TopFIND 4.0

Q08211: ATP-dependent RNA helicase A {ECO:0000305}

General Information

Protein names
- ATP-dependent RNA helicase A {ECO:0000305}
- 3.6.4.13 {ECO:0000269|PubMed:11416126, ECO:0000269|PubMed:1537828, ECO:0000269|PubMed:20510246, ECO:0000269|PubMed:20669935, ECO:0000269|PubMed:24049074, ECO:0000269|PubMed:25062910, ECO:0000269|PubMed:8690889}
- DEAH box protein 9
- DExH-box helicase 9 {ECO:0000312|HGNC:HGNC:2750}
- Leukophysin {ECO:0000303|PubMed:8690889}
- LKP {ECO:0000303|PubMed:8690889}
- Nuclear DNA helicase II {ECO:0000303|PubMed:1537828, ECO:0000303|PubMed:8344961, ECO:0000303|PubMed:9111062}
- NDH II {ECO:0000303|PubMed:8344961, ECO:0000303|PubMed:9111062}
- RNA helicase A {ECO:0000303|PubMed:9111062}
Gene names DHX9
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID Q08211

22

N-termini

9

C-termini

9

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MGDVKNFLYA WCGKRKMTPS YEIRAVGNKN RQKFMCEVQV EGYNYTGMGN STNKKDAQSN 
        70         80         90        100        110        120 
AARDFVNYLV RINEIKSEEV PAFGVASPPP LTDTPDTTAN AEGDLPTTMG GPLPPHLALK 
       130        140        150        160        170        180 
AENNSEVGAS GYGVPGPTWD RGANLKDYYS RKEEQEVQAT LESEEVDLNA GLHGNWTLEN 
       190        200        210        220        230        240 
AKARLNQYFQ KEKIQGEYKY TQVGPDHNRS FIAEMTIYIK QLGRRIFARE HGSNKKLAAQ 
       250        260        270        280        290        300 
SCALSLVRQL YHLGVVEAYS GLTKKKEGET VEPYKVNLSQ DLEHQLQNII QELNLEILPP 
       310        320        330        340        350        360 
PEDPSVPVAL NIGKLAQFEP SQRQNQVGVV PWSPPQSNWN PWTSSNIDEG PLAFATPEQI 
       370        380        390        400        410        420 
SMDLKNELMY QLEQDHDLQA ILQERELLPV KKFESEILEA ISQNSVVIIR GATGCGKTTQ 
       430        440        450        460        470        480 
VPQFILDDFI QNDRAAECNI VVTQPRRISA VSVAERVAFE RGEEPGKSCG YSVRFESILP 
       490        500        510        520        530        540 
RPHASIMFCT VGVLLRKLEA GIRGISHVIV DEIHERDINT DFLLVVLRDV VQAYPEVRIV 
       550        560        570        580        590        600 
LMSATIDTSM FCEYFFNCPI IEVYGRTYPV QEYFLEDCIQ MTHFVPPPKD KKKKDKDDDG 
       610        620        630        640        650        660 
GEDDDANCNL ICGDEYGPET RLSMSQLNEK ETPFELIEAL LKYIETLNVP GAVLVFLPGW 
       670        680        690        700        710        720 
NLIYTMQKHL EMNPHFGSHR YQILPLHSQI PREEQRKVFD PVPVGVTKVI LSTNIAETSI 
       730        740        750        760        770        780 
TINDVVYVID SCKQKVKLFT AHNNMTNYAT VWASKTNLEQ RKGRAGRVRP GFCFHLCSRA 
       790        800        810        820        830        840 
RFERLETHMT PEMFRTPLHE IALSIKLLRL GGIGQFLAKA IEPPPLDAVI EAEHTLRELD 
       850        860        870        880        890        900 
ALDANDELTP LGRILAKLPI EPRFGKMMIM GCIFYVGDAI CTIAAATCFP EPFINEGKRL 
       910        920        930        940        950        960 
GYIHRNFAGN RFSDHVALLS VFQAWDDARM GGEEAEIRFC EHKRLNMATL RMTWEAKVQL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
KEILINSGFP EDCLLTQVFT NTGPDNNLDV VISLLAFGVY PNVCYHKEKR KILTTEGRNA 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LIHKSSVNCP FSSQDMKYPS PFFVFGEKIR TRAISAKGMT LVTPLQLLLF ASKKVQSDGQ 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
IVLVDDWIKL QISHEAAACI TGLRAAMEAL VVEVTKQPAI ISQLDPVNER MLNMIRQISR 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
PSAAGINLMI GSTRYGDGPR PPKMARYDNG SGYRRGGSSY SGGGYGGGYS SGGYGSGGYG 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GSANSFRAGY GAGVGGGYRG VSRGGFRGNS GGDYRGPSGG YRGSGGFQRG GGRGAYGTGY 
      1270    
FGQGRGGGGY 

Isoforms

- Isoform 2 of ATP-dependent RNA helicase A

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MGDVKNFLYA WCGKRKMTPS YEIRAVGNKN RQKFMCEVQV EGYNYTGMGN STNKKDAQSN 
        70         80         90        100        110        120 
AARDFVNYLV RINEIKSEEV PAFGVASPPP LTDTPDTTAN AEGDLPTTMG GPLPPHLALK 
       130        140        150        160        170        180 
AENNSEVGAS GYGVPGPTWD RGANLKDYYS RKEEQEVQAT LESEEVDLNA GLHGNWTLEN 
       190        200        210        220        230        240 
AKARLNQYFQ KEKIQGEYKY TQVGPDHNRS FIAEMTIYIK QLGRRIFARE HGSNKKLAAQ 
       250        260        270        280        290        300 
SCALSLVRQL YHLGVVEAYS GLTKKKEGET VEPYKVNLSQ DLEHQLQNII QELNLEILPP 
       310        320        330        340        350        360 
PEDPSVPVAL NIGKLAQFEP SQRQNQVGVV PWSPPQSNWN PWTSSNIDEG PLAFATPEQI 
       370        380        390        400        410        420 
SMDLKNELMY QLEQDHDLQA ILQERELLPV KKFESEILEA ISQNSVVIIR GATGCGKTTQ 
       430        440        450        460        470        480 
VPQFILDDFI QNDRAAECNI VVTQPRRISA VSVAERVAFE RGEEPGKSCG YSVRFESILP 
       490        500        510        520        530        540 
RPHASIMFCT VGVLLRKLEA GIRGISHVIV DEIHERDINT DFLLVVLRDV VQAYPEVRIV 
       550        560        570        580        590        600 
LMSATIDTSM FCEYFFNCPI IEVYGRTYPV QEYFLEDCIQ MTHFVPPPKD KKKKDKDDDG 
       610        620        630        640        650        660 
GEDDDANCNL ICGDEYGPET RLSMSQLNEK ETPFELIEAL LKYIETLNVP GAVLVFLPGW 
       670        680        690        700        710        720 
NLIYTMQKHL EMNPHFGSHR YQILPLHSQI PREEQRKVFD PVPVGVTKVI LSTNIAETSI 
       730        740        750        760        770        780 
TINDVVYVID SCKQKVKLFT AHNNMTNYAT VWASKTNLEQ RKGRAGRVRP GFCFHLCSRA 
       790        800        810        820        830        840 
RFERLETHMT PEMFRTPLHE IALSIKLLRL GGIGQFLAKA IEPPPLDAVI EAEHTLRELD 
       850        860        870        880        890        900 
ALDANDELTP LGRILAKLPI EPRFGKMMIM GCIFYVGDAI CTIAAATCFP EPFINEGKRL 
       910        920        930        940        950        960 
GYIHRNFAGN RFSDHVALLS VFQAWDDARM GGEEAEIRFC EHKRLNMATL RMTWEAKVQL 
       970        980        990       1000       1010       1020 
KEILINSGFP EDCLLTQVFT NTGPDNNLDV VISLLAFGVY PNVCYHKEKR KILTTEGRNA 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
LIHKSSVNCP FSSQDMKYPS PFFVFGEKIR TRAISAKGMT LVTPLQLLLF ASKKVQSDGQ 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
IVLVDDWIKL QISHEAAACI TGLRAAMEAL VVEVTKQPAI ISQLDPVNER MLNMIRQISR 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
PSAAGINLMI GSTRYGDGPR PPKMARYDNG SGYRRGGSSY SGGGYGGGYS SGGYGSGGYG 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
GSANSFRAGY GAGVGGGYRG VSRGGFRGNS GGDYRGPSGG YRGSGGFQRG GGRGAYGTGY 
      1270    
FGQGRGGGGY 



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

22 N-termini - 9 C-termini - 9 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

Cleavages

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)