TopFIND 4.0

Q15029: 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component

General Information

Protein names
- 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component
- Elongation factor Tu GTP-binding domain-containing protein 2
- SNU114 homolog
- hSNU114
- U5 snRNP-specific protein, 116 kDa
- U5-116 kDa
Gene names EFTUD2
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q15029

8

N-termini

7

C-termini

6

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MDTDLYDEFG NYIGPELDSD EDDDELGRET KDLDEMDDDD DDDDVGDHDD DHPGMEVVLH 
        70         80         90        100        110        120 
EDKKYYPTAE EVYGPEVETI VQEEDTQPLT EPIIKPVKTK KFTLMEQTLP VTVYEMDFLA 
       130        140        150        160        170        180 
DLMDNSELIR NVTLCGHLHH GKTCFVDCLI EQTHPEIRKR YDQDLCYTDI LFTEQERGVG 
       190        200        210        220        230        240 
IKSTPVTVVL PDTKGKSYLF NIMDTPGHVN FSDEVTAGLR ISDGVVLFID AAEGVMLNTE 
       250        260        270        280        290        300 
RLIKHAVQER LAVTVCINKI DRLILELKLP PTDAYYKLRH IVDEVNGLIS MYSTDENLIL 
       310        320        330        340        350        360 
SPLLGNVCFS SSQYSICFTL GSFAKIYADT FGDINYQEFA KRLWGDIYFN PKTRKFTKKA 
       370        380        390        400        410        420 
PTSSSQRSFV EFILEPLYKI LAQVVGDVDT SLPRTLDELG IHLTKEELKL NIRPLLRLVC 
       430        440        450        460        470        480 
KKFFGEFTGF VDMCVQHIPS PKVGAKPKIE HTYTGGVDSD LGEAMSDCDP DGPLMCHTTK 
       490        500        510        520        530        540 
MYSTDDGVQF HAFGRVLSGT IHAGQPVKVL GENYTLEDEE DSQICTVGRL WISVARYHIE 
       550        560        570        580        590        600 
VNRVPAGNWV LIEGVDQPIV KTATITEPRG NEEAQIFRPL KFNTTSVIKI AVEPVNPSEL 
       610        620        630        640        650        660 
PKMLDGLRKV NKSYPSLTTK VEESGEHVIL GTGELYLDCV MHDLRKMYSE IDIKVADPVV 
       670        680        690        700        710        720 
TFCETVVETS SLKCFAETPN KKNKITMIAE PLEKGLAEDI ENEVVQITWN RKKLGEFFQT 
       730        740        750        760        770        780 
KYDWDLLAAR SIWAFGPDAT GPNILVDDTL PSEVDKALLG SVKDSIVQGF QWGTREGPLC 
       790        800        810        820        830        840 
DELIRNVKFK ILDAVVAQEP LHRGGGQIIP TARRVVYSAF LMATPRLMEP YYFVEVQAPA 
       850        860        870        880        890        900 
DCVSAVYTVL ARRRGHVTQD APIPGSPLYT IKAFIPAIDS FGFETDLRTH TQGQAFSLSV 
       910        920        930        940        950        960 
FHHWQIVPGD PLDKSIVIRP LEPQPAPHLA REFMIKTRRR KGLSEDVSIS KFFDDPMLLE 
       970    
LAKQDVVLNY PM

Isoforms

- Isoform 2 of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component - Isoform 3 of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MDTDLYDEFG NYIGPELDSD EDDDELGRET KDLDEMDDDD DDDDVGDHDD DHPGMEVVLH 
        70         80         90        100        110        120 
EDKKYYPTAE EVYGPEVETI VQEEDTQPLT EPIIKPVKTK KFTLMEQTLP VTVYEMDFLA 
       130        140        150        160        170        180 
DLMDNSELIR NVTLCGHLHH GKTCFVDCLI EQTHPEIRKR YDQDLCYTDI LFTEQERGVG 
       190        200        210        220        230        240 
IKSTPVTVVL PDTKGKSYLF NIMDTPGHVN FSDEVTAGLR ISDGVVLFID AAEGVMLNTE 
       250        260        270        280        290        300 
RLIKHAVQER LAVTVCINKI DRLILELKLP PTDAYYKLRH IVDEVNGLIS MYSTDENLIL 
       310        320        330        340        350        360 
SPLLGNVCFS SSQYSICFTL GSFAKIYADT FGDINYQEFA KRLWGDIYFN PKTRKFTKKA 
       370        380        390        400        410        420 
PTSSSQRSFV EFILEPLYKI LAQVVGDVDT SLPRTLDELG IHLTKEELKL NIRPLLRLVC 
       430        440        450        460        470        480 
KKFFGEFTGF VDMCVQHIPS PKVGAKPKIE HTYTGGVDSD LGEAMSDCDP DGPLMCHTTK 
       490        500        510        520        530        540 
MYSTDDGVQF HAFGRVLSGT IHAGQPVKVL GENYTLEDEE DSQICTVGRL WISVARYHIE 
       550        560        570        580        590        600 
VNRVPAGNWV LIEGVDQPIV KTATITEPRG NEEAQIFRPL KFNTTSVIKI AVEPVNPSEL 
       610        620        630        640        650        660 
PKMLDGLRKV NKSYPSLTTK VEESGEHVIL GTGELYLDCV MHDLRKMYSE IDIKVADPVV 
       670        680        690        700        710        720 
TFCETVVETS SLKCFAETPN KKNKITMIAE PLEKGLAEDI ENEVVQITWN RKKLGEFFQT 
       730        740        750        760        770        780 
KYDWDLLAAR SIWAFGPDAT GPNILVDDTL PSEVDKALLG SVKDSIVQGF QWGTREGPLC 
       790        800        810        820        830        840 
DELIRNVKFK ILDAVVAQEP LHRGGGQIIP TARRVVYSAF LMATPRLMEP YYFVEVQAPA 
       850        860        870        880        890        900 
DCVSAVYTVL ARRRGHVTQD APIPGSPLYT IKAFIPAIDS FGFETDLRTH TQGQAFSLSV 
       910        920        930        940        950        960 
FHHWQIVPGD PLDKSIVIRP LEPQPAPHLA REFMIKTRRR KGLSEDVSIS KFFDDPMLLE 
       970    
LAKQDVVLNY PM         10         20         30         40         50         60 
MDTDLYDEFG NYIGPELDSD EDDDELGRET KDLDEMDDDD DDDDVGDHDD DHPGMEVVLH 
        70         80         90        100        110        120 
EDKKYYPTAE EVYGPEVETI VQEEDTQPLT EPIIKPVKTK KFTLMEQTLP VTVYEMDFLA 
       130        140        150        160        170        180 
DLMDNSELIR NVTLCGHLHH GKTCFVDCLI EQTHPEIRKR YDQDLCYTDI LFTEQERGVG 
       190        200        210        220        230        240 
IKSTPVTVVL PDTKGKSYLF NIMDTPGHVN FSDEVTAGLR ISDGVVLFID AAEGVMLNTE 
       250        260        270        280        290        300 
RLIKHAVQER LAVTVCINKI DRLILELKLP PTDAYYKLRH IVDEVNGLIS MYSTDENLIL 
       310        320        330        340        350        360 
SPLLGNVCFS SSQYSICFTL GSFAKIYADT FGDINYQEFA KRLWGDIYFN PKTRKFTKKA 
       370        380        390        400        410        420 
PTSSSQRSFV EFILEPLYKI LAQVVGDVDT SLPRTLDELG IHLTKEELKL NIRPLLRLVC 
       430        440        450        460        470        480 
KKFFGEFTGF VDMCVQHIPS PKVGAKPKIE HTYTGGVDSD LGEAMSDCDP DGPLMCHTTK 
       490        500        510        520        530        540 
MYSTDDGVQF HAFGRVLSGT IHAGQPVKVL GENYTLEDEE DSQICTVGRL WISVARYHIE 
       550        560        570        580        590        600 
VNRVPAGNWV LIEGVDQPIV KTATITEPRG NEEAQIFRPL KFNTTSVIKI AVEPVNPSEL 
       610        620        630        640        650        660 
PKMLDGLRKV NKSYPSLTTK VEESGEHVIL GTGELYLDCV MHDLRKMYSE IDIKVADPVV 
       670        680        690        700        710        720 
TFCETVVETS SLKCFAETPN KKNKITMIAE PLEKGLAEDI ENEVVQITWN RKKLGEFFQT 
       730        740        750        760        770        780 
KYDWDLLAAR SIWAFGPDAT GPNILVDDTL PSEVDKALLG SVKDSIVQGF QWGTREGPLC 
       790        800        810        820        830        840 
DELIRNVKFK ILDAVVAQEP LHRGGGQIIP TARRVVYSAF LMATPRLMEP YYFVEVQAPA 
       850        860        870        880        890        900 
DCVSAVYTVL ARRRGHVTQD APIPGSPLYT IKAFIPAIDS FGFETDLRTH TQGQAFSLSV 
       910        920        930        940        950        960 
FHHWQIVPGD PLDKSIVIRP LEPQPAPHLA REFMIKTRRR KGLSEDVSIS KFFDDPMLLE 
       970    
LAKQDVVLNY PM



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

8 N-termini - 7 C-termini - 6 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

Cleavages

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)