TopFIND 4.0

Q9LXW7: Endoribonuclease Dicer homolog 3

General Information

Protein names
- Endoribonuclease Dicer homolog 3
- 3.1.26.-
- Dicer-like protein 3
- AtDCL3
Gene names DCL3
Organism Arabidopsis thaliana
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q9LXW7

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MHSSLEPEKM EEGGGSNSLK RKFSEIDGDQ NLDSVSSPMM TDSNGSYELK VYEVAKNRNI 
        70         80         90        100        110        120 
IAVLGTGIDK SEITKRLIKA MGSSDTDKRL IIFLAPTVNL VKQQCCEIRA LVNLKVEEYF 
       130        140        150        160        170        180 
GAKGVDKWTS QRWDEEFSKH DVLVMTPQIL LDVLRSAFLK LEMVCLLIID ECHHTTGNHP 
       190        200        210        220        230        240 
YAKLMKEFYH ESTSKPKIFG LTASAVIRKG IVSSPSNYAA QVSELERLMD SKIFNPEERE 
       250        260        270        280        290        300 
GVEKFATTVK EGPILYNPSP SCSLELKEKL ETSHLKFDAS LRRLQELGKD SFLNMDNKFE 
       310        320        330        340        350        360 
TYQKRLSIDY REILHCLDNL GLICAHLAAE VCLEKISDTK EESETYKECS MVCKEFLEDI 
       370        380        390        400        410        420 
LSTIGVYLPQ DDKSLVDLQQ NHLSAVISGH VSPKLKELFH LLDSFRGDKQ KQCLILVERI 
       430        440        450        460        470        480 
ITAKVIERFV KKEASLAYLN VLYLTENNPS TNVSAQKMQI EIPDLFQHGK VNLLFITDVV 
       490        500        510        520        530        540 
EEGFQVPDCS CMVCFDLPKT MCSYSQSQKH AKQSNSKSIM FLERGNPKQR DHLHDLMRRE 
       550        560        570        580        590        600 
VLIQDPEAPN LKSCPPPVKN GHGVKEIGSM VIPDSNITVS EEAASTQTMS DPPSRNEQLP 
       610        620        630        640        650        660 
PCKKLRLDNN LLQSNGKEKV ASSKSKSSSS AAGSKKRKEL HGTTCANALS GTWGENIDGA 
       670        680        690        700        710        720 
TFQAYKFDFC CNISGEVYSS FSLLLESTLA EDVGKVEMDL YLVRKLVKAS VSPCGQIRLS 
       730        740        750        760        770        780 
QEELVKAKYF QQFFFNGMFG KLFVGSKSQG TKREFLLQTD TSSLWHPAFM FLLLPVETND 
       790        800        810        820        830        840 
LASSATIDWS AINSCASIVE FLKKNSLLDL RDSDGNQCNT SSGQEVLLDD KMEETNLIHF 
       850        860        870        880        890        900 
ANASSDKNSL EELVVIAIHT GRIYSIVEAV SDSSAMSPFE VDASSGYATY AEYFNKKYGI 
       910        920        930        940        950        960 
VLAHPNQPLM KLKQSHHAHN LLVDFNEEMV VKTEPKAGNV RKRKPNIHAH LPPELLARID 
       970        980        990       1000       1010       1020 
VPRAVLKSIY LLPSVMHRLE SLMLASQLRE EIDCSIDNFS ISSTSILEAV TTLTCPESFS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
MERLELLGDS VLKYVASCHL FLKYPDKDEG QLSRQRQSII SNSNLHRLTT SRKLQGYIRN 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
GAFEPRRWTA PGQFSLFPVP CKCGIDTREV PLDPKFFTEN MTIKIGKSCD MGHRWVVSKS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
VSDCAEALIG AYYVSGGLSA SLHMMKWLGI DVDFDPNLVV EAINRVSLRC YIPKEDELIE 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
LERKIQHEFS AKFLLKEAIT HSSLRESYSY ERLEFLGDSV LDFLITRHLF NTYEQTGPGE 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
MTDLRSACVN NENFAQVAVK NNLHTHLQRC ATVLETQIND YLMSFQKPDE TGRSIPSIQG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PKALGDVVES IAGALLIDTR LDLDQVWRVF EPLLSPLVTP DKLQLPPYRE LNELCDSLGY 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
FFRVKCSNDG VKAQATIQLQ LDDVLLTGDG SEQTNKLALG KAASHLLTQL EKRNISRKTS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
LGDNQSSMDV NLACNHSDRE TLTSETTEIQ SIVIPFIGPI NMKKGGPRGT LHEFCKKHLW 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
PMPTFDTSEE KSRTPFEFID GGEKRTSFSS FTSTITLRIP NREAVMYAGE ARPDKKSSFD 
      1570       1580    
SAVVELLYEL ERRKIVIIQK 

Isoforms

- Isoform 2 of Endoribonuclease Dicer homolog 3

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MHSSLEPEKM EEGGGSNSLK RKFSEIDGDQ NLDSVSSPMM TDSNGSYELK VYEVAKNRNI 
        70         80         90        100        110        120 
IAVLGTGIDK SEITKRLIKA MGSSDTDKRL IIFLAPTVNL VKQQCCEIRA LVNLKVEEYF 
       130        140        150        160        170        180 
GAKGVDKWTS QRWDEEFSKH DVLVMTPQIL LDVLRSAFLK LEMVCLLIID ECHHTTGNHP 
       190        200        210        220        230        240 
YAKLMKEFYH ESTSKPKIFG LTASAVIRKG IVSSPSNYAA QVSELERLMD SKIFNPEERE 
       250        260        270        280        290        300 
GVEKFATTVK EGPILYNPSP SCSLELKEKL ETSHLKFDAS LRRLQELGKD SFLNMDNKFE 
       310        320        330        340        350        360 
TYQKRLSIDY REILHCLDNL GLICAHLAAE VCLEKISDTK EESETYKECS MVCKEFLEDI 
       370        380        390        400        410        420 
LSTIGVYLPQ DDKSLVDLQQ NHLSAVISGH VSPKLKELFH LLDSFRGDKQ KQCLILVERI 
       430        440        450        460        470        480 
ITAKVIERFV KKEASLAYLN VLYLTENNPS TNVSAQKMQI EIPDLFQHGK VNLLFITDVV 
       490        500        510        520        530        540 
EEGFQVPDCS CMVCFDLPKT MCSYSQSQKH AKQSNSKSIM FLERGNPKQR DHLHDLMRRE 
       550        560        570        580        590        600 
VLIQDPEAPN LKSCPPPVKN GHGVKEIGSM VIPDSNITVS EEAASTQTMS DPPSRNEQLP 
       610        620        630        640        650        660 
PCKKLRLDNN LLQSNGKEKV ASSKSKSSSS AAGSKKRKEL HGTTCANALS GTWGENIDGA 
       670        680        690        700        710        720 
TFQAYKFDFC CNISGEVYSS FSLLLESTLA EDVGKVEMDL YLVRKLVKAS VSPCGQIRLS 
       730        740        750        760        770        780 
QEELVKAKYF QQFFFNGMFG KLFVGSKSQG TKREFLLQTD TSSLWHPAFM FLLLPVETND 
       790        800        810        820        830        840 
LASSATIDWS AINSCASIVE FLKKNSLLDL RDSDGNQCNT SSGQEVLLDD KMEETNLIHF 
       850        860        870        880        890        900 
ANASSDKNSL EELVVIAIHT GRIYSIVEAV SDSSAMSPFE VDASSGYATY AEYFNKKYGI 
       910        920        930        940        950        960 
VLAHPNQPLM KLKQSHHAHN LLVDFNEEMV VKTEPKAGNV RKRKPNIHAH LPPELLARID 
       970        980        990       1000       1010       1020 
VPRAVLKSIY LLPSVMHRLE SLMLASQLRE EIDCSIDNFS ISSTSILEAV TTLTCPESFS 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
MERLELLGDS VLKYVASCHL FLKYPDKDEG QLSRQRQSII SNSNLHRLTT SRKLQGYIRN 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
GAFEPRRWTA PGQFSLFPVP CKCGIDTREV PLDPKFFTEN MTIKIGKSCD MGHRWVVSKS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
VSDCAEALIG AYYVSGGLSA SLHMMKWLGI DVDFDPNLVV EAINRVSLRC YIPKEDELIE 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
LERKIQHEFS AKFLLKEAIT HSSLRESYSY ERLEFLGDSV LDFLITRHLF NTYEQTGPGE 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
MTDLRSACVN NENFAQVAVK NNLHTHLQRC ATVLETQIND YLMSFQKPDE TGRSIPSIQG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
PKALGDVVES IAGALLIDTR LDLDQVWRVF EPLLSPLVTP DKLQLPPYRE LNELCDSLGY 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
FFRVKCSNDG VKAQATIQLQ LDDVLLTGDG SEQTNKLALG KAASHLLTQL EKRNISRKTS 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
LGDNQSSMDV NLACNHSDRE TLTSETTEIQ SIVIPFIGPI NMKKGGPRGT LHEFCKKHLW 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
PMPTFDTSEE KSRTPFEFID GGEKRTSFSS FTSTITLRIP NREAVMYAGE ARPDKKSSFD 
      1570       1580    
SAVVELLYEL ERRKIVIIQK 



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q9LXW7-1-unknown MHSSLE... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q9LXW7-1-unknown MHSSLE... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt72443

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...VIIQK 1580 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...VIIQK 1580 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt68061

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)