TopFIND 4.0

Q9UHB6: LIM domain and actin-binding protein 1

General Information

Protein names
- LIM domain and actin-binding protein 1
- Epithelial protein lost in neoplasm

Gene names LIMA1
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q9UHB6

11

N-termini

5

C-termini

2

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MESSPFNRRQ WTSLSLRVTA KELSLVNKNK SSAIVEIFSK YQKAAEETNM EKKRSNTENL 
        70         80         90        100        110        120 
SQHFRKGTLT VLKKKWENPG LGAESHTDSL RNSSTEIRHR ADHPPAEVTS HAASGAKADQ 
       130        140        150        160        170        180 
EEQIHPRSRL RSPPEALVQG RYPHIKDGED LKDHSTESKK MENCLGESRH EVEKSEISEN 
       190        200        210        220        230        240 
TDASGKIEKY NVPLNRLKMM FEKGEPTQTK ILRAQSRSAS GRKISENSYS LDDLEIGPGQ 
       250        260        270        280        290        300 
LSSSTFDSEK NESRRNLELP RLSETSIKDR MAKYQAAVSK QSSSTNYTNE LKASGGEIKI 
       310        320        330        340        350        360 
HKMEQKENVP PGPEVCITHQ EGEKISANEN SLAVRSTPAE DDSRDSQVKS EVQQPVHPKP 
       370        380        390        400        410        420 
LSPDSRASSL SESSPPKAMK KFQAPARETC VECQKTVYPM ERLLANQQVF HISCFRCSYC 
       430        440        450        460        470        480 
NNKLSLGTYA SLHGRIYCKP HFNQLFKSKG NYDEGFGHRP HKDLWASKNE NEEILERPAQ 
       490        500        510        520        530        540 
LANARETPHS PGVEDAPIAK VGVLAASMEA KASSQQEKED KPAETKKLRI AWPPPTELGS 
       550        560        570        580        590        600 
SGSALEEGIK MSKPKWPPED EISKPEVPED VDLDLKKLRR SSSLKERSRP FTVAASFQST 
       610        620        630        640        650        660 
SVKSPKTVSP PIRKGWSMSE QSEESVGGRV AERKQVENAK ASKKNGNVGK TTWQNKESKG 
       670        680        690        700        710        720 
ETGKRSKEGH SLEMENENLV ENGADSDEDD NSFLKQQSPQ EPKSLNWSSF VDNTFAEEFT 
       730        740        750    
TQNQKSQDVE LWEGEVVKEL SVEEQIKRNR YYDEDEDEE

Isoforms

- Isoform Alpha of LIM domain and actin-binding protein 1 - Isoform 3 of LIM domain and actin-binding protein 1 - Isoform 4 of LIM domain and actin-binding protein 1 - Isoform 5 of LIM domain and actin-binding protein 1

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MESSPFNRRQ WTSLSLRVTA KELSLVNKNK SSAIVEIFSK YQKAAEETNM EKKRSNTENL 
        70         80         90        100        110        120 
SQHFRKGTLT VLKKKWENPG LGAESHTDSL RNSSTEIRHR ADHPPAEVTS HAASGAKADQ 
       130        140        150        160        170        180 
EEQIHPRSRL RSPPEALVQG RYPHIKDGED LKDHSTESKK MENCLGESRH EVEKSEISEN 
       190        200        210        220        230        240 
TDASGKIEKY NVPLNRLKMM FEKGEPTQTK ILRAQSRSAS GRKISENSYS LDDLEIGPGQ 
       250        260        270        280        290        300 
LSSSTFDSEK NESRRNLELP RLSETSIKDR MAKYQAAVSK QSSSTNYTNE LKASGGEIKI 
       310        320        330        340        350        360 
HKMEQKENVP PGPEVCITHQ EGEKISANEN SLAVRSTPAE DDSRDSQVKS EVQQPVHPKP 
       370        380        390        400        410        420 
LSPDSRASSL SESSPPKAMK KFQAPARETC VECQKTVYPM ERLLANQQVF HISCFRCSYC 
       430        440        450        460        470        480 
NNKLSLGTYA SLHGRIYCKP HFNQLFKSKG NYDEGFGHRP HKDLWASKNE NEEILERPAQ 
       490        500        510        520        530        540 
LANARETPHS PGVEDAPIAK VGVLAASMEA KASSQQEKED KPAETKKLRI AWPPPTELGS 
       550        560        570        580        590        600 
SGSALEEGIK MSKPKWPPED EISKPEVPED VDLDLKKLRR SSSLKERSRP FTVAASFQST 
       610        620        630        640        650        660 
SVKSPKTVSP PIRKGWSMSE QSEESVGGRV AERKQVENAK ASKKNGNVGK TTWQNKESKG 
       670        680        690        700        710        720 
ETGKRSKEGH SLEMENENLV ENGADSDEDD NSFLKQQSPQ EPKSLNWSSF VDNTFAEEFT 
       730        740        750    
TQNQKSQDVE LWEGEVVKEL SVEEQIKRNR YYDEDEDEE         10         20         30         40         50         60 
MESSPFNRRQ WTSLSLRVTA KELSLVNKNK SSAIVEIFSK YQKAAEETNM EKKRSNTENL 
        70         80         90        100        110        120 
SQHFRKGTLT VLKKKWENPG LGAESHTDSL RNSSTEIRHR ADHPPAEVTS HAASGAKADQ 
       130        140        150        160        170        180 
EEQIHPRSRL RSPPEALVQG RYPHIKDGED LKDHSTESKK MENCLGESRH EVEKSEISEN 
       190        200        210        220        230        240 
TDASGKIEKY NVPLNRLKMM FEKGEPTQTK ILRAQSRSAS GRKISENSYS LDDLEIGPGQ 
       250        260        270        280        290        300 
LSSSTFDSEK NESRRNLELP RLSETSIKDR MAKYQAAVSK QSSSTNYTNE LKASGGEIKI 
       310        320        330        340        350        360 
HKMEQKENVP PGPEVCITHQ EGEKISANEN SLAVRSTPAE DDSRDSQVKS EVQQPVHPKP 
       370        380        390        400        410        420 
LSPDSRASSL SESSPPKAMK KFQAPARETC VECQKTVYPM ERLLANQQVF HISCFRCSYC 
       430        440        450        460        470        480 
NNKLSLGTYA SLHGRIYCKP HFNQLFKSKG NYDEGFGHRP HKDLWASKNE NEEILERPAQ 
       490        500        510        520        530        540 
LANARETPHS PGVEDAPIAK VGVLAASMEA KASSQQEKED KPAETKKLRI AWPPPTELGS 
       550        560        570        580        590        600 
SGSALEEGIK MSKPKWPPED EISKPEVPED VDLDLKKLRR SSSLKERSRP FTVAASFQST 
       610        620        630        640        650        660 
SVKSPKTVSP PIRKGWSMSE QSEESVGGRV AERKQVENAK ASKKNGNVGK TTWQNKESKG 
       670        680        690        700        710        720 
ETGKRSKEGH SLEMENENLV ENGADSDEDD NSFLKQQSPQ EPKSLNWSSF VDNTFAEEFT 
       730        740        750    
TQNQKSQDVE LWEGEVVKEL SVEEQIKRNR YYDEDEDEE         10         20         30         40         50         60 
MESSPFNRRQ WTSLSLRVTA KELSLVNKNK SSAIVEIFSK YQKAAEETNM EKKRSNTENL 
        70         80         90        100        110        120 
SQHFRKGTLT VLKKKWENPG LGAESHTDSL RNSSTEIRHR ADHPPAEVTS HAASGAKADQ 
       130        140        150        160        170        180 
EEQIHPRSRL RSPPEALVQG RYPHIKDGED LKDHSTESKK MENCLGESRH EVEKSEISEN 
       190        200        210        220        230        240 
TDASGKIEKY NVPLNRLKMM FEKGEPTQTK ILRAQSRSAS GRKISENSYS LDDLEIGPGQ 
       250        260        270        280        290        300 
LSSSTFDSEK NESRRNLELP RLSETSIKDR MAKYQAAVSK QSSSTNYTNE LKASGGEIKI 
       310        320        330        340        350        360 
HKMEQKENVP PGPEVCITHQ EGEKISANEN SLAVRSTPAE DDSRDSQVKS EVQQPVHPKP 
       370        380        390        400        410        420 
LSPDSRASSL SESSPPKAMK KFQAPARETC VECQKTVYPM ERLLANQQVF HISCFRCSYC 
       430        440        450        460        470        480 
NNKLSLGTYA SLHGRIYCKP HFNQLFKSKG NYDEGFGHRP HKDLWASKNE NEEILERPAQ 
       490        500        510        520        530        540 
LANARETPHS PGVEDAPIAK VGVLAASMEA KASSQQEKED KPAETKKLRI AWPPPTELGS 
       550        560        570        580        590        600 
SGSALEEGIK MSKPKWPPED EISKPEVPED VDLDLKKLRR SSSLKERSRP FTVAASFQST 
       610        620        630        640        650        660 
SVKSPKTVSP PIRKGWSMSE QSEESVGGRV AERKQVENAK ASKKNGNVGK TTWQNKESKG 
       670        680        690        700        710        720 
ETGKRSKEGH SLEMENENLV ENGADSDEDD NSFLKQQSPQ EPKSLNWSSF VDNTFAEEFT 
       730        740        750    
TQNQKSQDVE LWEGEVVKEL SVEEQIKRNR YYDEDEDEE         10         20         30         40         50         60 
MESSPFNRRQ WTSLSLRVTA KELSLVNKNK SSAIVEIFSK YQKAAEETNM EKKRSNTENL 
        70         80         90        100        110        120 
SQHFRKGTLT VLKKKWENPG LGAESHTDSL RNSSTEIRHR ADHPPAEVTS HAASGAKADQ 
       130        140        150        160        170        180 
EEQIHPRSRL RSPPEALVQG RYPHIKDGED LKDHSTESKK MENCLGESRH EVEKSEISEN 
       190        200        210        220        230        240 
TDASGKIEKY NVPLNRLKMM FEKGEPTQTK ILRAQSRSAS GRKISENSYS LDDLEIGPGQ 
       250        260        270        280        290        300 
LSSSTFDSEK NESRRNLELP RLSETSIKDR MAKYQAAVSK QSSSTNYTNE LKASGGEIKI 
       310        320        330        340        350        360 
HKMEQKENVP PGPEVCITHQ EGEKISANEN SLAVRSTPAE DDSRDSQVKS EVQQPVHPKP 
       370        380        390        400        410        420 
LSPDSRASSL SESSPPKAMK KFQAPARETC VECQKTVYPM ERLLANQQVF HISCFRCSYC 
       430        440        450        460        470        480 
NNKLSLGTYA SLHGRIYCKP HFNQLFKSKG NYDEGFGHRP HKDLWASKNE NEEILERPAQ 
       490        500        510        520        530        540 
LANARETPHS PGVEDAPIAK VGVLAASMEA KASSQQEKED KPAETKKLRI AWPPPTELGS 
       550        560        570        580        590        600 
SGSALEEGIK MSKPKWPPED EISKPEVPED VDLDLKKLRR SSSLKERSRP FTVAASFQST 
       610        620        630        640        650        660 
SVKSPKTVSP PIRKGWSMSE QSEESVGGRV AERKQVENAK ASKKNGNVGK TTWQNKESKG 
       670        680        690        700        710        720 
ETGKRSKEGH SLEMENENLV ENGADSDEDD NSFLKQQSPQ EPKSLNWSSF VDNTFAEEFT 
       730        740        750    
TQNQKSQDVE LWEGEVVKEL SVEEQIKRNR YYDEDEDEE



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

11 N-termini - 5 C-termini - 2 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

Cleavages

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)