQANAWKKLE LSHEYKNRNQ LREYQLEGVN WLLFNWYNRQ NCILADEMGL 
       850        860        870        880        890        900 
GKTIQSIAFL QEVYNVGIHG PFLVIAPLST ITNWEREFNT WTEMNTIVYH GSLASRQMIQ 
       910        920        930        940        950        960 
QYEMYCKDSR GRLIPGAYKF DALITTFEMI LSDCPELREI EWRCVIIDEA HRLKNRNCKL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LDSLKHMDLE HKVLLTGTPL QNTVEELFSL LHFLEPSQFP SESEFLKDFG DLKTEEQVQK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LQAILKPMML RRLKEDVEKN LAPKQETIIE VELTNIQKKY YRAILEKNFS FLSKGAGHTN 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
MPNLLNTMME LRKCCNHPYL INGAEEKILM EFREACHIIP QDFHLQAMVR SAGKLVLIDK 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
LLPKLKAGGH KVLIFSQMVR CLDILEDYLI QRRYLYERID GRVRGNLRQA AIDRFSKPDS 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
DRFVFLLCTR AGGLGINLTA ADTCIIFDSD WNPQNDLQAQ ARCHRIGQSK AVKVYRLITR 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
NSYEREMFDK ASLKLGLDKA VLQSMSGRDG NITGIQQFSK KEIEDLLRKG AYAAIMEEDD 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
EGSKFCEEDI DQILLRRTTT ITIESEGKGS TFAKASFVAS ENRTDISLDD PNFWQKWAKK 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
ADLDMDLLNS KNNLVIDTPR VRKQTRHFST LKDDDLVEFS DLESEDDERP RSRRHDRHHT 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
YGRTDCFRVE KHLLVYGWGR WRDILSHGRF KRRMTERDVE TICRAILVYC LLHYRGDENI 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KSFIWDLISP AENGKTKELQ NHSGLSIPVP RGRKGKKVKS QSTFDIHKAD WIRKYNPDTL 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
FQDESYKKHL KHQCNKVLLR VRMLYYLRQE VIGDQAEKVL GGAIASEIDI WFPVVDQLEV 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PTTWWDSEAD KSLLIGVFKH GYEKYNTMRA DPALCFLEKA GRPDDKAIAA EHRVLDNFSD 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
LVEGIDFDKD CEDPEYKPLQ GPPKDPDDEG DPLMMMDEEI SVIDGDEAPV TQQPGHLFWP 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
PGSALTARLR RLVTAYQRSY KREQMKIEAA ERGDRRRRRC EAAFKLKEIA RREKQQRWTR 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
REQTDFYRVV STFGVEYDPD NMQFHWDRFR TFARLDKKTD ESLTKYFHGF VAMCRQVCRL 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
PPAAGDEPPD PNLFIEPITE ERASRTLYRI ELLRRLREQV LCHPLLEDRL ALCQPPGLEL 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
PKWWEPVRHD GELLRGAARH GVSQTDCNIM QDPDFSFLAA RMNYMQNHQA GASAASLSRC 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
STPLLHQQCT SRTASPSPLR PDVPAEKSPE ENAVQVPSLD SLTLKLEDEV VARSRLTPQD 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
YEIRVASSDT APLSRSVPPV KLEDDDDSDS ELDLSKLSPS SSSSSSSSSS SSSSDESEDE 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
KEEKLTADRS RPKLYDEESL LSLTMSQDGF PNEDGEQMTP ELLLLQERQR ASEWPKDRVL 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
INRIDLVCQA VLSGKWPSNR RSQEMTTGGI LGPGNHLLDS PSLTPGEYGD SPVPTPRSSS 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
AASMVEEEAS AVTTAAAQFT KLRRGMDEKE FTVQIKDEEG LKLTFQKHRL MANGVMGDGH 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
PLFHKKKGNR KKLVELEVEC MEEPNHLDVD LETRIPVINK VDGTLLVGDE APRRAELDMW 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
LQGHPEFAVD PRFLAYMEER RKQKWQRCKK NNKTELNCLG MEPVQPANSR NGKKGHYAET 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
AFNRVLPGPI APENSKKRVR RTRPDLSKMM ALMQGGSTGS LSLHNTFQHS SSNLQSVSSL 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
GHSSATSASL PFMPFVMGGA AAPPHVDSST MLHHHHHHPH PHHHHHHHPG LRTTGYPSSP 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
ATTTSGTALR LPTLQHEDDD EEEDEDDDDL SQGYDSSERD FSLIDDPMMP ANSDSSDDAD 
   
D

Isoforms

- Isoform 2 of Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MADPIMDLFD DPNLFGLDSL TDDSFNQVTQ DPIEEALGLP SSLDSLDQMN QDGGSGDVGN 
        70         80         90        100        110        120 
SSASDLVPPP EETASTELPK ESTAPAPESL TLHDYTTQPT SQEQPAQPVL QTSTPTSGLL 
       130        140        150        160        170        180 
QVSKSQEILS QGNPFMGVSA TAVSPSNTGG QPSQSAPKIV ILKAPPNSSV TGAHVAQIQA 
       190        200        210        220        230        240 
QGITSTAQPL VAGTANGGKV TFTKVLTGTP LRPGVSIVSG NTVLATKVPG NQAAVQRIVQ 
       250        260        270        280        290        300 
PSRPVKQLVL QPVKGSAPAG NPGATGPPLK PAVTLTSTPA QGESKRITLV LQQPQSGGPQ 
       310        320        330        340        350        360 
GHRHVVLGSL PGKIVLQGNQ LAALTQAKSA QGQPAKVVTI QLQVQQPQQK IQIVPQPPSS 
       370        380        390        400        410        420 
QPQPQPPPSA QPLTLSSVQQ AQIMGPGQNP GQRLSVPLKM VLQPQAGSSQ GASSGLSVVK 
       430        440        450        460        470        480 
VLSASEVAAL SSPASCAPHT AGKTGMEENR RLEHQKKQEK ANRIVAEAIA RARARGEQNI 
       490        500        510        520        530        540 
PRVLNEDELP SVRPEEEGEK KRRKKSSGER LKEEKPKKSK TAAASKTKGK SKLNTITPVV 
       550        560        570        580        590        600 
GKKRKRNTSS DNSDVEVMPA QSPREDEESS IQKRRSNRQV KRKKYTEDLD IKITDDEEEE 
       610        620        630        640        650        660 
EVDVTGPIKP EPILPEPVPE PDGETLPSMQ FFVENPSEED AAIVDKVLSM RVVKKELPSG 
       670        680        690        700        710        720 
QYTEAEEFFV KYKNYSYLHC EWATISQLEK DKRIHQKLKR FKTKMAQMRH FFHEDEEPFN 
       730        740        750        760        770        780 
PDYVEVDRIL DESHSVDKDN GEPVIYYLVK WCSLPYEDST WELKEDVDEG KIREFKRIQS 
       790        800        810        820        830        840 
RHPELKRVNR PQANAWKKLE LSHEYKNRNQ LREYQLEGVN WLLFNWYNRQ NCILADEMGL 
       850        860        870        880        890        900 
GKTIQSIAFL QEVYNVGIHG PFLVIAPLST ITNWEREFNT WTEMNTIVYH GSLASRQMIQ 
       910        920        930        940        950        960 
QYEMYCKDSR GRLIPGAYKF DALITTFEMI LSDCPELREI EWRCVIIDEA HRLKNRNCKL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LDSLKHMDLE HKVLLTGTPL QNTVEELFSL LHFLEPSQFP SESEFLKDFG DLKTEEQVQK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LQAILKPMML RRLKEDVEKN LAPKQETIIE VELTNIQKKY YRAILEKNFS FLSKGAGHTN 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
MPNLLNTMME LRKCCNHPYL INGAEEKILM EFREACHIIP QDFHLQAMVR SAGKLVLIDK 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
LLPKLKAGGH KVLIFSQMVR CLDILEDYLI QRRYLYERID GRVRGNLRQA AIDRFSKPDS 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
DRFVFLLCTR AGGLGINLTA ADTCIIFDSD WNPQNDLQAQ ARCHRIGQSK AVKVYRLITR 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
NSYEREMFDK ASLKLGLDKA VLQSMSGRDG NITGIQQFSK KEIEDLLRKG AYAAIMEEDD 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
EGSKFCEEDI DQILLRRTTT ITIESEGKGS TFAKASFVAS ENRTDISLDD PNFWQKWAKK 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
ADLDMDLLNS KNNLVIDTPR VRKQTRHFST LKDDDLVEFS DLESEDDERP RSRRHDRHHT 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
YGRTDCFRVE KHLLVYGWGR WRDILSHGRF KRRMTERDVE TICRAILVYC LLHYRGDENI 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KSFIWDLISP AENGKTKELQ NHSGLSIPVP RGRKGKKVKS QSTFDIHKAD WIRKYNPDTL 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
FQDESYKKHL KHQCNKVLLR VRMLYYLRQE VIGDQAEKVL GGAIASEIDI WFPVVDQLEV 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PTTWWDSEAD KSLLIGVFKH GYEKYNTMRA DPALCFLEKA GRPDDKAIAA EHRVLDNFSD 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
LVEGIDFDKD CEDPEYKPLQ GPPKDPDDEG DPLMMMDEEI SVIDGDEAPV TQQPGHLFWP 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
PGSALTARLR RLVTAYQRSY KREQMKIEAA ERGDRRRRRC EAAFKLKEIA RREKQQRWTR 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
REQTDFYRVV STFGVEYDPD NMQFHWDRFR TFARLDKKTD ESLTKYFHGF VAMCRQVCRL 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
PPAAGDEPPD PNLFIEPITE ERASRTLYRI ELLRRLREQV LCHPLLEDRL ALCQPPGLEL 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
PKWWEPVRHD GELLRGAARH GVSQTDCNIM QDPDFSFLAA RMNYMQNHQA GASAASLSRC 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
STPLLHQQCT SRTASPSPLR PDVPAEKSPE ENAVQVPSLD SLTLKLEDEV VARSRLTPQD 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
YEIRVASSDT APLSRSVPPV KLEDDDDSDS ELDLSKLSPS SSSSSSSSSS SSSSDESEDE 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
KEEKLTADRS RPKLYDEESL LSLTMSQDGF PNEDGEQMTP ELLLLQERQR ASEWPKDRVL 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
INRIDLVCQA VLSGKWPSNR RSQEMTTGGI LGPGNHLLDS PSLTPGEYGD SPVPTPRSSS 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
AASMVEEEAS AVTTAAAQFT KLRRGMDEKE FTVQIKDEEG LKLTFQKHRL MANGVMGDGH 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
PLFHKKKGNR KKLVELEVEC MEEPNHLDVD LETRIPVINK VDGTLLVGDE APRRAELDMW 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
LQGHPEFAVD PRFLAYMEER RKQKWQRCKK NNKTELNCLG MEPVQPANSR NGKKGHYAET 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
AFNRVLPGPI APENSKKRVR RTRPDLSKMM ALMQGGSTGS LSLHNTFQHS SSNLQSVSSL 
      2470       2480       2490       2500       2510       2520 
GHSSATSASL PFMPFVMGGA AAPPHVDSST MLHHHHHHPH PHHHHHHHPG LRTTGYPSSP 
      2530       2540       2550       2560       2570       2580 
ATTTSGTALR LPTLQHEDDD EEEDEDDDDL SQGYDSSERD FSLIDDPMMP ANSDSSDDAD 
   
D



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q9JIX5-1-unknown MADPIM... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q9JIX5-1-unknown MADPIM... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt192420

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...DDADD 2581 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)