TopFIND 4.0

Q92900: Regulator of nonsense transcripts 1

General Information

Protein names
- Regulator of nonsense transcripts 1
- 3.6.4.-
- ATP-dependent helicase RENT1
- Nonsense mRNA reducing factor 1
- NORF1
- Up-frameshift suppressor 1 homolog
- hUpf1
Gene names UPF1
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q92900

5

N-termini

3

C-termini

2

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MSVEAYGPSS QTLTFLDTEE AELLGADTQG SEFEFTDFTL PSQTQTPPGG PGGPGGGGAG 
        70         80         90        100        110        120 
GPGGAGAGAA AGQLDAQVGP EGILQNGAVD DSVAKTSQLL AELNFEEDEE DTYYTKDLPI 
       130        140        150        160        170        180 
HACSYCGIHD PACVVYCNTS KKWFCNGRGN TSGSHIVNHL VRAKCKEVTL HKDGPLGETV 
       190        200        210        220        230        240 
LECYNCGCRN VFLLGFIPAK ADSVVVLLCR QPCASQSSLK DINWDSSQWQ PLIQDRCFLS 
       250        260        270        280        290        300 
WLVKIPSEQE QLRARQITAQ QINKLEELWK ENPSATLEDL EKPGVDEEPQ HVLLRYEDAY 
       310        320        330        340        350        360 
QYQNIFGPLV KLEADYDKKL KESQTQDNIT VRWDLGLNKK RIAYFTLPKT DSGNEDLVII 
       370        380        390        400        410        420 
WLRDMRLMQG DEICLRYKGD LAPLWKGIGH VIKVPDNYGD EIAIELRSSV GAPVEVTHNF 
       430        440        450        460        470        480 
QVDFVWKSTS FDRMQSALKT FAVDETSVSG YIYHKLLGHE VEDVIIKCQL PKRFTAQGLP 
       490        500        510        520        530        540 
DLNHSQVYAV KTVLQRPLSL IQGPPGTGKT VTSATIVYHL ARQGNGPVLV CAPSNIAVDQ 
       550        560        570        580        590        600 
LTEKIHQTGL KVVRLCAKSR EAIDSPVSFL ALHNQIRNMD SMPELQKLQQ LKDETGELSS 
       610        620        630        640        650        660 
ADEKRYRALK RTAERELLMN ADVICCTCVG AGDPRLAKMQ FRSILIDEST QATEPECMVP 
       670        680        690        700        710        720 
VVLGAKQLIL VGDHCQLGPV VMCKKAAKAG LSQSLFERLV VLGIRPIRLQ VQYRMHPALS 
       730        740        750        760        770        780 
AFPSNIFYEG SLQNGVTAAD RVKKGFDFQW PQPDKPMFFY VTQGQEEIAS SGTSYLNRTE 
       790        800        810        820        830        840 
AANVEKITTK LLKAGAKPDQ IGIITPYEGQ RSYLVQYMQF SGSLHTKLYQ EVEIASVDAF 
       850        860        870        880        890        900 
QGREKDFIIL SCVRANEHQG IGFLNDPRRL NVALTRARYG VIIVGNPKAL SKQPLWNHLL 
       910        920        930        940        950        960 
NYYKEQKVLV EGPLNNLRES LMQFSKPRKL VNTINPGARF MTTAMYDARE AIIPGSVYDR 
       970        980        990       1000       1010       1020 
SSQGRPSSMY FQTHDQIGMI SAGPSHVAAM NIPIPFNLVM PPMPPPGYFG QANGPAAGRG 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
TPKGKTGRGG RQKNRFGLPG PSQTNLPNSQ ASQDVASQPF SQGALTQGYI SMSQPSQMSQ 
      1090       1100       1110       1120    
PGLSQPELSQ DSYLGDEFKS QIDVALSQDS TYQGERAYQH GGVTGLSQY

Isoforms

- Isoform 2 of Regulator of nonsense transcripts 1

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MSVEAYGPSS QTLTFLDTEE AELLGADTQG SEFEFTDFTL PSQTQTPPGG PGGPGGGGAG 
        70         80         90        100        110        120 
GPGGAGAGAA AGQLDAQVGP EGILQNGAVD DSVAKTSQLL AELNFEEDEE DTYYTKDLPI 
       130        140        150        160        170        180 
HACSYCGIHD PACVVYCNTS KKWFCNGRGN TSGSHIVNHL VRAKCKEVTL HKDGPLGETV 
       190        200        210        220        230        240 
LECYNCGCRN VFLLGFIPAK ADSVVVLLCR QPCASQSSLK DINWDSSQWQ PLIQDRCFLS 
       250        260        270        280        290        300 
WLVKIPSEQE QLRARQITAQ QINKLEELWK ENPSATLEDL EKPGVDEEPQ HVLLRYEDAY 
       310        320        330        340        350        360 
QYQNIFGPLV KLEADYDKKL KESQTQDNIT VRWDLGLNKK RIAYFTLPKT DSGNEDLVII 
       370        380        390        400        410        420 
WLRDMRLMQG DEICLRYKGD LAPLWKGIGH VIKVPDNYGD EIAIELRSSV GAPVEVTHNF 
       430        440        450        460        470        480 
QVDFVWKSTS FDRMQSALKT FAVDETSVSG YIYHKLLGHE VEDVIIKCQL PKRFTAQGLP 
       490        500        510        520        530        540 
DLNHSQVYAV KTVLQRPLSL IQGPPGTGKT VTSATIVYHL ARQGNGPVLV CAPSNIAVDQ 
       550        560        570        580        590        600 
LTEKIHQTGL KVVRLCAKSR EAIDSPVSFL ALHNQIRNMD SMPELQKLQQ LKDETGELSS 
       610        620        630        640        650        660 
ADEKRYRALK RTAERELLMN ADVICCTCVG AGDPRLAKMQ FRSILIDEST QATEPECMVP 
       670        680        690        700        710        720 
VVLGAKQLIL VGDHCQLGPV VMCKKAAKAG LSQSLFERLV VLGIRPIRLQ VQYRMHPALS 
       730        740        750        760        770        780 
AFPSNIFYEG SLQNGVTAAD RVKKGFDFQW PQPDKPMFFY VTQGQEEIAS SGTSYLNRTE 
       790        800        810        820        830        840 
AANVEKITTK LLKAGAKPDQ IGIITPYEGQ RSYLVQYMQF SGSLHTKLYQ EVEIASVDAF 
       850        860        870        880        890        900 
QGREKDFIIL SCVRANEHQG IGFLNDPRRL NVALTRARYG VIIVGNPKAL SKQPLWNHLL 
       910        920        930        940        950        960 
NYYKEQKVLV EGPLNNLRES LMQFSKPRKL VNTINPGARF MTTAMYDARE AIIPGSVYDR 
       970        980        990       1000       1010       1020 
SSQGRPSSMY FQTHDQIGMI SAGPSHVAAM NIPIPFNLVM PPMPPPGYFG QANGPAAGRG 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
TPKGKTGRGG RQKNRFGLPG PSQTNLPNSQ ASQDVASQPF SQGALTQGYI SMSQPSQMSQ 
      1090       1100       1110       1120    
PGLSQPELSQ DSYLGDEFKS QIDVALSQDS TYQGERAYQH GGVTGLSQY



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

5 N-termini - 3 C-termini - 2 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

Cleavages

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)