TopFIND 4.0

Q9JJV9: Sodium channel protein type 5 subunit alpha

General Information

Protein names
- Sodium channel protein type 5 subunit alpha
- Sodium channel protein cardiac muscle subunit alpha
- Sodium channel protein type V subunit alpha
- Voltage-gated sodium channel subunit alpha Nav1.5
- mH1
Gene names Scn5a
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q9JJV9

1

N-termini

2

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MANFLLPRGT SSFRRFTRES LAAIEKRMAE KQARGSATSQ ESREGLPEEE APRPQLDLQA 
        70         80         90        100        110        120 
SKKLPDLYGN PPRELIGEPL EDLDPFYSTQ KTFIVLNKGK TIFRFSATNA LYVLSPFHPV 
       130        140        150        160        170        180 
RRAAVKILVH SLFSMLIMCT ILTNCVFMAQ HDPPPWTKYV EYTFTAIYTF ESLVKILARG 
       190        200        210        220        230        240 
FCLHAFTFLR DPWNWLDFSV IVMAYTTEFV DLGNVSALRT FRVLRALKTI SVISGLKTIV 
       250        260        270        280        290        300 
GALIQSVKKL ADVMVLTVFC LSVFALIGLQ LFMGNLRHKC VRNFTELNGT NGSVEADGIV 
       310        320        330        340        350        360 
WNSLDVYLND PANYLLKNGT TDVLLCGNSS DAGTCPEGYR CLKAGENPDH GYTSFDSFAW 
       370        380        390        400        410        420 
AFLALFRLMT QDCWERLYQQ TLRSAGKIYM IFFMLVIFLG SFYLVNLILA VVAMAYEEQN 
       430        440        450        460        470        480 
QATIAETEEK EKRFQEAMEM LKKEHEALTI RGVDTVSRSS LEMSPLAPVT NHERRSKRRK 
       490        500        510        520        530        540 
RLSSGTEDGG DDRLPKSDSE DGPRALNQLS LTHGLSRTSM RPRSSRGSIF TFRRRDQGSE 
       550        560        570        580        590        600 
ADFADDENST AGESESHRTS LLVPWPLRRP STQGQPGFGT SAPGHVLNGK RNSTVDCNGV 
       610        620        630        640        650        660 
VSLLGAGDAE ATSPGSHLLR PIVLDRPPDT TTPSEEPGGP QMLTPQAPCA DGFEEPGARQ 
       670        680        690        700        710        720 
RALSAVSVLT SALEELEESH RKCPPCWNRF AQHYLIWECC PLWMSIKQKV KFVVMDPFAD 
       730        740        750        760        770        780 
LTITMCIVLN TLFMALEHYN MTAEFEEMLQ VGNLVFTGIF TAEMTFKIIA LDPYYYFQQG 
       790        800        810        820        830        840 
WNIFDSIIVI LSLMELGLSR MGNLSVLRSF RLLRVFKLAK SWPTLNTLIK IIGNSVGALG 
       850        860        870        880        890        900 
NLTLVLAIIV FIFAVVGMQL FGKNYSELRH RISDSGLLPR WHMMDFFHAF LIIFRILCGE 
       910        920        930        940        950        960 
WIETMWDCME VSGQSLCLLV FLLVMVIGNL VVLNLFLALL LSSFSADNLT APDEDGEMNN 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LQLALARIQR GLRFVKRTTW DFCCGLLRRR PKKPAALATH SQLPSCIAAP RSPPPPEVEK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
APPARKETRF EEDKRPGQGT PGDTEPVCVP IAVAESDTDD QEEDEENSLG TEEEESSKQE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SQVVSGGHEP PQEPRAWSQV SETTSSEAEA STSQADWQQE REAEPRAPGC GETPEDSYSE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
GSTADMTNTA DLLEQIPDLG EDVKDPEDCF TEGCVRRCPC CMVDTTQAPG KVWWRLRKTC 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
YRIVEHSWFE TFIIFMILLS SGALAFEDIY LEERKTIKVL LEYADKMFTY VFVLEMLLKW 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
VAYGFKKYFT NAWCWLDFLI VDVSLVSLVA NTLGFAEMGP IKSLRTLRAL RPLRALSRFE 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
GMRVVVNALV GAIPSIMNVL LVCLIFWLIF SIMGVNLFAG KFGRCINQTE GDLPLNYTIV 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
NNKSECESFN VTGELYWTKV KVNFDNVGAG YLALLQVATF KGWMDIMYAA VDSRGYEEQP 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QWEDNLYMYI YFVVFIIFGS FFTLNLFIGV IIDNFNQQKK KLGGQDIFMT EEQKKYYNAM 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KKLGSKKPQK PIPRPLNKYQ GFIFDIVTKQ AFDVTIMFLI CLNMVTMMVE TDDQSPEKVN 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
ILAKINLLFV AIFTGECIVK MAALRHYYFT NSWNIFDFVV VILSIVGTVL SDIIQKYFFS 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PTLFRVIRLA RIGRILRLIR GAKGIRTLLF ALMMSLPALF NIGLLLFLVM FIYSIFGMAN 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
FAYVKWEAGI DDMFNFQTFA NSMLCLFQIT TSAGWDGLLS PILNTGPPYC DPNLPNSNGS 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
RGNCGSPAVG ILFFTTYIII SFLIVVNMYI AIILENFSVA TEESTEPLSE DDFDMFYEIW 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
EKFDPEATQF IEYLALSDFA DALSEPLRIA KPNQISLINM DLPMVSGDRI HCMDILFAFT 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
KRVLGESGEM DALKIQMEEK FMAANPSKIS YEPITTTLRR KHEEVSATVI QRAFRRHLLQ 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
RSVKHASFLF RQQAGSSGLS DEDAPEREGL IAYMMNENFS RRSGPLSSSS ISSTSFPPSY 
      1990       2000       2010    
DSVTRATSDN LPVRASDYSR SEDLADFPPS PDRDRESIV

Isoforms

- Isoform 2 of Sodium channel protein type 5 subunit alpha

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MANFLLPRGT SSFRRFTRES LAAIEKRMAE KQARGSATSQ ESREGLPEEE APRPQLDLQA 
        70         80         90        100        110        120 
SKKLPDLYGN PPRELIGEPL EDLDPFYSTQ KTFIVLNKGK TIFRFSATNA LYVLSPFHPV 
       130        140        150        160        170        180 
RRAAVKILVH SLFSMLIMCT ILTNCVFMAQ HDPPPWTKYV EYTFTAIYTF ESLVKILARG 
       190        200        210        220        230        240 
FCLHAFTFLR DPWNWLDFSV IVMAYTTEFV DLGNVSALRT FRVLRALKTI SVISGLKTIV 
       250        260        270        280        290        300 
GALIQSVKKL ADVMVLTVFC LSVFALIGLQ LFMGNLRHKC VRNFTELNGT NGSVEADGIV 
       310        320        330        340        350        360 
WNSLDVYLND PANYLLKNGT TDVLLCGNSS DAGTCPEGYR CLKAGENPDH GYTSFDSFAW 
       370        380        390        400        410        420 
AFLALFRLMT QDCWERLYQQ TLRSAGKIYM IFFMLVIFLG SFYLVNLILA VVAMAYEEQN 
       430        440        450        460        470        480 
QATIAETEEK EKRFQEAMEM LKKEHEALTI RGVDTVSRSS LEMSPLAPVT NHERRSKRRK 
       490        500        510        520        530        540 
RLSSGTEDGG DDRLPKSDSE DGPRALNQLS LTHGLSRTSM RPRSSRGSIF TFRRRDQGSE 
       550        560        570        580        590        600 
ADFADDENST AGESESHRTS LLVPWPLRRP STQGQPGFGT SAPGHVLNGK RNSTVDCNGV 
       610        620        630        640        650        660 
VSLLGAGDAE ATSPGSHLLR PIVLDRPPDT TTPSEEPGGP QMLTPQAPCA DGFEEPGARQ 
       670        680        690        700        710        720 
RALSAVSVLT SALEELEESH RKCPPCWNRF AQHYLIWECC PLWMSIKQKV KFVVMDPFAD 
       730        740        750        760        770        780 
LTITMCIVLN TLFMALEHYN MTAEFEEMLQ VGNLVFTGIF TAEMTFKIIA LDPYYYFQQG 
       790        800        810        820        830        840 
WNIFDSIIVI LSLMELGLSR MGNLSVLRSF RLLRVFKLAK SWPTLNTLIK IIGNSVGALG 
       850        860        870        880        890        900 
NLTLVLAIIV FIFAVVGMQL FGKNYSELRH RISDSGLLPR WHMMDFFHAF LIIFRILCGE 
       910        920        930        940        950        960 
WIETMWDCME VSGQSLCLLV FLLVMVIGNL VVLNLFLALL LSSFSADNLT APDEDGEMNN 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LQLALARIQR GLRFVKRTTW DFCCGLLRRR PKKPAALATH SQLPSCIAAP RSPPPPEVEK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
APPARKETRF EEDKRPGQGT PGDTEPVCVP IAVAESDTDD QEEDEENSLG TEEEESSKQE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
SQVVSGGHEP PQEPRAWSQV SETTSSEAEA STSQADWQQE REAEPRAPGC GETPEDSYSE 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
GSTADMTNTA DLLEQIPDLG EDVKDPEDCF TEGCVRRCPC CMVDTTQAPG KVWWRLRKTC 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
YRIVEHSWFE TFIIFMILLS SGALAFEDIY LEERKTIKVL LEYADKMFTY VFVLEMLLKW 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
VAYGFKKYFT NAWCWLDFLI VDVSLVSLVA NTLGFAEMGP IKSLRTLRAL RPLRALSRFE 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
GMRVVVNALV GAIPSIMNVL LVCLIFWLIF SIMGVNLFAG KFGRCINQTE GDLPLNYTIV 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
NNKSECESFN VTGELYWTKV KVNFDNVGAG YLALLQVATF KGWMDIMYAA VDSRGYEEQP 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
QWEDNLYMYI YFVVFIIFGS FFTLNLFIGV IIDNFNQQKK KLGGQDIFMT EEQKKYYNAM 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
KKLGSKKPQK PIPRPLNKYQ GFIFDIVTKQ AFDVTIMFLI CLNMVTMMVE TDDQSPEKVN 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
ILAKINLLFV AIFTGECIVK MAALRHYYFT NSWNIFDFVV VILSIVGTVL SDIIQKYFFS 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
PTLFRVIRLA RIGRILRLIR GAKGIRTLLF ALMMSLPALF NIGLLLFLVM FIYSIFGMAN 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
FAYVKWEAGI DDMFNFQTFA NSMLCLFQIT TSAGWDGLLS PILNTGPPYC DPNLPNSNGS 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
RGNCGSPAVG ILFFTTYIII SFLIVVNMYI AIILENFSVA TEESTEPLSE DDFDMFYEIW 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
EKFDPEATQF IEYLALSDFA DALSEPLRIA KPNQISLINM DLPMVSGDRI HCMDILFAFT 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
KRVLGESGEM DALKIQMEEK FMAANPSKIS YEPITTTLRR KHEEVSATVI QRAFRRHLLQ 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
RSVKHASFLF RQQAGSSGLS DEDAPEREGL IAYMMNENFS RRSGPLSSSS ISSTSFPPSY 
      1990       2000       2010    
DSVTRATSDN LPVRASDYSR SEDLADFPPS PDRDRESIV



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 2 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q9JJV9-1-unknown MANFLL... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q9JJV9-1-unknown MANFLL... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt89069

C-termini

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)