TopFIND 4.0

O60506: Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q

General Information

Protein names
- Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q
- hnRNP Q
- Glycine- and tyrosine-rich RNA-binding protein
- GRY-RBP
- NS1-associated protein 1
- Synaptotagmin-binding, cytoplasmic RNA-interacting protein

Gene names SYNCRIP
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID O60506

18

N-termini

11

C-termini

13

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MATEHVNGNG TEEPMDTTSA VIHSENFQTL LDAGLPQKVA EKLDEIYVAG LVAHSDLDER 
        70         80         90        100        110        120 
AIEALKEFNE DGALAVLQQF KDSDLSHVQN KSAFLCGVMK TYRQREKQGT KVADSSKGPD 
       130        140        150        160        170        180 
EAKIKALLER TGYTLDVTTG QRKYGGPPPD SVYSGQQPSV GTEIFVGKIP RDLFEDELVP 
       190        200        210        220        230        240 
LFEKAGPIWD LRLMMDPLTG LNRGYAFVTF CTKEAAQEAV KLYNNHEIRS GKHIGVCISV 
       250        260        270        280        290        300 
ANNRLFVGSI PKSKTKEQIL EEFSKVTEGL TDVILYHQPD DKKKNRGFCF LEYEDHKTAA 
       310        320        330        340        350        360 
QARRRLMSGK VKVWGNVGTV EWADPIEDPD PEVMAKVKVL FVRNLANTVT EEILEKAFSQ 
       370        380        390        400        410        420 
FGKLERVKKL KDYAFIHFDE RDGAVKAMEE MNGKDLEGEN IEIVFAKPPD QKRKERKAQR 
       430        440        450        460        470        480 
QAAKNQMYDD YYYYGPPHMP PPTRGRGRGG RGGYGYPPDY YGYEDYYDYY GYDYHNYRGG 
       490        500        510        520        530        540 
YEDPYYGYED FQVGARGRGG RGARGAAPSR GRGAAPPRGR AGYSQRGGPG SARGVRGARG 
       550        560        570        580        590        600 
GAQQQRGRGV RGARGGRGGN VGGKRKADGY NQPDSKRRQT NNQNWGSQPI AQQPLQGGDH 
       610        620    
SGNYGYKSEN QEFYQDTFGQ QWK

Isoforms

- Isoform 2 of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q - Isoform 3 of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q - Isoform 4 of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q - Isoform 5 of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MATEHVNGNG TEEPMDTTSA VIHSENFQTL LDAGLPQKVA EKLDEIYVAG LVAHSDLDER 
        70         80         90        100        110        120 
AIEALKEFNE DGALAVLQQF KDSDLSHVQN KSAFLCGVMK TYRQREKQGT KVADSSKGPD 
       130        140        150        160        170        180 
EAKIKALLER TGYTLDVTTG QRKYGGPPPD SVYSGQQPSV GTEIFVGKIP RDLFEDELVP 
       190        200        210        220        230        240 
LFEKAGPIWD LRLMMDPLTG LNRGYAFVTF CTKEAAQEAV KLYNNHEIRS GKHIGVCISV 
       250        260        270        280        290        300 
ANNRLFVGSI PKSKTKEQIL EEFSKVTEGL TDVILYHQPD DKKKNRGFCF LEYEDHKTAA 
       310        320        330        340        350        360 
QARRRLMSGK VKVWGNVGTV EWADPIEDPD PEVMAKVKVL FVRNLANTVT EEILEKAFSQ 
       370        380        390        400        410        420 
FGKLERVKKL KDYAFIHFDE RDGAVKAMEE MNGKDLEGEN IEIVFAKPPD QKRKERKAQR 
       430        440        450        460        470        480 
QAAKNQMYDD YYYYGPPHMP PPTRGRGRGG RGGYGYPPDY YGYEDYYDYY GYDYHNYRGG 
       490        500        510        520        530        540 
YEDPYYGYED FQVGARGRGG RGARGAAPSR GRGAAPPRGR AGYSQRGGPG SARGVRGARG 
       550        560        570        580        590        600 
GAQQQRGRGV RGARGGRGGN VGGKRKADGY NQPDSKRRQT NNQNWGSQPI AQQPLQGGDH 
       610        620    
SGNYGYKSEN QEFYQDTFGQ QWK         10         20         30         40         50         60 
MATEHVNGNG TEEPMDTTSA VIHSENFQTL LDAGLPQKVA EKLDEIYVAG LVAHSDLDER 
        70         80         90        100        110        120 
AIEALKEFNE DGALAVLQQF KDSDLSHVQN KSAFLCGVMK TYRQREKQGT KVADSSKGPD 
       130        140        150        160        170        180 
EAKIKALLER TGYTLDVTTG QRKYGGPPPD SVYSGQQPSV GTEIFVGKIP RDLFEDELVP 
       190        200        210        220        230        240 
LFEKAGPIWD LRLMMDPLTG LNRGYAFVTF CTKEAAQEAV KLYNNHEIRS GKHIGVCISV 
       250        260        270        280        290        300 
ANNRLFVGSI PKSKTKEQIL EEFSKVTEGL TDVILYHQPD DKKKNRGFCF LEYEDHKTAA 
       310        320        330        340        350        360 
QARRRLMSGK VKVWGNVGTV EWADPIEDPD PEVMAKVKVL FVRNLANTVT EEILEKAFSQ 
       370        380        390        400        410        420 
FGKLERVKKL KDYAFIHFDE RDGAVKAMEE MNGKDLEGEN IEIVFAKPPD QKRKERKAQR 
       430        440        450        460        470        480 
QAAKNQMYDD YYYYGPPHMP PPTRGRGRGG RGGYGYPPDY YGYEDYYDYY GYDYHNYRGG 
       490        500        510        520        530        540 
YEDPYYGYED FQVGARGRGG RGARGAAPSR GRGAAPPRGR AGYSQRGGPG SARGVRGARG 
       550        560        570        580        590        600 
GAQQQRGRGV RGARGGRGGN VGGKRKADGY NQPDSKRRQT NNQNWGSQPI AQQPLQGGDH 
       610        620    
SGNYGYKSEN QEFYQDTFGQ QWK         10         20         30         40         50         60 
MATEHVNGNG TEEPMDTTSA VIHSENFQTL LDAGLPQKVA EKLDEIYVAG LVAHSDLDER 
        70         80         90        100        110        120 
AIEALKEFNE DGALAVLQQF KDSDLSHVQN KSAFLCGVMK TYRQREKQGT KVADSSKGPD 
       130        140        150        160        170        180 
EAKIKALLER TGYTLDVTTG QRKYGGPPPD SVYSGQQPSV GTEIFVGKIP RDLFEDELVP 
       190        200        210        220        230        240 
LFEKAGPIWD LRLMMDPLTG LNRGYAFVTF CTKEAAQEAV KLYNNHEIRS GKHIGVCISV 
       250        260        270        280        290        300 
ANNRLFVGSI PKSKTKEQIL EEFSKVTEGL TDVILYHQPD DKKKNRGFCF LEYEDHKTAA 
       310        320        330        340        350        360 
QARRRLMSGK VKVWGNVGTV EWADPIEDPD PEVMAKVKVL FVRNLANTVT EEILEKAFSQ 
       370        380        390        400        410        420 
FGKLERVKKL KDYAFIHFDE RDGAVKAMEE MNGKDLEGEN IEIVFAKPPD QKRKERKAQR 
       430        440        450        460        470        480 
QAAKNQMYDD YYYYGPPHMP PPTRGRGRGG RGGYGYPPDY YGYEDYYDYY GYDYHNYRGG 
       490        500        510        520        530        540 
YEDPYYGYED FQVGARGRGG RGARGAAPSR GRGAAPPRGR AGYSQRGGPG SARGVRGARG 
       550        560        570        580        590        600 
GAQQQRGRGV RGARGGRGGN VGGKRKADGY NQPDSKRRQT NNQNWGSQPI AQQPLQGGDH 
       610        620    
SGNYGYKSEN QEFYQDTFGQ QWK         10         20         30         40         50         60 
MATEHVNGNG TEEPMDTTSA VIHSENFQTL LDAGLPQKVA EKLDEIYVAG LVAHSDLDER 
        70         80         90        100        110        120 
AIEALKEFNE DGALAVLQQF KDSDLSHVQN KSAFLCGVMK TYRQREKQGT KVADSSKGPD 
       130        140        150        160        170        180 
EAKIKALLER TGYTLDVTTG QRKYGGPPPD SVYSGQQPSV GTEIFVGKIP RDLFEDELVP 
       190        200        210        220        230        240 
LFEKAGPIWD LRLMMDPLTG LNRGYAFVTF CTKEAAQEAV KLYNNHEIRS GKHIGVCISV 
       250        260        270        280        290        300 
ANNRLFVGSI PKSKTKEQIL EEFSKVTEGL TDVILYHQPD DKKKNRGFCF LEYEDHKTAA 
       310        320        330        340        350        360 
QARRRLMSGK VKVWGNVGTV EWADPIEDPD PEVMAKVKVL FVRNLANTVT EEILEKAFSQ 
       370        380        390        400        410        420 
FGKLERVKKL KDYAFIHFDE RDGAVKAMEE MNGKDLEGEN IEIVFAKPPD QKRKERKAQR 
       430        440        450        460        470        480 
QAAKNQMYDD YYYYGPPHMP PPTRGRGRGG RGGYGYPPDY YGYEDYYDYY GYDYHNYRGG 
       490        500        510        520        530        540 
YEDPYYGYED FQVGARGRGG RGARGAAPSR GRGAAPPRGR AGYSQRGGPG SARGVRGARG 
       550        560        570        580        590        600 
GAQQQRGRGV RGARGGRGGN VGGKRKADGY NQPDSKRRQT NNQNWGSQPI AQQPLQGGDH 
       610        620    
SGNYGYKSEN QEFYQDTFGQ QWK



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

18 N-termini - 11 C-termini - 13 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

Cleavages

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)