TopFIND 4.0

Q9WU42: Nuclear receptor corepressor 2

General Information

Protein names
- Nuclear receptor corepressor 2
- N-CoR2
- Silencing mediator of retinoic acid and thyroid hormone receptor
- SMRT
- SMRTe
- T3 receptor-associating factor
- TRAC
- Thyroid-, retinoic-acid-receptor-associated corepressor
Gene names Ncor2
Organism Mus musculus
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q9WU42

1

N-termini

1

C-termini

0

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MSGSTQPVAQ TWRAAEPRYP PHGISYPVQI ARSHTDVGLL EYQHHPRDYT SHLSPGSIIQ 
        70         80         90        100        110        120 
PQRRRPSLLS EFQPGSERSQ ELHLRPESRT FLPELGKPDI EFTESKRPRL ELLPDTLLRP 
       130        140        150        160        170        180 
SPLLATGQPS GSEDLTKDRS LAGKLEPVSP PSPPHADPEL ELAPSRLSKE ELIQNMDRVD 
       190        200        210        220        230        240 
REITMVEQQI SKLKKKQQQL EEEAAKPPEP EKPVSPPPIE SKHRSLVQII YDENRKKAEA 
       250        260        270        280        290        300 
AHRILEGLGP QVELPLYNQP SDTRQYHENI KINQAMRKKL ILYFKRRNHA RKQWEQRFCQ 
       310        320        330        340        350        360 
RYDQLMEAWE KKVERIENNP RRRAKESKVR EYYEKQFPEI RKQRELQERM QSRVGQRGSG 
       370        380        390        400        410        420 
LSMSAARSEH EVSEIIDGLS EQENLEKQMR QLAVIPPMLY DADQQRIKFI NMNGLMDDPM 
       430        440        450        460        470        480 
KVYKDRQVTN MWSEQERDTF REKFMQHPKN FGLIASFLER KTVAECVLYY YLTKKNENYK 
       490        500        510        520        530        540 
SLVRRSYRRR GKSQQQQQQQ QQQQQQQMAR SSQEEKEEKE KEKEADKEEE KQDAENEKEE 
       550        560        570        580        590        600 
LSKEKTDDTS GEDNDEKEAV ASKGRKTANS QGRRKGRITR SMANEANHEE TATPQQSSEL 
       610        620        630        640        650        660 
ASMEMNESSR WTEEEMETAK KGLLEHGRNW SAIARMVGSK TVSQCKNFYF NYKKRQNLDE 
       670        680        690        700        710        720 
ILQQHKLKME KERNARRKKK KTPAAASEET AFPPAAEDEE MEASGASANE EELAEEAEAS 
       730        740        750        760        770        780 
QASGNEVPRV GECSGPAAVN NSSDTESVPS PRSEATKDTG PKPTGTEALP AATQPPVPPP 
       790        800        810        820        830        840 
EEPAVAPAEP SPVPDASGPP SPEPSPSPAA PPATVDKDEQ EAPAAPAPQT EDAKEQKSEA 
       850        860        870        880        890        900 
EEIDVGKPEE PEASEEPPES VKSDHKEETE EEPEDKAKGT EAIETVSEAP LKVEEAGSKA 
       910        920        930        940        950        960 
AVTKGSSSGA TQDSDSSATC SADEVDEPEG GDKGRLLSPR PSLLTPAGDP RASTSPQKPL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
DLKQLKQRAA AIPPIVTKVH EPPREDTVPP KPVPPVPPPT QHLQPEGDVS QQSGGSPRGK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SRSPVPPAEK EAEKPAFFPA FPTEGPKLPT EPPRWSSGLP FPIPPREVIK TSPHAADPSA 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
FSYTPPGHPL PLGLHDSARP VLPRPPISNP PPLISSAKHP GVLERQLGAI SQQGMSVQLR 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
VPHSEHAKAP MGPLTMGLPL AVDPKKLGTA LGSATSGSIT KGLPSTRAAD GPSYRGSITH 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GTPADVLYKG TISRIVGEDS PSRLDRARED TLPKGHVIYE GKKGHVLSYE GGMSVSQCSK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
EDGRSSSGPP HETAAPKRTY DMMEGRVGRT VTSASIEGLM GRAIPEQHSP HLKEQHHIRG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
SITQGIPRSY VEAQEDYLRR EAKLLKREGT PPPPPPPRDL TETYKPRPLD PLGPLKLKPT 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
HEGVVATVKE AGRSIHEIPR EELRRTPELP LAPRPLKEGS ITQGTPLKYD SGAPSTGTKK 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
HDVRSIIGSP GRPFPALHPL DIMADARALE RACYEESLKS RSGTSSGAGG SITRGAPVVV 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
PELGKPRQSP LTYEDHGAPF TSHLPRGSPV TTREPTPRLQ EGSLLSSKAS QDRKLTSTPR 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
EIAKSPHSTV PEHHPHPISP YEHLLRGVTG VDLYRGHIPL AFDPTSIPRG IPLEAAAAAY 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
YLPRHLAPSP TYPHLYPPYL IRGYPDTAAL ENRQTIINDY ITSQQMHHNA ASAMAQRADM 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
LRGLSPRESS LALNYAAGPR GIIDLSQVPH LPVLVPPTPG TPATAIDRLA YLPTAPPPFS 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
SRHSSSPLSP GGPTHLAKPT ATSSSERERE RERERDKSIL TSTTTVEHAP IWRPGTEQSS 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
GAGGSSRPAS HTHQHSPISP RTQDALQQRP SVLHNTSMKG VVTSVEPGTP TVLRWARSTS 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
TSSPVRPAAT FPPATHCPLG GTLEGVYPTL MEPVLLPKET SRVARPERPR VDAGHAFLTK 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
PPAREPASSP SKSSEPRSLA PPSSSHTAIA RTPAKNLAPH HASPDPPAPT SASDLHREKT 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
QSKPFSIQEL ELRSLGYHSG AGYSPDGVEP ISPVSSPSLT HDKGLSKPLE ELEKSHLEGE 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
LRHKQPGPMK LSAEAAHLPH LRPLPESQPS SSPLLQTAPG IKGHQRVVTL AQHISEVITQ 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
DYTRHHPQQL SGPLPAPLYS FPGASCPVLD LRRPPSDLYL PPPDHGTPAR GSPHSEGGKR 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
SPEPSKTSVL GSSEDAIEPV SPPEGMTEPG HARSTAYPLL YRDGEQGEPR MGSKSPGNTS 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
QPPAFFSKLT ESNSAMVKSK KQEINKKLNT HNRNEPEYNI GQPGTEIFNM PAITGAGLMT 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
CRSQAVQEHA STNMGLEAII RKALMGKYDQ WEEPPPLGAN AFNPLNASAS LPAAAMPITT 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
ADGRSDHALT SPGGGGKAKV SGRPSSRKAK SPAPGLASGD RPPSVSSVHS EGDCNRRTPL 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
TNRVWEDRPS SAGSTPFPYN PLIMRLQAGV MASPPPPGLA AGSGPLAGPH HAWDEEPKPL 
      2470    
LCSQYETLSD SE

Isoforms

- Isoform Beta of Nuclear receptor corepressor 2

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MSGSTQPVAQ TWRAAEPRYP PHGISYPVQI ARSHTDVGLL EYQHHPRDYT SHLSPGSIIQ 
        70         80         90        100        110        120 
PQRRRPSLLS EFQPGSERSQ ELHLRPESRT FLPELGKPDI EFTESKRPRL ELLPDTLLRP 
       130        140        150        160        170        180 
SPLLATGQPS GSEDLTKDRS LAGKLEPVSP PSPPHADPEL ELAPSRLSKE ELIQNMDRVD 
       190        200        210        220        230        240 
REITMVEQQI SKLKKKQQQL EEEAAKPPEP EKPVSPPPIE SKHRSLVQII YDENRKKAEA 
       250        260        270        280        290        300 
AHRILEGLGP QVELPLYNQP SDTRQYHENI KINQAMRKKL ILYFKRRNHA RKQWEQRFCQ 
       310        320        330        340        350        360 
RYDQLMEAWE KKVERIENNP RRRAKESKVR EYYEKQFPEI RKQRELQERM QSRVGQRGSG 
       370        380        390        400        410        420 
LSMSAARSEH EVSEIIDGLS EQENLEKQMR QLAVIPPMLY DADQQRIKFI NMNGLMDDPM 
       430        440        450        460        470        480 
KVYKDRQVTN MWSEQERDTF REKFMQHPKN FGLIASFLER KTVAECVLYY YLTKKNENYK 
       490        500        510        520        530        540 
SLVRRSYRRR GKSQQQQQQQ QQQQQQQMAR SSQEEKEEKE KEKEADKEEE KQDAENEKEE 
       550        560        570        580        590        600 
LSKEKTDDTS GEDNDEKEAV ASKGRKTANS QGRRKGRITR SMANEANHEE TATPQQSSEL 
       610        620        630        640        650        660 
ASMEMNESSR WTEEEMETAK KGLLEHGRNW SAIARMVGSK TVSQCKNFYF NYKKRQNLDE 
       670        680        690        700        710        720 
ILQQHKLKME KERNARRKKK KTPAAASEET AFPPAAEDEE MEASGASANE EELAEEAEAS 
       730        740        750        760        770        780 
QASGNEVPRV GECSGPAAVN NSSDTESVPS PRSEATKDTG PKPTGTEALP AATQPPVPPP 
       790        800        810        820        830        840 
EEPAVAPAEP SPVPDASGPP SPEPSPSPAA PPATVDKDEQ EAPAAPAPQT EDAKEQKSEA 
       850        860        870        880        890        900 
EEIDVGKPEE PEASEEPPES VKSDHKEETE EEPEDKAKGT EAIETVSEAP LKVEEAGSKA 
       910        920        930        940        950        960 
AVTKGSSSGA TQDSDSSATC SADEVDEPEG GDKGRLLSPR PSLLTPAGDP RASTSPQKPL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
DLKQLKQRAA AIPPIVTKVH EPPREDTVPP KPVPPVPPPT QHLQPEGDVS QQSGGSPRGK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SRSPVPPAEK EAEKPAFFPA FPTEGPKLPT EPPRWSSGLP FPIPPREVIK TSPHAADPSA 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
FSYTPPGHPL PLGLHDSARP VLPRPPISNP PPLISSAKHP GVLERQLGAI SQQGMSVQLR 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
VPHSEHAKAP MGPLTMGLPL AVDPKKLGTA LGSATSGSIT KGLPSTRAAD GPSYRGSITH 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GTPADVLYKG TISRIVGEDS PSRLDRARED TLPKGHVIYE GKKGHVLSYE GGMSVSQCSK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
EDGRSSSGPP HETAAPKRTY DMMEGRVGRT VTSASIEGLM GRAIPEQHSP HLKEQHHIRG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
SITQGIPRSY VEAQEDYLRR EAKLLKREGT PPPPPPPRDL TETYKPRPLD PLGPLKLKPT 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
HEGVVATVKE AGRSIHEIPR EELRRTPELP LAPRPLKEGS ITQGTPLKYD SGAPSTGTKK 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
HDVRSIIGSP GRPFPALHPL DIMADARALE RACYEESLKS RSGTSSGAGG SITRGAPVVV 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
PELGKPRQSP LTYEDHGAPF TSHLPRGSPV TTREPTPRLQ EGSLLSSKAS QDRKLTSTPR 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
EIAKSPHSTV PEHHPHPISP YEHLLRGVTG VDLYRGHIPL AFDPTSIPRG IPLEAAAAAY 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
YLPRHLAPSP TYPHLYPPYL IRGYPDTAAL ENRQTIINDY ITSQQMHHNA ASAMAQRADM 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
LRGLSPRESS LALNYAAGPR GIIDLSQVPH LPVLVPPTPG TPATAIDRLA YLPTAPPPFS 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
SRHSSSPLSP GGPTHLAKPT ATSSSERERE RERERDKSIL TSTTTVEHAP IWRPGTEQSS 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
GAGGSSRPAS HTHQHSPISP RTQDALQQRP SVLHNTSMKG VVTSVEPGTP TVLRWARSTS 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
TSSPVRPAAT FPPATHCPLG GTLEGVYPTL MEPVLLPKET SRVARPERPR VDAGHAFLTK 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
PPAREPASSP SKSSEPRSLA PPSSSHTAIA RTPAKNLAPH HASPDPPAPT SASDLHREKT 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
QSKPFSIQEL ELRSLGYHSG AGYSPDGVEP ISPVSSPSLT HDKGLSKPLE ELEKSHLEGE 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
LRHKQPGPMK LSAEAAHLPH LRPLPESQPS SSPLLQTAPG IKGHQRVVTL AQHISEVITQ 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
DYTRHHPQQL SGPLPAPLYS FPGASCPVLD LRRPPSDLYL PPPDHGTPAR GSPHSEGGKR 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
SPEPSKTSVL GSSEDAIEPV SPPEGMTEPG HARSTAYPLL YRDGEQGEPR MGSKSPGNTS 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
QPPAFFSKLT ESNSAMVKSK KQEINKKLNT HNRNEPEYNI GQPGTEIFNM PAITGAGLMT 
      2290       2300       2310       2320       2330       2340 
CRSQAVQEHA STNMGLEAII RKALMGKYDQ WEEPPPLGAN AFNPLNASAS LPAAAMPITT 
      2350       2360       2370       2380       2390       2400 
ADGRSDHALT SPGGGGKAKV SGRPSSRKAK SPAPGLASGD RPPSVSSVHS EGDCNRRTPL 
      2410       2420       2430       2440       2450       2460 
TNRVWEDRPS SAGSTPFPYN PLIMRLQAGV MASPPPPGLA AGSGPLAGPH HAWDEEPKPL 
      2470    
LCSQYETLSD SE



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

1 N-termini - 1 C-termini - 0 Cleavages - 0 Substrates

N-termini
    Name Sequence Position Modification Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMID)
    Q9WU42-1-unknown MSGSTQ... 1 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    Q9WU42-1-unknown MSGSTQ... 1 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TNt82439

C-termini

    Name Sequence Position Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)
    ...LSDSE 2472 inferred from electronic annotation electronic annotation UniProtKB inferred from uniprot
    ...LSDSE 2472 inferred from isoform by sequence similarity unknown TopFIND inferred from TCt78057

Cleavages

    Protease Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)