TopFIND 4.0

Q5TC82: Roquin-1 {ECO:0000305}

General Information

Protein names
- Roquin-1 {ECO:0000305}
- Roquin {ECO:0000305}
- 2.3.2.27 {ECO:0000269|PubMed:26489670}
- RING finger and C3H zinc finger protein 1
- RING finger and CCCH-type zinc finger domain-containing protein 1
- RING finger protein 198
Gene names RC3H1
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q5TC82

2

N-termini

2

C-termini

1

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MPVQAPQWTD FLSCPICTQT FDETIRKPIS LGCGHTVCKM CLNKLHRKAC PFDQTTINTD 
        70         80         90        100        110        120 
IELLPVNSAL LQLVGAQVPE QQPITLCSGV EDTKHYEEAK KCVEELALYL KPLSSARGVG 
       130        140        150        160        170        180 
LNSTTQSVLS RPMQRKLVTL VHCQLVEEEG RIRAMRAARS LGERTVTELI LQHQNPQQLS 
       190        200        210        220        230        240 
SNLWAAVRAR GCQFLGPAMQ EEALKLVLLA LEDGSALSRK VLVLFVVQRL EPRFPQASKT 
       250        260        270        280        290        300 
SIGHVVQLLY RASCFKVTKR DEDSSLMQLK EEFRTYEALR REHDSQIVQI AMEAGLRIAP 
       310        320        330        340        350        360 
DQWSSLLYGD QSHKSHMQSI IDKLQTPASF AQSVQELTIA LQRTGDPANL NRLRPHLELL 
       370        380        390        400        410        420 
ANIDPSPDAP PPTWEQLENG LVAVRTVVHG LVDYIQNHSK KGADQQQPPQ HSKYKTYMCR 
       430        440        450        460        470        480 
DMKQRGGCPR GASCTFAHSQ EELEKFRKMN KRLVPRRPLS ASLGQLNEVG LPSAAILPDE 
       490        500        510        520        530        540 
GAVDLPSRKP PALPNGIVST GNTVTQLIPR GTDPSYDSSL KPGKIDHLSS SAPGSPPDLL 
       550        560        570        580        590        600 
ESVPKSISAL PVNPHSIPPR GPADLPPMPV TKPLQMVPRG SQLYPAQQTD VYYQDPRGAA 
       610        620        630        640        650        660 
PPFEPAPYQQ GMYYTPPPQC VSRFVRPPPS APEPAPPYLD HYPPYLQERV VNSQYGTQPQ 
       670        680        690        700        710        720 
QYPPIYPSHY DGRRVYPAPS YTREEIFRES PIPIEIPPAA VPSYVPESRE RYQQIESYYP 
       730        740        750        760        770        780 
VAPHPTQIRP SYLREPPYSR LPPPPQPHPS LDELHRRRKE IMAQLEERKV ISPPPFAPSP 
       790        800        810        820        830        840 
TLPPTFHPEE FLDEDLKVAG KYKGNDYSQY SPWSCDTIGS YIGTKDAKPK DVVAAGSVEM 
       850        860        870        880        890        900 
MNVESKGMRD QRLDLQRRAA ETSDDDLIPF GDRPTVSRFG AISRTSKTIY QGAGPMQAMA 
       910        920        930        940        950        960 
PQGAPTKSIN ISDYSPYGTH GGWGASPYSP HQNIPSQGHF SERERISMSE VASHGKPLPS 
       970        980        990       1000       1010       1020 
AEREQLRLEL QQLNHQISQQ TQLRGLEAVS NRLVLQREAN TLAGQSQPPP PPPPKWPGMI 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SSEQLSLELH QVEREIGKRT RELSMENQCS LDMKSKLNTS KQAENGQPEP QNKVPAEDLT 
      1090       1100       1110       1120       1130    
LTFSDVPNGS ALTQENISLL SNKTSSLNLS EDPEGGGDNN DSQRSGVTPS SAP

Isoforms

- Isoform 2 of Roquin-1

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MPVQAPQWTD FLSCPICTQT FDETIRKPIS LGCGHTVCKM CLNKLHRKAC PFDQTTINTD 
        70         80         90        100        110        120 
IELLPVNSAL LQLVGAQVPE QQPITLCSGV EDTKHYEEAK KCVEELALYL KPLSSARGVG 
       130        140        150        160        170        180 
LNSTTQSVLS RPMQRKLVTL VHCQLVEEEG RIRAMRAARS LGERTVTELI LQHQNPQQLS 
       190        200        210        220        230        240 
SNLWAAVRAR GCQFLGPAMQ EEALKLVLLA LEDGSALSRK VLVLFVVQRL EPRFPQASKT 
       250        260        270        280        290        300 
SIGHVVQLLY RASCFKVTKR DEDSSLMQLK EEFRTYEALR REHDSQIVQI AMEAGLRIAP 
       310        320        330        340        350        360 
DQWSSLLYGD QSHKSHMQSI IDKLQTPASF AQSVQELTIA LQRTGDPANL NRLRPHLELL 
       370        380        390        400        410        420 
ANIDPSPDAP PPTWEQLENG LVAVRTVVHG LVDYIQNHSK KGADQQQPPQ HSKYKTYMCR 
       430        440        450        460        470        480 
DMKQRGGCPR GASCTFAHSQ EELEKFRKMN KRLVPRRPLS ASLGQLNEVG LPSAAILPDE 
       490        500        510        520        530        540 
GAVDLPSRKP PALPNGIVST GNTVTQLIPR GTDPSYDSSL KPGKIDHLSS SAPGSPPDLL 
       550        560        570        580        590        600 
ESVPKSISAL PVNPHSIPPR GPADLPPMPV TKPLQMVPRG SQLYPAQQTD VYYQDPRGAA 
       610        620        630        640        650        660 
PPFEPAPYQQ GMYYTPPPQC VSRFVRPPPS APEPAPPYLD HYPPYLQERV VNSQYGTQPQ 
       670        680        690        700        710        720 
QYPPIYPSHY DGRRVYPAPS YTREEIFRES PIPIEIPPAA VPSYVPESRE RYQQIESYYP 
       730        740        750        760        770        780 
VAPHPTQIRP SYLREPPYSR LPPPPQPHPS LDELHRRRKE IMAQLEERKV ISPPPFAPSP 
       790        800        810        820        830        840 
TLPPTFHPEE FLDEDLKVAG KYKGNDYSQY SPWSCDTIGS YIGTKDAKPK DVVAAGSVEM 
       850        860        870        880        890        900 
MNVESKGMRD QRLDLQRRAA ETSDDDLIPF GDRPTVSRFG AISRTSKTIY QGAGPMQAMA 
       910        920        930        940        950        960 
PQGAPTKSIN ISDYSPYGTH GGWGASPYSP HQNIPSQGHF SERERISMSE VASHGKPLPS 
       970        980        990       1000       1010       1020 
AEREQLRLEL QQLNHQISQQ TQLRGLEAVS NRLVLQREAN TLAGQSQPPP PPPPKWPGMI 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
SSEQLSLELH QVEREIGKRT RELSMENQCS LDMKSKLNTS KQAENGQPEP QNKVPAEDLT 
      1090       1100       1110       1120       1130    
LTFSDVPNGS ALTQENISLL SNKTSSLNLS EDPEGGGDNN DSQRSGVTPS SAP



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

2 N-termini - 2 C-termini - 1 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

Cleavages

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)