TopFIND 4.0

Q92841: Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17

General Information

Protein names
- Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17
- 3.6.4.13
- DEAD box protein 17
- DEAD box protein p72
- DEAD box protein p82 {ECO:0000303|PubMed:19995069}
- RNA-dependent helicase p72
Gene names DDX17
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q92841

26

N-termini

4

C-termini

3

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MPTGFVAPIL CVLLPSPTRE AATVASATGD SASERESAAP AAAPTAEAPP PSVVTRPEPQ 
        70         80         90        100        110        120 
ALPSPAIRAP LPDLYPFGTM RGGGFGDRDR DRDRGGFGAR GGGGLPPKKF GNPGERLRKK 
       130        140        150        160        170        180 
KWDLSELPKF EKNFYVEHPE VARLTPYEVD ELRRKKEITV RGGDVCPKPV FAFHHANFPQ 
       190        200        210        220        230        240 
YVMDVLMDQH FTEPTPIQCQ GFPLALSGRD MVGIAQTGSG KTLAYLLPAI VHINHQPYLE 
       250        260        270        280        290        300 
RGDGPICLVL APTRELAQQV QQVADDYGKC SRLKSTCIYG GAPKGPQIRD LERGVEICIA 
       310        320        330        340        350        360 
TPGRLIDFLE SGKTNLRRCT YLVLDEADRM LDMGFEPQIR KIVDQIRPDR QTLMWSATWP 
       370        380        390        400        410        420 
KEVRQLAEDF LRDYTQINVG NLELSANHNI LQIVDVCMES EKDHKLIQLM EEIMAEKENK 
       430        440        450        460        470        480 
TIIFVETKRR CDDLTRRMRR DGWPAMCIHG DKSQPERDWV LNEFRSGKAP ILIATDVASR 
       490        500        510        520        530        540 
GLDVEDVKFV INYDYPNSSE DYVHRIGRTA RSTNKGTAYT FFTPGNLKQA RELIKVLEEA 
       550        560        570        580        590        600 
NQAINPKLMQ LVDHRGGGGG GGGRSRYRTT SSANNPNLMY QDECDRRLRG VKDGGRRDSA 
       610        620        630        640        650        660 
SYRDRSETDR AGYANGSGYG SPNSAFGAQA GQYTYGQGTY GAAAYGTSSY TAQEYGAGTY 
       670        680        690        700        710        720 
GASSTTSTGR SSQSSSQQFS GIGRSGQQPQ PLMSQQFAQP PGATNMIGYM GQTAYQYPPP 
   
PPPPPPSRK

Isoforms

- Isoform 2 of Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 - Isoform 3 of Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 - Isoform 4 of Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MPTGFVAPIL CVLLPSPTRE AATVASATGD SASERESAAP AAAPTAEAPP PSVVTRPEPQ 
        70         80         90        100        110        120 
ALPSPAIRAP LPDLYPFGTM RGGGFGDRDR DRDRGGFGAR GGGGLPPKKF GNPGERLRKK 
       130        140        150        160        170        180 
KWDLSELPKF EKNFYVEHPE VARLTPYEVD ELRRKKEITV RGGDVCPKPV FAFHHANFPQ 
       190        200        210        220        230        240 
YVMDVLMDQH FTEPTPIQCQ GFPLALSGRD MVGIAQTGSG KTLAYLLPAI VHINHQPYLE 
       250        260        270        280        290        300 
RGDGPICLVL APTRELAQQV QQVADDYGKC SRLKSTCIYG GAPKGPQIRD LERGVEICIA 
       310        320        330        340        350        360 
TPGRLIDFLE SGKTNLRRCT YLVLDEADRM LDMGFEPQIR KIVDQIRPDR QTLMWSATWP 
       370        380        390        400        410        420 
KEVRQLAEDF LRDYTQINVG NLELSANHNI LQIVDVCMES EKDHKLIQLM EEIMAEKENK 
       430        440        450        460        470        480 
TIIFVETKRR CDDLTRRMRR DGWPAMCIHG DKSQPERDWV LNEFRSGKAP ILIATDVASR 
       490        500        510        520        530        540 
GLDVEDVKFV INYDYPNSSE DYVHRIGRTA RSTNKGTAYT FFTPGNLKQA RELIKVLEEA 
       550        560        570        580        590        600 
NQAINPKLMQ LVDHRGGGGG GGGRSRYRTT SSANNPNLMY QDECDRRLRG VKDGGRRDSA 
       610        620        630        640        650        660 
SYRDRSETDR AGYANGSGYG SPNSAFGAQA GQYTYGQGTY GAAAYGTSSY TAQEYGAGTY 
       670        680        690        700        710        720 
GASSTTSTGR SSQSSSQQFS GIGRSGQQPQ PLMSQQFAQP PGATNMIGYM GQTAYQYPPP 
   
PPPPPPSRK         10         20         30         40         50         60 
MPTGFVAPIL CVLLPSPTRE AATVASATGD SASERESAAP AAAPTAEAPP PSVVTRPEPQ 
        70         80         90        100        110        120 
ALPSPAIRAP LPDLYPFGTM RGGGFGDRDR DRDRGGFGAR GGGGLPPKKF GNPGERLRKK 
       130        140        150        160        170        180 
KWDLSELPKF EKNFYVEHPE VARLTPYEVD ELRRKKEITV RGGDVCPKPV FAFHHANFPQ 
       190        200        210        220        230        240 
YVMDVLMDQH FTEPTPIQCQ GFPLALSGRD MVGIAQTGSG KTLAYLLPAI VHINHQPYLE 
       250        260        270        280        290        300 
RGDGPICLVL APTRELAQQV QQVADDYGKC SRLKSTCIYG GAPKGPQIRD LERGVEICIA 
       310        320        330        340        350        360 
TPGRLIDFLE SGKTNLRRCT YLVLDEADRM LDMGFEPQIR KIVDQIRPDR QTLMWSATWP 
       370        380        390        400        410        420 
KEVRQLAEDF LRDYTQINVG NLELSANHNI LQIVDVCMES EKDHKLIQLM EEIMAEKENK 
       430        440        450        460        470        480 
TIIFVETKRR CDDLTRRMRR DGWPAMCIHG DKSQPERDWV LNEFRSGKAP ILIATDVASR 
       490        500        510        520        530        540 
GLDVEDVKFV INYDYPNSSE DYVHRIGRTA RSTNKGTAYT FFTPGNLKQA RELIKVLEEA 
       550        560        570        580        590        600 
NQAINPKLMQ LVDHRGGGGG GGGRSRYRTT SSANNPNLMY QDECDRRLRG VKDGGRRDSA 
       610        620        630        640        650        660 
SYRDRSETDR AGYANGSGYG SPNSAFGAQA GQYTYGQGTY GAAAYGTSSY TAQEYGAGTY 
       670        680        690        700        710        720 
GASSTTSTGR SSQSSSQQFS GIGRSGQQPQ PLMSQQFAQP PGATNMIGYM GQTAYQYPPP 
   
PPPPPPSRK         10         20         30         40         50         60 
MPTGFVAPIL CVLLPSPTRE AATVASATGD SASERESAAP AAAPTAEAPP PSVVTRPEPQ 
        70         80         90        100        110        120 
ALPSPAIRAP LPDLYPFGTM RGGGFGDRDR DRDRGGFGAR GGGGLPPKKF GNPGERLRKK 
       130        140        150        160        170        180 
KWDLSELPKF EKNFYVEHPE VARLTPYEVD ELRRKKEITV RGGDVCPKPV FAFHHANFPQ 
       190        200        210        220        230        240 
YVMDVLMDQH FTEPTPIQCQ GFPLALSGRD MVGIAQTGSG KTLAYLLPAI VHINHQPYLE 
       250        260        270        280        290        300 
RGDGPICLVL APTRELAQQV QQVADDYGKC SRLKSTCIYG GAPKGPQIRD LERGVEICIA 
       310        320        330        340        350        360 
TPGRLIDFLE SGKTNLRRCT YLVLDEADRM LDMGFEPQIR KIVDQIRPDR QTLMWSATWP 
       370        380        390        400        410        420 
KEVRQLAEDF LRDYTQINVG NLELSANHNI LQIVDVCMES EKDHKLIQLM EEIMAEKENK 
       430        440        450        460        470        480 
TIIFVETKRR CDDLTRRMRR DGWPAMCIHG DKSQPERDWV LNEFRSGKAP ILIATDVASR 
       490        500        510        520        530        540 
GLDVEDVKFV INYDYPNSSE DYVHRIGRTA RSTNKGTAYT FFTPGNLKQA RELIKVLEEA 
       550        560        570        580        590        600 
NQAINPKLMQ LVDHRGGGGG GGGRSRYRTT SSANNPNLMY QDECDRRLRG VKDGGRRDSA 
       610        620        630        640        650        660 
SYRDRSETDR AGYANGSGYG SPNSAFGAQA GQYTYGQGTY GAAAYGTSSY TAQEYGAGTY 
       670        680        690        700        710        720 
GASSTTSTGR SSQSSSQQFS GIGRSGQQPQ PLMSQQFAQP PGATNMIGYM GQTAYQYPPP 
   
PPPPPPSRK



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

26 N-termini - 4 C-termini - 3 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

Cleavages

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)