TopFIND 4.0

Q9UGL1: Lysine-specific demethylase 5B

General Information

Protein names
- Lysine-specific demethylase 5B
- 1.14.11.-
- Cancer/testis antigen 31
- CT31
- Histone demethylase JARID1B
- Jumonji/ARID domain-containing protein 1B
- PLU-1
- Retinoblastoma-binding protein 2 homolog 1
- RBP2-H1
Gene names KDM5B
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q9UGL1

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MEAATTLHPG PRPALPLGGP GPLGEFLPPP ECPVFEPSWE EFADPFAFIH KIRPIAEQTG 
        70         80         90        100        110        120 
ICKVRPPPDW QPPFACDVDK LHFTPRIQRL NELEAQTRVK LNFLDQIAKY WELQGSTLKI 
       130        140        150        160        170        180 
PHVERKILDL FQLNKLVAEE GGFAVVCKDR KWTKIATKMG FAPGKAVGSH IRGHYERILN 
       190        200        210        220        230        240 
PYNLFLSGDS LRCLQKPNLT TDTKDKEYKP HDIPQRQSVQ PSETCPPARR AKRMRAEAMN 
       250        260        270        280        290        300 
IKIEPEETTE ARTHNLRRRM GCPTPKCENE KEMKSSIKQE PIERKDYIVE NEKEKPKSRS 
       310        320        330        340        350        360 
KKATNAVDLY VCLLCGSGND EDRLLLCDGC DDSYHTFCLI PPLHDVPKGD WRCPKCLAQE 
       370        380        390        400        410        420 
CSKPQEAFGF EQAARDYTLR TFGEMADAFK SDYFNMPVHM VPTELVEKEF WRLVSTIEED 
       430        440        450        460        470        480 
VTVEYGADIA SKEFGSGFPV RDGKIKLSPE EEEYLDSGWN LNNMPVMEQS VLAHITADIC 
       490        500        510        520        530        540 
GMKLPWLYVG MCFSSFCWHI EDHWSYSINY LHWGEPKTWY GVPGYAAEQL ENVMKKLAPE 
       550        560        570        580        590        600 
LFVSQPDLLH QLVTIMNPNT LMTHEVPVYR TNQCAGEFVI TFPRAYHSGF NQGFNFAEAV 
       610        620        630        640        650        660 
NFCTVDWLPL GRQCVEHYRL LHRYCVFSHD EMICKMASKA DVLDVVVAST VQKDMAIMIE 
       670        680        690        700        710        720 
DEKALRETVR KLGVIDSERM DFELLPDDER QCVKCKTTCF MSAISCSCKP GLLVCLHHVK 
       730        740        750        760        770        780 
ELCSCPPYKY KLRYRYTLDD LYPMMNALKL RAESYNEWAL NVNEALEAKI NKKKSLVSFK 
       790        800        810        820        830        840 
ALIEESEMKK FPDNDLLRHL RLVTQDAEKC ASVAQQLLNG KRQTRYRSGG GKSQNQLTVN 
       850        860        870        880        890        900 
ELRQFVTQLY ALPCVLSQTP LLKDLLNRVE DFQQHSQKLL SEETPSAAEL QDLLDVSFEF 
       910        920        930        940        950        960 
DVELPQLAEM RIRLEQARWL EEVQQACLDP SSLTLDDMRR LIDLGVGLAP YSAVEKAMAR 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LQELLTVSEH WDDKAKSLLK ARPRHSLNSL ATAVKEIEEI PAYLPNGAAL KDSVQRARDW 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LQDVEGLQAG GRVPVLDTLI ELVTRGRSIP VHLNSLPRLE TLVAEVQAWK ECAVNTFLTE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
NSPYSLLEVL CPRCDIGLLG LKRKQRKLKE PLPNGKKKST KLESLSDLER ALTESKETAS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
AMATLGEARL REMEALQSLR LANEGKLLSP LQDVDIKICL CQKAPAAPMI QCELCRDAFH 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
TSCVAVPSIS QGLRIWLCPH CRRSEKPPLE KILPLLASLQ RIRVRLPEGD ALRYMIERTV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
NWQHRAQQLL SSGNLKFVQD RVGSGLLYSR WQASAGQVSD TNKVSQPPGT TSFSLPDDWD 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
NRTSYLHSPF STGRSCIPLH GVSPEVNELL MEAQLLQVSL PEIQELYQTL LAKPSPAQQT 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
DRSSPVRPSS EKNDCCRGKR DGINSLERKL KRRLEREGLS SERWERVKKM RTPKKKKIKL 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
SHPKDMNNFK LERERSYELV RSAETHSLPS DTSYSEQEDS EDEDAICPAV SCLQPEGDEV 
      1510       1520       1530       1540    
DWVQCDGSCN QWFHQVCVGV SPEMAEKEDY ICVRCTVKDA PSRK

Isoforms

- Isoform 2 of Lysine-specific demethylase 5B

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MEAATTLHPG PRPALPLGGP GPLGEFLPPP ECPVFEPSWE EFADPFAFIH KIRPIAEQTG 
        70         80         90        100        110        120 
ICKVRPPPDW QPPFACDVDK LHFTPRIQRL NELEAQTRVK LNFLDQIAKY WELQGSTLKI 
       130        140        150        160        170        180 
PHVERKILDL FQLNKLVAEE GGFAVVCKDR KWTKIATKMG FAPGKAVGSH IRGHYERILN 
       190        200        210        220        230        240 
PYNLFLSGDS LRCLQKPNLT TDTKDKEYKP HDIPQRQSVQ PSETCPPARR AKRMRAEAMN 
       250        260        270        280        290        300 
IKIEPEETTE ARTHNLRRRM GCPTPKCENE KEMKSSIKQE PIERKDYIVE NEKEKPKSRS 
       310        320        330        340        350        360 
KKATNAVDLY VCLLCGSGND EDRLLLCDGC DDSYHTFCLI PPLHDVPKGD WRCPKCLAQE 
       370        380        390        400        410        420 
CSKPQEAFGF EQAARDYTLR TFGEMADAFK SDYFNMPVHM VPTELVEKEF WRLVSTIEED 
       430        440        450        460        470        480 
VTVEYGADIA SKEFGSGFPV RDGKIKLSPE EEEYLDSGWN LNNMPVMEQS VLAHITADIC 
       490        500        510        520        530        540 
GMKLPWLYVG MCFSSFCWHI EDHWSYSINY LHWGEPKTWY GVPGYAAEQL ENVMKKLAPE 
       550        560        570        580        590        600 
LFVSQPDLLH QLVTIMNPNT LMTHEVPVYR TNQCAGEFVI TFPRAYHSGF NQGFNFAEAV 
       610        620        630        640        650        660 
NFCTVDWLPL GRQCVEHYRL LHRYCVFSHD EMICKMASKA DVLDVVVAST VQKDMAIMIE 
       670        680        690        700        710        720 
DEKALRETVR KLGVIDSERM DFELLPDDER QCVKCKTTCF MSAISCSCKP GLLVCLHHVK 
       730        740        750        760        770        780 
ELCSCPPYKY KLRYRYTLDD LYPMMNALKL RAESYNEWAL NVNEALEAKI NKKKSLVSFK 
       790        800        810        820        830        840 
ALIEESEMKK FPDNDLLRHL RLVTQDAEKC ASVAQQLLNG KRQTRYRSGG GKSQNQLTVN 
       850        860        870        880        890        900 
ELRQFVTQLY ALPCVLSQTP LLKDLLNRVE DFQQHSQKLL SEETPSAAEL QDLLDVSFEF 
       910        920        930        940        950        960 
DVELPQLAEM RIRLEQARWL EEVQQACLDP SSLTLDDMRR LIDLGVGLAP YSAVEKAMAR 
       970        980        990       1000       1010       1020 
LQELLTVSEH WDDKAKSLLK ARPRHSLNSL ATAVKEIEEI PAYLPNGAAL KDSVQRARDW 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LQDVEGLQAG GRVPVLDTLI ELVTRGRSIP VHLNSLPRLE TLVAEVQAWK ECAVNTFLTE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
NSPYSLLEVL CPRCDIGLLG LKRKQRKLKE PLPNGKKKST KLESLSDLER ALTESKETAS 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
AMATLGEARL REMEALQSLR LANEGKLLSP LQDVDIKICL CQKAPAAPMI QCELCRDAFH 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
TSCVAVPSIS QGLRIWLCPH CRRSEKPPLE KILPLLASLQ RIRVRLPEGD ALRYMIERTV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
NWQHRAQQLL SSGNLKFVQD RVGSGLLYSR WQASAGQVSD TNKVSQPPGT TSFSLPDDWD 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
NRTSYLHSPF STGRSCIPLH GVSPEVNELL MEAQLLQVSL PEIQELYQTL LAKPSPAQQT 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
DRSSPVRPSS EKNDCCRGKR DGINSLERKL KRRLEREGLS SERWERVKKM RTPKKKKIKL 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
SHPKDMNNFK LERERSYELV RSAETHSLPS DTSYSEQEDS EDEDAICPAV SCLQPEGDEV 
      1510       1520       1530       1540    
DWVQCDGSCN QWFHQVCVGV SPEMAEKEDY ICVRCTVKDA PSRK



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q9UGL1-1-unknown MEAATT... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q9UGL1-1-unknown MEAATT... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt78882

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...APSRK 1544 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...APSRK 1544 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt74500

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)