TopFIND 4.0

Q8N5C6: S1 RNA-binding domain-containing protein 1

General Information

Protein names
- S1 RNA-binding domain-containing protein 1
Gene names SRBD1
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q8N5C6

3

N-termini

2

C-termini

1

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MSSLPRRAKV QVQDVVLKDE FSSFSELSSA SEEDDKEDSA WEPQKKVPRS RKQPPPKESK 
        70         80         90        100        110        120 
PKRMPRVKKN APQISDGSEV VVVKEELNSS VAIADTALED RKNKLDTVQT LKTAKTKQKC 
       130        140        150        160        170        180 
AAQPHTVRRT KKLKVEEETS KASNLEGESN SSETPSTSTV WGGTCKKEEN DDDFTFGQSA 
       190        200        210        220        230        240 
LKKIKTETYP QGQPVKFPAN ANSTKEEVEM NWDMVQVLSE RTNIEPWVCA NIIRLFNDDN 
       250        260        270        280        290        300 
TIPFIIRYRK ELINNLDADS LREVQQTLEE LRAVAKKVHS TIQKIKKEGK MSECLLKAML 
       310        320        330        340        350        360 
NCKTFEELEH VSAPYKTGSK GTKAQRARQL GLEGAARALL EKPGELSLLS YIRPDVKGLS 
       370        380        390        400        410        420 
TLQDIEIGVQ HILADMIAKD KDTLDFIRNL CQKRHVCIQS SLAKVSSKKV NEKDVDKFLL 
       430        440        450        460        470        480 
YQHFSCNIRN IHHHQILAIN RGENLKVLTV KVNISDGVKD EFCRWCIQNR WRPRSFARPE 
       490        500        510        520        530        540 
LMKILYNSLN DSFKRLIYPL LCREFRAKLT SDAEKESVMM FGRNLRQLLL TSPVPGRTLM 
       550        560        570        580        590        600 
GVDPGYKHGC KLAIISPTSQ ILHTDVVYLH CGQGFREAEK IKTLLLNFNC STVVIGNGTA 
       610        620        630        640        650        660 
CRETEAYFAD LIMKNYFAPL DVVYCIVSEA GASIYSVSPE ANKEMPGLDP NLRSAVSIAR 
       670        680        690        700        710        720 
RVQDPLAELV KIEPKHIGVG MYQHDVSQTL LKATLDSVVE ECVSFVGVDI NICSEVLLRH 
       730        740        750        760        770        780 
IAGLNANRAK NIIEWREKNG PFINREQLKK VKGLGPKSFQ QCAGFIRINQ DYIRTFCSQQ 
       790        800        810        820        830        840 
TETSGQIQGV AVTSSADVEV TNEKQGKKKS KTAVNVLLKP NPLDQTCIHP ESYDIAMRFL 
       850        860        870        880        890        900 
SSIGGTLYEV GKPEMQQKIN SFLEKEGMEK IAERLQTTVH TLQVIIDGLS QPESFDFRTD 
       910        920        930        940        950        960 
FDKPDFKRSI VCLEDLQIGT VLTGKVENAT LFGIFVDIGV GKSGLIPIRN VTEAKLSKTK 
       970        980        990    
KRRSLGLGPG ERVEVQVLNI DIPRSRITLD LIRVL

Isoforms

- Isoform 2 of S1 RNA-binding domain-containing protein 1

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MSSLPRRAKV QVQDVVLKDE FSSFSELSSA SEEDDKEDSA WEPQKKVPRS RKQPPPKESK 
        70         80         90        100        110        120 
PKRMPRVKKN APQISDGSEV VVVKEELNSS VAIADTALED RKNKLDTVQT LKTAKTKQKC 
       130        140        150        160        170        180 
AAQPHTVRRT KKLKVEEETS KASNLEGESN SSETPSTSTV WGGTCKKEEN DDDFTFGQSA 
       190        200        210        220        230        240 
LKKIKTETYP QGQPVKFPAN ANSTKEEVEM NWDMVQVLSE RTNIEPWVCA NIIRLFNDDN 
       250        260        270        280        290        300 
TIPFIIRYRK ELINNLDADS LREVQQTLEE LRAVAKKVHS TIQKIKKEGK MSECLLKAML 
       310        320        330        340        350        360 
NCKTFEELEH VSAPYKTGSK GTKAQRARQL GLEGAARALL EKPGELSLLS YIRPDVKGLS 
       370        380        390        400        410        420 
TLQDIEIGVQ HILADMIAKD KDTLDFIRNL CQKRHVCIQS SLAKVSSKKV NEKDVDKFLL 
       430        440        450        460        470        480 
YQHFSCNIRN IHHHQILAIN RGENLKVLTV KVNISDGVKD EFCRWCIQNR WRPRSFARPE 
       490        500        510        520        530        540 
LMKILYNSLN DSFKRLIYPL LCREFRAKLT SDAEKESVMM FGRNLRQLLL TSPVPGRTLM 
       550        560        570        580        590        600 
GVDPGYKHGC KLAIISPTSQ ILHTDVVYLH CGQGFREAEK IKTLLLNFNC STVVIGNGTA 
       610        620        630        640        650        660 
CRETEAYFAD LIMKNYFAPL DVVYCIVSEA GASIYSVSPE ANKEMPGLDP NLRSAVSIAR 
       670        680        690        700        710        720 
RVQDPLAELV KIEPKHIGVG MYQHDVSQTL LKATLDSVVE ECVSFVGVDI NICSEVLLRH 
       730        740        750        760        770        780 
IAGLNANRAK NIIEWREKNG PFINREQLKK VKGLGPKSFQ QCAGFIRINQ DYIRTFCSQQ 
       790        800        810        820        830        840 
TETSGQIQGV AVTSSADVEV TNEKQGKKKS KTAVNVLLKP NPLDQTCIHP ESYDIAMRFL 
       850        860        870        880        890        900 
SSIGGTLYEV GKPEMQQKIN SFLEKEGMEK IAERLQTTVH TLQVIIDGLS QPESFDFRTD 
       910        920        930        940        950        960 
FDKPDFKRSI VCLEDLQIGT VLTGKVENAT LFGIFVDIGV GKSGLIPIRN VTEAKLSKTK 
       970        980        990    
KRRSLGLGPG ERVEVQVLNI DIPRSRITLD LIRVL



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

3 N-termini - 2 C-termini - 1 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

Cleavages

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)