TopFIND 4.0

P02458: Collagen alpha-1(II) chain {ECO:0000305}

General Information

Protein names
- Collagen alpha-1(II) chain {ECO:0000305}
- Alpha-1 type II collagen {ECO:0000305}
- Collagen alpha-1(II) chain {ECO:0000305}
- Chondrocalcin {ECO:0000303|PubMed:3800925}

Gene names COL2A1
Organism Homo sapiens
Protease Family
Protease ID
Chromosome location
UniProt ID P02458

74

N-termini

73

C-termini

180

Cleavages

0

Substrates

Sequence

        10         20         30         40         50         60 
MIRLGAPQTL VLLTLLVAAV LRCQGQDVQE AGSCVQDGQR YNDKDVWKPE PCRICVCDTG 
        70         80         90        100        110        120 
TVLCDDIICE DVKDCLSPEI PFGECCPICP TDLATASGQP GPKGQKGEPG DIKDIVGPKG 
       130        140        150        160        170        180 
PPGPQGPAGE QGPRGDRGDK GEKGAPGPRG RDGEPGTPGN PGPPGPPGPP GPPGLGGNFA 
       190        200        210        220        230        240 
AQMAGGFDEK AGGAQLGVMQ GPMGPMGPRG PPGPAGAPGP QGFQGNPGEP GEPGVSGPMG 
       250        260        270        280        290        300 
PRGPPGPPGK PGDDGEAGKP GKAGERGPPG PQGARGFPGT PGLPGVKGHR GYPGLDGAKG 
       310        320        330        340        350        360 
EAGAPGVKGE SGSPGENGSP GPMGPRGLPG ERGRTGPAGA AGARGNDGQP GPAGPPGPVG 
       370        380        390        400        410        420 
PAGGPGFPGA PGAKGEAGPT GARGPEGAQG PRGEPGTPGS PGPAGASGNP GTDGIPGAKG 
       430        440        450        460        470        480 
SAGAPGIAGA PGFPGPRGPP GPQGATGPLG PKGQTGEPGI AGFKGEQGPK GEPGPAGPQG 
       490        500        510        520        530        540 
APGPAGEEGK RGARGEPGGV GPIGPPGERG APGNRGFPGQ DGLAGPKGAP GERGPSGLAG 
       550        560        570        580        590        600 
PKGANGDPGR PGEPGLPGAR GLTGRPGDAG PQGKVGPSGA PGEDGRPGPP GPQGARGQPG 
       610        620        630        640        650        660 
VMGFPGPKGA NGEPGKAGEK GLPGAPGLRG LPGKDGETGA AGPPGPAGPA GERGEQGAPG 
       670        680        690        700        710        720 
PSGFQGLPGP PGPPGEGGKP GDQGVPGEAG APGLVGPRGE RGFPGERGSP GAQGLQGPRG 
       730        740        750        760        770        780 
LPGTPGTDGP KGASGPAGPP GAQGPPGLQG MPGERGAAGI AGPKGDRGDV GEKGPEGAPG 
       790        800        810        820        830        840 
KDGGRGLTGP IGPPGPAGAN GEKGEVGPPG PAGSAGARGA PGERGETGPP GPAGFAGPPG 
       850        860        870        880        890        900 
ADGQPGAKGE QGEAGQKGDA GAPGPQGPSG APGPQGPTGV TGPKGARGAQ GPPGATGFPG 
       910        920        930        940        950        960 
AAGRVGPPGS NGNPGPPGPP GPSGKDGPKG ARGDSGPPGR AGEPGLQGPA GPPGEKGEPG 
       970        980        990       1000       1010       1020 
DDGPSGAEGP PGPQGLAGQR GIVGLPGQRG ERGFPGLPGP SGEPGKQGAP GASGDRGPPG 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
PVGPPGLTGP AGEPGREGSP GADGPPGRDG AAGVKGDRGE TGAVGAPGAP GPPGSPGPAG 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
PTGKQGDRGE AGAQGPMGPS GPAGARGIQG PQGPRGDKGE AGEPGERGLK GHRGFTGLQG 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
LPGPPGPSGD QGASGPAGPS GPRGPPGPVG PSGKDGANGI PGPIGPPGPR GRSGETGPAG 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PPGNPGPPGP PGPPGPGIDM SAFAGLGPRE KGPDPLQYMR ADQAAGGLRQ HDAEVDATLK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
SLNNQIESIR SPEGSRKNPA RTCRDLKLCH PEWKSGDYWI DPNQGCTLDA MKVFCNMETG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
ETCVYPNPAN VPKKNWWSSK SKEKKHIWFG ETINGGFHFS YGDDNLAPNT ANVQMTFLRL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LSTEGSQNIT YHCKNSIAYL DEAAGNLKKA LLIQGSNDVE IRAEGNSRFT YTALKDGCTK 
      1450       1460       1470       1480    
HTGKWGKTVI EYRSQKTSRL PIIDIAPMDI GGPEQEFGVD IGPVCFL

Isoforms

- Isoform 1 of Collagen alpha-1(II) chain - Isoform 3 of Collagen alpha-1(II) chain

Sequence View

        10         20         30         40         50         60 
MIRLGAPQTL VLLTLLVAAV LRCQGQDVQE AGSCVQDGQR YNDKDVWKPE PCRICVCDTG 
        70         80         90        100        110        120 
TVLCDDIICE DVKDCLSPEI PFGECCPICP TDLATASGQP GPKGQKGEPG DIKDIVGPKG 
       130        140        150        160        170        180 
PPGPQGPAGE QGPRGDRGDK GEKGAPGPRG RDGEPGTPGN PGPPGPPGPP GPPGLGGNFA 
       190        200        210        220        230        240 
AQMAGGFDEK AGGAQLGVMQ GPMGPMGPRG PPGPAGAPGP QGFQGNPGEP GEPGVSGPMG 
       250        260        270        280        290        300 
PRGPPGPPGK PGDDGEAGKP GKAGERGPPG PQGARGFPGT PGLPGVKGHR GYPGLDGAKG 
       310        320        330        340        350        360 
EAGAPGVKGE SGSPGENGSP GPMGPRGLPG ERGRTGPAGA AGARGNDGQP GPAGPPGPVG 
       370        380        390        400        410        420 
PAGGPGFPGA PGAKGEAGPT GARGPEGAQG PRGEPGTPGS PGPAGASGNP GTDGIPGAKG 
       430        440        450        460        470        480 
SAGAPGIAGA PGFPGPRGPP GPQGATGPLG PKGQTGEPGI AGFKGEQGPK GEPGPAGPQG 
       490        500        510        520        530        540 
APGPAGEEGK RGARGEPGGV GPIGPPGERG APGNRGFPGQ DGLAGPKGAP GERGPSGLAG 
       550        560        570        580        590        600 
PKGANGDPGR PGEPGLPGAR GLTGRPGDAG PQGKVGPSGA PGEDGRPGPP GPQGARGQPG 
       610        620        630        640        650        660 
VMGFPGPKGA NGEPGKAGEK GLPGAPGLRG LPGKDGETGA AGPPGPAGPA GERGEQGAPG 
       670        680        690        700        710        720 
PSGFQGLPGP PGPPGEGGKP GDQGVPGEAG APGLVGPRGE RGFPGERGSP GAQGLQGPRG 
       730        740        750        760        770        780 
LPGTPGTDGP KGASGPAGPP GAQGPPGLQG MPGERGAAGI AGPKGDRGDV GEKGPEGAPG 
       790        800        810        820        830        840 
KDGGRGLTGP IGPPGPAGAN GEKGEVGPPG PAGSAGARGA PGERGETGPP GPAGFAGPPG 
       850        860        870        880        890        900 
ADGQPGAKGE QGEAGQKGDA GAPGPQGPSG APGPQGPTGV TGPKGARGAQ GPPGATGFPG 
       910        920        930        940        950        960 
AAGRVGPPGS NGNPGPPGPP GPSGKDGPKG ARGDSGPPGR AGEPGLQGPA GPPGEKGEPG 
       970        980        990       1000       1010       1020 
DDGPSGAEGP PGPQGLAGQR GIVGLPGQRG ERGFPGLPGP SGEPGKQGAP GASGDRGPPG 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
PVGPPGLTGP AGEPGREGSP GADGPPGRDG AAGVKGDRGE TGAVGAPGAP GPPGSPGPAG 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
PTGKQGDRGE AGAQGPMGPS GPAGARGIQG PQGPRGDKGE AGEPGERGLK GHRGFTGLQG 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
LPGPPGPSGD QGASGPAGPS GPRGPPGPVG PSGKDGANGI PGPIGPPGPR GRSGETGPAG 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PPGNPGPPGP PGPPGPGIDM SAFAGLGPRE KGPDPLQYMR ADQAAGGLRQ HDAEVDATLK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
SLNNQIESIR SPEGSRKNPA RTCRDLKLCH PEWKSGDYWI DPNQGCTLDA MKVFCNMETG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
ETCVYPNPAN VPKKNWWSSK SKEKKHIWFG ETINGGFHFS YGDDNLAPNT ANVQMTFLRL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LSTEGSQNIT YHCKNSIAYL DEAAGNLKKA LLIQGSNDVE IRAEGNSRFT YTALKDGCTK 
      1450       1460       1470       1480    
HTGKWGKTVI EYRSQKTSRL PIIDIAPMDI GGPEQEFGVD IGPVCFL         10         20         30         40         50         60 
MIRLGAPQTL VLLTLLVAAV LRCQGQDVQE AGSCVQDGQR YNDKDVWKPE PCRICVCDTG 
        70         80         90        100        110        120 
TVLCDDIICE DVKDCLSPEI PFGECCPICP TDLATASGQP GPKGQKGEPG DIKDIVGPKG 
       130        140        150        160        170        180 
PPGPQGPAGE QGPRGDRGDK GEKGAPGPRG RDGEPGTPGN PGPPGPPGPP GPPGLGGNFA 
       190        200        210        220        230        240 
AQMAGGFDEK AGGAQLGVMQ GPMGPMGPRG PPGPAGAPGP QGFQGNPGEP GEPGVSGPMG 
       250        260        270        280        290        300 
PRGPPGPPGK PGDDGEAGKP GKAGERGPPG PQGARGFPGT PGLPGVKGHR GYPGLDGAKG 
       310        320        330        340        350        360 
EAGAPGVKGE SGSPGENGSP GPMGPRGLPG ERGRTGPAGA AGARGNDGQP GPAGPPGPVG 
       370        380        390        400        410        420 
PAGGPGFPGA PGAKGEAGPT GARGPEGAQG PRGEPGTPGS PGPAGASGNP GTDGIPGAKG 
       430        440        450        460        470        480 
SAGAPGIAGA PGFPGPRGPP GPQGATGPLG PKGQTGEPGI AGFKGEQGPK GEPGPAGPQG 
       490        500        510        520        530        540 
APGPAGEEGK RGARGEPGGV GPIGPPGERG APGNRGFPGQ DGLAGPKGAP GERGPSGLAG 
       550        560        570        580        590        600 
PKGANGDPGR PGEPGLPGAR GLTGRPGDAG PQGKVGPSGA PGEDGRPGPP GPQGARGQPG 
       610        620        630        640        650        660 
VMGFPGPKGA NGEPGKAGEK GLPGAPGLRG LPGKDGETGA AGPPGPAGPA GERGEQGAPG 
       670        680        690        700        710        720 
PSGFQGLPGP PGPPGEGGKP GDQGVPGEAG APGLVGPRGE RGFPGERGSP GAQGLQGPRG 
       730        740        750        760        770        780 
LPGTPGTDGP KGASGPAGPP GAQGPPGLQG MPGERGAAGI AGPKGDRGDV GEKGPEGAPG 
       790        800        810        820        830        840 
KDGGRGLTGP IGPPGPAGAN GEKGEVGPPG PAGSAGARGA PGERGETGPP GPAGFAGPPG 
       850        860        870        880        890        900 
ADGQPGAKGE QGEAGQKGDA GAPGPQGPSG APGPQGPTGV TGPKGARGAQ GPPGATGFPG 
       910        920        930        940        950        960 
AAGRVGPPGS NGNPGPPGPP GPSGKDGPKG ARGDSGPPGR AGEPGLQGPA GPPGEKGEPG 
       970        980        990       1000       1010       1020 
DDGPSGAEGP PGPQGLAGQR GIVGLPGQRG ERGFPGLPGP SGEPGKQGAP GASGDRGPPG 
      1030       1040       1050       1060       1070       1080 
PVGPPGLTGP AGEPGREGSP GADGPPGRDG AAGVKGDRGE TGAVGAPGAP GPPGSPGPAG 
      1090       1100       1110       1120       1130       1140 
PTGKQGDRGE AGAQGPMGPS GPAGARGIQG PQGPRGDKGE AGEPGERGLK GHRGFTGLQG 
      1150       1160       1170       1180       1190       1200 
LPGPPGPSGD QGASGPAGPS GPRGPPGPVG PSGKDGANGI PGPIGPPGPR GRSGETGPAG 
      1210       1220       1230       1240       1250       1260 
PPGNPGPPGP PGPPGPGIDM SAFAGLGPRE KGPDPLQYMR ADQAAGGLRQ HDAEVDATLK 
      1270       1280       1290       1300       1310       1320 
SLNNQIESIR SPEGSRKNPA RTCRDLKLCH PEWKSGDYWI DPNQGCTLDA MKVFCNMETG 
      1330       1340       1350       1360       1370       1380 
ETCVYPNPAN VPKKNWWSSK SKEKKHIWFG ETINGGFHFS YGDDNLAPNT ANVQMTFLRL 
      1390       1400       1410       1420       1430       1440 
LSTEGSQNIT YHCKNSIAYL DEAAGNLKKA LLIQGSNDVE IRAEGNSRFT YTALKDGCTK 
      1450       1460       1470       1480    
HTGKWGKTVI EYRSQKTSRL PIIDIAPMDI GGPEQEFGVD IGPVCFL



Filter Information:


(REFRESH)

Directness:


Physiological Relevance:


Evidence Codes:


Methodology:


Perturbation of System:


Biological System:


Protease Assignment Confidence:


Evidence Names:


Database:


Lab:



Protein Neighborhood

Domains & Features

74 N-termini - 73 C-termini - 180 Cleavages - 0 Substrates

N-termini

C-termini

Cleavages

Substrates

    Substrate Position Sequence Evidence type Method Source (database) Source (Lab) Evidence name Publications (PMIDs)