TopFIND 4.0

Q6P2Q9: Pre-mRNA-processing-splicing factor 8

General Information

Protein names
- Pre-mRNA-processing-splicing factor 8
- 220 kDa U5 snRNP-specific protein
- PRP8 homolog
- Splicing factor Prp8
- p220
Gene names PRPF8
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q6P2Q9

9

N-termini

8

C-termini

6

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MAGVFPYRGP GNPVPGPLAP LPDYMSEEKL QEKARKWQQL QAKRYAEKRK FGFVDAQKED 
        70         80         90        100        110        120 
MPPEHVRKII RDHGDMTNRK FRHDKRVYLG ALKYMPHAVL KLLENMPMPW EQIRDVPVLY 
       130        140        150        160        170        180 
HITGAISFVN EIPWVIEPVY ISQWGSMWIM MRREKRDRRH FKRMRFPPFD DEEPPLDYAD 
       190        200        210        220        230        240 
NILDVEPLEA IQLELDPEED APVLDWFYDH QPLRDSRKYV NGSTYQRWQF TLPMMSTLYR 
       250        260        270        280        290        300 
LANQLLTDLV DDNYFYLFDL KAFFTSKALN MAIPGGPKFE PLVRDINLQD EDWNEFNDIN 
       310        320        330        340        350        360 
KIIIRQPIRT EYKIAFPYLY NNLPHHVHLT WYHTPNVVFI KTEDPDLPAF YFDPLINPIS 
       370        380        390        400        410        420 
HRHSVKSQEP LPDDDEEFEL PEFVEPFLKD TPLYTDNTAN GIALLWAPRP FNLRSGRTRR 
       430        440        450        460        470        480 
ALDIPLVKNW YREHCPAGQP VKVRVSYQKL LKYYVLNALK HRPPKAQKKR YLFRSFKATK 
       490        500        510        520        530        540 
FFQSTKLDWV EVGLQVCRQG YNMLNLLIHR KNLNYLHLDY NFNLKPVKTL TTKERKKSRF 
       550        560        570        580        590        600 
GNAFHLCREV LRLTKLVVDS HVQYRLGNVD AFQLADGLQY IFAHVGQLTG MYRYKYKLMR 
       610        620        630        640        650        660 
QIRMCKDLKH LIYYRFNTGP VGKGPGCGFW AAGWRVWLFF MRGITPLLER WLGNLLARQF 
       670        680        690        700        710        720 
EGRHSKGVAK TVTKQRVESH FDLELRAAVM HDILDMMPEG IKQNKARTIL QHLSEAWRCW 
       730        740        750        760        770        780 
KANIPWKVPG LPTPIENMIL RYVKAKADWW TNTAHYNRER IRRGATVDKT VCKKNLGRLT 
       790        800        810        820        830        840 
RLYLKAEQER QHNYLKDGPY ITAEEAVAVY TTTVHWLESR RFSPIPFPPL SYKHDTKLLI 
       850        860        870        880        890        900 
LALERLKEAY SVKSRLNQSQ REELGLIEQA YDNPHEALSR IKRHLLTQRA FKEVGIEFMD 
       910        920        930        940        950        960 
LYSHLVPVYD VEPLEKITDA YLDQYLWYEA DKRRLFPPWI KPADTEPPPL LVYKWCQGIN 
       970        980        990       1000       1010       1020 
NLQDVWETSE GECNVMLESR FEKMYEKIDL TLLNRLLRLI VDHNIADYMT AKNNVVINYK 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
DMNHTNSYGI IRGLQFASFI VQYYGLVMDL LVLGLHRASE MAGPPQMPND FLSFQDIATE 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
AAHPIRLFCR YIDRIHIFFR FTADEARDLI QRYLTEHPDP NNENIVGYNN KKCWPRDARM 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
RLMKHDVNLG RAVFWDIKNR LPRSVTTVQW ENSFVSVYSK DNPNLLFNMC GFECRILPKC 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
RTSYEEFTHK DGVWNLQNEV TKERTAQCFL RVDDESMQRF HNRVRQILMA SGSTTFTKIV 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
NKWNTALIGL MTYFREAVVN TQELLDLLVK CENKIQTRIK IGLNSKMPSR FPPVVFYTPK 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
ELGGLGMLSM GHVLIPQSDL RWSKQTDVGI THFRSGMSHE EDQLIPNLYR YIQPWESEFI 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
DSQRVWAEYA LKRQEAIAQN RRLTLEDLED SWDRGIPRIN TLFQKDRHTL AYDKGWRVRT 
      1450       1460       1470       1480       1490       1500 
DFKQYQVLKQ NPFWWTHQRH DGKLWNLNNY RTDMIQALGG VEGILEHTLF KGTYFPTWEG 
      1510       1520       1530       1540       1550       1560 
LFWEKASGFE ESMKWKKLTN AQRSGLNQIP NRRFTLWWSP TINRANVYVG FQVQLDLTGI 
      1570       1580       1590       1600       1610       1620 
FMHGKIPTLK ISLIQIFRAH LWQKIHESIV MDLCQVFDQE LDALEIETVQ KETIHPRKSY 
      1630       1640       1650       1660       1670       1680 
KMNSSCADIL LFASYKWNVS RPSLLADSKD VMDSTTTQKY WIDIQLRWGD YDSHDIERYA 
      1690       1700       1710       1720       1730       1740 
RAKFLDYTTD NMSIYPSPTG VLIAIDLAYN LHSAYGNWFP GSKPLIQQAM AKIMKANPAL 
      1750       1760       1770       1780       1790       1800 
YVLRERIRKG LQLYSSEPTE PYLSSQNYGE LFSNQIIWFV DDTNVYRVTI HKTFEGNLTT 
      1810       1820       1830       1840       1850       1860 
KPINGAIFIF NPRTGQLFLK IIHTSVWAGQ KRLGQLAKWK TAEEVAALIR SLPVEEQPKQ 
      1870       1880       1890       1900       1910       1920 
IIVTRKGMLD PLEVHLLDFP NIVIKGSELQ LPFQACLKVE KFGDLILKAT EPQMVLFNLY 
      1930       1940       1950       1960       1970       1980 
DDWLKTISSY TAFSRLILIL RALHVNNDRA KVILKPDKTT ITEPHHIWPT LTDEEWIKVE 
      1990       2000       2010       2020       2030       2040 
VQLKDLILAD YGKKNNVNVA SLTQSEIRDI ILGMEISAPS QQRQQIAEIE KQTKEQSQLT 
      2050       2060       2070       2080       2090       2100 
ATQTRTVNKH GDEIITSTTS NYETQTFSSK TEWRVRAISA ANLHLRTNHI YVSSDDIKET 
      2110       2120       2130       2140       2150       2160 
GYTYILPKNV LKKFICISDL RAQIAGYLYG VSPPDNPQVK EIRCIVMVPQ WGTHQTVHLP 
      2170       2180       2190       2200       2210       2220 
GQLPQHEYLK EMEPLGWIHT QPNESPQLSP QDVTTHAKIM ADNPSWDGEK TIIITCSFTP 
      2230       2240       2250       2260       2270       2280 
GSCTLTAYKL TPSGYEWGRQ NTDKGNNPKG YLPSHYERVQ MLLSDRFLGF FMVPAQSSWN 
      2290       2300       2310       2320       2330    
YNFMGVRHDP NMKYELQLAN PKEFYHEVHR PSHFLNFALL QEGEVYSADR EDLYA

Isoforms



Sequence View



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

9 N-termini - 8 C-termini - 6 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

Cleavages

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)